ГМ2А

ГМ2А
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1G13, 1PU5, 1PUB, 1TJJ, 2AF9, 2AG2, 2AG4, 2AG9
Идентификаторы
Псевдонимы	GM2A , GM2-AP, SAP-3, активатор ганглиозида GM2, GM2AP, активатор ганглиозида GM2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 613109; МГИ : 95762; гомологен : 349; Генные карты : GM2A; ОМА :GM2A – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 5 (человек)
Конец	151,270,440 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	55,003,855 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	вульва; ; человеческий пенис; ; плацента; ; эпителий шейки матки; ; десны; ; эпителий десны; ; кожа бедра; ; сосок; ; кожа бедра; ; нижний ганглий блуждающего нерва;
	Верх выражен в
	гаструла; ; верхняя поверхность языка; ; брыжеечные лимфатические узлы; ; восходящая аорта; ; аортальный клапан; ; сосудистое сплетение четвертого желудочка; ; желчный пузырь; ; вестибулярная мембрана улиткового протока; ; кучевые ячейки; ; надпочечник;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность липидного транспортера; активность активатора фосфолипазы; активность бета-N-ацетилгалактозаминидазы; активность бета-N-ацетилгексозаминидазы; активность активатора фермента; гидролазная активность; активность белка-активатора сфинголипида;
Клеточный компонент	цитоплазма; апикальная кора; лизосомальный просвет; митохондрия; АТФазный комплекс обмена калия и протона; цитоплазматическая сторона плазматической мембраны; лизосома; внеклеточная экзосома; внеклеточная область; азурофильные гранулы просвет; базолатеральная плазматическая мембрана; апикальная плазматическая мембрана;
Биологический процесс	положительная регуляция активности гидролазы; транспорт липидов; процесс метаболизма гликосфинголипидов; нервно-мышечный процесс, контролирующий равновесие; липидный обмен веществ; липидное хранение; нервная система процесс; обучение или память; катаболический процесс олигосахаридов; процесс метаболизма ганглиозидов; катаболический процесс ганглиозидов; процесс метаболизма сфинголипидов; дегрануляция нейтрофилов; позитивная регуляция каталитической активности;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	2760
	14667
	ENSG00000196743
	ENSMUSG00000000594
	P17900
	Q60648
	NM_001167607 ; NM_000405
	NM_010299
	NP_000396 ; NP_001161079
	NP_034429
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок млекопитающих обнаружен у Homo sapiens

Активатор ганглиозида GM2, также известный как GM2A, представляет собой белок , который у людей кодируется геном GM2A . ^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой небольшой гликолипидный транспортный белок, который действует как субстрат-специфический кофактор для лизосомального фермента β-гексозаминидазы А. β-гексозаминидаза А вместе с активатором ганглиозида GM2 катализирует деградацию ганглиозида GM2 и других молекул, содержащих терминальные N- ацетилгексозамины .

GM2A — белок-переносчик липидов, который стимулирует ферментативную обработку ганглиозидов , а также активацию Т-клеток посредством липидной презентации. Этот белок связывает молекулы ганглиозида GM2, извлекает их из мембран и представляет их бета- гексозаминидазе A для расщепления N-ацетил-D-галактозамина и преобразования в GM3.

В базе данных SMART он был идентифицирован как член семейства белков домена ML , участвующих в врожденном иммунитете и липидном обмене веществ . [1].

Регулирование

В меланоцитарных клетках экспрессия гена GM2A может регулироваться MITF . ^[7]

Клиническое значение

Мутации в этом гене, наследуемые по аутосомно-рецессивному типу, приводят к GM2-ганглиозидозу, варианту AB , редкому GM2-ганглиозидозу , симптомы и патология которого идентичны болезням Тея-Сакса и болезни Сандхоффа . ^[8]

Мутации GM2A регистрируются редко, а наблюдаемые случаи часто происходят у кровных родителей или в генетически изолированных популяциях. ^[9]

Поскольку вариант AB диагностируется очень редко, даже у младенцев, вполне вероятно, что большинство мутаций GM2A фатальны для плода в гомозиготах и генетических соединениях и, таким образом, никогда не наблюдаются клинически.

Смотрите также

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000196743 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000594 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Li SC, Nakamura T, Ogamo A, Li YT (ноябрь 1979). «Доказательства наличия двух отдельных белковых активаторов для ферментативного гидролиза ганглиозидов GM1 и GM2». J. Biol. Chem . 254 (21): 10592– 5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)86559-6 . PMID 115863.
^ Klima H, Tanaka A, Schnabel D, Nakano T, Schröder M, Suzuki K, Sandhoff K (сентябрь 1991 г.). «Характеристика полноразмерных кДНК и гена, кодирующего активаторный белок GM2 человека». FEBS Lett . 289 (2): 260– 4. doi : 10.1016/0014-5793(91)81084-L . PMID 1915857. S2CID 40408626.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM и др. (2008). «Новые цели MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76 . doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971. S2CID 24698373.
^ Махуран DJ (1999-10-08). «Биохимические последствия мутаций, вызывающих ганглиозидозы GM2». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1455 ( 2–3 ): 105–138 . doi :10.1016/S0925-4439(99)00074-5. ПМИД 10571007.
^ "Онлайн Менделевское наследование у человека". Национальный институт здравоохранения США . Получено 21 апреля 2009 г.

Дальнейшее чтение

Li SC, Nakamura T, Ogamo A, Li YT (1980). «Доказательства наличия двух отдельных белковых активаторов для ферментативного гидролиза ганглиозидов GM1 и GM2». J. Biol. Chem . 254 (21): 10592– 5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)86559-6 . PMID 115863.
Xie B, Kennedy JL, McInnes B и др. (1992). «Идентификация обработанного псевдогена, связанного с функциональным геном, кодирующим белок-активатор GM2: локализация псевдогена на человеческой хромосоме 3 и функционального гена на человеческой хромосоме 5». Genomics . 14 (3): 796– 8. doi :10.1016/S0888-7543(05)80190-9. PMID 1427911.
Nagarajan S, Chen HC, Li SC и др. (1992). «Доказательства наличия двух клонов кДНК, кодирующих белок-активатор GM2 человека». Biochem. J . 282 (3): 807– 13. doi :10.1042/bj2820807. PMC 1130859 . PMID 1554364.
Klima H, Tanaka A, Schnabel D и др. (1991). «Характеристика полноразмерных кДНК и гена, кодирующего белок-активатор GM2 человека». FEBS Lett . 289 (2): 260– 4. doi : 10.1016/0014-5793(91)81084-L . PMID 1915857. S2CID 40408626.
Шредер М., Шнабель Д., Сузуки К., Сандхофф К. (1991). «Мутация в гене гликолипид-связывающего белка (активатора GM2), вызывающая GM2-ганглиозидоз варианта AB». FEBS Lett . 290 ( 1– 2): 1– 3. doi :10.1016/0014-5793(91)81211-P. PMID 1915858. S2CID 26669859.
Xie B, McInnes B, Neote K и др. (1991). «Выделение и экспрессия полноразмерной кДНК, кодирующей белок-активатор человеческого GM2». Biochem. Biophys. Res. Commun . 177 (3): 1217– 23. doi :10.1016/0006-291X(91)90671-S. PMID 2059210.
Fürst W, Schubert J, Machleidt W и др. (1990). «Полные аминокислотные последовательности белка-активатора ганглиозида GM2 человека и белка-активатора сульфата цереброзида». Eur. J. Biochem . 192 (3): 709– 14. doi :10.1111/j.1432-1033.1990.tb19280.x. PMID 2209618.
Шредер М., Клима Х., Накано Т. и др. (1989). «Выделение кДНК, кодирующей белок-активатор человеческого GM2». FEBS Lett . 251 ( 1– 2): 197– 200. doi : 10.1016/0014-5793(89)81454-1 . PMID 2753159. S2CID 22615177.
Burg J, Banerjee A, Sandhoff K (1986). «Молекулярные формы белка-активатора GM2. Исследование его биосинтеза в фибробластах кожи человека». Biol. Chem. Hoppe-Seyler . 366 (9): 887– 91. doi :10.1515/bchm3.1985.366.2.887. PMID 3935131.
Banerjee A, Burg J, Conzelmann E и др. (1984). «Иммуноферментный анализ на белок-активатор ганглиозида GM2. Скрининг нормальных тканей и жидкостей организма человека, тканей ганглиозидоза GM2 и его субклеточной локализации». Hoppe-Seyler's Z. Physiol. Chem . 365 (3): 347–56 . doi :10.1515/bchm2.1984.365.1.347. PMID 6724528.
Hirabayashi Y, Li YT, Li SC (1983). «Активатор белка, специфичный для ферментативного гидролиза ганглиозида GM2 в нормальном человеческом мозге и мозге трех типов ганглиозидоза GM2». J. Neurochem . 40 (1): 168–75 . doi :10.1111/j.1471-4159.1983.tb12667.x. PMID 6848657. S2CID 33699881.
Шредер М., Шнабель Д., Гурвиц Р. и др. (1994). «Молекулярная генетика варианта AB GM2-ганглиозидоза: новая мутация и экспрессия в клетках BHK». Hum. Genet . 92 (5): 437– 40. doi :10.1007/BF00216446. PMID 8244332. S2CID 21839371.
Heng HH, Xie B, Shi XM и др. (1994). «Уточненное картирование локуса белка-активатора GM2 (GM2A) в 5q31.3-q33.1, дистальнее локуса спинальной мышечной атрофии». Геномика . 18 (2): 429–31 . doi :10.1006/geno.1993.1491. PMID 8288250.
Клима Х., Кляйн А., ван Эхтен Г. и др. (1993). «Сверхэкспрессия функционально активного человеческого белка-активатора GM2 в Escherichia coli». Биохим. Дж . 292 (2): 571–6 . doi : 10.1042/bj2920571. ПМЦ 1134248 . ПМИД 8503891.
Schepers U, Glombitza G, Lemm T и др. (1996). «Молекулярный анализ дефицита активатора GM2 у двух пациентов с вариантом AB GM2-ганглиозидоза». Am. J. Hum. Genet . 59 (5): 1048–56 . PMC 1914821. PMID 8900233 .
Ригат Б., Ван В., Леунг А., Махуран Д.Дж. (1997). «Два механизма повторного захвата внеклеточного белка-активатора GM2: доказательства основной секреторной формы белка». Биохимия . 36 (27): 8325– 31. doi :10.1021/bi970571c. PMID 9204879.
Ядао Ф., Хехтман П., Каплан Ф. (1997). «Образование тройного комплекса между белком-активатором GM2, ганглиозидом GM2 и гексозаминидазой А». Биохим. Биофиз. Акта . 1340 (1): 45–52 . doi :10.1016/S0167-4838(97)00027-7. ПМИД 9217013.
Schütte CG, Lemm T, Glombitza GJ, Sandhoff K (1998). "Полная локализация дисульфидных связей в белке-активаторе GM2". Protein Sci . 7 (4): 1039– 45. doi :10.1002/pro.5560070421. PMC 2143992. PMID 9568910 .
Chen B, Rigat B, Curry C, Mahuran DJ (1999). «Структура гена GM2A: идентификация бессмысленной мутации экзона 2 и естественного транскрипта с делецией экзона 2 в рамке считывания». Am. J. Hum. Genet . 65 (1): 77– 87. doi :10.1086/302463. PMC 1378077 . PMID 10364519.
Jinnai H, Nakamura S (2000). «Характеристика активации фосфолипазы D активатором GM2 в бесклеточной системе». Kobe Journal of Medical Sciences . 45 ( 3–4 ): 181–90 . PMID 10752311.

Эта статья о гене на 5-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000196743 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000594 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid115863-5] Li SC, Nakamura T, Ogamo A, Li YT (ноябрь 1979). «Доказательства наличия двух отдельных белковых активаторов для ферментативного гидролиза ганглиозидов GM1 и GM2». J. Biol. Chem . 254 (21): 10592– 5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)86559-6 . PMID 115863.

[pmid1915857-6] Klima H, Tanaka A, Schnabel D, Nakano T, Schröder M, Suzuki K, Sandhoff K (сентябрь 1991 г.). «Характеристика полноразмерных кДНК и гена, кодирующего активаторный белок GM2 человека». FEBS Lett . 289 (2): 260– 4. doi : 10.1016/0014-5793(91)81084-L . PMID 1915857. S2CID 40408626.

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM и др. (2008). «Новые цели MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76 . doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971. S2CID 24698373.

[mahuran-8] Махуран DJ (1999-10-08). «Биохимические последствия мутаций, вызывающих ганглиозидозы GM2». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1455 ( 2–3 ): 105–138 . doi :10.1016/S0925-4439(99)00074-5. ПМИД 10571007.

[omim-9] "Онлайн Менделевское наследование у человека". Национальный институт здравоохранения США . Получено 21 апреля 2009 г.