Фактор Крюппеля 3 — это белок , который у человека кодируется геном KLF3 .
Структура
KLF3, первоначально названный основным фактором типа Крюппеля (BKLF), был третьим членом семейства факторов типа Крюппеля, транскрипционных факторов типа цинковых пальцев , который был обнаружен. [5] Факторы транскрипции в этом семействе связывают ДНК с помощью 3 характерных трех цинковых пальцев C2H2 на их C-концах . Поскольку их ДНК-связывающие домены высококонсервативны в пределах семейства, все белки KLF распознают блоки CACCC или CGCCC общей формы NCR CRC CCN (где N — любое основание, а R — пурин ) .
Функция
В то время как C-концы в разных KLFs схожи, N-концы различаются, и соответственно разные KLFs могут либо активировать, либо подавлять транскрипцию, либо и то, и другое. KLF3, по-видимому, действует преимущественно как репрессор транскрипции. Он выключает гены. Он делает это, привлекая корепрессоры C-концевого связывающего белка CTBP1 и CTBP2 . [6] [7] CtBP присоединяется к короткому мотиву (остатки 61-65) в N-конце KLF3, имеющего общую форму пролин – изолейцин – аспартат – лейцин – серин (мотив PIDLS). [6] [7] CtBP, в свою очередь, привлекает ферменты, модифицирующие гистоны , для изменения хроматина и подавления экспрессии генов.
KLF3 сильно экспрессируется в эритроцитах или эритроидной линии. Здесь он управляется другим KLF, эритроидным KLF или KLF1 , и его экспрессия увеличивается по мере созревания эритроидных клеток. Исследования на мышах с нокаутом выявили легкую анемию при отсутствии функционального KLF3 и дерепрессию нескольких целевых генов, которые содержат блоки CACCC в своих регуляторных областях. [8] Многие из этих генов активируются KLF1, поэтому, по-видимому, KLF3 работает в отрицательной обратной связи, чтобы уравновесить активирующий потенциал KLF1. KLF3 также регулирует другой репрессивный KLF, KLF8 . [9] Таким образом, KLF1, KLF3 и KLF8 работают в тесной регуляторной сети. KLF3 и KLF8 могут иметь избыточные функции, так как у мышей, у которых отсутствуют как KLF3, так и KLF8, наблюдаются дефекты, которые более серьезны, чем при любом из нокаутов по отдельности. Они умирают внутриутробно примерно на 14-й день беременности. [10]
Помимо экспрессии в эритроидных клетках, KLF3 присутствует в других типах клеток, и анализ мышей с нокаутом выявил дефекты, затрагивающие жировую ткань [11] и В-клетки . [12] У мышей с дефицитом KLF3 меньше жировой ткани и признаки метаболического здоровья, что может быть связано с дерепрессией гена гормона адипокина адиполина . [13] Роль KLF3 в В-лимфоцитах сложна, но, по-видимому, он работает в сети с KLF2 и KLF4, влияя на переключение между маргинальной зоной селезенки и фолликулярными В-клетками . [14]
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000109787 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029178 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Crossley M (апрель 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей BKLF/TEF-2, основной белок, связывающий CACCC-box в эритроидных клетках и некоторых других клетках». Mol. Cell. Biol . 16 (4): 1695– 705. doi :10.1128/mcb.16.4.1695. PMC 231156. PMID 8657145 .
^ abcd Turner J, Nicholas H, Bishop D, Matthews JM, Crossley M (2003). "Белок LIM FHL3 связывает основной фактор типа Крюппеля/фактор типа Крюппеля 3 и его корепрессорный белок связывания С-терминала 2". J. Biol. Chem . 278 (15): 12786– 95. doi : 10.1074/jbc.M300587200 . PMID 12556451.
^ abc Turner J, Crossley M (1998). «Клонирование и характеристика mCtBP2, корепрессора, который ассоциируется с основным фактором типа Крюппеля и другими регуляторами транскрипции млекопитающих». EMBO J . 17 (17): 5129– 40. doi :10.1093/emboj/17.17.5129. PMC 1170841 . PMID 9724649.
^ Funnell AP, Norton LJ, Mak KS, Burdach J, Artuz CM, Twine NA, Wilkins MR, Power CA, Hung TT, Perdomo J, Koh P, Bell-Anderson KS, Orkin SH, Fraser ST, Perkins AC, Pearson RC, Crossley M (август 2012 г.). «CACCC-связывающий белок KLF3/BKLF подавляет подмножество целевых генов KLF1/EKLF и необходим для правильного созревания эритроидов in vivo». Mol. Cell. Biol . 32 (16): 3281– 92. doi :10.1128/MCB.00173-12. PMC 3434552. PMID 22711990 .
^ Eaton SA, Funnell AP, Sue N, Nicholas H, Pearson RC, Crossley M (август 2008 г.). «Сеть факторов типа Крюппеля (Klfs). Klf8 подавляется Klf3 и активируется Klf1 in vivo». J. Biol. Chem . 283 (40): 26937– 47. doi : 10.1074/jbc.M804831200 . PMC 2556010. PMID 18687676 .
^ Funnell AP, Mak KS, Twine NA, Pelka GJ, Norton LJ, Radziewic T, Power M, Wilkins MR, Bell-Anderson KS, Fraser ST, Perkins AC, Tam PP, Pearson RC, Crossley M (август 2013 г.). «Generation of Mice Deficient in KLF3/BKLF and KLF8 Reveals a Genetic Interaction and a Role for These Factors in Embryonic Globin Gene Silencing». Mol. Cell. Biol . 33 (15): 2976– 87. doi :10.1128/MCB.00074-13. PMC 3719677. PMID 23716600 .
^ Sue N, Jack BH, Eaton SA, Pearson RC, Funnell AP, Turner J, Czolij R, Denyer G, Bao S, Molero-Navajas JC, Perkins A, Fujiwara Y, Orkin SH, Bell-Anderson K, Crossley M (июнь 2008 г.). «Целенаправленное разрушение основного гена фактора Круппеля (Klf3) выявляет роль в адипогенезе». Mol Cell Biol . 28 (12): 3967– 78. doi :10.1128/MCB.01942-07. PMC 2423134. PMID 18391014 .
^ Vu TT, Gatto D, Turner V, Funnell AP, Mak KS, Norton LJ, Kaplan W, Cowley MJ, Agenès F, Kirberg J, Brink R, Pearson RC, Crossley M (ноябрь 2011 г.). «Нарушение развития В-клеток при отсутствии фактора Крюппеля 3». J. Immunol . 187 (10): 5032– 42. doi : 10.4049/jimmunol.1101450 . PMID 22003205.
^ Bell-Anderson KS, Funnell AP, Williams H, Mat Jusoh H, Scully T, Lim WF, Burdach JG, Mak KS, Knights AJ, Hoy AJ, Nicholas HR, Sainsbury A, Turner N, Pearson RC, Crossley M (апрель 2013 г.). «Потеря фактора 3, подобного Круппелю (KLF3/BKLF), приводит к повышению регуляции инсулиночувствительного фактора адиполина (FAM132A/CTRP12/C1qdc2)». Диабет . 62 (8): 2728– 37. doi :10.2337/db12-1745. PMC 3717849. PMID 23633521 .
^ Pearson RC, Funnell AP, Crossley M (февраль 2011 г.). «Транскрипционный фактор млекопитающих с цинковым пальцем, фактор типа Крюппеля 3 (KLF3/BKLF)». IUBMB Life . 63 (2): 86–93 . doi : 10.1002/iub.422 . PMID 21360637. S2CID 38842040.
Дальнейшее чтение
Turner J, Crossley M (2000). «Основной фактор типа Крюппеля функционирует в сети взаимодействующих гемопоэтических факторов транскрипции». Int. J. Biochem. Cell Biol . 31 (10): 1169– 74. doi :10.1016/S1357-2725(99)00067-9. PMID 10582345.
Wang MJ, Qu XH, Wang LS, Zhai Y, Wu SL, He FC (2003). «Клонирование кДНК, субклеточная локализация и тканевая экспрессия нового человеческого фактора транскрипции типа Крюппеля: человеческий основной фактор типа Крюппеля (hBKLF)». Yi Chuan Xue Bao . 30 (1): 1– 9. PMID 12812068.
Perdomo J, Verger A, Turner J, Crossley M (2005). "Роль модификации SUMO в облегчении репрессии транскрипции BKLF". Mol. Cell. Biol . 25 (4): 1549– 59. doi :10.1128/MCB.25.4.1549-1559.2005. PMC 548027. PMID 15684403 .
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямасита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ирие Р, Кусида Н, Ёнеяма Т, Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаси-Фудзи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геном Рез . 16 (1): 55–65 . doi :10.1101/гр.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
