Панель линий раковых клеток NCI -60 представляет собой группу из 60 линий раковых клеток человека, используемых Национальным институтом рака (NCI) для скрининга соединений с целью выявления потенциальной противораковой активности. [1]
Процедура скрининга называется NCI-60 Human Tumor Cell Lines Screen , и это одна из служб Discovery & Development Program NCI's Developmental Therapeutics Program (DTP). [2] [3] [4] Показатели скрининга для каждой линии клеток, цитостатическое и цитотоксическое воздействие тестируемых веществ. [2]
Благодаря разнообразию клеточных линий, можно сравнивать тестируемые соединения по их моделям воздействия, высокая корреляция потенциально соответствует схожим механизмам воздействия. [2] Автоматическое сравнение с базой данных, содержащей более 88 000 чистых соединений и более 34 000 неочищенных экстрактов (по состоянию на 6 января 2017 г. [обновлять]), осуществляется инструментом COMPARE, который показывает список веществ, ранжированных по коэффициентам корреляции Пирсона для данного тестируемого вещества. [5]
Та же панель используется в программе Molecular Target для характеристики молекулярных мишеней. Измерения включают уровни белка, измерения РНК, статус мутации и уровни активности ферментов . [6]
Панель содержит клеточные линии, представляющие лейкемию , меланому , немелкоклеточную карциному легких , а также рак мозга , яичников , молочной железы , толстой кишки , почек и простаты . [1] [2]
13 дополнительных линий клеток оцениваются для использования в программе скрининга, среди них две линии, полученные из до сих пор не представленной мелкоклеточной карциномы легких . [1]
Все линии клеток, кроме одной (по состоянию на 6 января 2017 г. [обновлять]), доступны другим лабораториям, включая дополнительные линии клеток. [1]
Начиная с начала тысячелетия, было обнаружено, что несколько линий клеток были неправильно идентифицированы или неправильно классифицированы во время исследования или ранее: [7] [8] [9]
MDA-MB-435 , первоначально классифицированная как клеточная линия рака молочной железы, была идентифицирована как клеточная линия меланомы. [7] При дальнейшем исследовании оказалось, что текущая MDA-MB-435 получена от того же человека, что и клеточная линия M14 . [7] Исследование клонов ясно показало, что путаница с M14 произошла очень рано в истории MDA-MB-435, до ее включения в Программу терапии развития. [7]
NCI/ADR-RES , первоначально классифицированная как линия клеток рака молочной железы, была идентифицирована как линия клеток опухоли яичников. [8] NCI/ADR-RES, по-видимому, была получена в какой-то момент времени из линии клеток OVCAR-8 . [8] Первоначально линия клеток называлась MCF-7/ADR-RES ; она была переименована вместе с изменением классификации. [8]
Было обнаружено, что две линии клеток рака мозга, SNB-19 и U251 , принадлежат одному и тому же человеку. [9] Это делает путаницу вероятной.
Было подтверждено, что 61-я клеточная линия, MDA-N , получена из ошибочно классифицированной клеточной линии MDA-MB-435. [7] Таким образом, она также неправильно классифицирована, на самом деле являясь клеточной линией меланомы, но по состоянию на 6 января 2018 года [обновлять]официальный сайт все еще указывает ее как клеточную линию рака молочной железы. [1] Эта клеточная линия недоступна по состоянию на 6 января 2018 года [обновлять]. [1]
Международный комитет по аутентификации клеточных линий ведет список загрязненных клеточных линий . [10] Он включает в себя клеточные линии, о которых сообщалось выше, хотя обычно с датами отчетности и статьями, значительно более поздними, чем первые даты, и статьями, вызывающими особую озабоченность относительно соответствующей клеточной линии. [10] [7] [8] [9]
По состоянию на 2014 год [обновлять]сотни исследований по-прежнему используют MDA-MB-435 в качестве модели рака молочной железы, даже после того, как в 2007 году она была официально объявлена клеточной линией меланомы, и даже в самых рейтинговых международных рецензируемых журналах. [11] То же самое справедливо и для других неправильно идентифицированных клеточных линий. [11]
Клеточная линия | Классификация опухолей | (Потенциально) неверно идентифицирован | Оригинальная классификация | Недоступно | Время удвоения (часы) | Плотность инокуляции | Идентификатор и ссылка на целлозавра |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CCRF-CEM | Лейкемия | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207) | |||
HL-60(ТБ) | Лейкемия | 28.6 | 40000 | HL-60(ТБ) (RRID:CVCL_A794) | |||
К-562 | Лейкемия | 19.6 | 5000 | К-562 (RRID:CVCL_0004) | |||
MOLT-4 | Лейкемия | 27.9 | 30000 | MOLT-4 (RRID:CVCL_0013) | |||
РПМИ-8226 | Лейкемия | 33,5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014) | |||
СР-786 | Лейкемия | 28.7 | 20000 | SR (RRID:CVCL_1711) | |||
А549 | Немелкоклеточное легкое | 22.9 | 7500 | А-549 (RRID:CVCL_0023) | |||
EKVX | Немелкоклеточное легкое | 43,6 | 20000 | EKVX (RRID:CVCL_1195) | |||
ХОП-62 | Немелкоклеточное легкое | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID:CVCL_1285) | |||
ХОП-92 | Немелкоклеточное легкое | 79,5 | 20000 | HOP-92 (RRID:CVCL_1286) | |||
NCI-H226 | Немелкоклеточное легкое | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID:CVCL_1544) | |||
NCI-H23 | Немелкоклеточное легкое | 33.4 | 20000 | NCI-H23 (RRID:CVCL_1547) | |||
NCI-H322M | Немелкоклеточное легкое | 35.3 | 20000 | NCI-H322M (RRID:CVCL_1557) | |||
NCI-H460 | Немелкоклеточное легкое | 17.8 | 7500 | NCI-H460 (RRID:CVCL_0459) | |||
NCI-H522 | Немелкоклеточное легкое | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (RRID:CVCL_1567) | |||
КОЛО 205 | Колон | 23.8 | 15000 | КОЛО 205 (RRID:CVCL_0218) | |||
ГКС-2998 | Колон | 31,5 | 15000 | HCC2998 (RRID:CVCL_1266) | |||
HCT116 | Колон | 17.4 | 5000 | HCT 116 (RRID:CVCL_0291) | |||
HCT-15 | Колон | 20.6 | 10000 | HCT 15 (RRID:CVCL_0292) | |||
ХТ-29 | Колон | 19.5 | 5000 | HT-29 (RRID:CVCL_0320) | |||
КМ12 | Колон | 23.7 | 15000 | КМ12 (RRID:CVCL_1331) | |||
SW-620 | Колон | 20.4 | 10000 | SW620 (RRID:CVCL_0547) | |||
СФ-268 | ЦНС | 33.1 | 15000 | SF268 (RRID:CVCL_1689) | |||
СФ-295 | ЦНС | 29.5 | 10000 | SF295 (RRID:CVCL_1690) | |||
СФ-539 | ЦНС | 35.4 | 15000 | SF539 (RRID:CVCL_1691) | |||
СНБ-19 | ЦНС | да | ЦНС | 34,6 | 15000 | SNB-19 (RRID:CVCL_0535) | |
СНБ-75 | ЦНС | 62.8 | 20000 | SNB-75 (RRID:CVCL_1706) | |||
U251 | ЦНС | да | ЦНС | 23.8 | 7500 | U-251MG (RRID:CVCL_0021) | |
LOX IMVI | Меланома | 20.5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381) | |||
МАЛЬМЕ-3М | Меланома | 46.2 | 20000 | Мальме-3М (RRID:CVCL_1438) | |||
М14 | Меланома | 26.3 | 15000 | M14 (RRID:CVCL_1395) | |||
МДА-МБ-435 | Меланома | да | Грудь | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417) | |
СК-МЭЛ-2 | Меланома | 45,5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID:CVCL_0069) | |||
СК-МЭЛ-28 | Меланома | 35.1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526) | |||
СК-МЕЛ-5 | Меланома | 25.2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID:CVCL_0527) | |||
УАКК-257 | Меланома | 38,5 | 20000 | UACC-257 (RRID:CVCL_1779) | |||
УАКК-62 | Меланома | 31.3 | 10000 | UACC-62 (RRID:CVCL_1780) | |||
ИГРОВ-1 | Яичниковый | 31 | 10000 | IGROV-1 (RRID:CVCL_1304) | |||
ОВКАР-3 | Яичниковый | 34.7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID:CVCL_0465) | |||
ОВКАР-4 | Яичниковый | 41.4 | 15000 | ОВКАР-4 (RRID:CVCL_1627) | |||
ОВКАР-5 | Яичниковый | 48.8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID:CVCL_1628) | |||
ОВКАР-8 | Яичниковый | 26.1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID:CVCL_1629) | |||
NCI/ADR-RES (первоначально MCF-7/ADR-RES) | Яичниковый | да | Грудь | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID:CVCL_1452) | |
СК-ОВ-3 | Яичниковый | 48.7 | 20000 | СК-ОВ-3 (RRID:CVCL_0532) | |||
786-О | Почечный | 22.4 | 10000 | 786-O (RRID:CVCL_1051) | |||
А498 | Почечный | 66.8 | 25000 | А-498 (RRID:CVCL_1056) | |||
АЧН | Почечный | 27.5 | 10000 | ACHN (RRID:CVCL_1067) | |||
КАКИ-1 | Почечный | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID:CVCL_0234) | |||
РХФ 393 | Почечный | 62.9 | 15000 | RXF 393L (RRID:CVCL_1673) | |||
SN12C | Почечный | 29.5 | 15000 | SN12C (RRID:CVCL_1705) | |||
ТК-10 | Почечный | 51.3 | 15000 | ТК-10 (RRID:CVCL_1773) | |||
УО-31 | Почечный | 41.7 | 15000 | УО-31 (RRID:CVCL_1911) | |||
ПК-3 | простата | 27.1 | 7500 | ПК-3 (RRID:CVCL_0035) | |||
ДУ-145 | простата | 32.3 | 10000 | DU145 (RRID:CVCL_0105) | |||
MCF7 | Грудь | 25.4 | 10000 | MCF-7 (RRID:CVCL_0031) | |||
МДА-МБ-231 | Грудь | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062) | |||
МДА-МБ-468 | Грудь | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419) | |||
ГС 578Т | Грудь | 53,8 | 20000 | Hs 578T (RRID:CVCL_0332) | |||
МДА-Н | Меланома | да | Грудь | недоступно | 22.5 | 15000 | MDA-N (RRID:CVCL_1910) |
БТ-549 | Грудь | 53,9 | 20000 | BT-549 (RRID:CVCL_1092) | |||
Т-47Д | Грудь | 45,5 | 20000 | Т-47Д (RRID:CVCL_0553) |
Клеточная линия | Классификация опухолей | Разновидность | Плотность инокуляции | Идентификатор и ссылка на целлозавра |
---|---|---|---|---|
ЛКСФЛ 529 | Немелкоклеточное легкое | человек | 10000 | LXFL 529L (RRID:CVCL_D085) |
ДМС 114 | Мелкоклеточное легкое | человек | 20000 | ДМС 114 (RRID:CVCL_1174) |
ШП-77 | Мелкоклеточное легкое | человек | 40000 | SHP-77 (RRID:CVCL_1693) |
ДЛД-1 | Колон | человек | 50000 | DLD-1 (RRID:CVCL_0248) |
КМ20Л2 | Колон | человек | 10000 | KM20L2 (RRID:CVCL_D889) |
СНБ-78 | ЦНС | человек | 20000 | SNB-78 (RRID:CVCL_B321) |
XF498 | ЦНС | человек | 20000 | XF 498 (RRID:CVCL_8928) |
RPMI-7951 | Меланома | человек | 20000 | RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666) |
М19-МЭЛ | Меланома | человек | 10000 | M19-MEL (RRID:CVCL_B415) |
РХФ-631 | Почечный | человек | 10000 | RXF 631L (RRID:CVCL_A780) |
СН12К1 | Почечный | человек | 10000 | SN12K1 (RRID:CVCL_D106) |
П388 | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 (RRID:CVCL_7222) |
P388/ADR | Лейкемия | мышь | 50000 | P388/ADR (RRID:CVCL_IZ75) |