Актин-связывающий белок LIM 1 , также известный как ABLIM1 , представляет собой белок , который у людей кодируется геном ABLIM1 . [ 5] [6]
Функция
Этот ген кодирует цитоскелетный белок LIM, который связывается с актиновыми нитями через домен, гомологичный эритроцитарному дематину . Домены LIM , обнаруженные в более чем 60 белках, играют ключевую роль в регуляции путей развития. Домены LIM также функционируют как интерфейсы связывания белков, опосредуя специфические белок-белковые взаимодействия. Белок, кодируемый этим геном, может опосредовать такие взаимодействия между актиновыми нитями и цитоплазматическими мишенями. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [5]
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000099204 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000025085 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab "Ген Entrez: ABLIM1 актин-связывающий белок LIM 1".
^ Roof DJ, Hayes A, Adamian M, Chishti AH, Li T (август 1997 г.). «Молекулярная характеристика abLIM, нового актин-связывающего белка с двойным цинковым пальцем». Журнал клеточной биологии . 138 (3): 575–88 . doi :10.1083/jcb.138.3.575. PMC 2141644. PMID 9245787 .
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Внешние ссылки
Расположение генома человека ABLIM1 и страница с подробностями гена ABLIM1 в браузере геномов UCSC .
Дальнейшее чтение
Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». Исследования ДНК . 9 (3): 99–106 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954.
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и моделей экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3– 174. PMID 7566098.
Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Сато С., Секи Н., Каварабаяси Ю., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». Исследования ДНК . 1 (5): 223–9 . doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . ПМИД 7584044.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Roof DJ, Hayes A, Adamian M, Chishti AH, Li T (август 1997 г.). «Молекулярная характеристика abLIM, нового актин-связывающего белка с двойным цинковым пальцем». Журнал клеточной биологии . 138 (3): 575– 88. doi :10.1083/jcb.138.3.575. PMC 2141644. PMID 9245787 .
Kim AC, Peters LL, Knoll JH, Van Huffel C, Ciciotte SL, Kleyn PW, Chishti AH (декабрь 1997 г.). «Лиматин (LIMAB1), связывающий актин белок LIM, картируется на мышиной хромосоме 19 и человеческой хромосоме 10q25, регионе, часто удаляемом при раке человека». Genomics . 46 (2): 291– 3. doi :10.1006/geno.1997.5029. PMID 9417918.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и комплексы закрепления, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». Журнал биологической химии . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (май 2004 г.). «Надежное фосфопротеомное профилирование участков фосфорилирования тирозина из человеческих Т-клеток с использованием иммобилизованной металл-аффинной хроматографии и тандемной масс-спектрометрии». Аналитическая химия . 76 (10): 2763– 72. doi :10.1021/ac035352d. PMID 15144186.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (август 2004 г.). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Current Biology . 14 (16): 1436– 50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325.
Ficarro SB, Salomon AR, Brill LM, Mason DE, Stettler-Gill M, Brock A, Peters EC (2005). "Автоматизированная платформа для иммобилизованной металл-аффинной хроматографии/наножидкостной хроматографии/масс-спектрометрии с электрораспылительной ионизацией для профилирования участков фосфорилирования белков". Rapid Communications in Mass Spectrometry . 19 (1): 57– 71. Bibcode : 2005RCMS...19...57F. doi : 10.1002/rcm.1746. PMID 15570572.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (январь 2005 г.). "Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках". Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (июнь 2005 г.). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора p53, который обычно подавляется при раке». Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (6): 785–95 . doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID 15778465.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R, Eng JK, Li XJ, Bodenmiller B, Watts JD, Hood L, Aebersold R (август 2005 г.). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии сопряжения дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Nature Methods . 2 (8): 591– 8. doi :10.1038/nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Эта статья о гене на человеческой хромосоме 10 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.
