НДУФАФ3
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
НДУФАФ3
Идентификаторы
ПсевдонимыNDUFAF3 , 2P1, C3orf60, E3-3, фактор сборки комплекса НАДН:убихиноноксидоредуктазы 3, MC1DN18
Внешние идентификаторыОМИМ : 612911; МГИ : 1913956; гомологен : 32460; GeneCards : NDUFAF3; OMA :NDUFAF3 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

25915

66706

Ансамбль

ENSG00000178057

ENSMUSG00000070283

UniProt

Q9BU61

Q9JKL4

РефСек (мРНК)

НМ_199417
НМ_199069
НМ_199070
НМ_199073
НМ_199074

NM_023247

RefSeq (белок)

НП_951032
НП_951033
НП_951047
НП_951056

NP_075736

Местоположение (UCSC)Хр 3: 49.02 – 49.02 МбХр 9: 108.44 – 108.44 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Фактор сборки субкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 альфа 3 , также известный как 2P1 , E3-3 или C3orf60 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном NDUFAF3 . [5] [6] [7] NDUFAF3 представляет собой белок сборки митохондрий, участвующий в сборке НАДН-дегидрогеназы (убихинон), также известной как комплекс I , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . [8] [9] Мутации в этом гене связаны с тяжелым дефицитом комплекса I и синдромом Лея . [5] [9] [10]

Структура

NDUFAF3 расположен на плече p хромосомы 3 в позиции 21.31 и имеет 7 экзонов . [5] Ген NDUFAF3 производит белок массой 20,4 кДа, состоящий из 184 аминокислот . [11] [12] NDUFAF3 кодирует две изоформы , которые имеют общий домен DUF498. Прогнозы показывают, что изоформа A содержит дополнительную последовательность из 35 аминокислот N-конца и, таким образом, длиннее изоформы B. Дополнительная последовательность может быть вовлечена в митохондриальное нацеливание , подтверждая функцию NDUFAF3 в сборке митохондрий. [9]

Функция

НАДН:убихиноноксидоредуктаза (комплекс I) катализирует перенос электронов от НАДН к убихинону (кофермент Q) на первом этапе митохондриальной дыхательной цепи , что приводит к транслокации протонов через внутреннюю мембрану митохондрий. [13] Ген NDUFAF3 кодирует белок сборки митохондриального комплекса I, который локализуется на внутренней мембране митохондрий и взаимодействует с субъединицами комплекса I, а также важен для правильного функционирования митохондриальной дыхательной цепи. [5] [9]

NDUFAF3 колокализуется , ко-мигрирует в несколько промежуточных продуктов сборки и является созависимым с NDUFAF4 от ранних до поздних стадий сборки комплекса I. В дополнение к их тесному взаимодействию друг с другом, NDUFAF3 и NDUFAF4 взаимодействуют с NDUFS2 , NDUFS3 , NDUFS8 и NDUFA5 в зависимом от трансляции механизме ранней сборки. Также предполагается, что NDUFAF3 участвует в сопряжении митохондриальной трансляции с вставкой мембраны в процессе сборки комплекса I. [9]

Клиническое значение

Мутации в NDUFAF3 связаны с дефицитом комплекса I и митохондриальными заболеваниями . Эти нарушения являются результатом дисфункции митохондриальной дыхательной цепи и могут вызывать широкий спектр клинических проявлений от летальной неонатальной болезни до нейродегенеративных расстройств у взрослых . Фенотипы включают макроцефалию с прогрессирующей лейкодистрофией , неспецифическую энцефалопатию , кардиомиопатию , миопатию , заболевание печени , синдром Лея , наследственную оптическую нейропатию Лебера и некоторые формы болезни Паркинсона . [6] [7] Мутации включают гомозиготные варианты c.494C > T; p.(Ala165Val), [10] c.365 G→C, приводящие к R122P, и c.2 T→C, приводящие к M1T. [9] Клинически мутации NDUFAF3 связаны с синдромом Лея [10] и тяжелым дефицитом комплекса I. [9] Некоторые общие признаки и симптомы включают лактатацидоз , нистагм , гипотонию и церебральные поражения . [9] [10]

Взаимодействия

Помимо ко-комплексов, NDUFAF3 имеет белок-белковые взаимодействия с NDUFAF4 [14] и SNRPA . [15]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000178057 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000070283 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ abcd "Фактор сборки комплекса NDUFAF3 NADH:убихинон оксидоредуктазы 3 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 25.07.2018 .
  6. ^ ab "NDUFAF3 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа субкомплексный фактор сборки 3 - Homo sapiens (человек) - ген и белок NDUFAF3". www.uniprot.org . Получено 25.07.2018 .
  7. ^ ab "UniProt: универсальная база знаний о белках". Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158 – D169 . Январь 2017. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID  27899622.  
  8. ^ Дональд Воэт; Джудит Г. Воэт; Шарлотта В. Пратт (2013). «18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр.  581–620 . ISBN. 9780470547847.
  9. ^ abcdefgh Саада А., Фогель Р.О., Хофс С.Дж., ван ден Бранд М.А., Весселс Х.Дж., Виллемс П.Х., Венселаар Х., Шааг А., Баргути Ф., Рейш О., Шохат М., Хюйнен М.А., Смейтинк Дж.А., ван ден Хеувел Л.П., Нейтманс Л.Г. (июнь 2009 г.). «Мутации в NDUFAF3 (C3ORF60), кодирующем белок сборки комплекса I, взаимодействующий с NDUFAF4 (C6ORF66), вызывают фатальные неонатальные митохондриальные заболевания». Американский журнал генетики человека . 84 (6): 718–27 . doi :10.1016/j.ajhg.2009.04.020. ПМК 2694978 . ПМИД  19463981. 
  10. ^ abcd Бартлинг Ф., Санчес-Кабальеро Л., Тимал С., ван ден Бранд М.А., Нгу Л.Х., Дистельмайер Ф., Роденбург Р.Дж., Нийтманс Л.Г. (март 2017 г.). «Мутации в факторе сборки митохондриального комплекса I NDUFAF3 вызывают синдром Лея». Молекулярная генетика и обмен веществ . 120 (3): 243–246 . doi :10.1016/j.ymgme.2016.12.005. ПМИД  27986404.
  11. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043–53 . doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID  23965338 . 
  12. ^ Яо, Дэниел. «База знаний атласа белков сердечной органеллы (COPaKB) —— Информация о белках». amino.heartproteome.org . Получено 25.07.2018 .
  13. ^ Ссылка, Genetics Home. "Ген NDUFAF1". Genetics Home Reference . Получено 25.07.2018 .
  14. ^ "ndufaf3-ndufaf4". IntAct . EMBL-EBI.
  15. ^ "ndufaf3-snrpa-1". IntAct . EMBL-EBI.

Дальнейшее чтение

  • Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Lehner B, Sanderson CM (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Research . 14 (7): 1315– 23. doi :10.1101/gr.2122004. PMC  442147. PMID  15231747 .
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287– 92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NDUFAF3&oldid=1142698196"