Гигромицин В

Гигромицин В
Клинические данные
Торговые наименования	Гигромикс
Другие имена	O -6-амино-6-дезокси-L-глицеро-D-галакто-гептопиранозил-(1-2-3)-O -β -D-талопиранозил(1-5)-2-дезокси-N 3 -метил-D-стрептамин , HYG
AHFS / Drugs.com	Международные названия лекарств
код АТС	никто;
Идентификаторы
	Название ИЮПАК (3' R ,3a S ,4 S ,4' R , 5' R ,6 R ,6' R ,7 S ,7a S )-4-{[(1 R ,2 S ,3 R ,5 S ,6 R )-3-амино-2,6-дигидрокси-5-(метиламино)циклогексил]окси}-6'-[(1 S )-1-амино-2-гидроксиэтил]-6-(гидроксиметил)-тетрагидро-3a H -спиро[[1,3]диоксоло[4,5-c]пиран-2,2'-оксан]-3',4',5',7-тетрол;
Номер CAS	31282-04-9 И;
CID PubChem	35766;
ChemSpider	32900 И;
УНИИ	3XQ2233B0B;
ChEMBL	ChEMBL1276484 Н;
Панель инструментов CompTox ( EPA )	DTXSID7041045;
Информационная карта ECHA	100.045.935
Химические и физические данные
Формула	С20Н37Н3О13
Молярная масса	527,524 г·моль −1
3D модель ( JSmol )	Интерактивное изображение;
Температура плавления	160–180 °C (320–356 °F) (разл.)
	УЛЫБКИ O1[C@H]4[C@@H](OC12O[C@@H]([C@H](O)[C@@H](O)[C@H]2O)[C@@H](N)CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]4O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](N)C[C@H](NC)[C@H]3O)CO;
	ИнЧи ИнЧИ=1S/C20H37N3O13/c1-23-7-2-5(21)9(26)15(10(7)27)33-19-17-16(11(28)8(4-25)32- 19)35-20(36-17)18(31)13(30)12(29) 14(34-20)6(22)3-24/h5-19,23-31H,2-4,21-22H2,1H3/t5-,6+,7+,8-,9+,10-, 11+,12-,13-,14-,15-,16+,17+,18-,19+,20?/м1/с1 И; Ключ:GRRNUXAQVGOGFE-KPBUCVLVSA-N И;
	НИ (что это?) (проверить)

Химическое соединение

Фармацевтическая смесь

Гигромицин B — антибиотик, вырабатываемый бактерией Streptomyces hygroscopicus . Это аминогликозид , который убивает бактерии , грибки и другие эукариотические клетки , ингибируя синтез белка . ^[1]

История

Гигромицин B был первоначально разработан в 1950-х годах для использования на животных и до сих пор добавляется в корм для свиней и кур в качестве антигельминтного или противоглистного средства (название продукта: Hygromix). Гигромицин B вырабатывается Streptomyces hygroscopicus , бактерией, выделенной в 1953 году из образца почвы. Гены устойчивости были обнаружены в начале 1980-х годов. ^[2]^[3]

Механизм действия

Гигромицин В, наряду с аминогликозидами, подавляет синтез белка, усиливая взаимодействие связывания тРНК в рибосомальном А-сайте. Гигромицин В также предотвращает транслокацию мРНК и тРНК с помощью неизвестного механизма. ^[4]

Использование в исследованиях

В лаборатории он используется для отбора и поддержания прокариотических и эукариотических клеток, содержащих ген устойчивости к гигромицину . Ген устойчивости представляет собой киназу , которая инактивирует гигромицин B посредством фосфорилирования . ^[5] С момента открытия генов устойчивости к гигромицину гигромицин B стал стандартным селективным антибиотиком в экспериментах по переносу генов во многих прокариотических и эукариотических клетках. На основе метода мониторинга примесей ^[6] в коммерческом гигромицине B от разных поставщиков обнаружено четыре различных вида примесей, а токсичность различных примесей для клеточных линий описана в следующих внешних ссылках. ^{[ необходима цитата ]}

Использование в исследованиях растений

Ген устойчивости к гигромицину часто используется в качестве селективного маркера в исследованиях растений . В системе трансформации риса , опосредованной Agrobacterium , гигромицин используется в концентрации около 30–75 мг/л ^, в среднем 50 мг/л ^. Использование гигромицина в концентрации 50 мг/л ^{показало} высокую токсичность для нетрансформированных каллусов . Таким образом, его можно эффективно использовать для отбора трансформантов . ^[7]

Грибок Coniothyrium minitans был трансформирован геном устойчивости к гигромицину B для улучшения показателей заражения Sclerotinia sclerotiorum , грибковым паразитом многих сельскохозяйственных культур. ^[8]

Ссылки

^ Pittenger RC, Wolfe RN, Hoehn MM, Marks PN, Daily WA, McGUIRE JM (декабрь 1953 г.). «Гигромицин. I. Предварительные исследования по производству и биологической активности нового антибиотика». Антибиотики и химиотерапия . 3 (12): 1268– 1278. PMID 24542808.
^ Gritz L, Davies J (ноябрь 1983 г.). "Плазмидная кодируемая устойчивость к гигромицину B: последовательность гена фосфотрансферазы гигромицина B и его экспрессия в Escherichia coli и Saccharomyces cerevisiae ". Gene . 25 ( 2– 3): 179– 188. doi :10.1016/0378-1119(83)90223-8. PMID 6319235.
^ Кастер KR, Бергетт SG, Рао RN, Инголия TD (октябрь 1983 г.). «Анализ гена устойчивости бактериального гигромицина B с помощью транскрипционных и трансляционных слияний и секвенирования ДНК». Nucleic Acids Research . 11 (19): 6895– 6911. doi :10.1093/nar/11.19.6895. PMC 326422. PMID 6314265 .
^ «Гигромицин Б». ТОКУ-Э . Проверено 28 июня 2024 г.
^ Rao RN, Allen NE, Hobbs JN, Alborn WE, Kirst HA, Paschal JW (ноябрь 1983 г.). «Генетическая и ферментативная основа устойчивости к гигромицину B у Escherichia coli». Antimicrobial Agents and Chemotherapy . 24 (5): 689– 695. doi :10.1128/aac.24.5.689. PMC 185926. PMID 6318654.
^ Кауфман Дж. С. (2009). «Аналитические стратегии мониторинга остаточных примесей. Лучшие методы мониторинга примесей, связанных с продуктом, на протяжении всего производственного процесса». BioPharm International . 23 : 1– 3.
^ Pazuki A, Asghari J, Sohani MM, Pessarakli M, Aflaki F (2014). "Влияние некоторых источников органического азота и антибиотиков на рост каллуса сортов индийского риса" (PDF) . Journal of Plant Nutrition . 38 (8): 1231– 1240. doi :10.1080/01904167.2014.983118. S2CID 84495391 . Получено 17 ноября 2014 г. .
^ Jones EE, Stewart A, Whipps JM (март 2003 г.). «Использование Coniothyrium minitans, трансформированного геном устойчивости к гигромицину B, для изучения выживаемости и инфицирования склероциями Sclerotinia sclerotiorum в почве» (PDF) . Mycological Research . 107 (Pt 3): 267–276 . doi :10.1017/S0953756203007457. PMID 12825495.

[discovery-1] Pittenger RC, Wolfe RN, Hoehn MM, Marks PN, Daily WA, McGUIRE JM (декабрь 1953 г.). «Гигромицин. I. Предварительные исследования по производству и биологической активности нового антибиотика». Антибиотики и химиотерапия . 3 (12): 1268– 1278. PMID 24542808.

[res1-2] Gritz L, Davies J (ноябрь 1983 г.). "Плазмидная кодируемая устойчивость к гигромицину B: последовательность гена фосфотрансферазы гигромицина B и его экспрессия в Escherichia coli и Saccharomyces cerevisiae ". Gene . 25 ( 2– 3): 179– 188. doi :10.1016/0378-1119(83)90223-8. PMID 6319235.

[res2-3] Кастер KR, Бергетт SG, Рао RN, Инголия TD (октябрь 1983 г.). «Анализ гена устойчивости бактериального гигромицина B с помощью транскрипционных и трансляционных слияний и секвенирования ДНК». Nucleic Acids Research . 11 (19): 6895– 6911. doi :10.1093/nar/11.19.6895. PMC 326422. PMID 6314265 .

[4] «Гигромицин Б». ТОКУ-Э . Проверено 28 июня 2024 г.

[pmid6318654-5] Rao RN, Allen NE, Hobbs JN, Alborn WE, Kirst HA, Paschal JW (ноябрь 1983 г.). «Генетическая и ферментативная основа устойчивости к гигромицину B у Escherichia coli». Antimicrobial Agents and Chemotherapy . 24 (5): 689– 695. doi :10.1128/aac.24.5.689. PMC 185926. PMID 6318654.

[impurities-6] Кауфман Дж. С. (2009). «Аналитические стратегии мониторинга остаточных примесей. Лучшие методы мониторинга примесей, связанных с продуктом, на протяжении всего производственного процесса». BioPharm International . 23 : 1– 3.

[pazuki-7] Pazuki A, Asghari J, Sohani MM, Pessarakli M, Aflaki F (2014). "Влияние некоторых источников органического азота и антибиотиков на рост каллуса сортов индийского риса" (PDF) . Journal of Plant Nutrition . 38 (8): 1231– 1240. doi :10.1080/01904167.2014.983118. S2CID 84495391 . Получено 17 ноября 2014 г. .

[8] Jones EE, Stewart A, Whipps JM (март 2003 г.). «Использование Coniothyrium minitans, трансформированного геном устойчивости к гигромицину B, для изучения выживаемости и инфицирования склероциями Sclerotinia sclerotiorum в почве» (PDF) . Mycological Research . 107 (Pt 3): 267–276 . doi :10.1017/S0953756203007457. PMID 12825495.