Гаплогруппа К2

Группировка ДНК Y-хромосомы человека, указывающая на общее происхождение

Гаплогруппа К2
Возможное время происхождения47 000–50 000 лет до н.э. [1]
Возможное место происхожденияВозможно, Ближний Восток , Центральная Азия [2] или Юго-Восточная Азия [3] [4]
ПредокК
ПотомкиK2a (M2308); K2b (МПС); K2c; K2d; K2e.
Определение мутацийrs2033003 (М526)

Гаплогруппа K2 , также известная как K-M526 и ранее известная как K(xLT) и MNOPS , [5] является гаплогруппой Y-ДНК человека .

Относительно своего возраста внутренняя структура K2 чрезвычайно сложна, и ее субклады переносятся самцами, родом из таких регионов, как Австралазия , Океания , Юго-Восточная Азия , Южная Азия , Восточная Азия , Центральная Азия , Америка , Европа и Африканский Рог . Многие из ее ветвей очень распространены, наиболее численно важными являются R в Европе и Южной Азии и O в Восточной и Юго-Восточной Азии (а также недавние иммигранты на другие континенты). Гаплогруппы N и Q , хотя они менее распространены в целом, также очень широко распространены в северной Евразии и Америке соответственно. M и S почти полностью ограничены Океанией и восточной Индонезией , где они встречаются с высокой частотой.

Редкие субклады за пределами этих основных линий известны в основном с островов Юго-Восточной Азии (включая Андаманские острова и Филиппины ).

Базальная парагруппа K2* была выявлена ​​среди коренных австралийцев, около 27% из них являются носителями базальной K-M526∗. [6]

K2a* был обнаружен только в останках верхнего палеолита из Западной Сибири и Балкан , известных соответственно как « Усть-Ишимский человек » и « Оазе-1 ». [7] Единственная первичная ветвь K2a, известная как K-M2313*, была задокументирована у двух ныне живущих людей, имеющих этнические связи с Южной Азией и Юго-Восточной Азией соответственно: телугу из Индии и этнического малайца из Сингапура. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является первичной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех ныне живущих людей из Индии . [8] Другой субклад, NO (M214)*, который некоторое время считался синонимом K2a (M2308)*, не был идентифицирован у ныне живущих людей или останков.

Базальная парагруппа K2b* не была идентифицирована среди ныне живущих мужчин, но была обнаружена у человека эпохи верхнего палеолита Тяньюань из Китая. [9] K2b1 (P397/P399), ранее известная как гаплогруппа MS , и гаплогруппа P (P-P295), также известная как K2b2 , являются единственными первичными кладами K2b.

По мнению генетика Спенсера Уэллса , гаплогруппа K, от которой произошла гаплогруппа P, возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии . Вероятно, что гаплогруппа P разделилась где-то в Южной Азии на P1, которая распространилась в Сибирь и Северную Евразию, и на P2, которая распространилась в Океанию и Юго-Восточную Азию. [2]

Генетик-популяционист Татьяна Карафет и другие исследователи (2014) отмечают, что и K2b1, и P* географически фактически ограничены Юго-Восточной Азией и Океанией . [3] В то время как, в разительном контрасте, P1 (P-M45) и ее основные субклады Q и R теперь составляют «наиболее распространенную гаплогруппу в Европе , Америке , Центральной Азии и Южной Азии ». По словам Карафет и др., предполагаемые даты ветвления K, K2, K2b и P указывают на «быструю диверсификацию» в пределах K2, «которая, вероятно, произошла в Юго-Восточной Азии», с последующим «расширением на запад» P*, P1, Q и R. [3] Однако эти авторы также оговаривают, что гаплогруппа K могла возникнуть в Евразии и позже там вымерла, и что любая из гипотез происхождения «одинаково экономна». [10]

Структура

Являясь прямым потомком гаплогруппы K , K2 является родственным звеном базальной/парагруппы K* и гаплогруппы LT (также известной как K1).

По состоянию на 2017 год филогения гаплогруппы К2 выглядит следующим образом:

K-M526 ( K2 ) M526 – ранее известный как K(xLT) и MNOPS

  • K-M2308 ( K2a ) M2308 – найден только в древних останках; см. выше) [7]
    • К-М2313 ( К2а1 ) М2313 [7]
      • NO-F549 ( NO* ) или K-M2335 F549/S22380/M2335/V4208; M2335/Z4952/M2339/E482; CTS11667 [8] [7]
        • NO1-M214 ( NO1* ) или NO-F176 M214/Page39; F176/M2314; CTS5858/M2325/F346; CTS11572 [8] [7] [11]
          • N-M231 ( N* ) M231; CTS2947/M2175; Z4891; CTS10118 [8]
          • О-М175 ( О* ) М175/П186/П191/П196; Ф369/М1755; Ф380/М1757/С27659 [8]
      • K-Y28299 ( первичный субклад K2a; филогенетическое название отсутствует по состоянию на 2017 г. ) Y28299/Y28355; Y28357; Y28412 – обнаружен у одного живущего человека в Индии [8]
      • K-Y28301 ( первичный субклад K2a; филогенетическое название отсутствует по состоянию на 2017 г. ) Y28301/Y28328; Y28358; Y28410 – обнаружен у двух ныне живущих особей в Индии [8]
  • K-P331 ( K2b ) M1221/P331/PF5911, CTS2019/M1205, PF5990/L405, PF5969 – субклады K2b включают основные гаплогруппы M ; S , P , Q и R
  • К-П261 ( К2с ) П261
  • К-П402 ( К2д ) П402
  • К-М147 ( К2е ) М147

Распределение

На уровне высокопроизводных субкладов K2 почти универсален в некоторых современных евразийских, австралазийских и индейских популяциях. Гаплогруппа NO (M214) , как потомок K2a (M2308) , включает большинство мужчин среди юго-восточноазиатских , восточноазиатских и финно-угроязычных популяций. [7] Аналогично, прямые потомки K2b включают основные гаплогруппы M ; S , P , Q и R. Они в настоящее время численно доминируют в: Океании , Центральной Азии , Сибири , среди индейских популяций, Европе и Южной Азии .

Быстрая диверсификация внутри и от K2 (M526), ​​скорее всего, в Юго-Восточной Азии, предполагается оценками момента времени, когда K2 ответвилась от K* (M9). Аналогично ответвление от K2 K2b (P331) и гаплогруппы P (K2b2 P295) от K2b, а также гаплогрупп Q и R от P (K2b2), и их последующее расширение на запад в Европу [3] и на восток в Америку.

K2c, K2d и K2e — чрезвычайно редкие подгаплогруппы, которые встречаются в определенных частях Южной и Юго-Восточной Азии. [3] K2c (P261) была зарегистрирована только среди мужчин на Бали , а K2d (P402) — только на Яве . K2e (M147), которая была обнаружена в двух современных случаях из Южной Индии , [3] была предварительно названа «пре-NO» (среди других названий), поскольку изначально считалась предковой для K2a (NO). Однако позже было обнаружено, что она является первичной ветвью гаплогруппы K2 (K-M526) и родственным клану K2a; новый клад был переименован в K2e.

Исследования, опубликованные в 2014 и 2015 годах, показали, что до 27% мужчин -аборигенов Австралии являются носителями K-M526*, который в то время не мог быть отнесен к известному субкладу, а еще 27%, вероятно, имеют K2b1a1 (P60, P304, P308; также известный как «S-P308») и, возможно, 2,0% имеют гаплогруппу M1 – также известную как M-M4 (или «M-M186») и K2b1d1 . [12] [3]

Нейминг

Название K2 было введено в 2014 году в связи с неудовлетворенностью предыдущими названиями.

K(xLT), название, введенное Консорциумом Y-хромосомы в 2012 году для замены MNOPS, было спорным. Согласно предыдущей методологии, такой термин, как «K(xLT)», обозначал все клады и субклады, которые принадлежали к K, но не принадлежали к гаплогруппе LT ; гаплогруппы, подчиненные MNOPS, вероятно, были бы переименованы в «U», «V», «W» и «X», и MNOPS, следовательно, стала бы «MNOPSUVWX». Это создавало проблему, поскольку не было способа устранить неоднозначность между «K(xLT)» в широком и узком значениях термина.

Сноски

  1. ^ Фу, Цяомэй; Ли, Хэн; Мурджани, Прия; Джей, Флора; Слепченко Сергей М.; Бондарев Алексей А.; Джонсон, Филип Л.Ф.; Аксиму-Петри, Айинуэр; Прюфер, Кей; де Филиппо, Чезаре; Мейер, Матиас; Цвинс, Николас; Саласар-Гарсия, Доминго К.; Кузьмин Ярослав Васильевич; Китс, Сьюзен Г.; Косинцев Павел А.; Ражев Дмитрий Иванович; Ричардс, Майкл П.; Перистов, Николай В.; Лахманн, Майкл; Дука, Катерина; Хайэм, Томас Ф.Г.; Слаткин, Монтгомери; Юблин, Жан-Жак; Райх, Дэвид; Келсо, Джанет; Виола, Т. Бенс; Паабо, Сванте (октябрь 2014 г.). «Геномная последовательность 45000-летнего современного человека из Западной Сибири». Nature . 514 (7523): 445– 449. Bibcode :2014Natur.514..445F. doi :10.1038/nature13810 . PMC  4753769 . PMID  25341783.
  2. ^ ab Wells, Spencer (20 ноября 2007 г.). Глубокое происхождение: эпохальный поиск ДНК для расшифровки нашего далекого прошлого. National Geographic Books. стр. 79. ISBN 978-1-4262-0211-7.«Учитывая широкое распространение К, он, вероятно, возник где-то на Ближнем Востоке или в Центральной Азии, возможно, в районе Ирана или Пакистана».
  3. ^ abcdefg Карафет, Татьяна М; Мендес, Фернандо Л; Судойо, Херавати; Лансинг, Дж. Стивен; Хаммер, Майкл Ф. (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». European Journal of Human Genetics . 23 (3): 369– 373. doi :10.1038/ejhg.2014.106. PMC 4326703 . PMID  24896152. 
  4. ^ Халласт, Пилле; Агджоян, Анастасия; Балановский, Олег; Сюэ, Яли; Тайлер-Смит, Крис (2021). «Юго-восточноазиатское происхождение современных неафриканских человеческих хромосом Y». Генетика человека . 140 (2): 299– 307. doi :10.1007/s00439-020-02204-9. PMC 7864842. PMID  32666166 . 
  5. ^ Chiaroni, Jacques; Underhill, Peter A.; Cavalli-Sforza, Luca L. (2009). «Разнообразие Y-хромосомы, человеческая экспансия, дрейф и культурная эволюция». PNAS . 106 (48): 20174– 9. Bibcode :2009PNAS..10620174C. doi : 10.1073/pnas.0910803106 . PMC 2787129 . PMID  19920170. 
  6. ^ Бергстрём, Андерс; Нэгл, Нано; Чэнь, Юань; Маккарти, Шейн; Поллард, Мартин О.; Аюб, Касим; Уилкокс, Стивен; Уилкокс, Лия; ван Ооршот, Роланд AH; МакАллистер, Питер; Уильямс, Лесли; Сюэ, Яли; Митчелл, Р. Джон; Тайлер-Смит, Крис (21 марта 2016 г.). «Глубокие корни Y-хромосом австралийских аборигенов». Current Biology . 26 (6): 809– 813. doi :10.1016/j.cub.2016.01.028. PMC 4819516. PMID  26923783 . 
  7. ^ abcdef Позник, Дж. Дэвид; Сюэ, Яли; Мендес, Фернандо Л; Виллемс, Томас Ф; Массайя, Андреа; Уилсон Сейрес, Мелисса А.; Аюб, Касим; Маккарти, Шейн А; Наречанья, Апурва; Кашин, Сева; Чен, Юань; Банерджи, Руби; Родригес-Флорес, Хуан Л.; Сересо, Мария; Шао, Хаоцзин; Гимрек, Мелисса; Малхотра, Анкит; Лузада, Сандра; Десаль, Роб; Ричи, Грэм Р.С.; Сервейра, Элиза; Фицджеральд, Томас В.; Гаррисон, Эрик; Маркетта, Энтони; Миттельман, Дэвид; Романович, Мэллори; Чжан, Чэншэн; Чжэн-Брэдли, Сянцюнь; Абекасис, Гонсалу Р.; Маккэрролл, Стивен А.; Фличек, Пол; Андерхилл, Питер А.; Коин, Лаклан; Зербино, Дэниел Р.; Янг, Фэнтан; Ли, Чарльз; Кларк, Лора; Отон, Адам; Эрлих, Янив; Хэндсейкер, Роберт Э.; Бустаманте, Карлос Д.; Тайлер-Смит, Крис (июнь 2016 г.). «Пунктуированные всплески в демографии мужчин, выведенные из 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Nature Genetics . 48 (6): 593– 599. doi :10.1038/ng.3559. PMC 4884158. PMID  27111036 . 
  8. ^ abcdefg YFull YTree v5.08, 2017, «K-M2335» (9 декабря 2017 г.); PhyloTree, 2017, «Подробности маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (9 декабря 2017 г.); GeneticHomeland.com, 2016, DNA Marker Index Chromosome Y V4208 (9 декабря 2017 г.).
  9. ^ "Загружаемые генотипы современных и древних данных ДНК (составленные из опубликованных статей) | Лаборатория Дэвида Райха". reich.hms.harvard.edu . Архивировано из оригинала 2 ноября 2019 г. . Получено 11 сентября 2019 г. .
  10. ^ Карафет и др. 2015 г. «Эта модель приводит нас к гипотезе о юго-восточно-азиатском происхождении P-P295 и более поздней экспансии предка подгаплогрупп R и Q на материковую часть Азии. Альтернативное объяснение включало бы вымирание предковых хромосом P-P295* по всей Азии. Эти сценарии одинаково экономны. Они включают либо миграцию (хромосомы P* из Индонезии на материковую часть Азии), либо вымирание парагруппы P-P295* в Евразии».
  11. ^ "ISOGG 2018 Y-ДНК гаплогруппа ствол дерева". www.isogg.org .
  12. ^ Nagle, Nano; Ballantyne, Kaye N.; van Oven, Mannis; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Taylor, Duncan; Wilcox, Stephen; Wilcox, Leah; Turkalov, Rust; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Kayser, Manfred; Mitchell, Robert J.; Genographic, Consortium. (март 2016 г.). «Древность и разнообразие Y-хромосом аборигенов Австралии: Y-хромосомы аборигенов Австралии». American Journal of Physical Anthropology . 159 (3): 367– 381. doi :10.1002/ajpa.22886. PMID  26515539.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Haplogroup_K2&oldid=1269639170"