GTF2H1

GTF2H1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1PFJ, 2DII, 2RNR, 2RUK, 2RVB
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2H1 , BTF2, P62, TFB1, TFIIH, субъединица 1 общего фактора транскрипции IIH
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 189972; МГИ : 1277216; гомологен : 3885; Генные карты : GTF2H1; OMA :GTF2H1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	18,367,045 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	46,473,224 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Ахиллово сухожилие; ; мозолистое тело; ; эндометрий; ; миндалина; ; правое яичко; ; левое яичко; ; моноцит; ; островок Лангерганса; ; гладкая мышечная ткань; ; желчный пузырь;
	Верх выражен в
	сперматоцит; ; сперматид; ; желточный мешок; ; Ростральный миграционный поток; ; слезная железа; ; генитальный бугорок; ; нервный слой сетчатки; ; эпибласт; ; морула; ; эндотелиальная клетка лимфатического сосуда;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность протеинкиназы; АТФ-зависимая активность, действующая на ДНК; связывание хроматина; связывание белков; РНК-полимераза II CTD гептапептидная повторная киназная активность;
Клеточный компонент	нуклеоплазма; транскрипционный фактор TFIIH голо комплекс; ядро; комплекс основного фактора транскрипции TFIIH;
Биологический процесс	прекращение транскрипции РНК-полимеразы I; регуляция активности циклинзависимой протеинсерин/треонин киназы; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I; удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; Кэпирование мРНК 7-метилгуанозином; транскрипция РНК-полимеразой II; транскрипция, ДНК-шаблон; клеточный ответ на повреждение ДНК; глобальная геномная нуклеотидная эксцизионная репарация; нуклеотидная эксцизионная репарация, связанная с транскрипцией; инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК; восстановление ДНК; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; нуклеотид-эксцизионная репарация, стабилизация преинцизионного комплекса; нуклеотид-эксцизионная репарация; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК, повреждение 5'-конца; нуклеотид-эксцизионная репарация, сборка преинцизионного комплекса; транскрипция РНК-полимеразой I; фосфорилирование С-концевого домена РНК-полимеразы II; нуклеотид-эксцизионная репарация, раскручивание дуплекса ДНК; нуклеотид-эксцизионная репарация, разрез ДНК, повреждение 3'-конца; удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы I;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	2965
	14884
	ENSG00000110768 ; ENSG00000288114
	ENSMUSG00000006599
	Р32780
	Q9DBA9
	NM_001142307 ; NM_005316
	NM_001291075 ; NM_008186 ; NM_001360075 ; NM_001360076
	NP_001135779 ; NP_005307
	НП_001278004 ; НП_032212 ; НП_001347004 ; НП_001347005
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица 1 общего фактора транскрипции IIH — это белок , который у человека кодируется геном GTF2H1 . [ ^5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что GTF2H1 взаимодействует с:

Циклинзависимая киназа 7 , ^[8]^[9]^[10]
Е2Ф1 , ^[11]
ERCC2 , ^[8]^[12]
Эстрогеновый рецептор альфа , ^[13]
TCEA1 , ^[14]^[15] и
XPB . ^[8]^[16]^[17]

Смотрите также

Фактор транскрипции II H

Ссылки

^ abc ENSG00000288114 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000110768, ENSG00000288114 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000006599 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Fischer L, Gerard M, Chalut C, Lutz Y, Humbert S, Kanno M, Chambon P, Egly JM (октябрь 1992 г.). «Клонирование 62-килодальтонного компонента основного фактора транскрипции BTF2». Science . 257 (5075): 1392–5. Bibcode :1992Sci...257.1392F. doi :10.1126/science.1529339. PMID 1529339.
^ Heng HH, Xiao H, Shi XM, Greenblatt J, Tsui LC (май 1994). «Гены, кодирующие общие факторы инициации транскрипции РНК-полимеразы II, рассеяны в геноме человека». Hum. Mol. Genet . 3 (1): 61–4. doi :10.1093/hmg/3.1.61. PMID 8162052.
^ "Ген Энтреза: GTF2H1 общий фактор транскрипции IIH, полипептид 1, 62 кДа".
^ abc Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (апрель 1997 г.). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (CAK) изменяется при ассоциации с TFIIH». EMBO J . 16 (7): 1628–37. doi :10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767 . PMID 9130708.
^ Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan DO, Reinberg D (март 1995). "Комплекс активирующей киназы Cdk является компонентом человеческого фактора транскрипции TFIIH". Nature . 374 (6519): 283–7. Bibcode :1995Natur.374..283S. doi :10.1038/374283a0. PMID 7533895. S2CID 4282418.
^ Йи А., Николс МА., Ву Л., Холл Ф.Л., Кобаяши Р., Сюн И. (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование CDK7-ассоциированного человеческого MAT1, фактора сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (CAK)». Cancer Res . 55 (24): 6058–62. PMID 8521393.
^ Vandel L, Kouzarides T (август 1999). «Остатки, фосфорилированные TFIIH, необходимы для деградации E2F-1 во время S-фазы». EMBO J . 18 (15): 4280–91. doi :10.1093/emboj/18.15.4280. PMC 1171504 . PMID 10428966.
^ Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (апрель 1994 г.). «Двойная роль TFIIH в репарации ДНК эксцизией и в транскрипции РНК-полимеразой II». Nature . 368 (6473): 769–72. Bibcode :1994Natur.368..769D. doi :10.1038/368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.
^ Chen D, Riedl T, Washbrook E, Pace PE, Coombes RC, Egly JM, Ali S (июль 2000 г.). «Активация рецептора эстрогена альфа фосфорилированием S118 включает лиганд-зависимое взаимодействие с TFIIH и участие CDK7». Mol. Cell . 6 (1): 127–37. doi :10.1016/s1097-2765(00)00014-9. PMID 10949034.
^ Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (октябрь 1998 г.). "FCP1, взаимодействующая с RAP74 субъединица человеческой протеинфосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксильный концевой домен РНК-полимеразы IIO". J. Biol. Chem . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293.
^ Pan G, Aso T, Greenblatt J (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов удлинения TFIIS и элонгина A с холоферментом РНК-полимеразы II человека, способным к специфической для промотора инициации и реагирующим на активаторы транскрипции». J. Biol. Chem . 272 (39): 24563–71. doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922.
^ Джилья-Мари Г, Монет Ф, Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Виджгерс Н., Джасперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсольд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен В. (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за трихотиодистрофию группы А синдрома репарации ДНК». Нат. Жене . 36 (7): 714–9. дои : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921.
^ Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (март 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции/репарации ДНК TFIIH». EMBO J . 16 (5): 1093–102. doi :10.1093/emboj/16.5.1093. PMC 1169708 . PMID 9118947.

Дальнейшее чтение

Джинг КТ (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi :10.1007/BF02253352. PMID 9570510.
Янкулов К, Бентли Д (1998). "Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и транскрипционное удлинение". Curr. Biol . 8 (13): R447-9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646.
Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan DO, Reinberg D (1995). "Комплекс активирующей киназы Cdk является компонентом человеческого фактора транскрипции TFIIH". Nature . 374 (6519): 283–7. Bibcode :1995Natur.374..283S. doi :10.1038/374283a0. PMID 7533895. S2CID 4282418.
Tong X, Drapkin R, Reinberg D, Kieff E (1995). «62- и 80-кДа субъединицы фактора транскрипции IIH опосредуют взаимодействие с ядерным белком 2 вируса Эпштейна-Барр». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (8): 3259–63. Bibcode :1995PNAS...92.3259T. doi : 10.1073/pnas.92.8.3259 . PMC 42145 . PMID 7724549.
Fantes JA, Oghene K, Boyle S, Danes S, Fletcher JM, Bruford EA, Williamson K, Seawright A, Schedl A, Hanson I (1995). "Высокоразрешающая интегрированная физическая, цитогенетическая и генетическая карта человеческой хромосомы 11: дистальная p13 к проксимальной p15.1". Genomics . 25 (2): 447–61. doi :10.1016/0888-7543(95)80045-N. PMID 7789978.
Xiao H, Pearson A, Coulombe B, Truant R, Zhang S, Regier JL, Triezenberg SJ, Reinberg D, Flores O, Ingles CJ (1994). "Связывание базального фактора транскрипции TFIIH с доменами кислотной активации VP16 и p53". Mol. Cell. Biol . 14 (10): 7013–24. doi :10.1128/mcb.14.10.7013. PMC 359231. PMID 7935417 .
Шеффер Л., Монколлин В., Рой Р., Стауб А., Меззина М., Сарасин А., Вида Г., Хоймейкерс Дж.Х., Эгли Дж.М. (1994). «Белок репарации ERCC2/ДНК связан с транскрипционным фактором BTF2/TFIIH класса II». ЭМБО Дж . 13 (10): 2388–92. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06522.x. ПМЦ 395103 . ПМИД 8194528.
Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). "Три функциональных класса домена активации транскрипции". Mol. Cell. Biol . 16 (5): 2044–55. doi :10.1128/MCB.16.5.2044. PMC 231191. PMID 8628270 .
Iyer N, Reagan MS, Wu KJ, Canagarajah B, Friedberg EC (1996). "Взаимодействия с участием комплекса транскрипции/эксцизионной репарации нуклеотидов человеческой РНК-полимеразы II TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Коккейна (CSB)". Биохимия . 35 (7): 2157–67. doi :10.1021/bi9524124. PMID 8652557.
Reardon JT, Ge H, Gibbs E, Sancar A, Hurwitz J, Pan ZQ (1996). "Выделение и характеристика двух комплексов, связанных с человеческим фактором транскрипции IIH (TFIIH): ERCC2/CAK и TFIIH". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (13): 6482–7. Bibcode :1996PNAS...93.6482R. doi : 10.1073/pnas.93.13.6482 . PMC 39049 . PMID 8692841.
Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D (1996). "Киназа, активирующая циклинзависимую киназу человека, существует в трех различных комплексах". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (13): 6488–93. Bibcode :1996PNAS...93.6488D. doi : 10.1073/pnas.93.13.6488 . PMC 39050 . PMID 8692842.
Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: кофактор для стимуляции транскрипционного удлинения HIV-1 Tat". Science . 274 (5287): 605–10. Bibcode :1996Sci...274..605Z. doi :10.1126/science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Parada CA, Roeder RG (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванная фосфорилированием ее карбокси-концевого домена, вызванным Tat». Nature . 384 (6607): 375–8. Bibcode :1996Natur.384..375P. doi :10.1038/384375a0. PMID 8934526. S2CID 4278432.
Гарсия-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор Р.Б. (1997). "Связь Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2". J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383.
Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (1997). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции/репарации ДНК TFIIH». EMBO J . 16 (5): 1093–102. doi :10.1093/emboj/16.5.1093. PMC 1169708 . PMID 9118947.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II». Mol. Cell. Biol . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128/mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (1997). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (CAK) изменяется при ассоциации с TFIIH». EMBO J . 16 (7): 1628–37. doi :10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767 . PMID 9130708.
García-Martínez LF, Mavankal G, Neveu JM, Lane WS, Ivanov D, Gaynor RB (1997). «Очистка Tat-ассоциированной киназы выявляет комплекс TFIIH, который модулирует транскрипцию ВИЧ-1». EMBO J . 16 (10): 2836–50. doi :10.1093/emboj/16.10.2836. PMC 1169892 . PMID 9184228.

Внешние ссылки

GTF2H1+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P32780 (субъединица 1 общего фактора транскрипции IIH) на сайте PDBe-KB .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000288114 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000110768, ENSG00000288114 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000006599 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1529339-5] Fischer L, Gerard M, Chalut C, Lutz Y, Humbert S, Kanno M, Chambon P, Egly JM (октябрь 1992 г.). «Клонирование 62-килодальтонного компонента основного фактора транскрипции BTF2». Science . 257 (5075): 1392–5. Bibcode :1992Sci...257.1392F. doi :10.1126/science.1529339. PMID 1529339.

[pmid8162052-6] Heng HH, Xiao H, Shi XM, Greenblatt J, Tsui LC (май 1994). «Гены, кодирующие общие факторы инициации транскрипции РНК-полимеразы II, рассеяны в геноме человека». Hum. Mol. Genet . 3 (1): 61–4. doi :10.1093/hmg/3.1.61. PMID 8162052.

[entrez-7] "Ген Энтреза: GTF2H1 общий фактор транскрипции IIH, полипептид 1, 62 кДа".

[pmid9130708-8] Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (апрель 1997 г.). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (CAK) изменяется при ассоциации с TFIIH». EMBO J . 16 (7): 1628–37. doi :10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767 . PMID 9130708.

[pmid7533895-9] Shiekhattar R, Mermelstein F, Fisher RP, Drapkin R, Dynlacht B, Wessling HC, Morgan DO, Reinberg D (март 1995). "Комплекс активирующей киназы Cdk является компонентом человеческого фактора транскрипции TFIIH". Nature . 374 (6519): 283–7. Bibcode :1995Natur.374..283S. doi :10.1038/374283a0. PMID 7533895. S2CID 4282418.

[pmid8521393-10] Йи А., Николс МА., Ву Л., Холл Ф.Л., Кобаяши Р., Сюн И. (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование CDK7-ассоциированного человеческого MAT1, фактора сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (CAK)». Cancer Res . 55 (24): 6058–62. PMID 8521393.

[pmid10428966-11] Vandel L, Kouzarides T (август 1999). «Остатки, фосфорилированные TFIIH, необходимы для деградации E2F-1 во время S-фазы». EMBO J . 18 (15): 4280–91. doi :10.1093/emboj/18.15.4280. PMC 1171504 . PMID 10428966.

[pmid8152490-12] Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (апрель 1994 г.). «Двойная роль TFIIH в репарации ДНК эксцизией и в транскрипции РНК-полимеразой II». Nature . 368 (6473): 769–72. Bibcode :1994Natur.368..769D. doi :10.1038/368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.

[pmid10949034-13] Chen D, Riedl T, Washbrook E, Pace PE, Coombes RC, Egly JM, Ali S (июль 2000 г.). «Активация рецептора эстрогена альфа фосфорилированием S118 включает лиганд-зависимое взаимодействие с TFIIH и участие CDK7». Mol. Cell . 6 (1): 127–37. doi :10.1016/s1097-2765(00)00014-9. PMID 10949034.

[pmid9765293-14] Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (октябрь 1998 г.). "FCP1, взаимодействующая с RAP74 субъединица человеческой протеинфосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксильный концевой домен РНК-полимеразы IIO". J. Biol. Chem . 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293.

[pmid9305922-15] Pan G, Aso T, Greenblatt J (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие факторов удлинения TFIIS и элонгина A с холоферментом РНК-полимеразы II человека, способным к специфической для промотора инициации и реагирующим на активаторы транскрипции». J. Biol. Chem . 272 (39): 24563–71. doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922.

[pmid15220921-16] Джилья-Мари Г, Монет Ф, Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Виджгерс Н., Джасперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсольд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен В. (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за трихотиодистрофию группы А синдрома репарации ДНК». Нат. Жене . 36 (7): 714–9. дои : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921.

[pmid9118947-17] Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (март 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции/репарации ДНК TFIIH». EMBO J . 16 (5): 1093–102. doi :10.1093/emboj/16.5.1093. PMC 1169708 . PMID 9118947.