МБД3
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
МБД3
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMBD3 , белок 3 домена связывания метил-CpG
Внешние идентификаторыОМИМ : 603573; МГИ : 1333812; гомологен : 2917; Генные карты : MBD3; OMA :MBD3 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

53615

17192

Ансамбль

ENSG00000071655

ENSMUSG00000035478

UniProt

О95983

Q9Z2D8

РефСек (мРНК)

НМ_003926
НМ_001281453
НМ_001281454

NM_013595
NM_001306143

RefSeq (белок)

NP_001268382
NP_001268383

NP_001293072
NP_038623

Местоположение (UCSC)Хр 19: 1,57 – 1,59 МбХр 10: 80,23 – 80,24 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 3 домена связывания метил-CpG — это белок , который у людей кодируется геном MBD3 . [ 5] [6] [7]

Функция

Метилирование ДНК является основной модификацией эукариотических геномов и играет важную роль в развитии млекопитающих. Человеческие белки MECP2 , MBD1 , MBD2 , MBD3 и MBD4 составляют семейство ядерных белков, связанных наличием в каждом из них домена связывания метил-CpG (MBD). Однако, в отличие от других членов семейства, MBD3 не способен связываться с метилированной ДНК, а вместо этого связывается с гидроксиметилированной ДНК . [8] Предсказанный белок MBD3 на 71% и 94% идентичен MBD2 (изоформа 1) и мышиному Mbd3. MBD3 является субъединицей NuRD , многосубъединичного комплекса, содержащего активность ремоделирования нуклеосом и гистондеацетилазы. MBD3 опосредует связь метастаз-ассоциированного белка 2 (MTA2) с основным комплексом гистондеацетилазы. [7]

MBD3 также содержит домен спиральной спирали, общий для всех трех изоформ MBD3. [9]

Взаимодействия

Было показано, что MBD3 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000071655 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000035478 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Хендрих Б., Бёрд А. (ноябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика семейства млекопитающих метил-CpG-связывающих белков». Молекулярная и клеточная биология . 18 (11): 6538– 47. doi :10.1128/mcb.18.11.6538. PMC 109239. PMID  9774669 . 
  6. ^ Хендрих Б., Эбботт К., Маккуин Х., Чемберс Д., Кросс С., Берд А. (сентябрь 1999 г.). «Геномная структура и хромосомное картирование генов Mbd1, Mbd2, Mbd3 и Mbd4 у мышей и человека». Геном млекопитающих . 10 (9): 906– 12. doi :10.1007/s003359901112. PMID  10441743. S2CID  819148.
  7. ^ ab "Ген Entrez: белок 3 домена связывания метил-CpG MBD3".
  8. ^ Yildirim O, Li R, Hung JH, Chen PB, Dong X, Ee LS, Weng Z, Rando OJ, Fazzio TG (декабрь 2011 г.). «Комплекс Mbd3/NURD регулирует экспрессию генов, маркированных 5-гидроксиметилцитозином, в эмбриональных стволовых клетках». Cell . 147 (7): 1498– 510. doi :10.1016/j.cell.2011.11.054. PMC 3252821 . PMID  22196727. 
  9. ^ Hirasaki M, Ueda A, Asaka MN, Uranishi K, Suzuki A, Kohda M, Mizuno Y, Okazaki Y, Nishimoto M, Sharif J, Koseki H, Okuda A (май 2018 г.). «Идентификация домена Coiled-Coil как важного элемента Mbd3 для сохранения потенциала приверженности линии эмбриональных стволовых клеток». Stem Cells . 36 (9): 1355– 1367. doi : 10.1002/stem.2849 . PMID  29761578.
  10. ^ abc Sakai H, Urano T, Ookata K, Kim MH, Hirai Y, Saito M, Nojima Y, Ishikawa F (декабрь 2002 г.). «MBD3 и HDAC1, два компонента комплекса NuRD, локализуются в Aurora-A-положительных центросомах в M-фазе». Журнал биологической химии . 277 (50): 48714– 23. doi : 10.1074/jbc.M208461200 . PMID  12354758.
  11. ^ Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (октябрь 2002 г.). «Два высокородственных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3». Журнал биологической химии . 277 (43): 40958– 66. doi : 10.1074/jbc.M207467200 . PMID  12183469.
  12. ^ Feng Q, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (январь 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66/p68 комплекса MeCP1». Молекулярная и клеточная биология . 22 (2): 536– 46. doi : 10.1128 /MCB.22.2.536-546.2002. PMC 139742. PMID  11756549. 
  13. ^ abc Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (август 1999). «Анализ субъединиц NuRD выявляет комплекс ядра гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Genes & Development . 13 (15): 1924– 35. doi :10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920 . PMID  10444591. 
  14. ^ ab Saito M, Ishikawa F (сентябрь 2002 г.). «Домен связывания mCpG человеческого MBD3 не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD/Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии . 277 (38): 35434– 9. doi : 10.1074/jbc.M203455200 . PMID  12124384.
  15. ^ Jiang CL, Jin SG, Pfeifer GP (декабрь 2004 г.). «MBD3L1 — это транскрипционный репрессор, который взаимодействует с метил-CpG-связывающим белком 2 (MBD2) и компонентами комплекса NuRD». Журнал биологической химии . 279 (50): 52456– 64. doi : 10.1074/jbc.M409149200 . PMID  15456747.

Дальнейшее чтение

  • Shen L, Zhang Y (июнь 2013 г.). «5-Гидроксиметилцитозин: генерация, судьба и геномное распределение». Current Opinion in Cell Biology . 25 (3): 289– 96. doi :10.1016/j.ceb.2013.02.017. PMC  4060438. PMID  23498661.
  • Abbott WM, Mellor A, Edwards Y, Feizi T (апрель 1989 г.). «Растворимый бычий галактозосвязывающий лектин. Клонирование кДНК раскрывает полную аминокислотную последовательность и антигенную связь с главным энцефалитогенным доменом основного белка миелина». The Biochemical Journal . 259 (1): 283– 90. doi :10.1042/bj2590283. PMC  1138502 . PMID  2470348.
  • Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (октябрь 1998 г.). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего гистондеацетилазу и активность ремоделирования нуклеосом». Cell . 95 (2): 279– 89. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID  9790534. S2CID  18786866.
  • Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина комплексом ремоделирования АТФ-зависимых нуклеосом». Nature . 395 (6705): 917– 21. Bibcode :1998Natur.395..917T. doi :10.1038/27699. PMID  9804427. S2CID  4355885.
  • Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (август 1999). «Анализ субъединиц NuRD выявляет комплекс ядра гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Genes & Development . 13 (15): 1924– 35. doi :10.1101/gad.13.15.1924. PMC  316920 . PMID  10444591.
  • Wade PA, Gegonne A, Jones PL, Ballestar E, Aubry F, Wolffe AP (сентябрь 1999 г.). «Комплекс Mi-2 связывает метилирование ДНК с ремоделированием хроматина и деацетилированием гистонов». Nature Genetics . 23 (1): 62– 6. doi :10.1038/12664. PMID  10471500. S2CID  52868103.
  • Tatematsu KI, Yamazaki T, Ishikawa F (август 2000 г.). «Комплекс MBD2-MBD3 связывается с полуметилированной ДНК и образует комплекс, содержащий DNMT1 в фокусах репликации в поздней S-фазе». Genes to Cells . 5 (8): 677–88 . doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x . PMID  10947852. S2CID  25185979.
  • Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (март 2001 г.). "Стабильные комплексы гистондеацетилазы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST/kiaa0071 и Mta-L1". Журнал биологической химии . 276 (9): 6817– 24. doi : 10.1074/jbc.M007372200 . PMID  11102443.
  • Shi Y, Downes M, Xie W, Kao HY, Ordentlich P, Tsai CC, Hon M, Evans RM (май 2001 г.). «Sharp, индуцируемый кофактор, который объединяет репрессию и активацию ядерного рецептора». Genes & Development . 15 (9): 1140– 51. doi :10.1101/gad.871201. PMC  312688 . PMID  11331609.
  • Feng Q, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (январь 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66/p68 комплекса MeCP1». Молекулярная и клеточная биология . 22 (2): 536– 46. doi : 10.1128 /MCB.22.2.536-546.2002. PMC  139742. PMID  11756549.
  • Schlegel J, Güneysu S, Mennel HD (2002). «Экспрессия генов белков домена связывания метила в глиомах человека». Oncology Reports . 9 (2): 393– 5. doi :10.3892/or.9.2.393. PMID  11836615.
  • Saito M, Ishikawa F (сентябрь 2002 г.). «Домен связывания mCpG человеческого MBD3 не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD/Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии . 277 (38): 35434– 9. doi : 10.1074/jbc.M203455200 . PMID  12124384.
  • Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (октябрь 2002 г.). «Два высокородственных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3». Журнал биологической химии . 277 (43): 40958– 66. doi : 10.1074/jbc.M207467200 . PMID  12183469.
  • Sakai H, Urano T, Ookata K, Kim MH, Hirai Y, Saito M, Nojima Y, Ishikawa F (декабрь 2002 г.). "MBD3 и HDAC1, два компонента комплекса NuRD, локализуются в Aurora-A-положительных центросомах в M-фазе". Журнал биологической химии . 277 (50): 48714– 23. doi : 10.1074/jbc.M208461200 . PMID  12354758.
  • Fujita N, Jaye DL, Kajita M, Geigerman C, Moreno CS, Wade PA (апрель 2003 г.). "MTA3, субъединица комплекса Mi-2/NuRD, регулирует инвазивный путь роста при раке груди". Cell . 113 (2): 207– 19. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00234-4 . PMID  12705869. S2CID  5773916.
  • Fujita N, Jaye DL, Geigerman C, Akyildiz A, Mooney MR, Boss JM, Wade PA (октябрь 2004 г.). «MTA3 и комплекс Mi-2/NuRD регулируют судьбу клеток во время дифференциации В-лимфоцитов». Cell . 119 (1): 75– 86. doi : 10.1016/j.cell.2004.09.014 . PMID  15454082. S2CID  17391732.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=MBD3&oldid=1224751444"