НДУФАФ1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
НДУФАФ1
Идентификаторы
ПсевдонимыNDUFAF1 , CGI65, CIA30, CGI-65, фактор сборки комплекса НАДН:убихиноноксидоредуктазы 1, MC1DN11
Внешние идентификаторыОМИМ : 606934; МГИ : 1916952; гомологен : 32289; GeneCards : NDUFAF1; OMA :NDUFAF1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_016013

NM_027175
NM_001356467

RefSeq (белок)

NP_057097

Местоположение (UCSC)Хр 15: 41.39 – 41.41 МбХр 2: 119.49 – 119.49 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Комплекс I промежуточно-ассоциированный белок 30, митохондриальный (CIA30) или фактор сборки 1 подкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 альфа (NDUFAF1) — это белок , который у людей кодируется геном NDUFAF1 или CIA30 . [5] [6] [7] [8] [9] Ген NDUFAF1 кодирует человеческий гомолог белка Neurospora crassa , участвующего в сборке комплекса I. [7] Белок NDUFAF1 является фактором сборки НАДН-дегидрогеназы (убихинон) , также известной как комплекс I, которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . [10] Варианты гена NDUFAF1 связаны с гипертрофической кардиомиопатией , лейкодистрофией и кардиоэнцефаломиопатией. [11] [12] [13]

Структура

NDUFAF1 расположен на плече q хромосомы 15 в позиции 15.1. [7] Ген NDUFAF1 производит белок массой 37,8 кДа, состоящий из 327 аминокислот. [14] [15] NDUFAF1 связан с комплексами массой 600 и 700 кДа. [8] Комплекс I структурирован в виде двойной L-образной конфигурации, которая состоит из периферического матричного плеча, состоящего из флавопротеинов и железо-серных белков, участвующих в переносе электронов, и мембранного плеча, состоящего из кодируемых мтДНК субъединиц, участвующих в восстановлении убихинона и перекачке протонов. [13] Было показано, что NDUFAF1 взаимодействует с промежуточными продуктами сборки и может играть роль в правильной сборке и объединении периферического плеча с полным мембранным плечом, а также в стабилизации и создании каркаса этих промежуточных продуктов посредством этих тесных взаимодействий. [8]

Функция

NDUFAF1 — это фактор сборки, который важен для правильной сборки NADH-дегидрогеназы (убихинон) . Он обеспечивает правильное сочетание сложных промежуточных продуктов и необходим для правильного функционирования NADH-дегидрогеназы (убихинон). В частности, NDUFAF1 связывается с большим промежуточным продуктом мембранного плеча и участвует в объединении малых и больших промежуточных продуктов мембранного плеча комплекса I. Также было высказано предположение, что NDUFAF1 участвует в стабилизации и создании каркаса промежуточных продуктов сборки и что эта роль может быть более значимой, чем его роль в промежуточном объединении. [8]

Клиническое значение

Мутации в NDUFAF1 могут приводить к митохондриальным дефицитам и связанным с ними расстройствам. Нарушение митохондриальной дыхательной цепи может вызывать широкий спектр клинических проявлений от летального неонатального заболевания до нейродегенеративных расстройств у взрослых . Фенотипы включают макроцефалию с прогрессирующей лейкодистрофией , неспецифическую энцефалопатию , кардиомиопатию , миопатию , заболевание печени , синдром Лея , наследственную оптическую нейропатию Лебера и некоторые формы болезни Паркинсона . [16]

У пациента с миссенс-мутациями в NDUFAF1 была диагностирована фатальная детская гипертрофическая кардиомиопатия . В этом случае разборка комплекса I привела к митохондриальной кардиомиопатии с выраженным лактатацидозом . [11] У другого пациента, ребенка с гетерозиготной мутацией (c.278A > G; c.247G > A) в экзоне 2 гена NDUFAF1, была диагностирована лейкодистрофия, связанная с дефицитом митохондриального комплекса I. Признаки и симптомы включали регресс умственного и двигательного развития, поражения белого вещества , периферическую невропатию с высоким мышечным напряжением и гиперрефлексией конечностей, а также высокие уровни лактата и креатинкиназы . Родители оказались гетерозиготными носителями мутации. [12] У третьего пациента была обнаружена мутация в обоих аллелях гена NDUFAF1, и ему был поставлен диагноз кардиоэнцефаломиопатии и сниженного уровня и активности комплекса I. [13]

Взаимодействия

Помимо ко-комплексов, NDUFAF1 имеет белок-белковые взаимодействия с PNLIPRP1, [17] TMEM97, [18] TMEM86B, [19] YIPF6 , [20] SLC30A2, [21] ATIC, [22] и MAGEA11 . [23]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137806 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027305 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Janssen R, Smeitink J, Smeets R, van Den Heuvel L (март 2002 г.). «CIA30 complex I assembly factor: a candidate for human complex I lack?». Генетика человека . 110 (3): 264–70 . doi :10.1007/s00439-001-0673-3. PMID  11935339. S2CID  19502660.
  6. ^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (май 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно сохраненных в Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Research . 10 (5): 703– 13. doi :10.1101/gr.10.5.703. PMC 310876. PMID  10810093. 
  7. ^ abc "Ген Entrez: субкомплекс NDUFAF1 NADH-дегидрогеназы (убихинон) 1 альфа, фактор сборки 1".
  8. ^ abcd Vogel RO, Janssen RJ, Ugalde C, Grovenstein M, Huijbens RJ, Visch HJ, van den Heuvel LP, Willems PH, Zeviani M, Smeitink JA, Nijtmans LG (октябрь 2005 г.). «Сборка митохондриального комплекса I человека опосредована NDUFAF1». Журнал ФЭБС . 272 (20): 5317– 26. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04928.x . PMID  16218961. S2CID  29896047.
  9. ^ "NDUFAF1 - Комплекс I промежуточно-ассоциированный белок 30, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок NDUFAF1". www.uniprot.org . Получено 23.07.2018 .
  10. ^ Дональд, Воет (2013). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне . Воет, Джудит Г., Пратт, Шарлотта У. (Четвертое изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Wiley. ISBN 9780470547847. OCLC  738349533.
  11. ^ ab Fassone E, Taanman JW, Hargreaves IP, Sebire NJ, Cleary MA, Burch M, Rahman S (октябрь 2011 г.). «Мутации в факторе сборки митохондриального комплекса I NDUFAF1 вызывают фатальную детскую гипертрофическую кардиомиопатию». Журнал медицинской генетики . 48 (10): 691– 7. doi :10.1136/jmedgenet-2011-100340. PMID  21931170. S2CID  35411085.
  12. ^ ab Wu L, Peng J, Ma Y, He F, Deng X, Wang G, Lifen Y, Yin F (2016). «Лейкодистрофия, связанная с дефицитом митохондриального комплекса I из-за новой мутации в гене NDUFAF1». Митохондриальная ДНК Часть A. 27 ( 2): 1034– 7. doi : 10.3109/19401736.2014.926543. PMID  24963768. S2CID  207677530.
  13. ^ abc Dunning CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A, Fletcher JM, Kirby DM, Thorburn DR, Ryan MT (июль 2007 г.). «Человеческий CIA30 участвует в ранней сборке митохондриального комплекса I, а мутации в его гене вызывают заболевание». The EMBO Journal . 26 (13): 3227– 37. doi :10.1038/sj.emboj.7601748. PMC 1914096 . PMID  17557076. 
  14. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043–53 . doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID  23965338 . 
  15. ^ Яо, Дэниел. «База знаний атласа белков сердечной органеллы (COPaKB) —— Информация о белках». amino.heartproteome.org . Архивировано из оригинала 2018-07-23 . Получено 2018-07-23 .
  16. ^ "Дефицит митохондриального комплекса I". www.uniprot.org . Получено 2018-07-23 .
  17. ^ "pnliprp1-ndufaf1-1". IntAct . Получено 2018-07-23 .
  18. ^ "tmem97-ndufaf1-1". IntAct . Получено 2018-07-23 .
  19. ^ "tmem86b-ndufaf1-1". IntAct . Получено 2018-07-23 .
  20. ^ "yipf6-ndufaf1-1". IntAct . Получено 2018-07-23 .
  21. ^ "slc30a2-ndufaf1-1". IntAct . Получено 2018-07-23 .
  22. ^ "atic-ndufaf1". IntAct . Получено 2018-07-23 .
  23. ^ "magea11-ndufaf1". IntAct . Получено 2018-07-23 .

Дальнейшее чтение

  • Küffner R, Rohr A, Schmiede A, Krüll C, Schulte U (октябрь 1998 г.). «Участие двух новых шаперонов в сборке митохондриальной NADH:убихинон оксидоредуктазы (комплекс I)». Журнал молекулярной биологии . 283 (2): 409– 17. doi :10.1006/jmbi.1998.2114. PMID  9769214.
  • Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Фогель Р.О., Янссен Р.Дж., ван ден Бранд М.А., Дитерен К.Э., Веркаарт С., Купман В.Дж., Виллемс П.Х., Плук В., ван ден Хеувел Л.П., Смейтинк Дж.А., Нейтманс Л.Г. (март 2007 г.). «Цитозольный сигнальный белок Ecsit также локализуется в митохондриях, где он взаимодействует с шапероном NDUFAF1 и участвует в сборке комплекса I». Гены и развитие . 21 (5): 615–24 . doi :10.1101/gad.408407. ПМК  1820902 . ПМИД  17344420.
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC  1847948. PMID  17353931. S2CID  670227 .
  • Фогель Р.О., ван ден Бранд М.А., Роденбург Р.Дж., ван ден Хеувел Л.П., Цунеока М., Смейтинк Дж.А., Нейтманс Л.Г. (июнь 2007 г.). «Исследование шаперонов сборки комплекса I B17.2L и NDUFAF1 в группе пациентов с дефицитом CI». Молекулярная генетика и обмен веществ . 91 (2): 176–82 . doi :10.1016/j.ymgme.2007.02.007. ПМИД  17383918.
  • Dunning CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A, Fletcher JM, Kirby DM, Thorburn DR, Ryan MT (июль 2007 г.). «Человеческий CIA30 участвует в ранней сборке митохондриального комплекса I, а мутации в его гене вызывают заболевание». The EMBO Journal . 26 (13): 3227– 37. doi :10.1038/sj.emboj.7601748. PMC  1914096 . PMID  17557076.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NDUFAF1&oldid=1212955362"