Интерферон Лямбда 3
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ИФНЛ3
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыIFNL3 , IL-28B, IL28B, IL28C, интерлейкин 28B, интерферон, лямбда 3, интерферон лямбда 3, IFN-лямбда-3, IFN-лямбда-4, IL-28C
Внешние идентификаторыОМИМ : 607402; МГИ : 2450574; гомологен : 77540; GeneCards : IFNL3; OMA :IFNL3 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

282617

338374

Ансамбль

ENSG00000197110

ENSMUSG00000060747

UniProt

Q8IZI9

Q8CGK6

РефСек (мРНК)

NM_172139
NM_001346937

NM_177396

RefSeq (белок)

NP_001333866
NP_742151

NP_796370

Местоположение (UCSC)Хр 19: 39.24 – 39.25 МбХр 7: 28.22 – 28.22 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Интерферон лямбда 3 (символ гена: IFNL3) кодирует белок IFNL3. IFNL3 ранее назывался IL28B , но Комитет по номенклатуре генов Организации генома человека переименовал этот ген в 2013 году, одновременно дав название недавно открытому тогда гену IFNL4 . [5] Вместе с IFNL1 (ранее IL29 ) и IFNL2 (ранее IL28A ) эти гены лежат в кластере на хромосомном участке 19q13. IFNL3 разделяет ~96% аминокислотной идентичности с IFNL2, ~80% идентичности с IFNL1 и ~30% идентичности с IFNL4.

Гены интерферона лямбда кодируют цитокины , классифицируемые как интерфероны типа III , которые отдаленно связаны с интерферонами типа I и семейством IL-10 . Интерфероны типа III индуцируются вирусной инфекцией и взаимодействуют с гетеродимерным рецептором цитокинов класса II, который состоит из рецептора интерлейкина 10, бета (IL10RB) и рецептора интерферона лямбда 1 (IFNLR1) для передачи сигнала через противовирусный путь JAK-STAT. [предоставлено RefSeq , июль 2008 г.].

Гепатит С

В 2009 году (т. е. до открытия IFNL4 ) результаты исследований ассоциаций по всему геному (GWAS) показали, что однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), лежащие рядом с IFNL3 (rs12979860, rs8099917 и другие), были тесно связаны с ответом на лечение пегилированным интерфероном-α и рибавирином хронического гепатита С, [6] [7] [8] [9], а также со спонтанным очищением от инфекции гепатита С (HCV). [10] [11] [12] [13] Ген, тогда известный как IL28B (теперь IFNL3), был ближайшим известным геном в то время, поэтому эти генетические варианты были названы « вариантами IL28B ». Предполагалось, что наблюдаемые ассоциации отражают различия в структуре или регуляции этого гена. Однако открытие IFNL4 показало, что SNP rs12979860 расположен в интроне 1 IFNL4 , тогда как rs8099917 лежит в межгенной области , но ближе всего к IFNL4. [5]   SNP rs12979860 и rs8099917 находятся в сильном неравновесии сцепления с вариантом IFNL4 ( IFNL4- ΔG/TT; rs368234815), который контролирует генерацию белка IFNL4. [5] IFNL4- ΔG/TT, по-видимому, является функциональным полиморфизмом, который объясняет ассоциации GWAS близлежащих SNP с клиренсом HCV, и было показано, что IFNL4- ΔG/TT имеет более сильную статистическую связь с клиренсом HCV, чем rs12979860, особенно в популяциях африканского происхождения, в которых неравновесное сцепление между этими вариантами слабее, чем в других популяциях. [5] [14]

Одним из возможных функциональных вариантов в IFNL3 является SNP rs4803217, который находится в 3'-нетранслируемой регуляторной области . Замена гуанина на предковый тимин в этом сайте увеличивает экспрессию мРНК IFNL3 за счет снижения деградации мРНК и связывания микроРНК, вызванного ВГС [15], и изменяет структуру РНК. [16] [11] Между rs4803217 и вариантом IFNL4- ΔG/TT существует высокое неравновесие сцепления . [5] Было показано, что rs4803217 ассоциируется с клиренсом ВГС, [16] однако эта ассоциация, по-видимому, обусловлена ​​неравновесием сцепления с IFNL4- ΔG/TT, а не прямым функциональным эффектом самого SNP rs4803217.

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197110 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000060747 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ abcde Prokunina-Olsson L, Muchmore B, Tang W, Pfeiffer RM, Park H, Dickensheets H и др. (февраль 2013 г.). «Вариант выше по течению IFNL3 (IL28B), создающий новый ген интерферона IFNL4, связан с нарушенным очищением от вируса гепатита С». Nature Genetics . 45 (2): 164– 71. doi :10.1038/ng.2521. PMC 3793390 . PMID  23291588. 
  6. ^ Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ и др. (сентябрь 2009 г.). «Генетическая вариация IL28B предсказывает вирусный клиренс, вызванный лечением гепатита C». Nature . 461 (7262): 399– 401. Bibcode :2009Natur.461..399G. doi :10.1038/nature08309. PMID  19684573. S2CID  1707096.
  7. ^ Suppiah V, Moldovan M, Ahlenstiel G, Berg T, Weltman M, Abate ML и др. (октябрь 2009 г.). «IL28B связан с ответом на терапию хронического гепатита C интерфероном-альфа и рибавирином». Nature Genetics . 41 (10): 1100– 4. doi :10.1038/ng.447. PMID  19749758. S2CID  21619093.
  8. ^ Tanaka Y, Nishida N, Sugiyama M, Kurosaki M, Matsuura K, Sakamoto N и др. (октябрь 2009 г.). «Геномная ассоциация IL28B с ответом на терапию пегилированным интерфероном-альфа и рибавирином при хроническом гепатите C». Nature Genetics . 41 (10): 1105– 9. doi :10.1038/ng.449. PMID  19749757. S2CID  20399078.
  9. ^ Muir AJ, Gong L, Johnson SG, Lee MT, Williams MS, Klein TE и др. (февраль 2014 г.). «Руководство Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC) для генотипа IFNL3 (IL28B) и схем на основе интерферона-α ПЭГ». Клиническая фармакология и терапия . 95 (2): 141– 6. doi :10.1038/clpt.2013.203. PMC 3904555. PMID  24096968 . 
  10. ^ Thomas DL, Thio CL, Martin MP, Qi Y, Ge D, O'Huigin C и др. (2009). «Генетическая изменчивость IL28B и спонтанное очищение от вируса гепатита C». Nature . 461 (7265): 798– 801. Bibcode :2009Natur.461..798T. doi :10.1038/nature08463. PMC 3172006 . PMID  19759533. 
  11. ^ ab Salum GM, Dawood RM, Abd El-Meguid M, Ibrahim NE, Abdel Aziz AO, El Awady MK (сентябрь 2020 г.). «Корреляция между генетическими вариантами IL28B/TLR4 и развитием ГЦК с/без лечения прямыми антиретровирусными препаратами у пациентов с хроническим гепатитом С». Genes & Diseases . 7 (3): 392– 400. doi : 10.1016/j.gendis.2019.05.004 . PMC 7452484 . PMID  32884993. 
  12. ^ Томас Д.Л., Тио К.Л., Мартин М.П., ​​Ци Ю, Ге Д., О'Хуигин С. и др. (октябрь 2009 г.). «Генетическая вариация IL28B и спонтанное клиренс вируса гепатита С». Природа . 461 (7265): 798–801 . Бибкод : 2009Natur.461..798T. дои : 10.1038/nature08463. ПМК 3172006 . ПМИД  19759533. 
  13. ^ Rauch A, Kutalik Z, Descombes P, Cai T, Di Iulio J, Mueller T и др. (апрель 2010 г.). «Генетическая вариация IL28B связана с хроническим гепатитом C и неэффективностью лечения: исследование ассоциаций по всему геному». Гастроэнтерология . 138 (4): 1338– 45, 1345.e1-7. doi : 10.1053/j.gastro.2009.12.056. PMID  20060832. S2CID  25546833.
  14. ^ Lu YF, Goldstein DB, Urban TJ, Bradrick SS (февраль 2015 г.). «Интерферон-λ4 — это клеточно-автономный интерферон III типа, связанный с бременем вируса гепатита С до начала лечения». Вирусология . 476 : 334–340 . doi : 10.1016/j.virol.2014.12.020. PMC 4494652. PMID  25577150. 
  15. ^ McFarland AP, Horner SM, Jarret A, Joslyn RC, Bindewald E, Shapiro BA и др. (январь 2014 г.). «Благоприятный генотип IFNL3 избегает распада мРНК, опосредованного элементами, богатыми AU, и микроРНК, индуцированными вирусом гепатита C». Nature Immunology . 15 (1): 72– 9. doi :10.1038/ni.2758. PMC 4183367 . PMID  24241692. 
  16. ^ ab Lu YF, Mauger DM, Goldstein DB, Urban TJ, Weeks KM, Bradrick SS (ноябрь 2015 г.). «Структура мРНК IFNL3 ремоделируется функциональным некодирующим полиморфизмом, связанным с клиренсом вируса гепатита C». Scientific Reports . 5 : 16037. Bibcode :2015NatSR...516037L. doi : 10.1038/srep16037 . PMC 4631997 . PMID  26531896. 

Дальнейшее чтение

  • Sheppard P, Kindsvogel W, Xu W, Henderson K, Schlutsmeyer S, Whitmore TE и др. (январь 2003 г.). "IL-28, IL-29 и их цитокиновый рецептор II класса IL-28R". Nature Immunology . 4 (1): 63– 8. doi :10.1038/ni873. PMID  12469119. S2CID  35764259.
  • Котенко СВ, Галлахер Г, Баурин ВВ, Льюис-Антес А, Шен М, Шах НК и др. (январь 2003 г.). «IFN-лямбда опосредует противовирусную защиту через отдельный комплекс цитокиновых рецепторов II класса». Nature Immunology . 4 (1): 69– 77. doi :10.1038/ni875. PMID  12483210. S2CID  2734534.
  • Ли М, Хе С (апрель 2006 г.). «Очистка и характеристика рекомбинантного человеческого интерлейкина-29, экспрессированного в Escherichia coli». Журнал биотехнологии . 122 (3): 334– 40. doi :10.1016/j.jbiotec.2005.11.019. PMID  16413080.
  • Mennechet FJ, Uzé G (июнь 2006 г.). «Дендритные клетки, обработанные лямбда-интерфероном, специфически индуцируют пролиферацию FOXP3-экспрессирующих супрессорных Т-клеток». Blood . 107 (11): 4417– 23. doi : 10.1182/blood-2005-10-4129 . PMID  16478884.
  • Li MC, Wang HY, Wang HY, Li T, He SH (апрель 2006 г.). «Липосомально-опосредованная экспрессия IL-28 и IL-29 в клетках A549 и противовирусный эффект IL-28 и IL-29 на клетки WISH». Acta Pharmacologica Sinica . 27 (4): 453– 9. doi : 10.1111/j.1745-7254.2006.00292.x . PMID  16539846.
  • Lasfar A, Lewis-Antes A, Smirnov SV, Anantha S, Abushahba W, Tian B и др. (апрель 2006 г.). «Характеристика системы лиганд-рецептор IFN-лямбда у мышей: IFN-лямбда проявляют противоопухолевую активность против меланомы B16». Cancer Research . 66 (8): 4468– 77. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-3653 . PMID  16618774.
  • Dellgren C, Gad HH, Hamming OJ, Melchjorsen J, Hartmann R (март 2009 г.). «Человеческий интерферон-лямбда3 является мощным членом семейства интерферонов типа III». Гены и иммунитет . 10 (2): 125–31 . doi : 10.1038/gene.2008.87 . PMID  18987645.
  • Li M, Liu X, Zhou Y, Su SB (июль 2009 г.). «Интерферон-лямбда: модуляторы антивирусных, противоопухолевых и иммунных реакций». Журнал биологии лейкоцитов . 86 (1): 23– 32. doi : 10.1189/jlb.1208761 . PMID  19304895. S2CID  37741272.
  • Gad HH, Dellgren C, Hamming OJ, Vends S, Paludan SR, Hartmann R (июль 2009 г.). «Интерферон-лямбда функционально является интерфероном, но структурно связан с семейством интерлейкина-10». Журнал биологической химии . 284 (31): 20869– 75. doi : 10.1074/jbc.M109.002923 . PMC  2742852. PMID  19457860 .
  • Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ и др. (сентябрь 2009 г.). «Генетическая вариация IL28B предсказывает вирусную элиминацию, вызванную лечением гепатита C». Nature . 461 (7262): 399– 401. Bibcode :2009Natur.461..399G. doi :10.1038/nature08309. PMID  19684573. S2CID  1707096.
Значок заглушки

Эта статья о гене на хромосоме 19 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Interferon_Lambda_3&oldid=1113059678"