ИРФ1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

ИРФ1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыIRF1 , IRF-1, MAR, фактор регуляции интерферона 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 147575; МГИ : 96590; Гомологен : 1658; Генные карты : IRF1; OMA :IRF1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_002198

НМ_001159393
НМ_001159396
НМ_008390

RefSeq (белок)

НП_002189
НП_001341853
НП_001341854

НП_001152865
НП_001152868
НП_032416

Местоположение (UCSC)н/дХр 11: 53,66 – 53,67 Мб
Поиск в PubMed[2][3]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Фактор регуляции интерферона 1 — это белок , который у людей кодируется геном IRF1 . [ 4] [5]

Функция

Фактор регуляции интерферона 1 был первым идентифицированным членом семейства факторов регуляции транскрипции интерферона (IRF). Первоначально описанный как фактор транскрипции, способный активировать экспрессию цитокина интерферона бета [6] , IRF-1 впоследствии показал себя как транскрипционный активатор или репрессор различных целевых генов. IRF-1 регулирует экспрессию целевых генов путем связывания с элементом ответа, стимулируемым интерфероном (ISRE) в их промоторах . Белок IRF-1 связывается с ISRE через N-концевой домен связывания ДНК спираль-поворот-спираль [7] , который является высококонсервативным среди всех белков IRF.

Помимо своей функции фактора транскрипции, IRF-1 также трансактивирует белок-супрессор опухолей p53 посредством привлечения его кофактора p300 . [8]

Было показано, что IRF-1 играет роль в иммунном ответе , регулируя апоптоз , повреждение ДНК и подавление опухолей . [9]

Регулирование

Было показано, что крайний C-конец IRF-1 регулирует его способность активировать транскрипцию, нанотела, нацеленные на этот домен (MF1), способны повышать активность IRF-1. [10]

Взаимодействия

Было показано, что IRF1 взаимодействует с:

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000018899 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Маруяма М., Фудзита Т., Танигучи Т. (июнь 1989 г.). "Последовательность кДНК, кодирующая человеческий IRF-1". Nucleic Acids Res . 17 (8): 3292. doi :10.1093/nar/17.8.3292. PMC 317732. PMID  2726461 . 
  5. ^ Itoh S, Harada H, Nakamura Y, White R, Taniguchi T (ноябрь 1991 г.). «Присвоение гена человеческого фактора регуляции интерферона-1 (IRF1) хромосоме 5q23-q31». Genomics . 10 (4): 1097– 9. doi :10.1016/0888-7543(91)90208-V. PMID  1680796.
  6. ^ Миямото М, Фудзита Т, Кимура Y, Маруяма М, Харада Х, Судо Y и др. (сентябрь 1988 г.). «Регулируемая экспрессия гена, кодирующего ядерный фактор IRF-1, который специфически связывается с регуляторными элементами гена IFN-бета». Cell . 54 (6): 903– 13. doi :10.1016/S0092-8674(88)91307-4. PMID  3409321. S2CID  35063951.
  7. ^ Эскаланте CR, Йе Дж, Танос Д, Аггарвал АК (январь 1998 г.). «Структура IRF-1 со связанной ДНК раскрывает детерминанты регуляции интерферона». Nature . 391 (6662): 103– 6. Bibcode :1998Natur.391..103E. doi :10.1038/34224. PMID  9422515. S2CID  4394514.
  8. ^ Dornan D, Eckert M, Wallace M, Shimizu H, Ramsay E, Hupp TR и др. (ноябрь 2004 г.). «Связывание регуляторного фактора интерферона 1 с p300 стимулирует ДНК-зависимое ацетилирование p53». Mol. Cell. Biol . 24 (22): 10083– 98. doi :10.1128 / MCB.24.22.10083-10098.2004. PMC 525491. PMID  15509808. 
  9. ^ "Ген Энтреза: фактор регуляции интерферона IRF1 1".
  10. ^ Möller A, Pion E, Narayan V, Ball KL (декабрь 2010 г.). «Внутриклеточная активация регуляторного фактора интерферона-1 нанотелами в многофункциональном домене (Mf1)». J. Biol. Chem . 285 (49): 38348– 61. doi : 10.1074/jbc.M110.149476 . PMC 2992268. PMID  20817723 . 
  11. ^ Narayan V, Pion E, Landré V, Müller P, Ball KL (октябрь 2010 г.). «Зависимое от стыковки убиквитинирование белка-супрессора опухолей интерферонового регуляторного фактора-1 с помощью убиквитинлигазы CHIP». J Biol Chem . 286 (1): 607–19 . doi : 10.1074/jbc.M110.153122 . PMC 3013021. PMID  20947504 . 
  12. ^ Kular RK, Yehiely F, Kotlo KU, Cilensek ZM, Bedi R, Deiss LP (октябрь 2009 г.). "GAGE, антиапоптотический белок связывает и модулирует экспрессию нуклеофосмина/B23 и регуляторного фактора интерферона 1". J. Interferon Cytokine Res . 29 (10): 645–55 . doi :10.1089/jir.2008.0099. PMID  19642896.
  13. ^ Narayan V, Eckert M, Zylicz A, Zylicz M, Ball KL (сентябрь 2009 г.). «Кооперативная регуляция белка-супрессора опухолей интерферонового регуляторного фактора-1 основными компонентами молекулярного шаперонового аппарата». J Biol Chem . 284 (38): 25889– 99. doi : 10.1074/jbc.M109.019505 . PMC 2757990. PMID  19502235 . 
  14. ^ Schaper F, Kirchhoff S, Posern G, Köster M, Oumard A, Sharf R и др. (октябрь 1998 г.). «Функциональные домены регуляторного фактора интерферона I (IRF-1)». Biochem. J . 335 (1): 147–57 . doi :10.1042/bj3350147. PMC 1219763 . PMID  9742224. 
  15. ^ Sharf R, Azriel A, Lejbkowicz F, Winograd SS, Ehrlich R, Levi BZ (июнь 1995 г.). "Анализ функционального домена белка, связывающего консенсусную последовательность интерферона (ICSBP), и его связь с факторами регуляции интерферона". J. Biol. Chem . 270 (22): 13063– 9. doi : 10.1074/jbc.270.22.13063 . PMID  7768900.
  16. ^ Umegaki N, Tamai K, Nakano H, Moritsugu R, Yamazaki T, Hanada K и др. (июнь 2007 г.). «Дифференциальная регуляция экспрессии кариоферина альфа 2 TGF-beta1 и IFN-gamma в нормальных человеческих эпидермальных кератиноцитах: очевидный вклад KPNA2 в ядерную транслокацию IRF-1». J. Invest. Dermatol . 127 (6): 1456– 64. doi : 10.1038/sj.jid.5700716 . PMID  17255955.
  17. ^ Negishi H, Fujita Y, Yanai H, Sakaguchi S, Ouyang X, Shinohara M и др. (октябрь 2006 г.). «Доказательства лицензирования фактора транскрипции IFN-gamma-induced IFN regulator factor 1 компанией MyD88 в программе индукции генов, зависимых от Toll-like рецепторов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (41): 15136– 41. Bibcode : 2006PNAS..10315136N. doi : 10.1073/pnas.0607181103 . PMC 1586247. PMID  17018642 . 
  18. ^ Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (март 1999). "Ацетилаза гистонов PCAF является индуцируемым форболовым эфиром коактиватором семейства IRF, который обеспечивает повышенную чувствительность к интерферону". Mol . Cell. Biol . 19 (3): 1810– 20. doi :10.1128/MCB.19.3.1810. PMC 83974. PMID  10022868. 
  19. ^ Чаттерджи-Кишор М., ван ден Аккер Ф., Старк ГР. (июль 2000 г.). «Аденовирус E1A подавляет транскрипцию LMP2, вмешиваясь в связывание stat1 с IRF1». J. Biol. Chem . 275 (27): 20406– 11. doi : 10.1074/jbc.M001861200 . PMID  10764778.
  20. ^ Sgarbanti M, Borsetti A, Moscufo N, Bellocchi MC, Ridolfi B, Nappi F и др. (май 2002 г.). «Модуляция репликации вируса иммунодефицита человека 1 с помощью факторов регуляции интерферона». J. Exp. Med . 195 (10): 1359–70 . doi :10.1084/jem.20010753. PMC 2193759. PMID  12021315 . 
  21. ^ Lee JH, Chun T, Park SY, Rho SB (сентябрь 2008 г.). «Фактор регуляции интерферона-1 (IRF-1) регулирует ангиогенез, индуцированный VEGF, в HUVEC». Biochim. Biophys. Acta . 1783 (9): 1654– 62. doi : 10.1016/j.bbamcr.2008.04.006 . PMID  18472010.
  22. ^ Gupta M, Rath PC (апрель 2014 г.). «Фактор регуляции интерферона-1 (IRF-1) взаимодействует с регулируемым фактором развития и ответом на повреждение ДНК 2 (REDD2) в цитоплазме клеток костного мозга мышей». Международный журнал биологических макромолекул . 65 : 41– 50. doi : 10.1016/j.ijbiomac.2014.01.005. PMID  24412152.

Дальнейшее чтение

  • Harada H, Taniguchi T, Tanaka N (1999). «Роль факторов регуляции интерферона в системе интерферона и контроле роста клеток». Biochimie . 80 ( 8– 9): 641– 50. doi :10.1016/S0300-9084(99)80017-0. PMID  9865486.
  • Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L и др. (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирус-опосредованной сигнализации и регуляции роста клеток». Biochimie . 80 ( 8– 9): 651– 8. doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . PMID  9865487.
  • Ю-Ли Л (2002). «Стимуляция фактора регуляции интерферона-1 пролактином». Lupus . 10 (10): 691– 9. doi :10.1191/096120301717164921. PMID  11721695. S2CID  13547888.
  • Pine R (2002). «IRF и туберкулез». J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 15– 25. doi :10.1089/107999002753452629. PMID  11846972.
  • Ромео Дж., Фиоруччи Дж., Кьянторе М.В., Перкарио З.А., Ваннукки С., Аффабрис Э. (2002). «IRF-1 как негативный регулятор пролиферации клеток». J. Интерферон Цитокин Рез . 22 (1): 39–47 . дои : 10.1089/107999002753452647. ПМИД  11846974.
  • Cha Y, Sims SH, Romine MF, Kaufmann M, Deisseroth AB (1992). "Человеческий фактор регуляции интерферона 1: интронно-экзонная организация". DNA Cell Biol . 11 (8): 605– 11. doi :10.1089/dna.1992.11.605. PMID  1382447.
  • Harada H, Fujita T, Miyamoto M, Kimura Y, Maruyama M, Furia A и др. (1989). «Структурно схожие, но функционально различные факторы, IRF-1 и IRF-2, связываются с теми же регуляторными элементами IFN и IFN-индуцируемых генов». Cell . 58 (4): 729– 39. doi :10.1016/0092-8674(89)90107-4. PMID  2475256. S2CID  2033941.
  • Миямото М., Фудзита Т., Кимура Й., Маруяма М., Харада Х., Судо Й. и др. (1988). «Регулируемая экспрессия гена, кодирующего ядерный фактор IRF-1, который специфически связывается с регуляторными элементами гена IFN-бета». Cell . 54 (6): 903– 13. doi :10.1016/S0092-8674(88)91307-4. PMID  3409321. S2CID  35063951.
  • Harada H, Takahashi E, Itoh S, Harada K, Hori TA, Taniguchi T (1994). "Структура и регуляция генов человеческого фактора регуляции интерферона 1 (IRF-1) и IRF-2: значение для сети генов в системе интерферона". Mol. Cell. Biol . 14 (2): 1500– 9. doi :10.1128/MCB.14.2.1500. PMC  358505. PMID  7507207 .
  • Sharf R, Azriel A, Lejbkowicz F, Winograd SS, Ehrlich R, Levi BZ (1995). "Анализ функционального домена белка, связывающего консенсусную последовательность интерферона (ICSBP), и его связь с факторами регуляции интерферона". J. Biol. Chem . 270 (22): 13063– 9. doi : 10.1074/jbc.270.22.13063 . PMID  7768900.
  • Willman CL, Sever CE, Pallavicini MG, Harada H, Tanaka N, Slovak ML и др. (1993). «Делеция IRF-1, картирующая хромосому 5q31.1, при лейкемии человека и прелейкемической миелодисплазии». Science . 259 (5097): 968– 71. Bibcode :1993Sci...259..968W. doi :10.1126/science.8438156. PMID  8438156. S2CID  40142541.
  • Drew PD, Franzoso G, Becker KG, Bours V, Carlson LM, Siebenlist U и др. (1997). «NF kappa B и регуляторный фактор интерферона 1 физически взаимодействуют и синергически вызывают экспрессию гена главного класса гистосовместимости I». J. Interferon Cytokine Res . 15 (12): 1037– 45. doi :10.1089/jir.1995.15.1037. PMID  8746784.
  • Ronco LV, Karpova AY, Vidal M, Howley PM (1998). "Онкопротеин E6 вируса папилломы человека 16 связывается с регуляторным фактором интерферона-3 и подавляет его транскрипционную активность". Genes Dev . 12 (13): 2061– 72. doi :10.1101/gad.12.13.2061. PMC  316980. PMID  9649509 .
  • Nozawa H, Oda E, Ueda S, Tamura G, Maesawa C, Muto T и др. (1998). «Функционально инактивирующая точечная мутация в гене-супрессоре опухоли IRF-1, выявленная при раке желудка у человека». Int. J. Cancer . 77 (4): 522– 7. doi :10.1002/(SICI)1097-0215(19980812)77:4<522::AID-IJC8>3.0.CO;2-W. PMID  9679752. S2CID  25951704.
  • Schaper F, Kirchhoff S, Posern G, Köster M, Oumard A, Sharf R и др. (1998). "Функциональные домены регуляторного фактора интерферона I (IRF-1)". Biochem. J . 335 (1): 147–57 . doi :10.1042/bj3350147. PMC  1219763 . PMID  9742224.
  • Masumi A, Wang IM, Lefebvre B, Yang XJ, Nakatani Y, Ozato K (1999). "Ацетилаза гистонов PCAF является индуцируемым форболовым эфиром коактиватором семейства IRF, который обеспечивает повышенную чувствительность к интерферону". Mol. Cell. Biol . 19 (3): 1810– 20. doi :10.1128/MCB.19.3.1810. PMC  83974. PMID  10022868 .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=IRF1&oldid=1236139948"