N-концевой домен оранжевого каротиноида
| Carot_N | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура оранжевого каротиноидного белка | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Carot_N | ||||||||
| Пфам | ПФ09150 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR015233 | ||||||||
| СКОП2 | 1m98 / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии N-концевой домен оранжевого каротиноида — это белковый домен, находящийся преимущественно на N-конце белка оранжевого каротиноида (OCP) и участвующий в нековалентном связывании хромофора каротиноида . Он уникален тем, что присутствует в растворимых белках, тогда как подавляющее большинство доменов, способных связывать каротиноиды, являются внутренними мембранными белками. До сих пор он был обнаружен исключительно в цианобактериях , среди которых он широко распространен. [1] Домен также существует сам по себе, в неохарактеризованных белках цианобактерий, называемых «красным каротиноидным белком» (RCP). Домен принимает альфа-спиральную структуру , состоящую из двух пучков из четырех спиралей. [2]
Оранжевые каротиноидсвязывающие белки (OCP) были впервые идентифицированы у видов цианобактерий , где они встречаются в сочетании с фикобилисомой в клеточной тилакоидной мембране . Эти белки выполняют функцию фотозащиты и необходимы для нефотохимического гашения (NPQ). [3] [4] В полноразмерном OCP активность NPQ регулируется фотоактивацией сильным сине-зеленым светом. OCP, по-видимому, действует как гомодимер и связывает одну молекулу 3'-гидроксиэхиненона ( кетокаротиноида ) и один хлорид- ион на субъединицу. Сайт связывания каротиноида выстлан поразительным количеством остатков метионина . N-концевой домен OCP обычно сопровождается C-концевым доменом, который принадлежит к суперсемейству NTF2 и помогает связывать каротиноид. OCP может быть протеолитически расщеплен до красной формы (RCP), в которой отсутствуют 15 остатков с N-конца и приблизительно 150 остатков с C-конца. [5] Этот домен участвует в связывании комплекса фикобилисомы, что тем самым способствует тепловому рассеиванию (тушению) избыточной поглощенной световой энергии. [6]
Смотрите также
Ссылки
- ^ Кириловский Д., Керфельд КА (июль 2013 г.). «Оранжевый каротиноидный белок: фотоактивный белок сине-зеленого света». Фотохимические и фотобиологические науки . 12 (7): 1135– 43. doi : 10.1039/c3pp25406b . PMID 23396391.
- ^ Kerfeld CA, Sawaya MR, Brahmandam V, Cascio D, Ho KK, Trevithick-Sutton CC, Krogmann DW, Yeates TO (январь 2003 г.). «Кристаллическая структура водорастворимого белка, связывающего каротиноиды цианобактерий». Структура . 11 (1): 55– 65. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00936-X . PMID 12517340.
- ^ Wilson A, Ajlani G, Verbavatz JM, Vass I, Kerfeld CA, Kirilovsky D (апрель 2006 г.). «Растворимый каротиноидный белок, участвующий в диссипации энергии, связанной с фикобилисомой, у цианобактерий». The Plant Cell . 18 (4): 992–1007 . doi :10.1105/tpc.105.040121. PMC 1425857. PMID 16531492 .
- ^ Wilson A, Boulay C, Wilde A, Kerfeld CA, Kirilovsky D (февраль 2007 г.). «Светоиндуцированное рассеивание энергии у цианобактерий, испытывающих нехватку железа: роль белков OCP и IsiA». The Plant Cell . 19 (2): 656–72 . doi :10.1105/tpc.106.045351. PMC 1867334. PMID 17307930 .
- ^ Kerfeld CA (2004). «Структура и функция водорастворимых каротиноидсвязывающих белков цианобактерий». Photosynthesis Research . 81 (3): 215– 25. doi :10.1023/B:PRES.0000036886.60187.c8. PMID 16034528. S2CID 28232976.
- ^ Wilson A, Gwizdala M, Mezzetti A, Alexandre M, Kerfeld CA, Kirilovsky D (май 2012). «Важная роль N-концевого домена оранжевого каротиноидного белка в фотозащите цианобактерий: важность положительного заряда для связывания фикобилисом». The Plant Cell . 24 (5): 1972–83 . doi :10.1105/tpc.112.096909. PMC 3442581 . PMID 22634762.
