NADH-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета субкомплекс субъединица 8, митохондриальная - это фермент , который у людей кодируется геном NDUFB8 . [ 5] [6] NADH-дегидрогеназа (убихинон) 1 бета субкомплекс субъединица 8 - это вспомогательная субъединица комплекса NADH-дегидрогеназы (убихинон) , расположенного во внутренней мембране митохондрий . Он также известен как Комплекс I и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . [7]
Ген
Ген NDUFB8 расположен на плече q хромосомы 10 в позиции 24.31 и имеет длину 6194 пар оснований. [8] [9]
Структура
Белок NDUFB8 весит 22 кДа и состоит из 186 аминокислот. [8] [9] NDUFB8 является субъединицей фермента NADH-дегидрогеназы (убихинон) , самого большого из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH. [7] Было показано , что NDUFB7 и NDUFB8 локализуются на межмембранной поверхности комплекса I. [10] Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен имеет потенциал для сворачивания в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю митохондриальную мембрану , с C-концевым гидрофильным доменом, взаимодействующим с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) на внутренней митохондриальной мембране. [6]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является вспомогательной субъединицей мультисубъединичной НАДН:убихинон оксидоредуктазы ( комплекс I ), которая не участвует напрямую в катализе. Комплекс I млекопитающих состоит из 45 различных субъединиц. Он расположен на внутренней мембране митохондрий . Этот белковый комплекс обладает активностью НАДН дегидрогеназы и оксидоредуктазы. Он переносит электроны от НАДН к дыхательной цепи . Непосредственным акцептором электронов для фермента считается убихинон . В этом локусе происходит альтернативный сплайсинг , и были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы. [6] Первоначально НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо простетического плеча флавинмононуклеотида (ФМН) , образуя ФМНН 2 . Электроны переносятся через ряд кластеров железа и серы (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH 2 ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриальной матрицы. [7]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000166136 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025204 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Эмахазион Т, Брукс А.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Картирование генов цепей переноса электронов NDUFA2, NDUFA6, NDUFA7, NDUFB8 и NDUFS8 с помощью гибридного картирования на основе интронов». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 ( 1–2 ): 114. doi :10.1159/000015081. PMID 9763676. S2CID 46861680.
^ abc Voet D , Voet JG , Pratt CW (2013). "Глава 18". Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Hoboken, NJ: Wiley. стр. 581– 620. ISBN978-0-470-54784-7.
^ ab Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). "Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний". Circulation Research . 113 (9): 1043–53 . doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338 .
^ ab "NADH-дегидрогеназа [убихинон] 1 бета субкомплекс субъединица 8". База знаний по атласу белков сердечной органеллы (COPaKB) .
↑ Шклярчик Р., Ваншерс Б.Ф., Набуурс С.Б., Ноус Дж., Нейтманс Л.Г., Хуйнен М.А. (март 2011 г.). «NDUFB7 и NDUFA8 расположены на межмембранной поверхности комплекса I». Письма ФЭБС . 585 (5): 737–43 . doi : 10.1016/j.febslet.2011.01.046 . PMID 21310150. S2CID 20557524.
Дальнейшее чтение
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Данбар DR, Шибасаки Y, Добби L, Андерссон B, Брукс AJ (1997). «Гибридизационная карта in situ геномных клонов для пяти генов комплекса I дыхательной цепи человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 78 (1): 21– 4. doi :10.1159/000134618. PMID 9345899.
Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бускенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (декабрь 1998 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 253 (2): 415–22 . doi :10.1006/bbrc.1998.9786. ПМИД 9878551.
Emahazion T, Jobs M, Howell WM, Siegfried M, Wyöni PI, Prince JA, Brookes AJ (октябрь 1999 г.). «Идентификация 167 полиморфизмов в 88 генах из потенциальных путей нейродегенерации». Gene . 238 (2): 315– 24. doi :10.1016/S0378-1119(99)00330-3. PMID 10570959.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34+». Genome Research . 10 (10): 1546– 60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152.
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Дж, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блёкер Х, Бауэрсакс С, Блюм Х, Лаубер Дж, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б, Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287– 92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Ma J, Dempsey AA, Stamatiou D, Marshall KW, Liew CC (март 2007 г.). «Определение паттернов экспрессии генов лейкоцитов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз . 191 (1): 63–72 . doi :10.1016/j.atherosclerosis.2006.05.032. PMID 16806233.
Hsieh SM, Maguire DJ, Lintell NA, McCabe M, Griffiths LR (2007). "Аберрации Pten и Ndufb8 в тканях рака шейки матки". Транспорт кислорода в ткани XXVIII . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том 599. С. 31– 6. doi :10.1007/978-0-387-71764-7_5. ISBN978-0-387-71763-0. PMID 17727244.
