ЛМО7

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

ЛМО7
Доступные структуры
ПДБПоиск человека UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLMO7 , FBX20, FBXO20, LOMP, домен LIM 7, LMO7b
Внешние идентификаторыОМИМ : 604362; МГИ : 1353586; гомологен : 83924; GeneCards : LMO7; OMA :LMO7 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001306080
NM_005358
NM_015842
NM_015843
NM_001330583

NM_201529
NM_001347628

RefSeq (белок)

н/д

Местоположение (UCSC)Хр 13: 75,62 – 75,86 МбХр 14: 101,73 – 101,93 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Только белок 7 домена LIM — это белок , который у людей кодируется геном LMO7 . [ 5] [6] [7]

Этот ген кодирует белок, содержащий домен гомологии кальпонина (CH), домен PDZ и домен LIM . Домен F-box (FBX) присутствует в вариантах альтернативного сплайсинга. Члены семейства белков LIM несут домен LIM, уникальный богатый цистеином домен связывания цинка. Члены семейства белков FBX участвуют в белок-белковых взаимодействиях. Кодируемый белок может участвовать в белок-белковых взаимодействиях. Было описано несколько вариантов альтернативного сплайсинга, но их полноразмерные последовательности не были определены. [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000136153 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000033060 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Путилина Т., Яворски С., Джентльмен С., Макдональд Б., Кадири М., Вонг П. (декабрь 1998 г.). «Анализ человеческой кДНК, содержащей тканеспецифичный альтернативно сплайсированный домен LIM». Biochem Biophys Res Commun . 252 (2): 433– 9. doi :10.1006/bbrc.1998.9656. PMID  9826547.
  6. ^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (декабрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-box человека». Curr Biol . 9 (20): 1177– 9. Bibcode : 1999CBio....9.1177C. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID  10531035.
  7. ^ ab "Ген Энтреза: LMO7 LIM домен 7".

Дальнейшее чтение

  • Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Рез . 9 (3): 99–106 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД  12168954.
  • Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М. и др. (1999). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 5 (6): 355–64 . doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . PMID  10048485.
  • Розенблюм Э., Вахтеристо П., Сандберг Т. и др. (2002). «Геномная карта 6-Мб региона 13q21-q22, вовлеченного в развитие рака: идентификация и характеристика генов-кандидатов». Hum. Genet . 110 (2): 111– 21. doi :10.1007/s00439-001-0646-6. PMID  11935316. S2CID  21371347.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Jin J, Smith FD, Stark C и др. (2004). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Biol . 14 (16): 1436– 50. Bibcode : 2004CBio...14.1436J. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID  15324660. S2CID  2371325.
  • Benzinger A, Muster N, Koch HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора p53, обычно подавляемого при раке». Mol. Cell. Proteomics . 4 (6): 785–95 . doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID  15778465.
  • Kim J, Bhinge AA, Morgan XC, Iyer VR (2005). «Картирование ДНК-белковых взаимодействий в больших геномах с помощью анализа последовательностей тегов геномного обогащения». Nat. Methods . 2 (1): 47– 53. doi :10.1038/nmeth726. PMID  15782160. S2CID  6135437.
  • Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res . 4 (4): 1339– 46. doi :10.1021/pr050048h. PMID  16083285.
  • Ивабучи К, Канеко Т, Кикуяма М (2006). «Ионный механизм механоперцепции у харовых». Plant Cell Physiol . 46 (11): 1863–71 . doi : 10.1093/pcp/pci204 . PMID  16192285.
  • Босолей СА, Виллен ДЖ, Гербер СА и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации участков». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285– 92. doi :10.1038/nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
  • Holaska JM, Rais-Bahrami S, Wilson KL (2007). «Lmo7 — это белок, связывающий эмерин, который регулирует транскрипцию эмерина и многих других генов, связанных с мышцами». Hum. Mol. Genet . 15 (23): 3459– 72. doi : 10.1093/hmg/ddl423 . PMID  17067998.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LMO7&oldid=1217123807"