MAP1LC3A
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
MAP1LC3A
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMAP1LC3A , ATG8E, LC3, LC3A, MAP1ALC3, MAP1BLC3, белок, ассоциированный с микротрубочками 1, легкая цепь 3 альфа
Внешние идентификаторыОМИМ : 601242; МГИ : 1915661; гомологен : 12021; GeneCards : MAP1LC3A; OMA :MAP1LC3A — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

84557

66734

Ансамбль

ENSG00000101460

ENSMUSG00000027602

UniProt

Q9H492

Q91VR7

РефСек (мРНК)

NM_032514
NM_181509

NM_025735

RefSeq (белок)

NP_115903
NP_852610

NP_080011

Местоположение (UCSC)Хр 20: 34.55 – 34.56 МбХр 2: 155.12 – 155.12 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белки 1A/1B, ассоциированные с микротрубочками, легкой цепи 3A — это белок , который у людей кодируется геном MAP1LC3A . [ 5] [6] [7] Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы.

Функция

MAP1A и MAP1B являются белками, ассоциированными с микротрубочками , которые опосредуют физические взаимодействия между микротрубочками и компонентами цитоскелета . MAP1A и MAP1B состоят из субъединицы тяжелой цепи и нескольких субъединиц легкой цепи. Белок, кодируемый этим геном, является одной из субъединиц легкой цепи и может ассоциироваться либо с MAP1A, либо с MAP1B. [7]

MAPLC3A является одним из гомологов млекопитающих дрожжевого ATG8 , важного маркера и эффектора аутофагии . [8]

Регулирование

MAP1LC3A регулируется несколькими посттрансляционными модификациями . К ним относятся ковалентное связывание C-конца с фосфатидилэтаноламином в аутофагических мембранах и фосфорилирование протеинкиназой A , [9] , что подавляет его функции аутофагии. Нековалентные взаимодействия важны для его функций нацеливания на груз при селективной аутофагии. Например, было показано, что он взаимодействует с секвестосомой 1. [ 10]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000101460 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027602 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Mann SS, Hammarback JA (май 1997). "Локализация гена и экспрессия легкой цепи 3 в процессе развития: общая субъединица белка 1A (MAP1A) и MAP1B, ассоциированного с микротрубочками". J Neurosci Res . 43 (5): 535–44. doi :10.1002/(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2-J. PMID  8833088. S2CID  23515321.
  6. ^ Pankiv S, Clausen TH, Lamark T, Brech A, Bruun JA, Outzen H, Overvatn A, Bjorkoy G, Johansen T (август 2007 г.). "p62/SQSTM1 напрямую связывается с Atg8/LC3, способствуя деградации убиквитинированных белковых агрегатов путем аутофагии". J Biol Chem . 282 (33): 24131–45. doi : 10.1074/jbc.M702824200 . PMID  17580304.
  7. ^ ab "Ген Entrez: MAP1LC3A микротрубочковый-ассоциированный белок 1 легкая цепь 3 альфа".
  8. ^ Валенте Г., Морани Ф., Никотра Г., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р., Алабисо О., Арисио Р., Кацарос Д., Бенедетто С., Исидоро С. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников». Биомед Рес Инт . 2014 : 462658. doi : 10.1155/2014/462658 . ПМК 4127242 . ПМИД  25136588. 
  9. ^ Черра С.Дж., Кулич С.М., Уечи Г., Баласубрамани М., Маунтцурис Дж., Дэй Б.В., Чу CT (август 2010 г.). «Регуляция белка аутофагии LC3 путем фосфорилирования». Дж. Клеточная Биол . 190 (4): 533–9. дои : 10.1083/jcb.201002108. ПМК 2928022 . ПМИД  20713600. 
  10. ^ Shvets E, Fass E, Scherz-Shouval R, Elazar Z (август 2008 г.). «N-конец и остаток Phe52 LC3 рекрутируют p62/SQSTM1 в аутофагосомы». J. Cell Sci . 121 (Pt 16): 2685–95. doi : 10.1242/jcs.026005 . PMID  18653543.

Дальнейшее чтение

  • Snásel J, Pichová I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Folia Biol. (Прага) . 42 (5): 227–30. doi :10.1007/BF02818986. PMID  8997639. S2CID  7617882.
  • Wallin M, Deinum J, Goobar L, Danielson UH (1990). «Протеолитическое расщепление белков, ассоциированных с микротрубочками, ретровирусными протеиназами». J. Gen. Virol . 71 (9): 1985–91. doi : 10.1099/0022-1317-71-9-1985 . PMID  2212989.
  • Schoenfeld TA, McKerracher L, Obar R, Vallee RB (1989). "MAP 1A и MAP 1B являются структурно связанными белками, ассоциированными с микротрубочками, с различными паттернами развития в ЦНС". J. Neurosci . 9 (5): 1712–30. doi : 10.1523/JNEUROSCI.09-05-01712.1989 . PMC  6569839 . PMID  2470876.
  • Mann SS, Hammarback JA (1994). "Молекулярная характеристика легкой цепи 3. Субъединица связывания микротрубочек MAP1A и MAP1B". J. Biol. Chem . 269 (15): 11492–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)78150-2 . PMID  7908909.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок ДНК человека». Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072. PMID  11230166 .
  • Bonnet C, Boucher D, Lazereg S и др. (2001). «Дифференциальная регуляция связывания белков MAP1A, MAP1B и MAP2, ассоциированных с микротрубочками, путем полиглутамилирования тубулина». J. Biol. Chem . 276 (16): 12839–48. doi : 10.1074/jbc.M011380200 . PMID  11278895.
  • Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 20». Nature . 414 (6866): 865–71. Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID  11780052.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • He H, Dang Y, Dai F и др. (2003). «Посттрансляционные модификации трех членов семейства человеческих MAP1LC3 и обнаружение нового типа модификации для MAP1LC3B». J. Biol. Chem . 278 (31): 29278–87. doi : 10.1074/jbc.M303800200 . PMID  12740394.
  • Tanida I, Sou YS, Ezaki J, et al. (2004). "HsAtg4B/HsApg4B/autophagin-1 расщепляет карбоксильные концы трех человеческих гомологов Atg8 и делипидизирует конъюгаты легкой цепи 3 белка, ассоциированного с микротрубочками, и белка-фосфолипида, ассоциированного с рецептором GABAA". J. Biol. Chem . 279 (35): 36268–76. doi : 10.1074/jbc.M401461200 . PMID  15187094.
  • Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I и др. (2005). "1H, 13C и 15N резонансные назначения легкой цепи-3 белка, ассоциированного с микротрубочками человека". J. Biomol. NMR . 29 (3): 415–6. doi :10.1023/B:JNMR.0000032505.99071.ea. PMID  15213446. S2CID  23561733.
  • Goehler H, Lalowski M, Stelzl U и др. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона». Mol. Cell . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID  15383276.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W и др. (2004). «От ORFeome к биологии: функциональный конвейер геномики». Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930. PMID  15489336 .
  • Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I и др. (2005). «Структура раствора легкой цепи 3 белка, ассоциированного с микротрубочками, и идентификация ее функциональных субдоменов». J. Biol. Chem . 280 (26): 24610–7. doi : 10.1074/jbc.M413565200 . PMID  15857831.
  • Sou YS, Tanida I, Komatsu M и др. (2006). «Фосфатидилсерин в дополнение к фосфатидилэтаноламину является in vitro мишенью модификаторов Atg8 млекопитающих, LC3, GABARAP и GATE-16». J. Biol. Chem . 281 (6): 3017–24. doi : 10.1074/jbc.M505888200 . PMID  16303767.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .


Значок заглушки

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Получено с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=MAP1LC3A&oldid=1114140743"