ПЛА2Г6

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ПЛА2Г6
Идентификаторы
ПсевдонимыPLA2G6 , CaI-PLA2, GVI, INAD1, IPLA2-VIA, NBIA2, NBIA2A, NBIA2B, PARK14, PLA2, PNPLA9, iPLA2, iPLA2beta, фосфолипаза A2 группа VI
Внешние идентификаторыОМИМ : 603604; МГИ : 1859152; Гомологен : 2635; Генные карты : PLA2G6; OMA :PLA2G6 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

8398

53357

Ансамбль

ENSG00000184381

ENSMUSG00000042632

UniProt

О60733

Р97819

РефСек (мРНК)

NM_001199023
NM_001199024
NM_001199025
NM_016915

RefSeq (белок)

NP_001185952
NP_001185953
NP_001185954
NP_058611

Местоположение (UCSC)Хр 22: 38.11 – 38.21 МбХр 15: 79.29 – 79.33 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

85 кДа кальций-независимая фосфолипаза А2 , также известная как 85/88 кДа кальций-независимая фосфолипаза А2 , фосфолипаза группы VI A2 , внутриклеточная мембранно-ассоциированная кальций-независимая фосфолипаза А2 бета или белок 9, содержащий домен пататин-подобной фосфолипазы, представляет собой фермент , который у людей кодируется геном PLA2G6 . [ 5] [6] [7] [8] [9] [10]

Структура

Ген PLA2G6 расположен на плече p хромосомы 22 в позиции 13.1 и охватывает 80 605 пар оснований. [8] Ген PLA2G6 производит белок массой 18,6 кДа, состоящий из 166 аминокислот . [11] [12] Было показано, что структура полученного белка содержит мотив липазы и 8 анкириновых повторов . [5] В отличие от PLA2G6 грызунов, который, как известно, на 90% совпадает с последовательностью аминокислот человека, человеческий белок PLA2G6 содержит вставку из 54 остатков, которая кодирует богатую пролином область. Было показано, что эта вставка нарушает последний предполагаемый анкириновый повтор , а также функционирует как линкерная область, которая отделяет N-концевой домен связывания белка от C-концевого каталитического домена. [5] [13]

Функция

Ген PLA2G6 кодирует фермент фосфолипазу A2 , который является подклассом ферментов, катализирующих высвобождение жирных кислот из фосфолипидов . [8] Этот тип ферментов отвечает за расщепление (метаболизм) фосфолипидов . Метаболизм фосфолипидов необходим для многих процессов в организме, включая помощь в поддержании целостности клеточной мембраны .

В частности, фосфолипаза A2 , продуцируемая геном PLA2G6 , иногда называемая группой VI PLA2, помогает регулировать уровни соединения, называемого фосфатидилхолином , который в изобилии присутствует в клеточной мембране. [14] Кодируемый белок также может играть роль в ремоделировании фосфолипидов , высвобождении арахидоновой кислоты , высвобождении арахидоновой кислоты , вызванном оксидом азота или вазопрессином, а также в синтезе лейкотриенов и простагландинов , апоптозе , опосредованном рецептором Fas , и трансмембранном ионном потоке в стимулированных глюкозой В-клетках . [8] [9]

Кроме того, он играет роль в деацилировании кардиолипина (CL) и необходим как для скорости, так и для направленности хемотаксиса , индуцированного моноцитами MCP1/CCL2, посредством регуляции полимеризации F-актина в псевдоподиях . Изоформа анкирин-iPLA2-1 и изоформа анкирин-iPLA2-2, в которых отсутствует каталитический домен, вероятно, участвуют в отрицательной регуляции активности PLA2G6. [9] Было описано несколько вариантов транскриптов, кодирующих несколько изоформ , но на сегодняшний день определена полноразмерная природа только двух из них. [8]

Каталитическая активность

Фосфатидилхолин + H2O = 1-ацилглицерофосфохолин + карбоксилат. [10] [9]

Клиническое значение

Было показано, что мутации в PLA2G6 приводят к митохондриальным дефицитам и связанным с ними расстройствам, включая нейродегенерацию, связанную с PLA2G6 (PLAN), которая имеет несколько подтипов и также известна как нейродегенерация с накоплением железа в мозге типа 2 (NBIA2), другие формы заболевания также называются болезнью Паркинсона 14 (PARK14) и наследственной спастической параплегией . [15] [9] [10]

PLA2G6-ассоциированная нейродегенерация (PLAN)

PLA2G6-ассоциированная нейродегенерация (PLAN) — нейродегенеративное расстройство, связанное с накоплением железа в мозге, в первую очередь в базальных ганглиях . Характеризуется прогрессирующей экстрапирамидной дисфункцией, приводящей к ригидности, дистонии , дизартрии и сенсомоторным нарушениям. [9] [10] [16]

Детская нейроаксональная дистрофия (ИНАД)

Самая тяжелая форма называется инфантильная нейроаксональная дистрофия (INAD), также нейродегенерация с накоплением железа в мозге типа 2A (NBIA2A), и характеризуется патологическим аксональным отеком и сфероидными тельцами в центральной нервной системе . Начало в течение первых 2 лет жизни со смертью часто в возрасте 10 лет. [9] [10] [16]

Атипичная нейроаксональная дистрофия (атипичная НАД)

Более поздняя детская и более медленно прогрессирующая форма называется атипичной нейроаксональной дистрофией (атипичная НАД), а также нейродегенерацией с накоплением железа в мозге типа 2B (НБИА2Б). [16]

Заболевание, возникающее у взрослых, называемое дистонией-паркинсонизмом, связанным с PLA2G6, приводит к развитию дистонии и паркинсонизма после более раннего нормального развития и также вызывается биаллельными мутациями в PLA2G6 . [16]

Болезнь Паркинсона 14 (PARK14)

Болезнь Паркинсона 14 типа (PARK14) — прогрессирующее нейродегенеративное заболевание, возникающее у взрослых и характеризующееся паркинсонизмом, дистонией , тяжелым снижением когнитивных функций, церебральной и мозжечковой атрофией и отсутствием железа в базальных ганглиях при магнитно-резонансной томографии . [9] [10]

Наследственная спастическая параплегия

Наследственные спастические параплегии — это разнообразный класс наследственных дегенеративных заболеваний спинного мозга , характеризующихся медленной, постепенной, прогрессирующей слабостью и спастичностью (скованностью) ног. Первоначальные симптомы могут включать трудности с равновесием, слабость и скованность в ногах, мышечные спазмы и волочение пальцев ног при ходьбе. При некоторых формах расстройства могут появляться симптомы со стороны мочевого пузыря (например, недержание), или слабость и скованность могут распространяться на другие части тела. Скорость прогрессирования и тяжесть симптомов весьма различны. [17]

Другим заболеванием, связанным с мутациями в этом гене, является детская нейроаксональная дистрофия .

Взаимодействия

Было показано, что PLA2G6 взаимодействует с белками следующими соединениями. [18] [9]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000184381 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000042632 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ abc Larsson PK, Claesson HE, Kennedy BP (январь 1998). «Множественные варианты сплайсинга человеческой кальций-независимой фосфолипазы A2 и их влияние на активность фермента». Журнал биологической химии . 273 (1): 207–214 . doi : 10.1074/jbc.273.1.207 . PMID  9417066.
  6. ^ Wilson PA, Gardner SD, Lambie NM, Commans SA, Crowther DJ (сентябрь 2006 г.). «Характеристика семейства человеческих пататин-подобных фосфолипаз». Journal of Lipid Research . 47 (9): 1940–1949 . doi : 10.1194/jlr.M600185-JLR200 . PMID  16799181.
  7. ^ Kienesberger PC, Oberer M, Lass A, Zechner R (апрель 2009 г.). «Пататиновый домен млекопитающих, содержащий белки: семейство с разнообразной липолитической активностью, участвующее в нескольких биологических функциях». Journal of Lipid Research . 50 Suppl (Suppl): S63 – S68 . doi : 10.1194/jlr.R800082-JLR200 . PMC 2674697 . PMID  19029121.  
  8. ^ abcde "Ген Entrez: PLA2G6 фосфолипаза A2, группа VI (цитозольная, кальций-независимая)".Общественное достояниеВ данной статье использован текст из этого источника, находящегося в общественном достоянии .
  9. ^ abcdefghi "PLA2G6 - 85/88 кДа кальций-независимая фосфолипаза A2 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PLA2G6" . Получено 22.08.2018 . В данной статье используется текст, доступный по лицензии CC BY 4.0.
  10. ^ abcdef "UniProt: универсальная база знаний о белках". Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158 – D169 . Январь 2017. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID  27899622.  
  11. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS и др. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043– 1053. doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID  23965338 . 
  12. ^ "85/88 кДа кальций-независимая фосфолипаза A2". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) . Архивировано из оригинала 2018-08-23 . Получено 2018-08-23 .
  13. ^ Ma Z, Wang X, Nowatzke W, Ramanadham S, Turk J (апрель 1999 г.). «Человеческие панкреатические островки экспрессируют виды мРНК, кодирующие две различные каталитически активные изоформы фосфолипазы A2 группы VI (iPLA2), которые возникают из-за механизма пропуска экзонов альтернативного сплайсинга транскрипта из гена iPLA2 на хромосоме 22q13.1». Журнал биологической химии . 274 (14): 9607– 9616. doi : 10.1074/jbc.274.14.9607 . PMC 3715997. PMID  10092647 . 
  14. ^ "PLA2G6". Генетика Главная Справочник . NCBI.Общественное достояниеВ данной статье использован текст из этого источника, находящегося в общественном достоянии .
  15. ^ Ozes B, Karagoz N, Schüle R, Rebelo A, Sobrido MJ, Harmuth F, et al. (Ноябрь 2017 г.). «Мутации PLA2G6, связанные с непрерывным клиническим спектром от нейроаксональной дистрофии до наследственной спастической параплегии». Clinical Genetics . 92 (5): 534– 539. doi :10.1111/cge.13008. PMC 5597457 . PMID  28295203. 
  16. ^ abcd Gregory A, Kurian MA, Maher ER, Hogarth P, Hayflick SJ (1993). "PLA2G6-ассоциированная нейродегенерация". GeneReviews . Университет Вашингтона, Сиэтл. PMID  20301718. Получено 21 апреля 2022 г.
  17. ^ "Наследственная спастическая параплегия". www.uniprot.org .
  18. ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I и др. (декабрь 2012 г.). «MITRAC связывает транслокацию митохондриальных белков со сборкой дыхательной цепи и трансляционной регуляцией». Cell . 151 (7): 1528– 1541. doi : 10.1016/j.cell.2012.11.053 . hdl : 11858/00-001M-0000-000E-DDDF-4 . PMID  23260140.

Дальнейшее чтение

  • Schröder HC, Perovic S, Kavsan V, Ushijima H, Müller WE (1998). «Механизмы гибели нейрональных клеток, вызванной prionSc и HIV-1 gp120». Neurotoxicology . 19 ( 4–5 ): 683–688 . PMID  9745929.
  • Leslie CC (февраль 2004 г.). «Регулирование доступности арахидоновой кислоты для производства эйкозаноидов». Биохимия и клеточная биология . 82 (1): 1– 17. doi :10.1139/o03-080. PMID  15052324.
  • Turk J, Ramanadham S (октябрь 2004 г.). «Экспрессия и функция группы VIA кальций-независимой фосфолипазы A2 (iPLA2beta) в бета-клетках». Canadian Journal of Physiology and Pharmacology . 82 (10): 824– 832. doi :10.1139/y04-064. PMID  15573142.
  • Law MH, Cotton RG, Berger GE (июнь 2006 г.). «Роль фосфолипаз A2 при шизофрении». Молекулярная психиатрия . 11 (6): 547–556 . doi : 10.1038/sj.mp.4001819 . PMID  16585943.
  • Tang J, Kriz RW, Wolfman N, Shaffer M, Seehra J, Jones SS (март 1997). «Новая цитозольная кальций-независимая фосфолипаза A2 содержит восемь анкириновых мотивов». Журнал биологической химии . 272 ​​(13): 8567– 8575. doi : 10.1074/jbc.272.13.8567 . PMID  9079687.
  • Mavoungou E, Georges-Courbot MC, Poaty-Mavoungou V, Nguyen HT, Yaba P, Delicat A и др. (сентябрь 1997 г.). «Гликопротеины оболочки ВИЧ и SIV вызывают активацию фосфолипазы A2 в лимфоцитах человека и макаки». Журнал синдромов приобретенного иммунодефицита и ретровирусологии человека . 16 (1): 1– 9. doi : 10.1097/00042560-199709010-00001 . PMID  9377118.
  • Larsson Forsell PK, Kennedy BP, Claesson HE (июнь 1999). «Множественные ферменты гена человеческой кальций-независимой фосфолипазы A2 с различными свойствами из одного гена». European Journal of Biochemistry . 262 (2): 575–585 . doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00418.x . PMID  10336645.
  • Данхэм И., Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э. и др. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека». Природа . 402 (6761): 489–495 . Бибкод : 1999Natur.402..489D. дои : 10.1038/990031 . ПМИД  10591208.
  • Kim SJ, Gershov D, Ma X, Brot N, Elkon KB (сентябрь 2002 г.). «Активация I-PLA(2) во время апоптоза способствует воздействию мембранного лизофосфатидилхолина, что приводит к связыванию с естественными антителами иммуноглобулина М и активации комплемента». Журнал экспериментальной медицины . 196 (5): 655– 665. doi :10.1084/jem.20020542. PMC  2194002. PMID  12208880 .
  • Hichami A, Joshi B, Simonin AM, Khan NA (ноябрь 2002 г.). «Роль трех изоформ фосфолипазы A2 в емкостном притоке кальция в Т-клетки человека». European Journal of Biochemistry . 269 (22): 5557– 5563. doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03261.x . PMID  12423354.
  • Cummings BS, McHowat J, Schnellmann RG (март 2004 г.). «Роль Ca2+-независимой фосфолипазы A2 эндоплазматического ретикулума в апоптозе почечных клеток, вызванном цисплатином». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии . 308 (3): 921– 928. doi :10.1124/jpet.103.060541. PMID  14634037. S2CID  1036850.
  • Bao S, Jin C, Zhang S, Turk J, Ma Z, Ramanadham S (февраль 2004 г.). "Бета-клеточная кальций-независимая группа VIA фосфолипазы A(2) (iPLA(2)beta): отслеживание движений iPLA(2)beta в ответ на стимуляцию стимуляторами секреции инсулина в клетках INS-1". Диабет . 53 (90001, Suppl 1): S186 – S189 . doi :10.2337/diabetes.53.2007.S186. PMC  3761941 . PMID  14749286.
  • Танака Х., Минаками Р., Канайя Х., Сумимото Х. (август 2004 г.). «Каталитические остатки кальций-независимой фосфолипазы А2 группы VIB (iPLA2gamma)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 320 (4): 1284–1290 . doi :10.1016/j.bbrc.2004.05.225. ПМИД  15249229.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PLA2G6&oldid=1233083140"