ОРС6
| Белок NS6 бетакоронавируса | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | bCoV_NS6 | ||||||||
| Пфам | ПФ12133 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR022736 | ||||||||
| |||||||||
ORF6 — это ген , кодирующий вирусный вспомогательный белок в коронавирусах подрода Sarbecovirus , включая SARS-CoV и SARS-CoV-2 . Он отсутствует в MERS-CoV . Считается, что он снижает реакцию иммунной системы на вирусную инфекцию посредством антагонизма интерферона . [1] [ 2] [3]
Структура
Белок ORF6 довольно мал, его длина составляет 63 аминокислотных остатка в SARS-CoV [2] и 61 в SARS-CoV-2 . [3] Последовательность ORF6 не очень хорошо сохраняется , и она имеет относительно низкую идентичность последовательностей между двумя вирусами - около 66%. [4] Он имеет амфипатическую N-концевую альфа-спираль , которая ассоциируется с мембраной , но не является трансмембранным белком . Его C-концевой хвост из примерно 20 остатков является полярным и простирается в цитозоль , а также содержит сигнальные последовательности для транспортировки белка . [1] [2]
Выражение и локализация
Как и гены других дополнительных белков, ген ORF6 расположен рядом с генами, кодирующими структурные белки , на 5'- конце генома РНК коронавируса. Наряду с ORF7a , ORF7b и ORF8 , ORF6 расположен между генами мембраны (M) и нуклеокапсида (N). [1] [2] [3] Он локализован в эндоплазматическом ретикулуме и аппарате Гольджи , [1] [2] [3] причем исследования SARS-CoV-2 также указывают на связь с везикулами , такими как аутофагосомы и лизосомы . [3]
Функция
Считается, что основная функция белка ORF6 — иммуномодуляция и антагонизм интерферона . Он не является необходимым для репликации вируса , хотя его отсутствие, по-видимому, снижает эффективность репликации. [1] [2]
Взаимодействие вирусных белков
Исследования SARS-CoV показывают, что белок ORF6 демонстрирует белок-белковые взаимодействия с другим вирусным вспомогательным белком, белком ORF9b . [1] [5] В SARS-CoV, но не в рекомбинантном вирусе гепатита мыши , белок ORF6 был обнаружен в вирусоподобных частицах и зрелых вирионах , что позволяет предположить, что он может быть второстепенным вирусным структурным белком . [1] [2]
Иммунные эффекты
Белок ORF6 как из SARS-CoV, так и из SARS-CoV-2 является антагонистом интерферона и, как полагают, участвует в иммунном уклонении . Было описано несколько взаимодействий белок-белок с белками клетки-хозяина, которые опосредуют этот эффект. Сообщалось, что он ингибирует ядерный импорт фактора транскрипции STAT , ингибируя активацию интерферона. [1] [3] Исследования SARS-CoV сообщают, что это может быть опосредовано связыванием белка ORF6 с кариоферинами . [1] [4] В SARS-CoV-2 белок ORF6, как сообщается, взаимодействует с RAE1 и NUP98 , блокируя взаимодействия кариоферина. [3] [6]
Ссылки
- ^ abcdefghi Liu DX, Fung TS, Chong KK, Shukla A, Hilgenfeld R (сентябрь 2014 г.). «Вспомогательные белки SARS-CoV и других коронавирусов». Antiviral Research . 109 : 97– 109. doi : 10.1016/j.antiviral.2014.06.013. PMC 7113789. PMID 24995382 .
- ^ abcdefg McBride R, Fielding BC (ноябрь 2012 г.). «Роль дополнительных белков тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС)-коронавируса в патогенезе вируса». Вирусы . 4 (11): 2902–2923 . doi : 10.3390/v4112902 . PMC 3509677. PMID 23202509 .
- ^ abcdefg Редондо Н, Залдивар-Лопес С, Гарридо Дж. Дж., Монтойя М (7 июля 2021 г.). «Вспомогательные белки SARS-CoV-2 в вирусном патогенезе: известные и неизвестные». Frontiers in Immunology . 12 : 708264. doi : 10.3389/fimmu.2021.708264 . PMC 8293742. PMID 34305949 .
- ^ ab Suryawanshi RK, Koganti R, Agelidis A, Patil CD, Shukla D (март 2021 г.). «Нарушение регуляции клеточной сигнализации SARS-CoV-2». Trends in Microbiology . 29 (3): 224– 237. doi :10.1016/j.tim.2020.12.007. PMC 7836829. PMID 33451855 .
- ^ Кальво Э., ДеДиего М.Л., Гарсиа П., Лопес Х.А., Перес-Бренья П., Фалькон А. (октябрь 2012 г.). «Дополнительные белки 6 и 9b коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома взаимодействуют in vivo». Вирусные исследования . 169 (1): 282–288 . doi :10.1016/j.virusres.2012.07.012. ПМЦ 7114373 . ПМИД 22820404.
- ^ Miorin L, Kehrer T, Sanchez-Aparicio MT, Zhang K, Cohen P, Patel RS и др. (ноябрь 2020 г.). «SARS-CoV-2 Orf6 захватывает Nup98, чтобы блокировать ядерный импорт STAT и противодействовать передаче сигналов интерферона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (45): 28344– 28354. Bibcode : 2020PNAS..11728344M. doi : 10.1073 /pnas.2016650117 . PMC 7668094. PMID 33097660.
