феррик-хелатредуктаза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Номер ЕС | 1.16.1.7 | ||||||||
Номер CAS | 122097-10-3 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
В энзимологии феррик -хелатредуктаза ( EC 1.16.1.7) — это фермент , катализирующий химическую реакцию
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются Fe(II) и НАД + , тогда как его тремя продуктами являются Fe(III) , НАДН и Н + .
Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктаз , в частности, к тем, которые окисляют ион металла с помощью НАД + или НАДФ + в качестве акцептора. Систематическое название этого класса ферментов — Fe(II):НАД + оксидоредуктаза . Другие общеупотребительные названия включают:
Большинство изученных ферриредуктаз в бактериях являются либо специфичными для комплекса трехвалентного железа, либо неспецифичными флавин-железоредуктазами, причем последние более распространены в бактериях. [1] Обе формы редуктаз являются подходящими дополнительными растворимыми путями для эффективного извлечения железа через сидерофоры . [1]
Неспецифическая бактериальная флавинредуктаза была хорошо изучена в E. coli , которая является NAD(P)H: флавиноксидоредуктазой (Fre). [1] В E. coli NAD(P)H восстанавливается либо до свободного FAD, либо до рибофлавина, который, как известно, восстанавливает трехвалентное железо до двухвалентного железа внутриклеточно. Fre также структурно похож на ферредоксин-NADP + редуктазу (Fpr) и заставляет кофактор флавина восстанавливать трехвалентное железо, связанное с ферредоксином и сидерофором. [2] Несмотря на эти предполагаемые структурные сходства, в целом об этой ферментативной структуре известно немного.
Paracoccus denitrificans содержит два фермента, которые способствуют восстановлению железа - ферриредуктазы A и B (FerA и FerB). [3] FerA связывается с окисленными флавинами (FMN и FAD). [3] В отличие от многих структурных неизвестных, окружающих Fre, кристаллическая структура FerA хорошо определена (см. рис. 6 в Sedlácek et. al., 2016). FerA состоит из двух белковых субъединиц, с тремя альфа-спиралями и десятью бета-слоями в общей сложности. [3]
Было показано, что Archaeoglobus fulgidus имеет железоредуктазу (FeR), похожую на семейство NAD(P)H:флавиноксидоредуктаз. [1] FeR является специфичным для архей и восстанавливает внешние, синтетические комплексы трехвалентного железа и Fe(III)-цитрат с NAD(P)H и связанным кофактором флавинадениндинуклеотида (FAD) или флавинмононуклеотида (FMN). [4]
Железоредуктазы присутствуют в некоторых одноклеточных эукариотах, включая патогенные дрожжи, которые используют железоредуктазы во время заражения хозяина. [5] [6] В отличие от архей и бактерий, растворимые железоредуктазы встречаются у грибов гораздо реже, и необходимы дополнительные исследования, чтобы определить, насколько широко распространены растворимые железоредуктазы среди грибов. [1] Известно, что эти растворимые железоредуктазы в грибах действуют внеклеточно, поскольку грибы способны выделять их для восстановления железа в окружающей среде. [1] Этот механизм выделения железоредуктазы позволяет лабилизировать железо в окружающей среде и обычно происходит одновременно с путями грибковых сидерофоров и восстановлением железа на клеточных поверхностях, которые происходят с мембраносвязанными железоредуктазами. [1]
Мембранно-связанные железоредуктазы более распространены в дрожжевых клетках по сравнению с растворимыми железоредуктазами. Эти редуктазы используют НАД(Ф)Н, фальвин и кофакторы гема b для перемещения восстанавливающих агентов через свои мембраны к внеклеточному источнику Fe(III). [5] [6] После этого восстановленное Fe(II) может быть повторно окислено и отскочить для повторного переноса через мембрану как через Cu-зависимую ферроксидазу, так и через транспортные белки Fe(III). [6] [7] Альтернативно, двухвалентное, нехелатированное железо может транспортироваться через низкоаффинные белки, однако этот механизм менее распространен, чем первый. [6]
Большинство растений содержат феррик-хелатредуктазу для поглощения железа из окружающей среды. Arabidopsis способен повышать активность феррик-хелатредуктазы, которая находится в мембранах эпидермальных клеток корней, в средах с ограниченной доступностью железа. [8] Кроме того, предполагается, что активность этой редуктазы стимулирует высвобождение железа из органических соединений в почве, высвобождая его для биологического поглощения. [9] Кристаллическая структура этого фермента в Arabidopsis пока еще не была хорошо изучена, однако предполагается, что из-за его схожих функций его структура, вероятно, похожа на феррик-хелатредуктазы как в дрожжах, так и в человеческой фагоцитарной НАДФН-оксидазе gp91phox. [10] [11]