Гаплогруппа M-P256
| Гаплогруппа M-P256 | |
|---|---|
 | |
| Возможное время происхождения | 32 000–47 000 лет до н.э. [1] |
| Возможное место происхождения | Уоллесия (восточная Индонезия) или Новая Гвинея [2] |
| Предок | К2б1 |
| Определение мутаций | П256 |
Гаплогруппа M , также известная как M-P256 и гаплогруппа K2b1b (ранее K2b1d) — это гаплогруппа ДНК Y-хромосомы . M-P256 — это потомок гаплогруппы K2b1 , и, как полагают, она впервые появилась между 32 000 и 47 000 лет назад. [1]
M-P256 является наиболее часто встречающейся гаплогруппой Y-хромосомы в Западном Папуа и западной Папуа-Новой Гвинее . [3] Кроме того, M-P256 также встречается в соседних частях Меланезии , Индонезии и у коренных австралийцев .
Филогенетическая структура
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано в первую очередь на деревьях, опубликованных YCC в 2008 году [4] и ISOGG в 2016 году [5].
- М* (P256)
- М1 (М4, М5/П73, М106, М186, М189, М296, П35)
- М1а (П34_1, П34_2, П34_3, П34_4, П34_5)
- М1а1 (П51)
- М1а2 (П94)
- М1б (P87)
- М1б1 (М104_1/П22_1, М104_2/П22_2)
- М1б1а (М16)
- М1б1б (М83)
- М1б1 (М104_1/П22_1, М104_2/П22_2)
- М1а (П34_1, П34_2, П34_3, П34_4, П34_5)
- М2 (М353, М387)
- М2а (M177/SRY9138)
- М3 (П117, П118)
- М1 (М4, М5/П73, М106, М186, М189, М296, П35)
Распределение
М* (М-П256*)
Парагруппа M-P256* встречается с низкой частотой в Новой Гвинее (6,3%) и Флоресе (2,5%). [2]
М1 (М-М4)
| Гаплогруппа М-М4 | |
|---|---|
| Возможное время происхождения | 8200 [3800–20600] лет до н.э. [3] |
| Возможное место происхождения | Юго-Восточная Азия - Меланезия [ необходима ссылка ] |
| Предок | М-П256 |
| Определение мутаций | M4, M5/P73, M106, M186, M189, M296, P35 [ необходима цитата ] |
Эта группа часто встречается в Новой Гвинее и Меланезии , с умеренным распространением в соседних частях Индонезии , Микронезии и Полинезии .
- Уна 100% [3]
- Кетенгбан 100% [3]
- Авью 100% [3]
- Читак 86% [3]
- Асмат 75% [3]
- Западное Папуа
- Низменности/побережье 77,5% [3]
- Горная местность 74,5% [3]
- Комбаи / Короваи 46% [3]
- Папуа-Новая Гвинея
- Побережье 29% [3]
- Горная местность 35,5% [3]
- Толай (Новая Британия) 31% [3]
- Острова Тробриан 30% [3]
- Молуккские острова (Молуккские острова) 21% [3]
- Жители островов Торресова пролива (Австралия): до 2,0% – т.е. 0,9% выборок, когда 45% от общего числа считались «некоренными» [6]
Крайний географический выброс, по-видимому, был выявлен в исследовании 2012 года, в котором сообщалось о хазарейце из Мазари-Шарифа , Афганистан, с M1 (среди выборки из 60 мужчин из упомянутой области). [7] Хазарейец был носителем SNP M186 (который, как полагают, эквивалентен M4).
| Старые названия (YCC 2002/2008) | М-М4 |
| Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 | 24 |
| Андерхилл 2000 | 8-й |
| Хаммер 2001 | 1U |
| Карафет 2001 | 37 |
| Семино 2000 | Еу16 |
| Вс 1999 | Н17 |
| Капелли 2001 | Э |
| YCC 2002 (Полное письмо) | М* |
| YCC 2005 (Полный текст) | М |
| YCC 2008 (Полный текст) | М1 |
| YCC 2010r (Лучшее письмо) | М1 |
М1а (М-П34)
M1a (M-P34) является наиболее часто встречающейся гаплогруппой ДНК Y-хромосомы в Западной Новой Гвинее . Она также встречается с умеренной частотой в соседних частях Индонезии ( Малуку , Нуса-Тенгара ) и по всей Папуа-Новой Гвинее , включая прибрежные острова. [3] [8]
| Старые названия (YCC 2002/2008) | М-П34 |
| Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 | 24 |
| Андерхилл 2000 | 8-й |
| Хаммер 2001 | 1U |
| Карафет 2001 | 37 |
| Семино 2000 | Еу16 |
| Вс 1999 | Н17 |
| Капелли 2001 | Э |
| YCC 2002 (Полное письмо) | М1 |
| YCC 2005 (Полный текст) | М1 |
| YCC 2008 (Полный текст) | М1а |
| YCC 2010r (Лучшее письмо) | М1а |
М1б (М-П87)
M1b M-P87(xM104/P22) был обнаружен примерно в 18% (20/109) пула образцов из Новой Ирландии , примерно в 12% (5/43) образца Лавонгаи из Нью-Ганновера , примерно в 5% (19/395) пула образцов из Новой Британии (и, в частности, примерно в 24% (15/63) образца Бейнинга из Восточной Новой Британии ), а также у одной особи Сапоса из северного Бугенвиля и еще одной особи с северного побережья Папуа-Новой Гвинеи . [1]
Субклад M1b1 (M104_1/P22_1, M104_2/P22_2) часто встречается в популяциях архипелага Бисмарка и острова Бугенвиль , с умеренным распространением в Новой Гвинее , Фиджи , Тонга , Восточной Футуне и Самоа . [1] [9]
| Старые названия (YCC 2002/2008) | М-П22 |
| Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 | 24 |
| Андерхилл 2000 | 8-й |
| Хаммер 2001 | 1U |
| Карафет 2001 | 38 |
| Семино 2000 | Еу16 |
| Вс 1999 | Н17 |
| Капелли 2001 | Э |
| YCC 2002 (Полное письмо) | М2* |
| YCC 2005 (Полный текст) | М2а |
| YCC 2008 (Полный текст) | М1б1 |
| YCC 2010r (Лучшее письмо) | М1б1 |
М2 (М-М353)
M2 встречается с низкой частотой на Фиджи и в Восточной Футуне . [10]
Субклад M2a (M-M177, также называемый M-SRY9138) был обнаружен у одного представителя племени насиои с восточного побережья Бугенвиля и у одного представителя племени из провинции Малаита на Соломоновых островах . [11]
Ниже перечислены альтернативные названия, ранее использовавшиеся в рецензируемой литературе для субклада M2a.
| Старые названия (YCC 2002/2008) | K-SRY9138/M-SRY9138, он же M-M177 |
| Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 | 23 |
| Андерхилл 2000 | 8-й |
| Хаммер 2001 | 1Э |
| Карафет 2001 | 25 |
| Семино 2000 | Еу16 |
| Вс 1999 | Н5 |
| Капелли 2001 | Ф |
| YCC 2002 (Полное письмо) | К1 |
| YCC 2005 (Полный текст) | К1 |
| YCC 2008 (Полный текст) | М2а |
| YCC 2010r (Лучшее письмо) | М2а |
М3 (М-П117)
M3 (P117, P118) часто встречается в популяциях Новой Британии , а также иногда наблюдается в северной части Бугенвиля , Фиджи и Восточной Футуне . [9] [1]
Предыдущая филогенетическая история
До 2002 года в академической литературе использовалось не менее семи различных систем наименований для филогенетического дерева хромосомы Y, что приводило к значительной путанице. Чтобы решить эту проблему, в 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум по хромосоме Y (YCC). Это привело к публикации совместной статьи, которая содержала одно новое дерево в качестве стандарта для использования научным сообществом. Позднее другая группа ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, работала над постоянным совершенствованием системы наименований.
В таблице ниже собрана номенклатура, использовавшаяся в исследованиях гаплогруппы M до появления знаменательного дерева YCC 2002 года, что позволяет исследователям, просматривающим более старую литературу, быстро переходить от одной используемой номенклатуры к другой.
| YCC 2002/2008 (стенография) | (α) | (β) | (γ) | (δ) | (ε) | (ζ) | (η) | YCC 2002 (Полное письмо) | YCC 2005 (Полный текст) | YCC 2008 (Полный текст) | YCC 2010r (Лучшее письмо) | ИСООГГ 2006 | ИСООГГ 2007 | ИСООГГ 2008 | ИСООГГ 2009 | ИСООГГ 2010 | ИСООГГ 2011 | ИСООГГ 2012 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| М4 | 24 | 8-й | 1U | 37 | Еу16 | Н17 | Э | М* | М | М1 | М1 | - | - | - | - | - | - | - |
| М-П34 | 24 | 8-й | 1U | 37 | Еу16 | Н17 | Э | М1 | М1 | М1а | М1а | - | - | - | - | - | - | - |
| М-П22/М-М104 | 24 | 8-й | 1U | 38 | Еу16 | Н17 | Э | М2* | М2а | М1б1 | М1б1 | - | - | - | - | - | - | - |
| М-М16 | 24 | 8-й | 1U | 39 | Еу16 | Н17 | Э | М2а | М2а1 | М1б1а | М1б1а | - | - | - | - | - | - | - |
| М-М83 | 24 | 8-й | 1U | 38 | Еу16 | Н17 | Э | М2б | М2а2 | М1б1б | М1б1б | - | - | - | - | - | - | - |
| K-SRY9138/M-SRY9138 | 23 | 8-й | 1Э | 25 | Еу16 | Н5 | Ф | К1 | К1 | М2а | М2а | - | - | - | - | - | - | - |
- Источники
В создании YCC Tree приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.
- α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
- β Андерхилл 2000
- γ Молот 2001
- δ Карафет 2001
- ε Семино 2000
- ζ Вс 1999
- η Капелли 2001
В статье Карафета 2008 года был представлен ряд изменений по сравнению с предыдущим деревом ISOGG 2006 года. [4] До открытия маркера P256 текущая подгруппа M-M4 (определяемая маркером M4) ранее представляла всю гаплогруппу M-P256; а подгруппы M2 и M3 ранее классифицировались как подгруппы K1 и K7 родительской гаплогруппы K. [ необходима ссылка ]
Ссылки
- ^ abcde Шейнфельдт, Лаура; Фридлендер, Франсуаза; Фридлендер, Джонатан; Латам, Криста; Коки, Джордж; Карафет, Татьяна; Хаммер, Майкл; Лоренц, Джозеф (2006-06-05). "Неожиданная вариация хромосомы NRY на Северном острове Меланезия". Молекулярная биология и эволюция . 23 (8): 1628–1641. doi :10.1093/molbev/msl028. ISSN 1537-1719. PMID 16754639.
- ^ ab Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс, Херавати Судойо , Шон Дауни, Дж. Стивен Лансинг и Майкл Ф. Хаммер, «Основное разделение Восток–Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии», Молекулярная биологическая эволюция , (2010), т. 27, № 8, стр. 1833-1844.
- ^ abcdefghijklmnop Кайзер, Манфред; Брауэр, Силке; Вайс, Гюнтер; Шифенхёфель, Вульф; Андерхилл, Питер; Шен, Пейдонг; Офнер, Питер; Томмасео-Понзетта, Мила; Стоункинг, Марк (2003). «Редуцированная Y-хромосома, но не митохондриальная ДНК, разнообразие в человеческих популяциях из Западной Новой Гвинеи». Американский журнал генетики человека . 72 (2): 281–302. doi :10.1086/346065. ISSN 0002-9297. PMC 379223. PMID 12532283 .
- ^ ab Karafet, Tatiana M.; Mendez, Fernando L.; Meilerman, Monica B.; Underhill, Peter A.; Zegura, Stephen L.; Hammer, Michael F. (2008-05-01). "Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека". Genome Research . 18 (5): 830–838. doi :10.1101/gr.7172008. ISSN 1088-9051. PMC 2336805 . PMID 18385274.
- ^ "ISOGG 2018 Y-ДНК Гаплогруппа M". isogg.org . Получено 2024-09-18 .
- ^ Nagle, Nano; Ballantyne, Kaye N.; van Oven, Mannis; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Taylor, Duncan; Wilcox, Stephen; Wilcox, Leah; Turkalov, Rust; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Kayser, Manfred; Mitchell, Robert J.; The Genographic Consortium (2016). «Древность и разнообразие Y-хромосом аборигенов Австралии». American Journal of Physical Anthropology . 159 (3): 367–381. doi :10.1002/ajpa.22886. ISSN 0002-9483. PMID 26515539.
- ^ Хабер, Марк; Платт, Дэниел Э.; Бонаб, Мазиар Ашрафиан; Юханна, Соня К.; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуайхи, Бушра; Гассибе-Саббах, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг; Ганбари, Мохсен; Уэйл, Джон; Балановский, Олег; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Тайлер-Смит, Крис (28.03.2012). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode : 2012PLoSO...734288H. doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . ISSN 1932-6203. PMC 3314501 . PMID 22470552.
- ^ Karafet, Tatiana M; Lansing, J. S; Redd, Alan J; Watkins, Joseph C; Surata, SP K; Arthawiguna, W. A; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; Jorde, Lynn B; Hammer, Michael F (2005). «Взгляд на заселение Индонезии с точки зрения балийской Y-хромосомы: генетический вклад охотников-собирателей донеолитического периода, австронезийских фермеров и индийских торговцев». Human Biology . 77 (1): 93–114. doi :10.1353/hub.2005.0030. ISSN 1534-6617. PMID 16114819.
- ^ ab Kayser, M.; Choi, Y.; van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, RJ; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W.; Stoneking, M. (2008-04-03). «Влияние австронезийской экспансии: доказательства из мтДНК и разнообразия хромосом Y на островах Адмиралтейства в Меланезии». Молекулярная биология и эволюция . 25 (7): 1362–1374. doi :10.1093/molbev/msn078. ISSN 0737-4038.
- ^ Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Cordaux, Richard; Casto, Amanda; Lao, Oscar; Zhivotovsky, Lev A.; Moyse-Faurie, Claire; Rutledge, Robb B.; Schiefenhoevel, Wulf; Gil, David; Lin, Alice A.; Underhill, Peter A.; Oefner, Peter J.; Trent, Ronald J.; Stoneking, Mark (2006). «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: градиенты мтДНК и Y-хромосомы через Тихий океан». Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2234–2244. doi :10.1093/molbev/msl093. ISSN 1537-1719. PMID 16923821.
- ^ Кокс, Мюррей П.; Миразон Лар, Марта (2006). «Разнообразие Y-хромосомы обратно пропорционально языковой принадлежности в парных австронезийско- и папуасскоязычных сообществах Соломоновых Островов». Американский журнал биологии человека . 18 (1): 35–50. doi :10.1002/ajhb.20459. ISSN 1042-0533. PMID 16378340.
Источники таблиц преобразования
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (февраль 2001 г.). «Преимущественно коренное отцовское наследие для австронезийско-говорящих народов островной Юго-Восточной Азии и Океании». The American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432–443. doi : 10.1086/318205 . PMC 1235276. PMID 11170891 .
- Хаммер, Майкл Ф.; Карафет, Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосомы человека». Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID 11420360.
- Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новые применения новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID 10904265
- Каладжиева, Люба; Калафель, Франсеск; Джоблинг, Марк А.; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Модели меж- и внутригруппового генетического разнообразия влакских цыган, выявленные с помощью линий Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». European Journal of Human Genetics . 9 (2): 97–104. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . PMID 11313742.
- Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы». Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490. PMID 11481588 .
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива хромосомы AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Bibcode : 2000Sci...290.1155S, doi : 10.1126/science.290.5494.1155, PMID 11073453
- Су, Бин; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Y-хромосома: доказательства миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода». Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. doi : 10.1086/302680 . PMC 1288383. PMID 10577926 .
- Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Линь, Элис А.; Цзинь, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Изменение последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480.
Внешние ссылки
- Распространение гаплогруппы M, от National Geographic
Смотрите также
