HMG20B

HMG20B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2CRJ
Идентификаторы
Псевдонимы	HMG20B , BRAF25, BRAF35, HMGX2, HMGXB2, PP7706, SMARCE1r, SOXL, pp8857, группа высокой мобильности 20B
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605535; МГИ : 1341190; гомологен : 74949; Генные карты : HMG20B; ОМА :HMG20B - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 19 (человек)
Конец	3,579,088 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 10 (мышь)
Конец	81,186,314 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	икроножный нерв; ; стромальная клетка эндометрия; ; обонятельная зона слизистой оболочки носа; ; кожа ноги; ; мышечный слой сигмовидной кишки; ; канал шейки матки; ; подколенная артерия; ; большеберцовые артерии; ; кожа живота; ; правая маточная труба;
	Верх выражен в
	межжелудочковая перегородка; ; губа; ; желточный мешок; ; генитальный бугорок; ; гранулоцит; ; желудочковая зона; ; линза; ; внутренняя сонная артерия; ; хвост эмбриона; ; двенадцатиперстная кишка;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность гетеродимеризации белка; связывание ДНК; связывание белков; активность гистондеацетилазы; ДНК-связывающая активность фактора транскрипции, специфичная для РНК-полимеразы II;
Клеточный компонент	ядро; нуклеоплазма; хромосома; ядерное тело;
Биологический процесс	дифференцировка клеток скелетных мышц; клеточный цикл; отрицательная регуляция сумоилирования белков; свертывание крови; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; позитивная регуляция дифференциации нейронов; транскрипция, ДНК-шаблон; деацетилирование гистонов; организация хроматина; регуляция транскрипции РНК-полимеразой II;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	10362
	15353
	ENSG00000064961
	ENSMUSG00000020232
	Q9P0W2
	Q9Z104
	NM_006339
	НМ_001163165 ; НМ_001163166 ; НМ_010440
	NP_006330
	НП_001156637 ; НП_001156638 ; НП_034570
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

SWI/SNF-связанный с матриксом актин-зависимый регулятор хроматина подсемейства E, относящийся к белку 1 , который у людей кодируется геном HMG20B . [ ^5]^[6]

HMG20B — это белок, связывающий ДНК с группой высокой подвижности (HMG). HMG20B содержит карбоксильную концевую область, которая необходима для цитокинеза, поскольку она регулирует прогрессирование клеточного цикла от фазы G2 до митоза ^[7]. Эта карбоксильная концевая область HMG20B взаимодействует с белком-супрессором опухолей BRCA2 . Конкретная мутация в этой области гена HMG20B связана с раком легких . Эта мутация препятствует ассоциации белков HMG20B и BRCA2. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что HMG20B взаимодействует с:

BRCA2 , ^[8]^[9]
HDAC1 , ^[8]
HDAC2 , ^[8]^[10]
КИФ4А , ^[11]
PHF21A , ^[8]^[12] и
RCOR1 . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000064961 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020232 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сумой Л., Карим Л., Эскарселлер М., Надаль М., Гратакос М., Пухана М.А., Эстивилл X, Перал Б (июнь 2000 г.). «HMG20A и HMG20B картируются на хромосомах человека 15q24 и 19p13.3 и составляют отдельный класс генов HMG-бокса с повсеместной экспрессией». Цитогенетика и клеточная генетика . 88 ( 1–2 ): 62–7 . дои : 10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.
^ "Entrez Gene: HMG20B высокомобильная группа 20B".
^ ab Lee M, Venkitaraman AR (2014). «Мутация, связанная с раком, инактивирует область белка группы высокой подвижности HMG20b, необходимого для цитокинеза». Cell Cycle . 13 (16): 2554– 63. doi :10.4161/15384101.2014.942204. PMC 4614378 . PMID 25486196.
^ abcde Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (май 2002 г.). «Комплекс core-BRAF35, содержащий гистондеацетилазу, опосредует репрессию нейронально-специфических генов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420– 5. Bibcode : 2002PNAS...99.7420H. doi : 10.1073/pnas.112008599 . PMC 124246. PMID 12032298 .
^ Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан ГК, Бочар Д.А., Бения Х, Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный ДНК-связывающий компонент, влияет на развитие клеточного цикла». Клетка . 104 (2): 247–57 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . PMID 11207365. S2CID 5822368.
^ Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (февраль 2003 г.). «Кандидатный ген умственной отсталости, связанный с Х-хромосомой, является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии . 278 (9): 7234– 9. doi : 10.1074/jbc.M208992200 . PMID 12493763.
^ Lee YM, Kim W (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация белка суперсемейства человеческого кинезина 4 с фактором 35, ассоциированным с BRCA2». The Biochemical Journal . 374 (Pt 2): 497– 503. doi :10.1042/BJ20030452. PMC 1223617 . PMID 12809554.
^ Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–8 . doi :10.1016/j.bbrc.2004.07.163. ПМИД 15325272.

Дальнейшее чтение

Wattler F, Wattler S, Kelly M, Skinner HB, Nehls M (сентябрь 1999 г.). «Клонирование, хромосомное расположение и анализ экспрессии мышиного Smarce1-родственного, нового члена семейства генов группы высокой подвижности 365». Genomics . 60 (2): 172– 8. doi :10.1006/geno.1999.5913. PMID 10486208.
Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан ГК, Бочар Д.А., Бения Х., Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный компонент, связывающийся с ДНК, влияет на развитие клеточного цикла». Клетка . 104 (2): 247–57 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . PMID 11207365. S2CID 5822368.
Lee YM, Shin H, Choi W, Ahn S, Kim W (апрель 2002 г.). «Характеристика белка группы высокой подвижности SMARCE1r человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1574 (3): 269– 76. doi :10.1016/s0167-4781(01)00373-6. PMID 11997092.
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (май 2002 г.). «Комплекс core-BRAF35, содержащий гистондеацетилазу, опосредует репрессию нейронально-специфических генов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420– 5. Bibcode : 2002PNAS...99.7420H. doi : 10.1073/pnas.112008599 . PMC 124246. PMID 12032298 .
Wang C, McCarty IM, Balazs L, Li Y, Steiner MS (июль 2002 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей альтернативно сплайсированный белок фактора 35, ассоциированного с BRCA2». Biochemical and Biophysical Research Communications . 295 (1): 129– 35. doi :10.1016/S0006-291X(02)00624-1. PMID 12083779.
Wang C, McCarty IM, Balazs L, Li Y, Steiner MS (июль 2002 г.). «Иммуногистологическое обнаружение BRAF25 в образцах опухолей и рака предстательной железы человека». Biochemical and Biophysical Research Communications . 295 (1): 136– 41. doi :10.1016/S0006-291X(02)00625-3. PMID 12083780.
Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (февраль 2003 г.). «Кандидатный ген умственной отсталости, связанный с Х-хромосомой, является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии . 278 (9): 7234– 9. doi : 10.1074/jbc.M208992200 . PMID 12493763.
Lee YM, Kim W (сентябрь 2003 г.). «Связь белка суперсемейства человеческого кинезина, члена 4, с фактором 35, ассоциированным с BRCA2». The Biochemical Journal . 374 (Pt 2): 497– 503. doi :10.1042/BJ20030452. PMC 1223617 . PMID 12809554.
Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–8 . doi :10.1016/j.bbrc.2004.07.163. ПМИД 15325272.
Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Внешние ссылки

Расположение гена человека HMG20B в браузере генома UCSC .
Подробная информация о гене человека HMG20B в браузере геномов UCSC .

Эта статья о гене на хромосоме 19 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000064961 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020232 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10773667-5] Сумой Л., Карим Л., Эскарселлер М., Надаль М., Гратакос М., Пухана М.А., Эстивилл X, Перал Б (июнь 2000 г.). «HMG20A и HMG20B картируются на хромосомах человека 15q24 и 19p13.3 и составляют отдельный класс генов HMG-бокса с повсеместной экспрессией». Цитогенетика и клеточная генетика . 88 ( 1–2 ): 62–7 . дои : 10.1159/000015486. PMID 10773667. S2CID 22921110.

[entrez-6] "Entrez Gene: HMG20B высокомобильная группа 20B".

[Lee2014-7] Lee M, Venkitaraman AR (2014). «Мутация, связанная с раком, инактивирует область белка группы высокой подвижности HMG20b, необходимого для цитокинеза». Cell Cycle . 13 (16): 2554– 63. doi :10.4161/15384101.2014.942204. PMC 4614378 . PMID 25486196.

[pmid12032298-8] Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (май 2002 г.). «Комплекс core-BRAF35, содержащий гистондеацетилазу, опосредует репрессию нейронально-специфических генов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (11): 7420– 5. Bibcode : 2002PNAS...99.7420H. doi : 10.1073/pnas.112008599 . PMC 124246. PMID 12032298 .

[pmid11207365-9] Марморштейн Л.Ю., Кинев А.В., Чан ГК, Бочар Д.А., Бения Х, Эпштейн Дж.А., Йен Т.Дж., Шихаттар Р. (январь 2001 г.). «Комплекс BRCA2 человека, содержащий структурный ДНК-связывающий компонент, влияет на развитие клеточного цикла». Клетка . 104 (2): 247–57 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . PMID 11207365. S2CID 5822368.

[pmid12493763-10] Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (февраль 2003 г.). «Кандидатный ген умственной отсталости, связанный с Х-хромосомой, является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии . 278 (9): 7234– 9. doi : 10.1074/jbc.M208992200 . PMID 12493763.

[pmid12809554-11] Lee YM, Kim W (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация белка суперсемейства человеческого кинезина 4 с фактором 35, ассоциированным с BRCA2». The Biochemical Journal . 374 (Pt 2): 497– 503. doi :10.1042/BJ20030452. PMC 1223617 . PMID 12809554.

[pmid15325272-12] Ивасе С., Джанума А., Миямото К., Шоно Н., Хонда А., Янагисава Дж., Баба Т. (сентябрь 2004 г.). «Характеристика BHC80 в комплексе BRAF-HDAC, участвующем в репрессии нейрон-специфических генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (2): 601–8 . doi :10.1016/j.bbrc.2004.07.163. ПМИД 15325272.