ЛИПЛАЛ1
 Кристаллическая структура человеческого LYPLAL1, код PDB 3u0v. Альфа-спирали обозначены красным, бета-тяжи — золотым, остатки каталитического центра — черным. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Символ | Белок 1, подобный лизофосфолипазе | ||||||||
| Пфам | ПФ02230 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR029058 | ||||||||
| КАТ | 3у0в | ||||||||
| СКОП2 | 3u0v / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Лизофосфолипазоподобный белок 1 у людей кодируется геном LYPLAL1 . [ 1] Этот белок представляет собой α /β-гидролазу с неопределенной метаболической функцией. Исследования ассоциаций по всему геному у людей связали этот ген с распределением жира [2] и соотношением талии и бедер . [3] Ферментативная функция белка неясна. Сообщалось, что LYPLAL1 действует как триглицеридлипаза в жировой ткани [4] , а другое исследование предположило, что этот белок может играть роль в депальмитоилировании кальций-активируемых калиевых каналов . [5] Однако LYPLAL1 не депальмитоилирует онкоген Ras [6] , а структурное и ферментативное исследование пришло к выводу, что LYPLAL1, как правило, не может действовать как липаза, а вместо этого является эстеразой , которая предпочитает субстраты с короткой цепью, такие как ацетильные группы . [7] Структурные сравнения предполагают, что LYPLAL1 может быть протеиндеацетилазой, но это не было экспериментально проверено. [8]
Связь с ацил-протеинтиоэстеразами
Сохранение последовательности и структурная гомология предполагают тесную связь белков LYPLAL1 с ацил-протеин тиоэстеразами , и, следовательно, было высказано предположение, что LYPLAL1 может быть третьей человеческой ацил-протеин тиоэстеразой. [9] Однако основное структурное различие между обоими семействами белков было установлено в гидрофобном субстратсвязывающем туннеле, который был идентифицирован в человеческих ацил-протеин тиоэстеразах 1 [10] и 2, [11] , а также в ацил-протеин тиоэстеразе 2 Zea mays . [12] В LYPLAL1 этот туннель закрыт из-за другой конформации петли , что изменяет субстратную специфичность фермента на короткие ацильные цепи . [7]
Ссылки
- ^ "Entrez Gene: Lysophospholipase-like 1" . Получено 2013-02-27 .
- ^ Benjamin AM, Suchindran S, Pearce K, Rowell J, Lien LF, Guyton JR, McCarthy JJ (2011). «Взаимодействие генов и пола для измерения ожирения в исследовании сердца Фрамингема». Журнал ожирения . 2011 : 329038. doi : 10.1155/2011/329038 . PMC 3021872. PMID 21253498 .
- ^ Heid IM, Jackson AU, Randall JC, Winkler TW, Qi L, Steinthorsdottir V и др. (ноябрь 2010 г.). «Метаанализ выявляет 13 новых локусов, связанных с соотношением талии и бедер, и выявляет половой диморфизм в генетической основе распределения жира». Nature Genetics . 42 (11): 949– 60. doi :10.1038/ng.685. PMC 3000924 . PMID 20935629.
- ^ Steinberg GR, Kemp BE, Watt MJ (октябрь 2007 г.). «Экспрессия адипоцитарной триглицеридлипазы при ожирении у человека». Американский журнал физиологии. Эндокринология и метаболизм . 293 (4): E958-64. doi :10.1152/ajpendo.00235.2007. PMID 17609260.
- ^ Tian L, McClafferty H, Knaus HG, Ruth P, Shipston MJ (апрель 2012 г.). «Различные ацилпротеинтрансферазы и тиоэстеразы контролируют поверхностную экспрессию кальций-активируемых калиевых каналов». Журнал биологической химии . 287 (18): 14718– 25. doi : 10.1074/jbc.M111.335547 . PMC 3340283. PMID 22399288 .
- ^ Гёрмер К., Бюргер М., Круйцер Дж. А., Веттер И., Вартак Н., Брунсвельд Л., Бастианс П. И., Лискамп Р. М., Триола Г., Вальдманн Х. (май 2012 г.). «Химико-биологическое исследование возможностей техники рас-де- и репальмитоилирования». ХимБиоХим . 13 (7): 1017–23 . doi :10.1002/cbic.201200078. PMID 22488913. S2CID 37748152.
- ^ ab Bürger M, Zimmermann TJ, Kondoh Y, Stege P, Watanabe N, Osada H, Waldmann H, Vetter IR (январь 2012 г.). «Кристаллическая структура предсказанной фосфолипазы LYPLAL1 обнаруживает неожиданную функциональную пластичность, несмотря на тесную связь с ацил-протеинтиоэстеразами». Journal of Lipid Research . 53 (1): 43– 50. doi : 10.1194/jlr.M019851 . PMC 3243480 . PMID 22052940.
- ^ Бюргер М., Чори Дж. (2018). «Структурная и химическая биология деацетилаз для углеводов, белков, малых молекул и гистонов». Communications Biology . 1 : 217. doi :10.1038/s42003-018-0214-4. PMC 6281622. PMID 30534609 .
- ^ Zeidman R, Jackson CS, Magee AI (январь 2009). "Протеиновые ацилтиоэстеразы (обзор)". Молекулярная мембранная биология . 26 (1): 32– 41. doi : 10.1080/09687680802629329. hdl : 10044/1/1452 . PMID 19115143. S2CID 10591154.
- ^ Devedjiev Y, Dauter Z, Kuznetsov SR, Jones TL, Derewenda ZS (ноябрь 2000 г.). "Кристаллическая структура человеческой ацил-протеинтиоэстеразы I из одного набора рентгеновских данных до 1,5 А". Structure . 8 (11): 1137– 46. doi : 10.1016/s0969-2126(00)00529-3 . PMID 11080636.
- ^ Вон SJ, Давда Д., Лабби К.Дж., Хван С.Ю., Прайсер Р., Маджмудар Дж.Д., Армакост К.А., Родригес Л.А., Родригес КЛ, Чонг Ф.С., Тороссян К.А., Палакурти Дж., Хур Э.С., Мигер Дж.Л., Брукс КЛ., Стаки Дж.А., Мартин БР (декабрь 2016 г.). «Молекулярный механизм изоформ-селективного ингибирования ацилпротеинтиоэстераз 1 и 2 (APT1 и APT2)». АКС Химическая биология . 11 (12): 3374–3382 . doi :10.1021/acschembio.6b00720. ПМК 5359770 . ПМИД 27748579.
- ^ Bürger M, Willige BC, Chory J (декабрь 2017 г.). «Механизм гидрофобного якоря определяет семейство деацетилаз, которое подавляет реакцию хозяина против эффекторов YopJ». Nature Communications . 8 (1): 2201. Bibcode :2017NatCo...8.2201B. doi :10.1038/s41467-017-02347-w. PMC 5736716 . PMID 29259199.
Дальнейшее чтение
