Фактор G-CSF дестабилизирующий элемент стебель-петля

Фактор G-CSF, дестабилизирующий элемент стебель-петля (SLDE)
Фактор G-CSF, дестабилизирующий элемент стебель-петля (SLDE)
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности G-CSF_SLDE
Идентификаторы
Символ	G-CSF_SLDE
Рфам	РФ00183
Другие данные
Тип РНК	Цис-рег
Домены	Эукариоты
ТАК	SO:0000233
Структуры PDB	ПДБе

РНК-семейство

Дестабилизирующий элемент петли ствола фактора G-CSF (SLDE) представляет собой элемент РНК, секретируемый фибробластами и эндотелиальными клетками в ответ на воспалительные медиаторы интерлейкин-1 (IL-1) и фактор некроза опухоли-альфа , а также активированными макрофагами . Синтез G-CSF регулируется как транскрипционно , так и посредством контроля стабильности мРНК . В нестимулированных клетках мРНК G-CSF нестабильна, но стабилизируется в ответ на IL-1 или фактор некроза опухоли-альфа, а также в случае моноцитов и макрофагов в ответ на липополисахарид . Вероятно, что присутствие SLDE в мРНК G-CSF способствует специфичности регуляции мРНК G-CSF и увеличивает скорость укорочения поли (А)-хвоста . ^[1]

Элементы, богатые аденилат-уридилатом (AUREs), присутствуют в других мРНК цитокинов, но SLDE является наиболее важным элементом, который стабилизирует мРНК G-CSF в ответ на IL-1 или фактор некроза опухоли-альфа. ^[2] Кроме того, существуют дестабилизирующие элементы, подобные SLDE, обнаруженные в IL-2 и IL-6 . 3'-UTR мРНК G-CSF содержит дестабилизирующий элемент, который нечувствителен к ионофору кальция , поэтому SLDE регулирует мРНК G-CSF. AUDEs не функционируют в клетках карциномы мочевого пузыря 5637, но SLDE функционирует. Два дестабилизирующих элемента, SLDE и AURE, обеспечивают множественные механизмы для регуляции экспрессии цитокинов.

Нейтрофилы являются наиболее распространенным типом гранулоцитов и отвечают за руководство первым ответом иммунной системы против захватчиков. Фактор стимуляции колоний гранулоцитов (G-CSF) представляет собой гликопротеин , который стимулирует пролиферацию клеток-предшественников нейтрофилов и приводит к созреванию нейтрофилов. Моноциты и макрофаги являются клетками, которые секретируют G-CSF, но обнаружено, что эндотелиальные клетки , фибробласты и стромальные клетки костного мозга также секретируют гликопротеин. Экспрессия гликопротеина G-CSF сложна и имеет как транскрипционную, так и посттранскрипционную регуляцию. Два конкретных типа регуляторных элементов присутствуют в 3'-нетранслируемой области (3'UTR) мРНК G-CSF . Эти элементы называются элементами, богатыми аденилат-уридилатом (AUREs), и элементом, дестабилизирующим петлю ствола (SLDE). Было показано, что они являются дестабилизирующими элементами мРНК G-CSF. С другой стороны, стабильность мРНК регулируется митоген-активируемой протеинкиназой p38 (МАРК), и было показано, что этот фосфорилирующий фермент связан с AURE в 3'UTR.

SB203580 специфически ингибирует каталитическую активность p38 MAPK путем конкурентного связывания с активным сайтом, где АТФ должен связываться, и используется для исследования роли p38 MAPK в клетках. ^[3] SB203580 усиливал вызванное липополисахаридом увеличение уровней мРНК G-CSF в макрофагах, полученных из костного мозга мышей , и в макрофагах человека THP-1. Демонстрируя, что распад мРНК G-CSF в присутствии актиномицина D был медленнее в клетках, обработанных SB203580. SB203580 повышал стабильность мРНК G-CSF. SLDE имеет важное значение для вызванного SB203580 увеличения стабильности мРНК.

элемент РНК

Ссылки

^ Putland RA, Sassinis TA, Harvey JS, Diamond P, Coles LS, Brown CY, Goodall GJ (март 2002 г.). «Дестабилизация РНК дестабилизирующим элементом стебель-петля гранулоцитарного колониестимулирующего фактора включает в себя один стебель-петля, который способствует деаденилированию». Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1664– 1673. doi :10.1128/MCB.22.6.1664-1673.2002. PMC 135610. PMID 11865046 .
^ Brown CY, Lagnado CA, Goodall GJ (ноябрь 1996 г.). «Элемент, дестабилизирующий мРНК цитокина, который структурно и функционально отличается от элементов, богатых A+U». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (24): 13721– 13725. Bibcode : 1996PNAS...9313721B. doi : 10.1073/pnas.93.24.13721 . PMC 19403. PMID 8943001 .
^ Chang SF, Li HC, Huang YP, Tasi WJ, Chou YY, Lu SC (январь 2016 г.). «SB203580 увеличивает выработку G-CSF через элемент дестабилизации стебля-петли в 3'-нетранслируемой области макрофагов независимо от его влияния на активность p38 MAPK». Журнал биомедицинской науки . 23 (1): 3. doi : 10.1186/s12929-016-0221-z . PMC 4715298. PMID 26772539 .

Внешние ссылки

Страница для дестабилизирующего элемента стволовой петли фактора G-CSF (SLDE) в Rfam

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Putland RA, Sassinis TA, Harvey JS, Diamond P, Coles LS, Brown CY, Goodall GJ (март 2002 г.). «Дестабилизация РНК дестабилизирующим элементом стебель-петля гранулоцитарного колониестимулирующего фактора включает в себя один стебель-петля, который способствует деаденилированию». Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1664– 1673. doi :10.1128/MCB.22.6.1664-1673.2002. PMC 135610. PMID 11865046 .

[2] Brown CY, Lagnado CA, Goodall GJ (ноябрь 1996 г.). «Элемент, дестабилизирующий мРНК цитокина, который структурно и функционально отличается от элементов, богатых A+U». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (24): 13721– 13725. Bibcode : 1996PNAS...9313721B. doi : 10.1073/pnas.93.24.13721 . PMC 19403. PMID 8943001 .

[3] Chang SF, Li HC, Huang YP, Tasi WJ, Chou YY, Lu SC (январь 2016 г.). «SB203580 увеличивает выработку G-CSF через элемент дестабилизации стебля-петли в 3'-нетранслируемой области макрофагов независимо от его влияния на активность p38 MAPK». Журнал биомедицинской науки . 23 (1): 3. doi : 10.1186/s12929-016-0221-z . PMC 4715298. PMID 26772539 .