HNRNPС

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

HNRNPС
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHNRNPC , C1, C2, HNRNP, HNRPC, SNRPC, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин C (C1/C2), гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин C
Внешние идентификаторыОМИМ : 164020; МГИ : 107795; гомологен : 74524; GeneCards : HNRNPC; OMA :HNRNPC — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001077442
NM_001077443
NM_004500
NM_031314

RefSeq (белок)

НП_001070910
НП_001070911
НП_004491
НП_112604

Местоположение (UCSC)Хр 14: 21.21 – 21.27 МбХр 14: 52.31 – 52.34 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины C1/C2 — это белок , который у человека кодируется геном HNRNPC . [5] [6]

Он аномально экспрессируется у плодов как ЭКО, так и ИКСИ , что может способствовать повышению риска врожденных дефектов при этих ВРТ . [7]

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP являются белками, связывающими РНК, и они образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК (ссылка: Koenig J. nature structure and Molecular Biology 2010: iCLIP) и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают различными свойствами связывания нуклеиновых кислот. Транскрипционная регуляция гормональным 1,25-дигидроксивитамином D(3) ( кальцитриолом ) включает в себя занятие элементов ответа витамина D (VDRE) HNRNPC или 1,25(OH)(2)D(3)-связанным рецептором витамина D (VDR) . [8] [9] [10] Эта связь нарушается повышенным уровнем HNRNPC, вызывая форму наследственного витамин D-резистентного рахита (HVDRR) как у людей [8] , так и у нечеловеческих приматов. [11] Белок, кодируемый этим геном, может действовать как тетрамер и участвует в сборке частиц 40S hnRNP. Видоспецифическая тетрамеризация субъединиц HNRNPC важна для связывания его нуклеиновой кислоты, в результате чего избыточная экспрессия основных человеческих субъединиц HNRNPC в остеобластных клетках мышей придает устойчивость к витамину D. [12] Для этого гена были описаны множественные варианты транскриптов, кодирующие по крайней мере две различные изоформы. [6]

Взаимодействия

Было показано, что HNRNPC взаимодействует с Grb2 . [13]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000092199 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000060373 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Nakagawa TY, Swanson MS, Wold BJ, Dreyfuss G (май 1986). «Молекулярное клонирование кДНК для ядерных рибонуклеопротеиновых частиц C белков: консервативное семейство генов». Proc Natl Acad Sci USA . 83 (7): 2007–11. Bibcode : 1986PNAS...83.2007N. doi : 10.1073 /pnas.83.7.2007 . PMC 323219. PMID  3457372. 
  6. ^ ab "Ген Энтреза: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин C (C1/C2) HNRPC".
  7. ^ Zhang Y, Zhang YL, Feng C, Wu YT, Liu AX, Sheng JZ, Cai J, Huang HF (сентябрь 2008 г.). «Сравнительный протеомный анализ человеческой плаценты, полученной с помощью вспомогательных репродуктивных технологий». Proteomics . 8 (20): 4344–56. doi :10.1002/pmic.200800294. PMID  18792929. S2CID  206362532.
  8. ^ ab Lisse TS, Liu T, Irmler M, Beckers J, Chen H, Adams JS, Hewison M (март 2011 г.). «Нацеливание генов с помощью белка, связывающего элемент ответа витамина D, раскрывает роль витамина D в передаче сигналов mTOR остеобластами». FASEB J . 25 (3): 937–47. doi : 10.1096/fj.10-172577 . PMC 3042839 . PMID  21123297. 
  9. ^ Chen H, Hewison M, Adams JS (декабрь 2006 г.). «Функциональная характеристика гетерогенного ядерного рибонуклеарного белка C1/C2 при устойчивости к витамину D: новый белок, связывающий элемент ответа». J Biol Chem . 281 (51): 39114–20. doi : 10.1074/jbc.m608006200 . PMID  17071612.
  10. ^ Lisse TS, Hewison M, Adams JS (март 2011 г.). «Связывающие белки элемента гормонального ответа: новые регуляторы витамина D и сигнализации эстрогена». Steroids . 76 (4): 331–9. doi :10.1016/j.steroids.2011.01.002. PMC 3042887 . PMID  21236284. 
  11. ^ Адамс Дж. С., Чен Х., Чун Р. Ф., Нгуен Л., Ву С., Рен С. И., Барсони Дж., Гакад М. А. (февраль 2003 г.). «Новые регуляторы действия и метаболизма витамина D: уроки, полученные в зоопарке Лос-Анджелеса». J Cell Biochem . 88 (2): 308–14. doi :10.1002/jcb.10333. PMID  12520531. S2CID  25970432.
  12. ^ Lisse TS, Vadivel K, Bajaj SP, Chun RF, Hewison M, Adams JS (июль 2014 г.). «Гетеродимерная структура гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина C1/C2 диктует 1,25-дигидроксивитамин D-направленные транскрипционные события в остеобластах». Bone Research . 2 : 14011–. doi :10.1038/boneres.2014.11. PMC 4261231 . PMID  25506471. 
  13. ^ Romero F, Ramos-Morales F, Domínguez A, Rios RM, Schweighoffer F, Tocqué B, Pintor-Toro JA, Fischer S, Tortolero M (март 1998 г.). "Grb2 и его апоптотическая изоформа Grb3-3 ассоциируются с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином C, и эти взаимодействия модулируются поли(U) РНК". J. Biol. Chem . 273 (13): 7776–81. doi : 10.1074/jbc.273.13.7776 . PMID  9516488.

Дальнейшее чтение

  • Görlach M, Wittekind M, Beckman RA, Mueller L, Dreyfuss G (1992). «Взаимодействие домена связывания РНК белков hnRNP C с РНК». EMBO J . 11 (9): 3289–95. doi :10.1002/j.1460-2075.1992.tb05407.x. PMC  556863 . PMID  1380452.
  • Wittekind M, Görlach M, Friedrichs M, Dreyfuss G, Mueller L (1992). "1H, 13C и 15N ЯМР-распределения и глобальный паттерн сворачивания РНК-связывающего домена белков hnRNP C человека". Биохимия . 31 (27): 6254–65. doi :10.1021/bi00142a013. PMID  1385725.
  • Burd CG, Swanson MS, Görlach M, Dreyfuss G (1990). «Первичные структуры гетерогенных ядерных рибонуклеопротеиновых белков A2, B1 и C2: разнообразие РНК-связывающих белков генерируется небольшими пептидными вставками». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (24): 9788–92. Bibcode :1989PNAS...86.9788B. doi : 10.1073/pnas.86.24.9788 . PMC  298587 . PMID  2557628.
  • Merrill BM, Barnett SF, LeStourgeon WM, Williams KR (1989). «Различия в первичной структуре белков C1 и C2 ядерных рибонуклеопротеиновых частиц HeLa 40S». Nucleic Acids Res . 17 (21): 8441–9. doi :10.1093/nar/17.21.8441. PMC  335017. PMID  2587210 .
  • Swanson MS, Nakagawa TY, LeVan K, Dreyfuss G (1987). "Первичная структура белков ядерной рибонуклеопротеиновой частицы C человека: сохранение последовательности и доменных структур в гетерогенных ядерных РНК, мРНК и пре-рРНК-связывающих белках". Mol. Cell. Biol . 7 (5): 1731–9. doi :10.1128/mcb.7.5.1731. PMC  365274 . PMID  3110598.
  • Sébillon P, Beldjord C, Kaplan JC, Brody E, Marie J (1995). «Мутация AT в G в полипиримидиновом тракте второго интрона гена бета-глобина человека снижает эффективность сплайсинга in vitro: доказательство повышенного взаимодействия hnRNP C». Nucleic Acids Res . 23 (17): 3419–25. doi :10.1093/nar/23.17.3419. PMC  307219. PMID  7567451 .
  • Като С, Секин С, О С, Ким Н. С., Умэдзава И., Абэ Н., Ёкояма-Кобаяши М., Аоки Т. (1995). «Создание банка человеческой полноразмерной ДНК». Gene . 150 (2): 243–50. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID  7821789.
  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Huang M, Rech JE, Northington SJ, Flicker PF, Mayeda A, Krainer AR, LeStourgeon WM (1994). «Тетрамер C-белка связывает 230–240 нуклеотидов пре-мРНК и зарождает сборку 40S гетерогенных ядерных рибонуклеопротеиновых частиц». Mol. Cell. Biol . 14 (1): 518–33. doi :10.1128/mcb.14.1.518. PMC  358402. PMID  8264621 .
  • Hamilton BJ, Nagy E, Malter JS, Arrick BA, Rigby WF (1993). "Ассоциация гетерогенных ядерных рибонуклеопротеиновых белков A1 и C с повторяющимися последовательностями AUUUA". J. Biol. Chem . 268 (12): 8881–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)52955-0 . PMID  8473331.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Romero F, Ramos-Morales F, Domínguez A, Rios RM, Schweighoffer F, Tocqué B, Pintor-Toro JA, Fischer S, Tortolero M (1998). "Grb2 и его апоптотическая изоформа Grb3-3 ассоциируются с гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином C, и эти взаимодействия модулируются поли(U) РНК". J. Biol. Chem . 273 (13): 7776–81. doi : 10.1074/jbc.273.13.7776 . PMID  9516488.
  • Neubauer G, King A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать многобелковый сплайсосомный комплекс». Nat. Genet . 20 (1): 46–50. doi :10.1038/1700. PMID  9731529. S2CID  585778.
  • Sella O, Gerlitz G, Le SY, Elroy-Stein O (1999). "Индуцированная дифференциацией внутренняя трансляция c-sis мРНК: анализ cis-элементов и их дифференцируемого связывания с белком hnRNP C". Mol. Cell. Biol . 19 (8): 5429–40. doi : 10.1128/mcb.19.8.5429. PMC  84385. PMID  10409733.
  • Wang W, Furneaux H, Cheng H, Caldwell MC, Hutter D, Liu Y, Holbrook N, Gorospe M (2000). "HuR регулирует стабилизацию мРНК p21 под действием УФ-излучения". Mol. Cell. Biol . 20 (3): 760–9. doi : 10.1128/MCB.20.3.760-769.2000. PMC  85192. PMID  10629032.
  • Spångberg K, Wiklund L, Schwartz S (2000). "HuR, белок, участвующий в распаде мРНК онкогенов и факторов роста, связывается с 3'-концами РНК вируса гепатита С обеих полярностей". Вирусология . 274 (2): 378–90. doi : 10.1006/viro.2000.0461 . PMID  10964780.
  • Shahied L, Braswell EH, LeStourgeon WM, Krezel AM (2001). «Антипараллельный пучок из четырех спиралей ориентирует сайты связывания высокоаффинной РНК в hnRNP C: механизм активности РНК-шаперонина». J. Mol. Biol . 305 (4): 817–28. doi :10.1006/jmbi.2000.4331. PMID  11162094.
  • Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID  11790298.
  • Stone JR, Collins T (2002). «Быстрое фосфорилирование гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина C1/C2 в ответ на физиологические уровни перекиси водорода в эндотелиальных клетках человека». J. Biol. Chem . 277 (18): 15621–8. doi : 10.1074/jbc.M112153200 . PMID  11877401.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=HNRNPC&oldid=1215901515"