Мотив РНК GOLLD

ЗОЛОТОЙ
ЗОЛОТОЙ
	Консенсусная вторичная структура и сохранение последовательности 3'-половины гигантской, орнаментированной, полученной от озерных и лактобацилл (GOLLD) РНК
Идентификаторы
Символ	ЗОЛОТОЙ
Рфам	РФ02032
Другие данные
Тип РНК	Ген
ТАК	SO:0001263
Структуры PDB	ПДБе

Гигантская, орнаментированная, полученная из озер и лактобацилл (GOLLD) РНК — это консервативная структура РНК, присутствующая в бактериях . Первоначально РНК GOLLD были обнаружены на основе метагеномных последовательностей ДНК , выделенных из озера Гатун в Панаме. ^[1] Однако известно, что они присутствуют по крайней мере в восьми штаммах культивируемых бактерий. РНК GOLLD необычайно велики по сравнению с другими РНК с консервативной, сложной вторичной структурой и в среднем состоят примерно из 800 нуклеотидов. Такие большие, сложные РНК часто являются рибозимами , хотя биохимическая функция РНК GOLLD остается неизвестной. Открытие больших РНК, таких как РНК GOLLD, среди бактерий, которые в основном не культивируются в лабораторных условиях, предполагает, что многие другие необычно большие РНК могут быть обнаружены в бактериях, которые еще не были изучены. ^[1]

РНК GOLLD в Lactobacillus brevis ATCC 367 была изучена экспериментально. ^[1] Эта РНК GOLLD, по-видимому, кодируется профагом , и ее транскрипция увеличивается во время литического цикла фага . Следовательно, эта РНК GOLLD предположительно выполняет функцию, которая полезна для фага во время этого процесса. РНК GOLLD часто располагаются вблизи транспортных РНК (тРНК), и в некоторых случаях предсказывают, что тРНК находится внутри самой структуры РНК GOLLD. Однако биологическая причина, лежащая в основе этой ассоциации, не понята. ^[1]

Недавно обнаруженная большая бактериальная РНК, названная мотивом РНК ROOL , разделяет свойства с РНК GOLLD. Помимо относительно большого размера и высокой степени структурной сложности этих мотивов РНК, они обе только иногда располагаются в профагах и часто располагаются рядом с тРНК. Однако последовательность и структуры РНК GOLLD и ROOL не связаны.

Модель Rfam РНК GOLLD использует только 3'-половину GOLLD, поскольку эта область полной РНК имеет высокую последовательность структуры.

Ссылки

^ abcd Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома». Nature . 462 (7273): 656–659. Bibcode :2009Natur.462..656W. doi :10.1038/nature08586. PMC 4140389 . PMID 19956260.

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[zasha-1] Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома». Nature . 462 (7273): 656–659. Bibcode :2009Natur.462..656W. doi :10.1038/nature08586. PMC 4140389 . PMID 19956260.