Экзосортаза
| Трансмембранная экзосортаза (Exosortase_EpsH) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Экзосортаза_EpsH | ||||||||
| Пфам | ПФ09721 | ||||||||
| |||||||||
Экзосортаза относится к семейству интегральных мембранных белков, которые встречаются в грамотрицательных бактериях , которые распознают и расщепляют сортировочный сигнал карбоксильного конца PEP-CTERM. [1] [2] Название происходит от предсказанной роли, аналогичной сортазе , несмотря на отсутствие какой-либо обнаруживаемой гомологии последовательностей , и сильной ассоциации генов экзосортазы с локусами биосинтеза экзополисахарида или внеклеточного полимерного вещества . Многие археи имеют археосортазу , гомологичную экзосортазам, а не сортазам. Археосортаза A распознает сигнал PGF-CTERM, обнаруженный на С-конце некоторых белков S-слоя архей . После обработки археосортазой A область PGF-CTERM исчезает, и вместо этого на С-конце присутствует липидный якорь, полученный из пренила.
Экзосортаза сама по себе не была охарактеризована биохимически. Однако работа по направленному мутагенезу археосортазы А, архейного гомолога экзосортаз, решительно поддерживает идею активного сайта Cys и конвергентной эволюции с транспептидазами семейства сортаз . [3] Недавнее исследование Zoogloea resiniphila, бактерии, обнаруженной в очистных сооружениях сточных вод с активированным илом, показало, что белки PEP-CTERM (и, как следствие, экзосортаза) необходимы для образования хлопьев в некоторых системах. [4]
Ссылки
- ^ Хафт ДХ, Полсен ИТ, Уорд Н, Селенгут ДЖ (август 2006 г.). «Сортировка белков, связанных с экзополисахаридом, в организмах окружающей среды: система PEP-CTERM/EpsH. Применение новой эвристики филогенетического профилирования». BMC Biology . 4 : 29. doi : 10.1186/1741-7007-4-29 . PMC 1569441 . PMID 16930487.
- ^ Haft DH, Payne SH, Selengut JD (январь 2012 г.). «Археосортазы и экзосортазы — широко распространенные системы, связывающие мембранный транзит с посттрансляционной модификацией». Журнал бактериологии . 194 (1): 36–48 . doi :10.1128/JB.06026-11. PMC 3256604. PMID 22037399 .
- ^ Абдул Халим МФ, Родригес Р, Штольцфус ДЖД, Даггин ИГ, Польшродер М (май 2018). «Консервативные остатки имеют решающее значение для каталитической активности археосортазы Haloferax volcanii: Последствия для конвергентной эволюции каталитических механизмов негомологичных сортаз из архей и бактерий». Молекулярная микробиология . 108 (3): 276–287 . doi : 10.1111/mmi.13935 . PMID 29465796.
- ^ Gao N, Xia M, Dai J, Yu D, An W, Li S, Liu S, He P, Zhang L, Wu Z, Bi X, Chen S, Haft DH, Qiu D (май 2018 г.). «Для образования хлопьев Zoogloea resiniphila и других бактерий активированного ила требуются как широко распространенные белки PEP-CTERM, так и экзополисахариды». Environmental Microbiology . 20 (5): 1677– 1692. doi :10.1111/1462-2920.14080. PMID 29473278. S2CID 4341022. Архивировано из оригинала 21.01.2021 . Получено 14.12.2019 .
 | Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
