Молликуты
Класс бактерий

Молликуты
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Микоплазматота
Сорт:Молликуты
Эдвард и Фрейндт 1967 [1]
Заказы

Acholeplasmatales
Anaeroplasmatales
Entomoplasmatales
Haloplasmatales
Mycoplasmatales

Синонимы
  • Куликоидибактерии Neupane et al. 2020 год
  • Erysipelotrichia Людвиг, Шлейфер и Уитмен, 2010 г.
  • "Erysipelotrichidae" исправлено Cavalier-Smith 2020
  • «Иземаплазма» (так в оригинале) Скеннертон и др. 2016 год
  • «Парамицеты» Сабин 1941

Mollicutes — это класс бактерий [2], отличающийся отсутствием клеточной стенки . Слово «Mollicutes» происходит от латинского mollis (что означает «мягкий» или «гибкий») и cutis (что означает «кожа»). Особи очень малы, обычно всего 0,2–0,3 мкм (200–300 нм ) в размере и имеют очень маленький размер генома . Они различаются по форме, хотя у большинства есть стерины , которые делают клеточную мембрану несколько более жесткой. Многие способны перемещаться посредством скольжения , но члены рода Spiroplasma являются спиралевидными и движутся путем скручивания. Самый известный род в Mollicutes — Mycoplasma . Колонии имеют типичный вид «жареного яйца».

Молликуты — паразиты различных животных и растений, живущие на клетках хозяина или в них. Многие из них вызывают заболевания у людей, прикрепляясь к клеткам дыхательных или мочеполовых путей, в частности виды Mycoplasma и Ureaplasma . Фитоплазма и спироплазма — это патогены растений, связанные с переносчиками-насекомыми.

Если раньше тривиальное название «микоплазма» (во множественном числе: «микоплазмы») обычно обозначало любого представителя класса Mollicutes, то теперь в научной классификации оно относится исключительно к представителю рода Mycoplasma .

Происхождение и развитие паразитического образа жизни

Анализ геномов Mollicutes («микоплазм») дает веские основания для гипотезы о том, что Mollicutes произошли от грамположительных бактерий в процессе редуктивной эволюции. Приняв паразитический образ жизни с использованием питательных веществ от своих хозяев, многие Mollicutes смогли значительно сократить свой генетический материал. С другой стороны, они утратили гены для многих ассимиляционных процессов. Таким образом, Mycoplasma , возможно, стала самым маленьким самовоспроизводящимся организмом в природе. Mycoplasma genitalium , с 580 000 пар оснований, имеет особенно маленький размер генома. Некоторые фитоплазмы также имеют очень маленький размер генома. Роды с самым маленьким геномом считаются филогенетически самыми «последними» mollicutes.

Для поддержания паразитического образа жизни молликуты выработали довольно сложные механизмы колонизации своих хозяев и сопротивления их иммунной системе. [3]

Распространение

Молликуты (ранее также называемые плевропневмония-подобными организмами, PPLO), а также бактерии L-формы (ранее также называемые бактериями L-фазы), оба не имеющие клеточных стенок, размножаются не бинарным делением, а почкованием. В 1954 году этот способ пролиферации был продемонстрирован постоянными наблюдениями за живыми клетками с использованием фазово-контрастной микроскопии. [4]

Раньше молликуты иногда считались стабильными бактериями L-формы, но филогенетический анализ определил их как бактерии, утратившие свои клеточные стенки в ходе эволюции. [5]

История классификации

Классификация Mollicutes всегда была сложной. Особи крошечные, и, будучи паразитами, их нужно культивировать на специальных средах. До сих пор многие виды вообще не могли быть выделены. Вначале было неясно, были ли они грибками, вирусами или бактериями. Кроме того, сходство с L-формами сбивало с толку. Сначала все члены класса Mollicutes обычно назывались «микоплазмами» или плевропневмониевыми организмами (PPLO). Mollicutes, за исключением некоторых членов рода Mycoplasma, все еще были не идентифицированы. Первым видом Mycoplasma / Mollicutes, который удалось выделить, была Mycoplasma mycoides . Эта бактерия была выращена Нокаром и Ру в 1898 году. [6]

В 1956 году Д. Г. Эдвард и Э. А. Фрейндт сделали первое предложение по классификации и наименованию PPLO. Однако они не решили, относятся ли они к бактериям ( прокариотам , в 1956 году названным «шизомицетами») или к эукариотам . В качестве типового вида (вида, дающего название) PPLO/микоплазм Эдвард и Фрейндт предложили Mycoplasma mycoides , являющийся возбудителем плевропневмонии крупного рогатого скота и относящийся к организмам, подобным плевропневмонии. До этого Mycoplasma mycoides была известна как Asterococcus mycoides , но позже это название не было признано действительным. В своей публикации 1956 года они описали 15 видов Mycoplasma . [7] В 1967 году класс Mollicutes, содержащий порядок Mycoplasmatales , был предложен Подкомитетом по таксономии Mycoplasmata. [1] Теперь название Mycoplasma должно использоваться исключительно для членов рода Mycoplasma , а не как тривиальное название для любого Mollicute. Поскольку тривиальное название использовалось в литературе в течение длительного времени, это все еще не всегда так.

Три отдела бактерий

Традиционно таксономия бактерий основывалась на сходстве и различии в морфологии (таксономия Линнея).

В 1962 году Р. Г. Э. Мюррей предложил разделить «царство» (теперь домен [8] ) бактерий на три отдела (=филума) на основе типов клеточной стенки:

  1. Грамотрицательные Gracilicutes , с тонкой клеточной стенкой и небольшим количеством пептидогликана ;
  2. Грамположительные Firmicutes , с более толстой клеточной стенкой и большим количеством пептидогликана (название позже было изменено на «Firmicutes » ), и
  3. «Молликуты», без клеточной стенки. [9]

Филогения

Филогенетическое положение Mollicutes среди бактерий с использованием последовательностей 16S рРНК. [10]

Для классификации и номенклатуры молликут существуют специальные правила, которые поддерживаются Подкомитетом по таксономии молликут Международного комитета по систематике прокариот (ICSP) (ранее Подкомитетом по таксономии микоплазменных бактерий Международного комитета по систематической бактериологии (ICSB) ). [11]

Традиционно таксономия Mollicutes основывалась на серологических и фенотипических характеристиках . Однако большинство современных классификаций основаны на последовательностях ДНК или РНК, особенно последовательностях 16S рРНК [5] (см. рисунок).

Тип для Mollicutes

Результаты филогенетического анализа Mollicutes были спорными. Некоторые таксономисты помещают их в Bacillota, другие в Mycoplasmatota. Woese et al. предположили, что Mollicutes могли произойти от разных ветвей бактерий. Они пришли к выводу, что Mollicutes не являются филогенетически связанной группой и, следовательно, не образуют отдельный таксон более высокого уровня. Вместо этого они группируются внутри грамположительных бактерий типа Bacillota. [5] Результаты молекулярно-филогенетического анализа частично зависели от выбранного молекулярного маркера, такого как рРНК , фактор элонгации или другой белок. [12] Филогенетические деревья, основанные на аминокислотных последовательностях фосфоглицераткиназы (Pgk), указали на монофилетическое происхождение Mollicutes внутри Bacillota. [13]

Раннее издание Руководства по систематической бактериологии Берджи поместило класс Mollicutes в тип Bacillota , [14] [15] тогда как в анонсированном 2-м издании они перемещены в отдельный тип Tenericutes (позже переименованный в Mycoplasmatota ). [16] [17] [18] Изменение мотивировано «их уникальными фенотипическими свойствами, в частности, отсутствием жестких клеточных стенок и общей низкой поддержкой альтернативными маркерами». [12] В Таксономическом очерке бактерий и архей (TOBA Release 7.7), март 2007 г., Mollicutes являются классом в типе Bacillota. [19]

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [20] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [21].

LTP на основе 16S рРНК _08_2023 [22] [23] [24]120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [25] [26] [27]
Бациллы

другой

"Lottiidibacillaceae"

Лоттидибациллы

Culicoidibacteraceae

Куликоидибактерии

другой

Бациллы

другой

«Стафилококки»

"Erysipelotrichidae"
Culicoidibacterales
Culicoidibacteraceae

Куликоидибактерии

«Батиоплазмалес»
"Bathyoplasmaceae"

" Ca. Bathoplasma" [MAG-NZ]

"Иземоплазменные"

"Hujiaoplasmataceae"

"Иземоплазматовые"

Ахолеплазменные  ♦
/ Анаэроплазменные )
"Афодоколес"

"Афодоколевые" [RF39]

РФН20

"Каккосоматовые"

"Энтеросоматовые"

"Энтеромонадовые"

Рожисто-триховые
Микоплазменные  ♦

Видовая группа Spiroplasma 3 {VBWQ01}

Mycoplasmataceae (включая Entomoplasmataceae и Spiroplasmataceae )

" Ca. Spiroplasma holothuricola" {MT37}

Микоплазмоидные

" Ca. Hepatoplasma" {"Hepatoplasmataceae"}

Метамикоплазменные

Энтомоплазменные )

Лактобациллы

♦ Парафилетические молликуты

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Edward, DG; FA Freundt (июль 1967 г.). «Предложение о Mollicutes как названии класса, установленного для порядка Mycoplasmatales». Int J Syst Bacteriol . 17 (3): 267– 268. doi : 10.1099/00207713-17-3-267 .
  2. ^ [1] "Mollicutes", из Encyclopædia Britannica Online. Получено 15 октября 2011 г.
  3. ^ Шмуэль Разин, Дэвид Йогев и Иегудит Наот Молекулярная биология и патогенность микоплазм. Микрон. и Молек. Biology Reviews, декабрь 1998 г. , стр. 1094–1156, Vol. 62, № 4
  4. ^ Кандлер, Гертрауд; Кандлер, Отто (1954). «Untersuchungen über die Morphologie und die Vermehrung der pleuropneumonia-ähnlichen Organismen und der L-Phase der Bacterien. I. Lichtmikroskopische Untersuchungen» [Исследования по морфологии и размножению плевропневмоноподобных организмов и бактериальной L-фазе, I. Световая микроскопия (сейчас микоплазмы и Бактерии L-формы)] (PDF) . Archiv für Mikrobiologie (на немецком языке). 21 (2). (Доступна статья на английском языке): 178–201 . doi : 10.1007/BF01816378. PMID  14350641. S2CID  21257985.
  5. ^ abc CR Woese, J. Maniloff и LB Zablen Филогенетический анализ микоплазм Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol. 77, No. 1, стр. 494–498, январь 1980 г.
  6. ^ Хейфлик Л. и Чанок, Р. М. (1965). «Mycoplasma Species of Man» (PDF) . Бактериологические обзоры . 29 (2): 185–221 . doi : 10.1128/MMBR.29.2.185-221.1965 . PMC 441270. PMID  14304038 . 
  7. ^ Эдвард ДГ, Фрейндт EA (февраль 1956). «Классификация и номенклатура организмов группы плевропневмонии». J. Gen. Microbiol . 14 (1): 197–207 . doi : 10.1099/00221287-14-1-197 . PMID  13306904.pdf-файл [2]
  8. ^ Woese, Carl R. ; Kandler, Otto ; Wheelis, Mark L. (1990). «К естественной системе организмов: предложение для доменов Archaea, Bacteria и Eucarya». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576– 9. Bibcode :1990PNAS...87.4576W. doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . PMC 54159 . PMID  2112744. 
  9. ^ Предложения NE Gibbons и RGE Murray относительно высших таксонов бактерий [ постоянная неработающая ссылка ‍ ] Int J Syst Bacteriol Vol. 28 (1) январь 1978 г., стр. 1–6.
  10. ^ Осима, К; Маэдзима, К; Намба, С (2013). «Геномные и эволюционные аспекты фитоплазм». Frontiers in Microbiology . 4 : 230. doi : 10.3389/fmicb.2013.00230 . PMC 3743221. PMID  23966988 . 
  11. ^ Пересмотренные минимальные стандарты для описания новых видов класса Mollicutes (отдел Tenericutes) Архивировано 10 июля 2010 г. на Wayback Machine PDF [3] [ постоянная нерабочая ссылка ‍ ] ; Daniel R. Brown, Robert F. Whitcomb и Janet M. Bradbury (2007) Int J Syst Evol Microbiol 57 2703–2719; doi :10.1099/ijs.0.64722-0
  12. ^ ab Людвиг, В. и Шлейфер, К. Х. Молекулярная филогения бактерий на основе сравнительного анализа последовательностей консервативных генов Микробная филогения и эволюция, 2005, стр. 70–98.
  13. ^ Вольф, Маттиас; Мюллер, Т; Дандекар, Т; Поллак, Дж. Д.; и др. (2004). «Филогения Firmicutes с особым упором на Mycoplasma (Mollicutes), выведенная из данных по аминокислотной последовательности фосфоглицераткиназы». Int J Syst Evol Microbiol . 54 (Pt 3): 871– 875. doi : 10.1099/ijs.0.02868-0 . PMID  15143038.DOI 10.1099/ijs.0.02868-0
  14. ^ Таксономический очерк прокариот. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Архивировано 29 декабря 2009 г. в Wayback Machine Garrity, Bell & Lilburn; Второе издание, выпуск 5.0 (2004); стр. 140–204. doi :10.1007/bergeysoutline200405.
  15. ^ К. Йоханссон и Б. Петтерссон, Таксономия Mollicutes books.google.com (2002)
  16. ^ "Tenericutes". Обозреватель таксономии . NCBI . Получено 11 сентября 2008 г.
  17. ^ Вольфганг Людвиг, Карл-Хайнц Шлейфер и Уильям Б. Уитмен (В печати, выпуск в 2009 г. ). "Пересмотренная дорожная карта к типу Firmicutes". В P. De Vos et al. (ред.) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology , 2-е изд., т. 3 (The Firmicutes). Springer-Verlag, Нью-Йорк. ISBN 0-387-95041-9 ; PDF Архивировано 21 сентября 2010 г. на Wayback Machine 
  18. ^ Проверка публикации новых названий и новых комбинаций ... Int. J. Syst. Bacteriol.; июль 1984 г., стр. 355–357
  19. ^ Garrity, et al. Таксономический очерк бактерий и архей Архивировано 2013-05-02 в Wayback Machine (TOBA Release 7.7); Март 2007. "Таксономический очерк бактерий и архей" (PDF) . Таксономический очерк бактерий и архей . Архивировано из оригинала (PDF) 2011-10-07 . Получено 2009-08-13 .
  20. ^ JP Euzéby. "Erysipelotrichia". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 21 октября 2016 г.
  21. ^ Sayers; et al. "Erysipelotrichia". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 20.03.2013 .
  22. ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  23. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  24. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
  25. ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  26. ^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  27. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

Mollicutes в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mollicutes&oldid=1259972695"