вирус эшерихии HK97

вирус эшерихии HK97
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Дуплоднавирия
Королевство:	Хынгонгвире
Тип:	Уровирикота
Сорт:	Каудовирицеты
Заказ:	Каудовирусы
Семья:	Сифовирусы
Род:	вирус Хендрикса
Разновидность:	вирус эшерихии HK97

Виды вируса

Вирус Escherichia HK97 , часто сокращаемый до HK97, является видом вируса , который заражает Escherichia coli и родственные бактерии . Он назван в честь Гонконга (HK), где он был впервые обнаружен. Геном HK97 представляет собой двухцепочечную ДНК.

Сборка и созревание

Вирус Escherichia HK97, полученный с помощью просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ) при увеличении 300000x.

Основной капсидный белок HK97, называемый gp5, при созревании сшивается, образуя структуру, похожую на кольчугу . ^[1] Пока ДНК упаковывается в капсид, капсид расширяется почти на 5 нм и меняет форму со сферической на икосаэдрическую. ^{[ требуется ссылка ]}

Путь сборки HK97 начинается с самосборки gp5 в пентамеры и гексамеры. Протеаза, называемая gp4, расщепляет gp5 на его N-конце . Присоединение портального белка gp3 в сочетании с конформационными изменениями приводит к образованию проголовки , или прокапсида, который является предшественником зрелого капсида. ^[2] Для сборки капсида не требуется белок-каркас. [ 3 ^] Однако исследования эффектов удаления дельта-домена основного капсидного белка или его частей показывают, что он необходим для сборки. ^[4]

Ссылки

^ Helgstrand, Charlotte; Wikoff, William R; Duda, Robert L; Hendrix, Roger W; Johnson, John E; Liljas, Lars (1 декабря 2003 г.). «Усовершенствованная структура белковой катенаны: капсид бактериофага HK97 с разрешением 3,44Å». Journal of Molecular Biology . 334 (5): 885–899. doi :10.1016/j.jmb.2003.09.035. PMID 14643655.
^ Хендрикс, РВ; Джонсон, ДЖЕ (2012). «Сборка и созревание капсида бактериофага HK97». Вирусные молекулярные машины . Достижения в экспериментальной медицине и биологии. Том 726. С. 351–63. doi :10.1007/978-1-4614-0980-9_15. ISBN 978-1-4614-0979-3. PMID 22297521.
^ Duda RL, Martincic K, Hendrix RW (1995). «Генетическая основа сборки проголовки бактериофага HK97». J. Mol. Biol . 247 (4): 636–47. doi :10.1006/jmbi.1994.0169. PMID 7723020.
^ Oh B, Moyer CL, Hendrix RW, Duda RL (2014). «Дельта-домен основного капсидного белка HK97 необходим для сборки». Вирусология . 456–457: 171–8. doi :10.1016/j.virol.2014.03.022. PMC 4044616. PMID 24889236 .

Дальнейшее чтение

Публикации доктора Боба Дуды
Архив публикаций доктора Роджера Хендрикса от 25.11.2014 на Wayback Machine

Внешние ссылки

Таксономия UniProt: фаг энтеробактерий HK97

[1] Helgstrand, Charlotte; Wikoff, William R; Duda, Robert L; Hendrix, Roger W; Johnson, John E; Liljas, Lars (1 декабря 2003 г.). «Усовершенствованная структура белковой катенаны: капсид бактериофага HK97 с разрешением 3,44Å». Journal of Molecular Biology . 334 (5): 885–899. doi :10.1016/j.jmb.2003.09.035. PMID 14643655.

[2] Хендрикс, РВ; Джонсон, ДЖЕ (2012). «Сборка и созревание капсида бактериофага HK97». Вирусные молекулярные машины . Достижения в экспериментальной медицине и биологии. Том 726. С. 351–63. doi :10.1007/978-1-4614-0980-9_15. ISBN 978-1-4614-0979-3. PMID 22297521.

[pmid7723020-3] Duda RL, Martincic K, Hendrix RW (1995). «Генетическая основа сборки проголовки бактериофага HK97». J. Mol. Biol . 247 (4): 636–47. doi :10.1006/jmbi.1994.0169. PMID 7723020.

[pmid24889236-4] Oh B, Moyer CL, Hendrix RW, Duda RL (2014). «Дельта-домен основного капсидного белка HK97 необходим для сборки». Вирусология . 456–457: 171–8. doi :10.1016/j.virol.2014.03.022. PMC 4044616. PMID 24889236 .