GTF2H4

GTF2H4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	5IY9, 5IVW, 5IY7, 5IY8, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2H4 , общий фактор транскрипции IIH, полипептид 4, 52 кДа, P52, TFB2, TFIIH, субъединица 4 общего фактора транскрипции IIH
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601760; МГИ : 1338799; гомологен : 7090; Генные карты : GTF2H4; OMA :GTF2H4 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 6 (человек)
Конец	30,914,106 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	35,984,631 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правая доля печени; ; Гипофиз; ; правое полушарие мозжечка; ; передняя доля гипофиза; ; левая доля щитовидной железы; ; правая доля щитовидной железы; ; тело матки; ; большеберцовые артерии; ; правая коронарная артерия; ; верхушка сердца;
	Верх выражен в
	тимус; ; слуховой пузырек; ; слуховая плакода; ; сперматоцит; ; эпибласт; ; мешочек; ; выступ нижней челюсти; ; брюшная стенка; ; верхнечелюстной выступ; ; желудочковая зона;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность протеинкиназы; АТФ-зависимая активность, действующая на ДНК; Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; ДНК-хеликазная активность; связывание белков; РНК-полимераза II CTD гептапептидная повторная киназная активность; связывание двухцепочечной ДНК; Активность активатора АТФазы; РНК-полимераза II общая активность фактора инициации транскрипции;
Клеточный компонент	нуклеоплазма; транскрипционный фактор TFIIH голо комплекс; основная часть комплекса TFIIH голографического комплекса TFIIH; комплекс основного фактора транскрипции TFIIH; ядро; комплекс факторов транскрипции TFIID; ядерная пылинка;
Биологический процесс	прекращение транскрипции РНК-полимеразы I; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; фосфорилирование С-концевого домена РНК-полимеразы II; инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I; удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; Кэпирование мРНК 7-метилгуанозином; транскрипция РНК-полимеразой II; транскрипция, ДНК-шаблон; клеточный ответ на повреждение ДНК; глобальная геномная нуклеотидная эксцизионная репарация; нуклеотидная эксцизионная репарация, связанная с транскрипцией; инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК; восстановление ДНК; нуклеотид-эксцизионная репарация; нуклеотид-эксцизионная репарация, стабилизация преинцизионного комплекса; нуклеотид-эксцизионная репарация, сборка преинцизионного комплекса; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК, повреждение 5'-конца; раскручивание дуплекса ДНК; позитивная регуляция АТФ-зависимой активности; нуклеотид-эксцизионная репарация, раскручивание дуплекса ДНК; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК, повреждение 3'-конца; удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы I;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	2968
	14885
	ENSG00000213780
	ENSMUSG00000001524
	Q92759
	О70422
	NM_001517
	NM_010364
	NP_001508
	NP_034494
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица 4 общего фактора транскрипции IIH представляет собой белок , который у человека кодируется геном GTF2H4 . ^[5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что GTF2H4 взаимодействует с:

Смотрите также

Фактор транскрипции II H

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213780 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001524 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции/репарации ДНК TFIIH». EMBO J . 16 (5): 1093– 102. doi :10.1093/emboj/16.5.1093. PMC 1169708 . PMID 9118947.
^ "Ген Энтреза: GTF2H4 общий фактор транскрипции IIH, полипептид 4, 52 кДа".
^ abcde Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (май 1997). "BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605– 10. Bibcode :1997PNAS...94.5605S. doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119.
^ Джилья-Мари Г, Монет Ф, Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Вигерс Н., Джасперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсолд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен В. (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за трихотиодистрофию группы А синдрома репарации ДНК». Нат. Жене . 36 (7): 714–9 . doi : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921.

Дальнейшее чтение

Джинг КТ (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Sci . 5 (1): 24– 7. doi :10.1007/BF02253352. PMID 9570510.
Янкулов К, Бентли Д (1998). "Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и транскрипционное удлинение". Curr. Biol . 8 (13): R447-9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646.
Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). "Три функциональных класса домена активации транскрипции". Mol. Cell. Biol . 16 (5): 2044– 55. doi :10.1128/MCB.16.5.2044. PMC 231191. PMID 8628270 .
Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D (1996). "Киназа, активирующая циклинзависимую киназу человека, существует в трех различных комплексах". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (13): 6488– 93. Bibcode :1996PNAS...93.6488D. doi : 10.1073/pnas.93.13.6488 . PMC 39050 . PMID 8692842.
Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: кофактор для стимуляции транскрипционного удлинения HIV-1 Tat". Science . 274 (5287): 605– 10. Bibcode :1996Sci...274..605Z. doi :10.1126/science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Parada CA, Roeder RG (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванная фосфорилированием ее карбокси-концевого домена, вызванным Tat». Nature . 384 (6607): 375– 8. Bibcode :1996Natur.384..375P. doi :10.1038/384375a0. PMID 8934526. S2CID 4278432.
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2". J. Biol. Chem . 272 (11): 6951– 8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II». Mol. Cell. Biol . 17 (4): 1817– 23. doi : 10.1128 /mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (1997). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (CAK) изменяется при ассоциации с TFIIH». EMBO J . 16 (7): 1628– 37. doi :10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767 . PMID 9130708.
Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). "BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605– 10. Bibcode :1997PNAS...94.5605S. doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119.
García-Martínez LF, Mavankal G, Neveu JM, Lane WS, Ivanov D, Gaynor RB (1997). «Очистка Tat-ассоциированной киназы выявляет комплекс TFIIH, который модулирует транскрипцию ВИЧ-1». EMBO J . 16 (10): 2836– 50. doi :10.1093/emboj/16.10.2836. PMC 1169892 . PMID 9184228.
Nekhai S, Shukla RR, Kumar A (1997). "Первичная Т-лимфоцитарная производная вируса иммунодефицита человека типа 1 Tat-ассоциированная киназа фосфорилирует С-концевой домен РНК-полимеразы II и индуцирует активность CAK". J. Virol . 71 (10): 7436– 41. doi :10.1128/JVI.71.10.7436-7441.1997. PMC 192089 . PMID 9311822.
Cujec TP, Okamoto H, Fujinaga K, Meyer J, Chamberlin H, Morgan DO, Peterlin BM (1997). "Трансактиватор ВИЧ TAT связывается с активирующей CDK киназой и активирует фосфорилирование карбокси-концевого домена РНК-полимеразы II". Genes Dev . 11 (20): 2645– 57. doi :10.1101/gad.11.20.2645. PMC 316603. PMID 9334327 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом". Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Li XY, Green MR (1998). "Клеточный коактиватор Tat ВИЧ-1 Tat Tat-SF1 является общим фактором удлинения транскрипции". Genes Dev . 12 (19): 2992– 6. doi :10.1101/gad.12.19.2992. PMC 317190. PMID 9765201 .
Ping YH, Rana TM (1999). "Tat-ассоциированная киназа (P-TEFb): компонент комплексов преинициации и удлинения транскрипции". J. Biol. Chem . 274 (11): 7399– 404. doi : 10.1074/jbc.274.11.7399 . PMID 10066804.

Внешние ссылки

GTF2H4+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья о гене на хромосоме 6 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213780 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001524 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9118947-5] Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции/репарации ДНК TFIIH». EMBO J . 16 (5): 1093– 102. doi :10.1093/emboj/16.5.1093. PMC 1169708 . PMID 9118947.

[entrez-6] "Ген Энтреза: GTF2H4 общий фактор транскрипции IIH, полипептид 4, 52 кДа".

[pmid9159119-7] Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (май 1997). "BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605– 10. Bibcode :1997PNAS...94.5605S. doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119.

[pmid15220921-8] Джилья-Мари Г, Монет Ф, Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Вигерс Н., Джасперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсолд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен В. (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за трихотиодистрофию группы А синдрома репарации ДНК». Нат. Жене . 36 (7): 714–9 . doi : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921.