Кальсенилин

KCNIP3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2E6W
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNIP3 , CSEN, DREAM, KCHIP3, белок 3, взаимодействующий с потенциалзависимым калиевым каналом
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604662; МГИ : 1929258; гомологен : 8382; Генные карты : KCNIP3; OMA :KCNIP3 — ортологи
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	127,364,014 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	префронтальная кора; ; Район Бродмана 9; ; левая доля щитовидной железы; ; Миндалевидное тело; ; правая доля щитовидной железы; ; прилежащее ядро; ; хвостатое ядро; ; Гипоталамус; ; путамен; ; собственно гиппокамп;
	Верх выражен в
	поясничный спинномозговой ганглий; ; первичная зрительная кора; ; верхняя лобная извилина; ; грушевидная кора; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; кора мозжечка; ; медиальное дорсальное ядро; ; подложка; ; префронтальная кора; ; медиальное коленчатое ядро;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ДНК; связывание ионов кальция; последовательность-специфическое связывание ДНК; активность калиевых каналов; активность корепрессора транскрипции; активность потенциалзависимых ионных каналов; связывание ионов металлов; Связывание ДНК с цис-регуляторной областью РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности; ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфичная для РНК-полимеразы II; связывание белков; активность регулятора калиевых каналов; связывание трансмембранного транспортера;
Клеточный компонент	цитоплазма; окончание аксона; цитозоль; аппарат Гольджи; мембрана; комплекс потенциалзависимых калиевых каналов; аксон; дендрит; комплекс белок-ДНК; эндоплазматический ретикулум; ядро; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; регуляция трансмембранного транспорта ионов; отрицательная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; транспорт ионов; транскрипция, ДНК-шаблон; транспорт ионов калия; Трансмембранный транспорт ионов калия; локализация белка на плазматической мембране; внутриклеточный транспорт белков; регуляция трансмембранного транспорта ионов калия; передача сигнала; апоптотический процесс; негативная регуляция транскрипции, основанной на шаблонах нуклеиновых кислот; сердечная проводимость;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	30818
	56461
	н/д
	ENSMUSG00000079056
	Q9Y2W7
	Q9QXT8 ; P0C092
	NM_001034914 ; NM_013434
	NM_001111331 ; NM_001291005 ; NM_019789
	NP_001030086 ; NP_038462
	НП_001104801 ; НП_001277934 ; НП_062763
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок, обнаруженный в организме человека

Кальсенилин — это белок , который у людей кодируется геном KCNIP3 . [ ^4]^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства потенциалзависимых калиевых (Kv) каналов-взаимодействующих белков , которые принадлежат к семейству нейрональных кальциевых сенсорных белков. ^[7]^[8] Члены этого семейства представляют собой небольшие кальцийсвязывающие белки, содержащие домены типа EF-hand . Они являются неотъемлемыми субъединичными компонентами нативных комплексов каналов Kv4, которые могут регулировать токи типа A и, следовательно, нейрональную возбудимость в ответ на изменения внутриклеточного кальция. Кодируемый белок также функционирует как регулируемый кальцием транскрипционный репрессор и взаимодействует с пресенилинами . Кроме того, было показано, что белок транскрипционно подавляет экспрессию A20 ( TNFAIP3 ) и, таким образом, модулирует противовоспалительную сигнализацию. ^[9] Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что кальсенилин взаимодействует с PSEN1 ^[4]^[10] и PSEN2 . ^[4]^[11]

Смотрите также

Потенциал-управляемый калиевый канал

Ссылки

^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000079056 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc Buxbaum JD, Choi EK, Luo Y, Lilliehook C, Crowley AC, Merriam DE, Wasco W (октябрь 1998 г.). «Кальсенилин: связывающий кальций белок, который взаимодействует с пресенилинами и регулирует уровни фрагмента пресенилина». Nat Med . 4 (10): 1177– 81. doi :10.1038/2673. PMID 9771752. S2CID 10799492.
^ Carrión AM, Link WA, Ledo F, Mellström B, Naranjo JR (март 1999). "DREAM — это регулируемый Ca2+ транскрипционный репрессор". Nature . 398 (6722): 80– 4. Bibcode :1999Natur.398...80C. doi :10.1038/18044. PMID 10078534. S2CID 204991618.
^ ab "Ген Entrez: белок 3, взаимодействующий с Kv-каналом KCNIP3, кальсенилин".
^ Burgoyne RD (2007). «Нейрональные кальциевые сенсорные белки: создание разнообразия в нейронной сигнализации Ca2+». Nat. Rev. Neurosci . 8 (3): 182– 193. doi :10.1038/nrn2093. PMC 1887812 . PMID 17311005.
^ Burgoyne RD, O'Callaghan DW, Hasdemir B, Haynes LP, Tepikin AV (2004). «Нейрональные белки-сенсоры Ca2+: многофункциональные регуляторы нейрональных функций». Trends Neurosci . 27 (4): 203– 9. doi :10.1016/j.tins.2004.01.010. PMID 15046879. S2CID 24156457.
^ Tiruppathi C, Soni D, Wang DM и др. (март 2014 г.). «Транскрипционный фактор DREAM подавляет A20 и опосредует воспаление». Nat Immunol . 15 (3): 239– 247. doi :10.1038/ni.2823. PMC 4005385. PMID 24487321 .
^ Kashiwa A, Yoshida H, Lee S, Paladino T, Liu Y, Chen Q, Dargusch R, Schubert D, Kimura H (июль 2000 г.). «Выделение и характеристика нового пресенилин-связывающего белка». J. Neurochem . 75 (1): 109– 16. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750109.x . PMID 10854253. S2CID 24838995.
^ Choi EK, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (июнь 2001 г.). «Кальсенилин является субстратом для каспазы-3, которая преимущественно взаимодействует с C-концевым фрагментом пресенилина 2, связанным с семейной болезнью Альцгеймера». J. Biol. Chem . 276 (22): 19197– 204. doi : 10.1074/jbc.M008597200 . PMID 11278424.

Дальнейшее чтение

Carrión AM, Mellström B, Naranjo JR (1998). "Протеинкиназа А-зависимая дерепрессия гена человеческого продинорфина посредством дифференциального связывания с внутригенным элементом-глушителем". Mol. Cell. Biol . 18 (12): 6921– 9. doi : 10.1128 /MCB.18.12.6921. PMC 109275. PMID 9819380.
An WF, Bowlby MR, Betty M, Cao J, Ling HP, Mendoza G, Hinson JW, Mattsson KI, Strassle BW, Trimmer JS, Rhodes KJ (2000). «Модуляция калиевых каналов типа А семейством кальциевых сенсоров». Nature . 403 (6769): 553– 6. Bibcode :2000Natur.403..553A. doi :10.1038/35000592. PMID 10676964. S2CID 4419472.
Leissring MA, Yamasaki TR, Wasco W, Buxbaum JD, Parker I, LaFerla FM (2000). «Кальсенилин обращает пресенилино-опосредованное усиление кальциевой сигнализации». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (15): 8590– 3. Bibcode : 2000PNAS...97.8590L. doi : 10.1073/pnas.97.15.8590 . PMC 26992. PMID 10900016 .
Buxbaum JD, Lilliehook C, Chan JY, Go RC, Bassett SS, Tanzi RE, Wasco W, Blacker D (2000). «Геномная структура, паттерн экспрессии и хромосомная локализация гена человеческого кальсенилина: нет связи между экзонным полиморфизмом и болезнью Альцгеймера». Neurosci. Lett . 294 (3): 135– 8. doi :10.1016/S0304-3940(00)01553-6. PMID 11072133. S2CID 16765518.
Ledo F, Carrión AM, Link WA, Mellström B, Naranjo JR (2001). «Взаимодействие DREAM-αCREM через заряженные лейцином домены подавляет транскрипцию, зависящую от нисходящего регуляторного элемента». Mol. Cell. Biol . 20 (24): 9120– 6. doi :10.1128/MCB.20.24.9120-9126.2000. PMC 102170. PMID 11094064 .
Jo DG, Kim MJ, Choi YH, Kim IK, Song YH, Woo HN, Chung CW, Jung YK (2001). "Проапоптотическая функция кальсенилина/DREAM/KChIP3". FASEB J . 15 (3): 589– 91. doi : 10.1096/fj.00-0541fje . PMID 11259376. S2CID 37815129.
Choi EK, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (2001). «Кальсенилин является субстратом для каспазы-3, которая преимущественно взаимодействует с C-концевым фрагментом пресенилина 2, связанным с семейной болезнью Альцгеймера». J. Biol. Chem . 276 (22): 19197– 204. doi : 10.1074/jbc.M008597200 . PMID 11278424.
Osawa M, Tong KI, Lilliehook C, Wasco W, Buxbaum JD, Cheng HY, Penninger JM, Ikura M, Ames JB (2001). "Связывание ДНК, регулируемое кальцием, и олигомеризация нейронального белка, чувствительного к кальцию, кальсенилина/DREAM/KChIP3". J. Biol. Chem . 276 (44): 41005– 13. doi : 10.1074/jbc.M105842200 . PMID 11535596.
Ченг Х.И., Питчер Г.М., Лавиолетт С.Р., Уишоу IQ, Тонг К.И., Кокеритц Л.К., Вада Т., Джоза Н.А., Краковер М., Гонсалвес Дж., Сароси И., Вуджетт Дж.Р., Оливейра-дос-Сантос А.Дж., Икура М., ван дер Кой Д., Солтер М.В., Пеннингер Дж.М. (2002). «DREAM является важным репрессором транскрипции для модуляции боли». Клетка . 108 (1): 31–43 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00629-8 . PMID 11792319. S2CID 16602843.
Lilliehook C, Chan S, Choi EK, Zaidi NF, Wasco W, Mattson MP, Buxbaum JD (2002). «Кальсенилин усиливает апоптоз, изменяя кальциевую сигнализацию эндоплазматического ретикулума». Mol. Cell. Neurosci . 19 (4): 552– 9. doi :10.1006/mcne.2001.1096. PMID 11988022. S2CID 42446025.
Такимото К, Янг ЕК, Конфорти Л (2002). «Пальмитоилирование вариантов сплайсинга KChIP необходимо для эффективной экспрессии каналов Kv4.3 на поверхности клеток». J. Biol. Chem . 277 (30): 26904– 11. doi : 10.1074/jbc.M203651200 . PMID 12006572.
Ledo F, Kremer L, Mellström B, Naranjo JR (2002). «Ca2+-зависимая блокировка транскрипции CREB–CBP репрессором DREAM». EMBO J . 21 (17): 4583– 92. doi :10.1093/emboj/cdf440. PMC 126180 . PMID 12198160.
Zaidi NF, Berezovska O, Choi EK, Miller JS, Chan H, Lilliehook C, Hyman BT, Buxbaum JD, Wasco W (2002). «Биохимическая и иммуноцитохимическая характеристика кальсенилина в мозге мышей». Neuroscience . 114 (1): 247– 63. doi :10.1016/S0306-4522(02)00251-8. PMID 12207970. S2CID 12738777.
Sanz C, Horita M, Fernandez-Luna JL (2004). «Fas-сигнализация и блокада киназы Bcr-Abl вызывают апоптотический белок Hrk посредством ингибирования DREAM в клетках лейкемии человека». Haematologica . 87 (9): 903–7 . PMID 12217801.
Schrader LA, Anderson AE, Mayne A, Pfaffinger PJ, Sweatt JD (2002). "PKA-модуляция Kv4.2-кодируемых калиевых каналов типа A требует образования супрамолекулярного комплекса". J. Neurosci . 22 (23): 10123– 33. doi :10.1523/JNEUROSCI.22-23-10123.2002. PMC 6758737 . PMID 12451113.
Hong YM, Jo DG, Lee MC, Kim SY, Jung YK (2003). «Сниженная экспрессия кальсенилина/DREAM/KChIP3 в мозге пациентов с эпилепсией и судорогами, вызванными каиновой кислотой». Neurosci. Lett . 340 (1): 33– 6. doi :10.1016/S0304-3940(03)00067-3. PMID 12648752. S2CID 10647796.
Shibata R, Misonou H, Campomanes CR, Anderson AE, Schrader LA, Doliveira LC, Carroll KI, Sweatt JD, Rhodes KJ, Trimmer JS (2003). "Фундаментальная роль KChIP в определении молекулярных свойств и трафика калиевых каналов Kv4.2". J. Biol. Chem . 278 (38): 36445– 54. doi : 10.1074/jbc.M306142200 . PMID 12829703.
Venn N, Haynes LP, Burgoyne RD (2008). «Специфические эффекты KChIP3/calsenilin/DREAM, но не KChIPs 1, 2 и 4, на кальциевую сигнализацию и регулируемую секрецию в клетках PC12». Biochem. J . 413 (1): 71– 80. doi :10.1042/BJ20080441. PMC 2474559 . PMID 18393943.

Внешние ссылки

KCNIP3+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
белки NCS

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCm38Ensembl-1] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000079056 – Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9771752-4] Buxbaum JD, Choi EK, Luo Y, Lilliehook C, Crowley AC, Merriam DE, Wasco W (октябрь 1998 г.). «Кальсенилин: связывающий кальций белок, который взаимодействует с пресенилинами и регулирует уровни фрагмента пресенилина». Nat Med . 4 (10): 1177– 81. doi :10.1038/2673. PMID 9771752. S2CID 10799492.

[pmid10078534-5] Carrión AM, Link WA, Ledo F, Mellström B, Naranjo JR (март 1999). "DREAM — это регулируемый Ca2+ транскрипционный репрессор". Nature . 398 (6722): 80– 4. Bibcode :1999Natur.398...80C. doi :10.1038/18044. PMID 10078534. S2CID 204991618.

[entrez-6] "Ген Entrez: белок 3, взаимодействующий с Kv-каналом KCNIP3, кальсенилин".

[pmid17311005-7] Burgoyne RD (2007). «Нейрональные кальциевые сенсорные белки: создание разнообразия в нейронной сигнализации Ca2+». Nat. Rev. Neurosci . 8 (3): 182– 193. doi :10.1038/nrn2093. PMC 1887812 . PMID 17311005.

[pmid15046879-8] Burgoyne RD, O'Callaghan DW, Hasdemir B, Haynes LP, Tepikin AV (2004). «Нейрональные белки-сенсоры Ca2+: многофункциональные регуляторы нейрональных функций». Trends Neurosci . 27 (4): 203– 9. doi :10.1016/j.tins.2004.01.010. PMID 15046879. S2CID 24156457.

[PMC4005385-9] Tiruppathi C, Soni D, Wang DM и др. (март 2014 г.). «Транскрипционный фактор DREAM подавляет A20 и опосредует воспаление». Nat Immunol . 15 (3): 239– 247. doi :10.1038/ni.2823. PMC 4005385. PMID 24487321 .

[pmid10854253-10] Kashiwa A, Yoshida H, Lee S, Paladino T, Liu Y, Chen Q, Dargusch R, Schubert D, Kimura H (июль 2000 г.). «Выделение и характеристика нового пресенилин-связывающего белка». J. Neurochem . 75 (1): 109– 16. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750109.x . PMID 10854253. S2CID 24838995.

[pmid11278424-11] Choi EK, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (июнь 2001 г.). «Кальсенилин является субстратом для каспазы-3, которая преимущественно взаимодействует с C-концевым фрагментом пресенилина 2, связанным с семейной болезнью Альцгеймера». J. Biol. Chem . 276 (22): 19197– 204. doi : 10.1074/jbc.M008597200 . PMID 11278424.