L2HGDH

L2HGDH
Идентификаторы
Псевдонимы	L2HGDH , C14orf160, L2HGA, L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609584; МГИ : 2384968; Гомологен : 11767; Генные карты : L2HGDH; OMA :L2HGDH — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 14 (человек)
Конец	50,312,229 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 12 (мышь)
Конец	69,771,647 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	гонада; ; мышца ноги; ; икроножная мышца; ; мышца бедра; ; яичко; ; человеческая почка; ; островок Лангерганса; ; желудочковая зона; ; прямая кишка; ; Скелетная мышечная ткань двуглавой мышцы плеча;
	Верх выражен в
	правая почка; ; проксимальный каналец; ; межжелудочковая перегородка; ; жевательная мышца; ; слуховой пузырек; ; человеческая почка; ; сперматоцит; ; супраоптическое ядро; ; мешочек; ; морула;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	оксидоредуктазная активность; Активность 2-гидроксиглутаратдегидрогеназы; Активность оксидазы (S)-2-гидроксикислоты;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; внутренняя мембрана митохондрий; митохондрия; неотъемлемый компонент внутренней мембраны митохондрий;
Биологический процесс	Процесс метаболизма 2-оксоглутарата;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	79944
	217666
	ENSG00000087299
	ENSMUSG00000020988
	Q9H9P8
	Q91YP0
	NM_024884
	NM_145443
	NP_079160
	NP_663418
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа, митохондриальная, представляет собой фермент , который у людей кодируется геном L2HGDH , также известным как C14orf160, на хромосоме 14. [ ^5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу, фермент, зависимый от флавинадениндинуклеотида (ФАД), который окисляет L-2-гидроксиглутарат до альфа-кетоглутарата в различных тканях млекопитающих. Мутации в этом гене вызывают L-2-гидроксиглутаровую ацидурию , редкое аутосомно-рецессивное нейрометаболическое расстройство, приводящее к умеренной или тяжелой умственной отсталости. ^[6]

L2HGDH кодирует белок размером 50 кДа. Белок L2HGDH содержит транзитный пептид, нацеленный на митохондрии ^[7] , и локализуется на внутренней мембране митохондрий внутри митохондрий внутри клетки. Белок L2HGDH катализирует следующую реакцию и требует флавинадениндинуклеотида (FAD) в качестве кофактора :

(S)-2-гидроксиглутарат + акцептор = 2-оксоглутарат + восстановленный акцептор. ^[5]

L-2-гидроксиглутарат образуется в результате беспорядочного действия малатдегидрогеназы на 2-оксоглутарат; таким образом , белок L2HGDH является примером фермента восстановления метаболитов , поскольку он преобразует бесполезный продукт повреждения L-2-гидроксиглутарат обратно в 2-оксоглутарат.

Клиническое значение

Мутации в гене L2HGDH вызывают L-2-гидроксиглутаровую ацидурию , редкое аутосомно-рецессивное нейрометаболическое расстройство. У людей с мутациями L2HGDH наблюдается токсическое накопление высокой концентрации L-2-гидроксиглутаровой кислоты в плазме и спинномозговой жидкости . ^[8] У пациентов обнаружено не менее 70 болезнетворных вариантов гена L2HGDH. ^[9] Пациенты с L-2-гидроксиглутаровой ацидурией связаны с умеренной или тяжелой умственной отсталостью , психомоторной отсталостью , мозжечковой атаксией , макроцефалией или эпилепсией . ^[9]

L2HGDH играет роль посредника в дифференциации Т-клеток посредством своей активности на S-2HG ^[10]

Молекулярные взаимодействия

КЛК10 ^[11]

Смотрите также

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000087299 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020988 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ аб Рзем Р., Ван Шафтинген Э., Вейга-да-Кунья М. (январь 2006 г.). «Ген, мутировавший в l-2-гидроксиглутаровой ацидурии, кодирует l-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу». Биохимия . 88 (1): 113–116. дои : 10.1016/j.biochi.2005.06.005. ПМИД 16005139.
^ ab "Ген Энтреза: L2HGDH L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа".
^ "L2HGDH - L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок L2HGDH". www.uniprot.org .
^ Виларинью Л., Тафуло С., Сибилио М., Кок Ф., Фонтана Ф., Диого Л., Венансиу М., Феррейра М., Ногейра С., Валонго С., Паренти Г., Аморим А., Азеведо Л. (январь 2010 г.). «Идентификация новых мутаций гена L2HGDH и обновление патологического спектра». Журнал генетики человека . 55 (1): 55–8. дои : 10.1038/jhg.2009.110 . ПМИД 19911013.
^ ab Steenweg ME, Jakobs C, Errami A, van Dooren SJ, Adeva Bartolomé MT, Aerssens P и др. (апрель 2010 г.). «Обзор вариантов гена L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназы (L2HGDH): исследование генотипа-фенотипа». Человеческая мутация . 31 (4): 380–90. дои : 10.1002/humu.21197 . ПМИД 20052767.
^ Tyrakis PA, Palazon A, Macias D, Lee KL, Phan AT, Veliça P, You J, Chia GS, Sim J, Doedens A, Abelanet A, Evans CE, Griffiths JR, Poellinger L, Goldrath AW, Johnson RS (декабрь 2016 г.). «S-2-гидроксиглутарат регулирует судьбу Т-лимфоцитов CD8+». Nature . 540 (7632): 236–241. Bibcode :2016Natur.540..236T. doi :10.1038/nature20165. PMC 5149074 . PMID 27798602.
^ Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, et al. (Июль 2015 г.). «Сеть BioPlex: систематическое исследование человеческого интерактома». Cell . 162 (2): 425–40. doi :10.1016/j.cell.2015.06.043. PMC 4617211 . PMID 26186194.

Дальнейшее чтение

Duran M, Kamerling JP, Bakker HD, van Gennip AH, Wadman SK (1981). «L-2-гидроксиглутаровая ацидурия: врожденная ошибка метаболизма?». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 3 (4): 109–12. doi :10.1007/BF02312543. PMID 6787330. S2CID 22073735.
Jansen GA, Wanders RJ (ноябрь 1993 г.). "L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа: идентификация новой активности фермента в печени крысы и человека. Последствия для L-2-гидроксиглутаровой ацидемии". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы заболеваний . 1225 (1): 53–6. doi :10.1016/0925-4439(93)90121-g. PMID 8241290.
Topçu M, Jobard F, Halliez S, Coskun T, Yalçinkayal C, Gerceker FO, Wanders RJ, Prud'homme JF, Lathrop M, Ozguc M, Fischer J (ноябрь 2004 г.). "L-2-гидроксиглутаровая ацидурия: идентификация мутантного гена C14orf160, локализованного на хромосоме 14q22.1". Молекулярная генетика человека . 13 (22): 2803–11. doi : 10.1093/hmg/ddh300 . PMID 15385440.
Rzem R, Veiga-da-Cunha M, Noël G, Goffette S, Nassogne MC, Tabarki B, Schöller C, Marquardt T, Vikkula M, Van Schaftingen E (ноябрь 2004 г.). «Ген, кодирующий предполагаемую FAD-зависимую L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу, мутирует при L-2-гидроксиглутаровой ацидурии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (48): 16849–54. Bibcode : 2004PNAS..10116849R. doi : 10.1073/pnas.0404840101 . PMC 534725. PMID 15548604 .
Виларинью Л, Кардосу МЛ, Гаспар П, Барбо К, Азеведо Л, Диого Л, Сантос М, Каррилью И, Финеза И, Кок Ф, Чорао Р, Алегрия П, Мартинс Э, Тейшейра Х, Кабрал Фернандес Х, Верховен Н.М., Саломонс Г.С., Санторелли Ф.М., Кабрал П., Аморим А., Якобс С. (октябрь 2005 г.). «Новые мутации L2HGDH у 21 пациента с L-2-гидроксиглутаровой ацидурией португальского происхождения». Человеческая мутация . 26 (4): 395–6. дои : 10.1002/humu.9373 . ПМИД 16134148.
Struys EA, Gibson KM, Jakobs C (октябрь 2007 г.). «Новые идеи L-2-гидроксиглутаровой ацидурии: массовые изотопомерные исследования показывают, что 2-оксоглутаровая кислота является метаболическим предшественником L-2-гидроксиглутаровой кислоты». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 30 (5): 690–3. doi :10.1007/s10545-007-0697-5. PMID 17876720. S2CID 10571813.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 14 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000087299 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020988 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid16005139-5] аб Рзем Р., Ван Шафтинген Э., Вейга-да-Кунья М. (январь 2006 г.). «Ген, мутировавший в l-2-гидроксиглутаровой ацидурии, кодирует l-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу». Биохимия . 88 (1): 113–116. дои : 10.1016/j.biochi.2005.06.005. ПМИД 16005139.

[entrez-6] "Ген Энтреза: L2HGDH L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа".

[7] "L2HGDH - L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок L2HGDH". www.uniprot.org .

[8] Виларинью Л., Тафуло С., Сибилио М., Кок Ф., Фонтана Ф., Диого Л., Венансиу М., Феррейра М., Ногейра С., Валонго С., Паренти Г., Аморим А., Азеведо Л. (январь 2010 г.). «Идентификация новых мутаций гена L2HGDH и обновление патологического спектра». Журнал генетики человека . 55 (1): 55–8. дои : 10.1038/jhg.2009.110 . ПМИД 19911013.

[Steenweg_380–90-9] Steenweg ME, Jakobs C, Errami A, van Dooren SJ, Adeva Bartolomé MT, Aerssens P и др. (апрель 2010 г.). «Обзор вариантов гена L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназы (L2HGDH): исследование генотипа-фенотипа». Человеческая мутация . 31 (4): 380–90. дои : 10.1002/humu.21197 . ПМИД 20052767.

[10] Tyrakis PA, Palazon A, Macias D, Lee KL, Phan AT, Veliça P, You J, Chia GS, Sim J, Doedens A, Abelanet A, Evans CE, Griffiths JR, Poellinger L, Goldrath AW, Johnson RS (декабрь 2016 г.). «S-2-гидроксиглутарат регулирует судьбу Т-лимфоцитов CD8+». Nature . 540 (7632): 236–241. Bibcode :2016Natur.540..236T. doi :10.1038/nature20165. PMC 5149074 . PMID 27798602.

[11] Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, et al. (Июль 2015 г.). «Сеть BioPlex: систематическое исследование человеческого интерактома». Cell . 162 (2): 425–40. doi :10.1016/j.cell.2015.06.043. PMC 4617211 . PMID 26186194.