вирус Цзинмэнь
Группа вирусов

вирус Цзинмэнь
Классификация вирусов Редактировать эту классификацию
(без рейтинга):Вирус
Область :Рибовирус
Королевство:Орторнавирусы
Тип:Китриновирикота
Сорт:Фласувирицеты
Заказ:Амарилловирусные
Семья:Флавивирусы  (?)
(без рейтинга):вирус Цзинмэнь
Вирусы-участники

Вирус Цзинмэнь — это группа одноцепочечных РНК-вирусов с положительным смыслом и сегментированными геномами . Они в основном связаны с членистоногими и являются одними из двух известных вирусов с сегментированной РНК, которые заражают животных-хозяев. [1] [2] [3] Первый член группы, вирус клещей Цзинмэнь (JMTV), был описан в 2014 году. [4] Другой член, вирус Гуайко Кулекс (GCXV), имеет весьма необычную многокомпонентную архитектуру, в которой сегменты генома отдельно заключены в разные вирусные капсиды. [5]

Примеры

вирус клеща Цзинмэнь

Первый член группы был описан в 2014 году и назван вирусом клещей Цзинмэнь (JMTV), поскольку он был выделен из клеща, взятого в Цзинмэнь , Китай. [4] Это оболочечный сферический вирус, немного больший, чем его ближайшие вирусные родственники. Геном JMTV состоит из четырех сегментов, два из которых содержат гены с последовательностью, гомологичной неструктурным белкам, обнаруженным у флавивирусов , включая метилтрансферазу и РНК-зависимую РНК-полимеразу . Предполагаемые структурные белки в геноме JMTV не имеют известных гомологов. [4] Помимо идентификации у клещей, JMTV также был идентифицирован в небольших количествах у комаров, таких как Aedes albopictus . [6]

вирус Гуайко Кулекс

Вирус Guaico Culex (GCXV) был зарегистрирован в 2016 году после выделения из комаров Culex , обнаруженных около Гуайко , Тринидад. [5] Различные изоляты вируса имеют четыре или пять сегментов генома, хотя пятый не является необходимым для вирусной пролиферации. GCXV является многокомпонентным ( многокомпонентным ) вирусом, в котором каждый сегмент генома заключен в свой небольшой, оболочечный вирусный капсид . По крайней мере три сегмента генома, содержащие гены неструктурных белков и компонентов капсида, должны проникнуть в клетку, чтобы заразить ее и успешно воспроизвести вирус. [5] До открытия GMXV многокомпонентная архитектура ранее была описана только для вирусов, которые заражают растения и грибы , и никогда не наблюдалась в оболочечном вирусе. [1] [5]

Другие вирусы

Генетический материал, который, вероятно, принадлежит другим вирусам цзинмэнь, может быть идентифицирован с помощью биоинформатики . В некоторых случаях такие последовательности не были распознаны как вирусные или сегментированная природа генома не была распознана до описания JMTV. Например, было обнаружено, что зарегистрированный геном паразита собак Toxocara canis содержит последовательности с гомологией с JMTV, что, вероятно, представляет собой вирусную инфекцию у паразита, который был секвенирован. [4] [7] Вирус клеща Mogiana, впервые описанный в 2011 году, является похожим примером; его сегментированный геном не был распознан при первой публикации, но был повторно проанализирован и идентифицирован как вирус цзинмэнь в 2017 году. [8]

Последовательности с гомологией с JMTV также были выделены из красного колобуса , что предполагает возможность сегментированного, возможно, многокомпонентного вируса, способного инфицировать приматов. [5] Метагеномное исследование флавивирусов членистоногих выявило пять дополнительных примеров вероятных последовательностей вируса цзинмэнь. [9]

Эволюция

Вирусы Цзинмэнь связаны с флавивирусами , которые имеют несегментированные геномы, передаваемые в одном капсиде. Гомология постоянно наблюдалась между генами, кодирующими неструктурные белки вирусов Цзинмэнь и флавивирусов, включая РНК-зависимую РНК-полимеразу . Однако геномная архитектура гомологичных генов значительно различается; канонический геном флавивируса состоит из одной открытой рамки считывания (ORF), белковый продукт которой обрабатывается протеазами , тогда как неструктурные белки вируса Цзинмэнь кодируются в двух сегментах генома, каждый из которых содержит одну ORF. Хотя известно немного последовательностей вируса Цзинмэнь, состав генов сегментов генома, по-видимому, хорошо сохраняется. [4] [5] [9] Напротив, предполагаемые структурные белки вируса Цзинмэнь , которые, вероятно, составляют его капсиды , не имеют гомологии с известными белками. [4] [5]

Поразительно, что ближайшие известные родственники сегментированных вирусов цзинмэнь не сегментированы. [1] [2] Эволюционные механизмы, лежащие в основе сегментации генома и особенно многокомпонентной архитектуры, плохо изучены. Хотя сегментированные геномы, по-видимому, эволюционировали несколько раз в вироме , эволюционный механизм, лежащий в основе этой структуры, неясен. [10] [11] Аналогично, неясно, является ли многокомпонентная архитектура отдельной эволюционной стратегией или артефактом механизма сегментации, возможно, через образование дефектных интерферирующих частиц . [1] [10]

Ссылки

  1. ^ abcd Холмс, Эдвард С. (сентябрь 2016 г.). «Расширяющаяся виросфера». Cell Host & Microbe . 20 (3): 279– 280. doi : 10.1016/j.chom.2016.08.007 . PMID  27631697.
  2. ^ ab Attar, Naomi (6 сентября 2016 г.). «Вирусы животных в деталях». Nature Reviews Microbiology . 14 (10): 606–7 . doi : 10.1038/nrmicro.2016.133 . PMID  27595788.
  3. ^ Михалакис, Яннис (сентябрь 2020 г.). «Любопытная стратегия многокомпонентных вирусов» (PDF) . Ежегодный обзор вирусологии . 7 (1): 203–218 . doi :10.1146/annurev-virology-010220-063346. PMID  32991271. S2CID  222161056.
  4. ^ abcdef Qin, X.-C.; Shi, M.; Tian, ​​J.-H.; Lin, X.-D.; Gao, D.-Y.; He, J.-R.; Wang, J.-B.; Li, C.-X.; Kang, Y.-J.; Yu, B.; Zhou, D.-J.; Xu, J.; Plyusnin, A.; Holmes, EC ; Zhang, Y.-Z. (21 апреля 2014 г.). «Клещевой сегментированный РНК-вирус содержит геномные сегменты, полученные от несегментированных вирусных предков». Труды Национальной академии наук . 111 (18): 6744– 6749. Bibcode :2014PNAS..111.6744Q. doi : 10.1073/pnas.1324194111 . PMC 4020047. PMID 24753611  . 
  5. ^ abcdefg Ладнер, Джейсон Т.; Уайли, Майкл Р.; Бейтцель, Бретт; Огюст, Альберт Дж.; Дюпюи, Алан П.; Линдквист, Майкл Э.; Сибли, Сэмюэл Д.; Кота, Кришна П.; Феттерер, Дэвид; Иствуд, Джиллиан; Киммел, Дэвид; Прието, Карла; Гузман, Хильда; Алиота, Мэтью Т.; Рейес, Дэниел; Брюггеманн, Эрнст Э.; Святой Иоанн, Лена; Хероба, Дэвид; Лаук, Майкл; Фридрих, Томас К.; О'Коннор, Дэвид Х.; Гестоле, Мари К.; Казарес, Лиза Х.; Попов Всеволод Л.; Кастро-Льянос, Фанни; Кохель, Тадеуш Дж.; Кенни, Тара; Уайт, Бейли; Уорд, Майкл Д.; Лоаиса, Хосе Р.; Голдберг, Тони Л.; Уивер, Скотт К.; Крамер, Лора Д.; Теш, Роберт Б.; Паласиос, Густаво (сентябрь 2016 г.). «Многокомпонентный вирус животных, выделенный из комаров». Cell Host & Microbe . 20 (3): 357– 367. doi :10.1016/j.chom.2016.07.011. PMC 5025392 . PMID  27569558. 
  6. ^ Parry R, ​​James ME, Asgari S (2021). «Раскрытие всемирного разнообразия и эволюции вирома комаров Aedes aegypti и Aedes albopictus». Микроорганизмы . 9 (8): 1653. doi : 10.3390/microorganisms9081653 . PMC 8398489. PMID  34442732 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  7. ^ Tetteh, KK; Loukas, A; Tripp, C; Maizels, RM (сентябрь 1999 г.). «Идентификация обильно экспрессируемых новых и консервативных генов из инфекционной личиночной стадии Toxocara canis с помощью стратегии экспрессируемой последовательности меток». Инфекция и иммунитет . 67 (9): 4771– 9. doi :10.1128/IAI.67.9.4771-4779.1999. PMC 96808. PMID  10456930. 
  8. ^ Вилла, Эрика С.; Маруяма, Сандра Р.; де Миранда-Сантос, Изабель КФ; Паласиос, Густаво; Ладнер, Джейсон Т. (4 мая 2017 г.). «Полная кодирующая последовательность генома для вируса клещей Mogiana, вируса Jingmen, выделенного из клещей в Бразилии». Genome Announcements . 5 (18): e00232–17. doi :10.1128/genomeA.00232-17. PMC 5477184 . PMID  28473376. 
  9. ^ ab Shi, Mang; Lin, Xian-Dan; Vasilakis, Nikos; Tian, ​​Jun-Hua; Li, Ci-Xiu; Chen, Liang-Jun; Eastwood, Gillian; Diao, Xiu-Nian; Chen, Ming-Hui; Chen, Xiao; Qin, Xin-Cheng; Widen, Steven G.; Wood, Thomas G.; Tesh, Robert B.; Xu, Jianguo; Holmes, Edward C .; Zhang, Yong-Zhen ; Ou, J.-HJ (15 января 2016 г.). «Дивергентные вирусы, обнаруженные у членистоногих и позвоночных, пересматривают эволюционную историю флавивирусов и родственных вирусов». Журнал вирусологии . 90 (2): 659–669 . doi :10.1128/JVI.02036-15. ПМК 4702705 . ПМИД  26491167. 
  10. ^ ab Lucía-Sanz, Adriana; Manrubia, Susanna (9 ноября 2017 г.). «Многокомпонентные вирусы: адаптивный трюк или эволюционное угощение?». npj Systems Biology and Applications . 3 (1): 34. doi :10.1038/s41540-017-0035-y. PMC 5680193. PMID  29263796 . 
  11. ^ Сикард, Энн; Михалакис, Яннис; Гутьеррес, Серафин; Блан, Стефан; Хобман, Том С. (3 ноября 2016 г.). «Странный образ жизни многочленных вирусов». ПЛОС Патогены . 12 (11): e1005819. дои : 10.1371/journal.ppat.1005819 . ПМК 5094692 . ПМИД  27812219. 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Jingmenvirus&oldid=1240732887"