ХИФ1АН

ХИФ1АН
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1H2K, 1H2L, 1H2M, 1H2N, 1IZ3, 1MZE, 1MZF, 1YCI, 2CGN, 2CGO, 2ILM, 2W0X, 2WA3, 2WA4, 2XUM, 2Y0I, 2YC0, 2YDE, 3D8C, 3KCX, 3KCY, 3OD4, 3P3N, 3P3P, 4AI8, 4B7E, 4B7K, 4BIO, 4JAA, 4NR1, 4Z2W, 4Z1V
Идентификаторы
Псевдонимы	HIF1AN , FIH1, ингибитор субъединицы альфа-индуцируемого гипоксией фактора 1, ингибитор субъединицы альфа-индуцируемого гипоксией фактора 1, HIFAN
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 606615; МГИ : 2442345; гомологен : 9906; Генные карты : HIF1AN; OMA :HIF1AN — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 10 (человек)
Конец	100,559,998 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 19 (мышь)
Конец	44,564,713 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	икроножная мышца; ; Скелетная мышечная ткань прямой мышцы живота; ; мышца бедра; ; ягодичные мышцы; ; сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; стромальная клетка эндометрия; ; трехглавая мышца плеча; ; четырехглавая мышца бедра; ; широкая латеральная мышца бедра; ; островок Лангерганса;
	Верх выражен в
	мышца бедра; ; коленный сустав; ; скелетная мышечная ткань; ; трехглавая мышца плеча; ; широкая латеральная мышца бедра; ; грудино-ключично-сосцевидная мышца; ; передняя большеберцовая мышца; ; височная мышца; ; двубрюшная мышца; ; икроножная мышца;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов железа; пептидил-аспарагин 3-диоксигеназная активность; активность гомодимеризации белка; связывание анкиринового повтора; связывание ионов цинка; активность диоксигеназы; связывание ионов металлов; Связывание NF-kappaB; Связывание выемки; связывание белков; связывание карбоновой кислоты; оксидоредуктазная активность; активность пептидил-гистидин диоксигеназы; активность газорецепторов кислорода; 2-оксоглутарат-зависимая диоксигеназная активность; гипоксия-индуцируемый фактор-аспарагиновая оксигеназная активность;
Клеточный компонент	цитоплазма; нуклеоплазма; перинуклеарная область цитоплазмы; ядро; цитозоль;
Биологический процесс	регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; гидроксилирование пептидил-гистидина; транскрипция, ДНК-шаблон; гидроксилирование пептидил-аспарагиновой кислоты; гидроксилирование пептидил-аспарагина; позитивная регуляция дифференцировки миобластов; позитивная регуляция васкулогенеза; регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию; негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию; негативная регуляция сигнального пути Notch;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	55662
	319594
	ENSG00000166135
	ENSMUSG00000036450
	Q9NWT6
	Q8BLR9
	NM_017902
	NM_176958
	NP_060372
	NP_795932
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Ингибитор фактора 1-альфа, индуцируемого гипоксией (FIH), представляет собой белок , который у людей кодируется геном HIF1AN . [ ^5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что FIH взаимодействует с HIF1A ^[5] и супрессором опухолей Von Hippel-Lindau . ^[5] Кроме того, аспарагинилгидроксилирование HIF1α FIH-1 (HIF1AN) в N803 ухудшает его взаимодействие с CBP/P300. ^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000166135 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036450 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc Mahon PC, Hirota K, Semenza GL (октябрь 2001 г.). "FIH-1: новый белок, который взаимодействует с HIF-1α и VHL для опосредования репрессии транскрипционной активности HIF-1". Genes Dev . 15 (20): 2675– 86. doi :10.1101/gad.924501. PMC 312814. PMID 11641274 .
^ «Ген Энтреза: фактор 1, индуцируемый гипоксией HIF1AN, ингибитор субъединицы альфа».
^ Чен С, Лу Т (2017). «Факторы, индуцируемые гипоксией при гепатоцеллюлярной карциноме». Oncotarget . 8 (28): 46691– 703. doi :10.18632/oncotarget.17358. PMC 5542303 . PMID 28493839.

Дальнейшее чтение

Lando D, Peet DJ, Whelan DA, Gorman JJ, Whitelaw ML (2002). «Аспарагиновое гидроксилирование домена трансактивации HIF — гипоксический переключатель». Science . 295 (5556): 858– 61. Bibcode :2002Sci...295..858L. doi :10.1126/science.1068592. PMID 11823643. S2CID 24045310.
Freedman SJ, Sun ZY, Poy F, Kung AL, Livingston DM, Wagner G, Eck MJ (2002). "Структурная основа для рекрутирования CBP/p300 гипоксией-индуцируемым фактором-1α". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (8): 5367– 72. Bibcode :2002PNAS...99.5367F. doi : 10.1073/pnas.082117899 . PMC 122775 . PMID 11959990.
Hewitson KS, McNeill LA, Riordan MV, Tian YM, Bullock AN, Welford RW, Elkins JM, Oldham NJ, Bhattacharya S, Gleadle JM, Ratcliffe PJ, Pugh CW, Schofield CJ (2002). "Аспарагингидроксилаза фактора, индуцируемого гипоксией (HIF), идентична фактору, ингибирующему HIF (FIH), и относится к структурному семейству купинов". J. Biol. Chem . 277 (29): 26351– 5. doi : 10.1074/jbc.C200273200 . PMID 12042299.
Lando D, Peet DJ, Gorman JJ, Whelan DA, Whitelaw ML, Bruick RK (2002). "FIH-1 — это фермент аспарагинилгидроксилаза, который регулирует транскрипционную активность фактора, индуцируемого гипоксией". Genes Dev . 16 (12): 1466–71 . doi :10.1101/gad.991402. PMC 186346. PMID 12080085 .
Dann CE, Bruick RK, Deisenhofer J (2003). "Структура фактора, ингибирующего гипоксию-индуцируемый фактор 1: аспарагинилгидроксилаза, участвующая в пути гипоксического ответа". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (24): 15351– 6. doi : 10.1073/pnas.202614999 . PMC 137720 . PMID 12432100.
Elkins JM, Hewitson KS, McNeill LA, Seibel JF, Schlemminger I, Pugh CW, Ratcliffe PJ, Schofield CJ (2003). "Структура фактора, ингибирующего гипоксию-индуцируемый фактор (HIF), раскрывает механизм окислительной модификации HIF-1 альфа". J. Biol. Chem . 278 (3): 1802– 6. doi : 10.1074/jbc.C200644200 . PMID 12446723.
Lee C, Kim SJ, Jeong DG, Lee SM, Ryu SE (2003). «Структура человеческого FIH-1 раскрывает уникальный карман активного сайта и сайты взаимодействия для HIF-1 и фон Хиппель-Линдау». J. Biol. Chem . 278 (9): 7558– 63. doi : 10.1074/jbc.M210385200 . PMID 12482756.
Koivunen P, Hirsilä M, Günzler V, Kivirikko KI, Myllyharju J (2004). «Каталитические свойства аспарагинилгидроксилазы (FIH) в пути восприятия кислорода отличаются от свойств ее пролил-4-гидроксилаз». J. Biol. Chem . 279 (11): 9899– 904. doi : 10.1074/jbc.M312254200 . PMID 14701857.
Linke S, Stojkoski C, Kewley RJ, Booker GW, Whitelaw ML, Peet DJ (2004). "Требования к субстрату для фактора, ингибирующего гипоксию, чувствительного к кислороду, аспарагинилгидроксилазного фактора". J. Biol. Chem . 279 (14): 14391– 7. doi : 10.1074/jbc.M313614200 . PMID 14734545.
Kato H, Tamamizu-Kato S, Shibasaki F (2004). «Гистондеацетилаза 7 ассоциируется с индуцируемым гипоксией фактором 1альфа и увеличивает транскрипционную активность». J. Biol. Chem . 279 (40): 41966– 74. doi : 10.1074/jbc.M406320200 . PMID 15280364.
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Cockman ME, Lancaster DE, Stolze IP, Hewitson KS, McDonough MA, Coleman ML, Coles CH, Yu X, Hay RT, Ley SC, Pugh CW, Oldham NJ, Masson N, Schofield CJ, Ratcliffe PJ (2006). "Посттрансляционное гидроксилирование анкириновых повторов в белках IκB аспарагинилгидроксилазой фактора, индуцируемого гипоксией (HIF), фактора, ингибирующего HIF (FIH)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (40): 14767– 72. Bibcode : 2006PNAS..10314767C. doi : 10.1073/pnas.0606877103 . PMC 1578504 . PMID 17003112.
Coleman ML, McDonough MA, Hewitson KS, Coles C, Mecinovic J, Edelmann M, Cook KM, Cockman ME, Lancaster DE, Kessler BM, Oldham NJ, Ratcliffe PJ, Schofield CJ (2007). "Аспарагинилгидроксилирование домена повтора анкирина Notch фактором, ингибирующим индуцируемый гипоксией фактор". J. Biol. Chem . 282 (33): 24027– 38. doi : 10.1074/jbc.M704102200 . PMID 17573339.
Chen C, Lou T (2017). «Факторы, индуцируемые гипоксией при гепатоцеллюлярной карциноме». Oncotarget . 8 (28): 46691– 703. doi : 10.18632/oncotarget.17358 . PMC 5542303 . PMID 28493839.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 10 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000166135 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036450 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11641274-5] Mahon PC, Hirota K, Semenza GL (октябрь 2001 г.). "FIH-1: новый белок, который взаимодействует с HIF-1α и VHL для опосредования репрессии транскрипционной активности HIF-1". Genes Dev . 15 (20): 2675– 86. doi :10.1101/gad.924501. PMC 312814. PMID 11641274 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: фактор 1, индуцируемый гипоксией HIF1AN, ингибитор субъединицы альфа».

[pmid28493839-7] Чен С, Лу Т (2017). «Факторы, индуцируемые гипоксией при гепатоцеллюлярной карциноме». Oncotarget . 8 (28): 46691– 703. doi :10.18632/oncotarget.17358. PMC 5542303 . PMID 28493839.