ЛИН7Б

ЛИН7Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2ДКР
Идентификаторы
Псевдонимы	LIN7B , LIN-7B, MALS-2, MALS2, VELI2, гомолог B lin-7, компонент комплекса полярности клеток крошек
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 612331; МГИ : 1330858; гомологен : 22648; Генные карты : LIN7B; OMA :LIN7B — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 19 (человек)
Конец	49,118,460 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	45,020,007 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	передняя поясная кора; ; эндотелиальная клетка; ; правая лобная доля; ; прилежащее ядро; ; Район Бродмана 9; ; передняя доля гипофиза; ; префронтальная кора; ; Миндалевидное тело; ; хвостатое ядро; ; путамен;
	Верх выражен в
	двигательное ядро лица; ; двигательный нейрон; ; верхняя лобная извилина; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; первичная зрительная кора; ; черная субстанция; ; стволовая кора; ; первичная моторная кора; ; передняя миндалевидная область; ; Область I гиппокампа;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	Привязка домена PDZ; специфическое связывание домена белка; Связывание домена L27; связывание белков;
Клеточный компонент	постсинаптическая мембрана; постсинаптическая плотность; мембрана; соединение клетка-клетка; двуклеточный плотный контакт; плазматическая мембрана; клеточный переход; базолатеральная плазматическая мембрана; проекция нейрона; пресинапс; синапс; Комплекс MPP7-DLG1-LIN7;
Биологический процесс	локализация белка на базолатеральной плазматической мембране; поддержание апикальной/базальной полярности эпителиальных клеток; транспорт белков; секреция нейромедиатора; экзоцитоз;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	64130
	22342
	ENSG00000104863
	ENSMUSG00000003872
	Q9HAP6
	О88951
	NM_001308419 ; NM_022165
	NM_011698
	NP_001295348 ; NP_071448
	NP_035828
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Гомолог Lin-7 B — это белок , который у людей кодируется геном LIN7B . [ ^5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что LIN7B взаимодействует с:

ACCN3 , ^[7]
ГРИН2Б , ^[5]
KCNJ12 ^[8]^[9] и
KCNJ4 . ^[10]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104863 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000003872 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Jo K, Derin R, Li M, Bredt DS (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS/Velis-1, -2 и -3: семейство гомологов млекопитающих LIN-7, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптической плотностью-95/постсинаптическим комплексом рецептора NMDA». J Neurosci . 19 (11): 4189– 99. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-11-04189.1999 . PMC 6782594 . PMID 10341223.
^ "Ген Энтреза: LIN7B lin-7 гомолог B (C. elegans)".
^ Hruska-Hageman AM, Benson CJ, Leonard AS, Price MP, Welsh MJ (ноябрь 2004 г.). «PSD-95 и Lin-7b взаимодействуют с чувствительным к кислоте ионным каналом-3 и оказывают противоположное воздействие на ток, управляемый H+». J. Biol. Chem . 279 (45): 46962– 8. doi : 10.1074/jbc.M405874200 . PMID 15317815.
^ Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.
^ Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (апрель 2004 г.). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.
^ Olsen O, Liu H, Wade JB, Merot J, Welling PA (январь 2002 г.). «Базолатеральная мембранная экспрессия канала Kir 2.3 координируется взаимодействием PDZ с комплексом Lin-7/CASK». Am. J. Physiol., Cell Physiol . 282 (1): C183-95. doi :10.1152/ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.

Дальнейшее чтение

Butz S, Okamoto M, Südhof TC (1998). «Трехкомпонентный белковый комплекс с потенциалом связывания экзоцитоза синаптических везикул с клеточной адгезией в мозге». Cell . 94 (6): 773– 82. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81736-5 . PMID 9753324. S2CID 12465062.
Olsen O, Liu H, Wade JB, Merot J, Welling PA (2002). «Базолатеральная мембранная экспрессия канала Kir 2.3 координируется взаимодействием PDZ с комплексом Lin-7/CASK». Am. J. Physiol., Cell Physiol . 282 (1): C183–95. doi :10.1152/ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.
Coussen F, Normand E, Marchal C, Costet P, Choquet D, Lambert M, Mège RM, Mulle C (2002). «Рекрутирование субъединицы рецептора каината глутаматного рецептора 6 комплексами кадгерин/катенин». J. Neurosci . 22 (15): 6426– 36. doi :10.1523/JNEUROSCI.22-15-06426.2002. PMC 6758172 . PMID 12151522.
Хори К, Конно Д, Маруока Х, Собуэ К (2003). «MALS является связывающим партнером IRSp53 в межклеточных контактах». FEBS Lett . 554 ( 1– 2): 30– 4. doi : 10.1016/S0014-5793(03)01074-3 . PMID 14596909. S2CID 30329043.
Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (2004). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (2004). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.
Hruska-Hageman AM, Benson CJ, Leonard AS, Price MP, Welsh MJ (2004). "PSD-95 и Lin-7b взаимодействуют с чувствительным к кислоте ионным каналом-3 и оказывают противоположное воздействие на ток, управляемый H+". J. Biol. Chem . 279 (45): 46962– 8. doi : 10.1074/jbc.M405874200 . PMID 15317815.
Okuhira K, Fitzgerald ML, Sarracino DA, Manning JJ, Bell SA, Goss JL, Freeman MW (2006). «Очистка АТФ-связывающего кассетного транспортера A1 и связанных с ним связывающих белков раскрывает важность бета1-синтрофина в оттоке холестерина». J. Biol. Chem . 280 (47): 39653– 64. doi : 10.1074/jbc.M510187200 . PMID 16192269.
Каваи С., Фукуда С., Мукаи Т., Мурата К. (2006). «MJ0917 у археи Methanococcus jannaschii представляет собой новую НАДФ-фосфатазу / НАД-киназу». Ж. Биол. Хим . 280 (47): 39200–7 . doi : 10.1074/jbc.M506426200 . ПМИД 16192277.
Li Z, Benard O, Margolskee RF (2006). "Ggamma13 взаимодействует с белками, содержащими домен PDZ". J. Biol. Chem . 281 (16): 11066– 73. doi : 10.1074/jbc.M600113200 . PMID 16473877.
Sudo K, Ito H, Iwamoto I, Morishita R, Asano T, Nagata K (2007). «Идентификация белка, связанного с полярностью клеток, Lin-7B, как партнера по связыванию для эффектора Rho, Rhotekin, и их возможное взаимодействие в нейронах». Neurosci. Res . 56 (4): 347– 55. doi :10.1016/j.neures.2006.08.003. PMID 16979770. S2CID 45834664.

Эта статья о гене на хромосоме 19 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104863 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000003872 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10341223-5] Jo K, Derin R, Li M, Bredt DS (июнь 1999 г.). «Характеристика MALS/Velis-1, -2 и -3: семейство гомологов млекопитающих LIN-7, обогащенных в синапсах мозга в связи с постсинаптической плотностью-95/постсинаптическим комплексом рецептора NMDA». J Neurosci . 19 (11): 4189– 99. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-11-04189.1999 . PMC 6782594 . PMID 10341223.

[entrez-6] "Ген Энтреза: LIN7B lin-7 гомолог B (C. elegans)".

[pmid15317815-7] Hruska-Hageman AM, Benson CJ, Leonard AS, Price MP, Welsh MJ (ноябрь 2004 г.). «PSD-95 и Lin-7b взаимодействуют с чувствительным к кислоте ионным каналом-3 и оказывают противоположное воздействие на ток, управляемый H+». J. Biol. Chem . 279 (45): 46962– 8. doi : 10.1074/jbc.M405874200 . PMID 15317815.

[pmid15024025-8] Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (май 2004 г.). «Белковый транспорт и якорные комплексы, выявленные с помощью протеомного анализа белков, связанных с внутренним выпрямительным калиевым каналом (Kir2.x)». J. Biol. Chem . 279 (21): 22331– 46. doi : 10.1074/jbc.M400285200 . PMID 15024025.

[pmid14960569-9] Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (апрель 2004 г.). «Мультипротеиновый транспортный комплекс, состоящий из SAP97, CASK, Veli и Mint1, связан с внутренними выпрямляющими калиевыми каналами Kir2». J. Biol. Chem . 279 (18): 19051– 63. doi : 10.1074/jbc.M400284200 . PMID 14960569.

[pmid11742811-10] Olsen O, Liu H, Wade JB, Merot J, Welling PA (январь 2002 г.). «Базолатеральная мембранная экспрессия канала Kir 2.3 координируется взаимодействием PDZ с комплексом Lin-7/CASK». Am. J. Physiol., Cell Physiol . 282 (1): C183-95. doi :10.1152/ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.