Эфрин В2

ЭФНБ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2HLE, 2I85, 2VSK, 2VSM, 2WO2, 3GXU, 4UF7
Идентификаторы
Псевдонимы	EFNB2 , EPLG5, HTKL, Htk-L, LERK5, эфрин B2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600527; МГИ : 105097; гомологен : 3019; GeneCards : EFNB2; OMA :EFNB2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 13 (человек)
Конец	106,535,662 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	8,711,242 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	желудочковая зона; ; ганглионарное возвышение; ; слизистая оболочка сигмовидной кишки; ; висцеральная плевра; ; амниотическая жидкость; ; париетальная плевра; ; периодонтальное волокно; ; вторичный ооцит; ; сосок; ; волосяной фолликул;
	Верх выражен в
	поясничный спинномозговой ганглий; ; собирательный проток мозгового вещества; ; почечное тельце; ; волосяной фолликул; ; Ростральный миграционный поток; ; правое легкое; ; левое легкое; ; ганглионарное возвышение; ; семявыносящий проток; ; вестибулярная мембрана улиткового протока;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность вирусного рецептора; связывание белков; связывание сигнальных рецепторов; связывание рецептора эфрина; активность протеинтирозинкиназы;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; мембрана; фокальная адгезия; плазматическая мембрана; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; Коллатераль Шаффера - синапс CA1; глутаматергический синапс; неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны; неотъемлемый компонент постсинаптической мембраны плотности;
Биологический процесс	дифференциация клеток; морфогенез кровеносных сосудов; негативная регуляция пролиферации кератиноцитов; регуляция хемотаксиса; сигнализация клетка-клетка; анатомическая структура морфогенез; Костимуляция Т-клеток; развитие лимфатических сосудов; развитие нервной системы; миграция клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза; развитие многоклеточного организма; адгезия клеток; морфогенез почечных протоков; ангиогенез; морфогенез органов животных; проникновение вируса в клетку-хозяина; позитивная регуляция дифференцировки клеток сердечной мышцы; вирусный процесс; морфогенез венозных кровеносных сосудов; позитивная регуляция морфогенеза аорты; позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции; сигнальный путь рецептора эфрина; аксонное руководство; негативная регуляция развития нейронных проекций; пептидил-тирозиновое фосфорилирование; пресинаптическая сборка; регуляция уровней рецепторов нейротрансмиттеров постсинаптической мембраны; регуляция интернализации постсинаптических нейротрансмиттерных рецепторов; позитивная регуляция гибели нейронов;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	1948
	13642
	ENSG00000125266
	ENSMUSG00000001300
	Р52799
	Р52800
	NM_004093 ; NM_001372056 ; NM_001372057 ; NM_001372058
	NM_010111 ; NM_001368299
	NP_004084 ; NP_001358985 ; NP_001358986 ; NP_001358987
	NP_034241 ; NP_001355228
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Эфрин-B2 — это белок , который у людей кодируется геном EFNB2 . [ ^5]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства эфринов (EPH). Эфрины и рецепторы, связанные с EPH, составляют крупнейшее подсемейство рецепторных протеинтирозинкиназ и участвуют в опосредовании событий развития, особенно в нервной системе и в эритропоэзе . На основании их структур и взаимосвязей последовательностей эфрины делятся на класс эфринов-A (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфринов-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Этот ген кодирует эфрин класса EFNB, который связывается с рецепторами EPHB4 и EPHA3 . ^[6]

Рак

Ген EFNB2, как было отмечено, постепенно подавляется в неопластических кератиноцитах, положительных на вирус папилломы человека , полученных из пренеопластических поражений шейки матки на разных уровнях злокачественности. ^{[7] По этой причине EFNB2, вероятно, связан с опухолеобразованием и может быть потенциальным прогностическим маркером прогрессирования}пренеопластических поражений шейки матки . ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что EFNB2 взаимодействует с EPHA3 ^[8]^[9] и EPHB1 в развитии зрительного перекреста . ^[10]

Было также показано, что EFNB2 служит рецептором для вирусов Хендра и Нипах , опосредуя проникновение в клетку во время инфекции. ^[11]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000125266 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001300 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Bonaldo MF, Yu MT, Jelenc P, Brown S, Su L, Lawton L, Deaven L, Efstratiadis A, Warburton D, Soares MB (сентябрь 1994 г.). «Выбор кДНК с использованием специфичных для хромосом геномных клонов: применение к человеческой хромосоме 13». Human Molecular Genetics . 3 (9): 1663–73 . doi :10.1093/hmg/3.9.1663. PMID 7833926.
^ "Ген Энтреза: EFNB2 эфрин-B2".
^ ab Ротондо Х.К., Боси С., Басси С., Феррацин М., Ланца Г., Гафа Р., Магри Э., Селватичи Р., Торресани С., Марси Р., Гарутти П., Негрини М., Тоньон М., Мартини Ф (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа цервикальных неопластических кератиноцитов». J Клеточная Физиол . 230 (4): 802–812 . doi :10.1002/jcp.24808. hdl : 11392/2066612 . PMID 25205602. S2CID 24986454.
^ Серретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковски Э., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт DJ (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда тирозинкиназ рецептора, родственного eph». Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205 . doi :10.1016/0161-5890(95)00108-5. ПМИД 8559144.
^ Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (июнь 1997 г.). «Лиганд для EPH-связанной киназы (LERK) 7 является предпочтительным высокоаффинным лигандом для рецептора HEK». Журнал биологической химии . 272 (26): 16521– 30. doi : 10.1074/jbc.272.26.16521 . PMID 9195962.
^ Williams SE, Mann F, Erskine L, Sakurai T, Wei S, Rossi DJ, Gale NW, Holt CE, Mason CA, Henkemeyer M (сентябрь 2003 г.). "Ephrin-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки в зрительном перекресте". Neuron . 39 (6): 919– 35. doi : 10.1016/j.neuron.2003.08.017 . PMID 12971893.
^ Bonaparte MI, Dimitrov AS, Bossart KN, Crameri G, Mungall BA, Bishop KA, Choudhry V, Dimitrov DS, Wang LF, Eaton BT, Broder CC (июль 2005 г.). «Лиганд Ephrin-B2 является функциональным рецептором для вирусов Хендра и Нипах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (30): 10652– 7. Bibcode : 2005PNAS..10210652B. doi : 10.1073/pnas.0504887102 . PMC 1169237. PMID 15998730 .

Дальнейшее чтение

Фланаган Дж. Г., Вандерхаген П. (1998). «Эфрины и рецепторы ЭФ в развитии нейронов». Annual Review of Neuroscience . 21 : 309–45 . doi :10.1146/annurev.neuro.21.1.309. PMID 9530499.
Zhou R (март 1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакология и терапия . 77 (3): 151– 81. doi :10.1016/S0163-7258(97)00112-5. PMID 9576626.
Holder N, Klein R (май 1999). "Eph-рецепторы и эфрины: эффекторы морфогенеза". Development . 126 (10): 2033– 44. doi :10.1242/dev.126.10.2033. PMID 10207129.
Wilkinson DG (2000). "Eph рецепторы и эфрины: регуляторы руководства и сборки". International Review of Cytology . 196 : 177– 244. doi :10.1016/S0074-7696(00)96005-4. ISBN 9780123646002. PMID 10730216.
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (июль 2000 г.). «Роли рецепторов Eph и эфринов в сегментном паттернировании». Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Серия B, Биологические науки . 355 (1399): 993– 1002. doi :10.1098/rstb.2000.0635. PMC 1692797. PMID 11128993 .
Wilkinson DG (март 2001 г.). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нейронов». Nature Reviews. Neuroscience . 2 (3): 155– 64. doi : 10.1038/35058515. PMID 11256076. S2CID 205014301.
Bennett BD, Zeigler FC, Gu Q, Fendly B, Goddard AD, Gillett N, Matthews W (март 1995 г.). «Молекулярное клонирование лиганда для рецепторного белка тирозинкиназы Htk, связанного с EPH». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (6): 1866–70 . Bibcode : 1995PNAS...92.1866B. doi : 10.1073 /pnas.92.6.1866 . PMC 42383. PMID 7534404.
Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Э., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда тирозинкиназ рецептора, родственного eph». Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205 . doi :10.1016/0161-5890(95)00108-5. ПМИД 8559144.
Cerretti DP, Lyman SD, Kozlosky CJ, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Valentine V, Kirstein MN, Shapiro DN, Morris SW (апрель 1996 г.). «Гены, кодирующие лиганды тирозинкиназы рецепторов eph LERK-1 (EPLG1, Epl1), LERK-3 (EPLG3, Epl3) и LERK-4 (EPLG4, Epl4), сгруппированы на человеческой хромосоме 1 и мышиной хромосоме 3». Genomics . 33 (2): 277– 82. doi :10.1006/geno.1996.0192. PMID 8660976.
Gale NW, Holland SJ, Valenzuela DM, Flenniken A, Pan L, Ryan TE, Henkemeyer M, Strebhardt K, Hirai H, Wilkinson DG, Pawson T, Davis S, Yancopoulos GD (июль 1996 г.). «Eph-рецепторы и лиганды включают два основных подкласса специфичности и взаимно компартментализируются во время эмбриогенеза». Neuron . 17 (1): 9– 19. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80276-7 . PMID 8755474.
Holland SJ, Gale NW, Mbamalu G, Yancopoulos GD, Henkemeyer M, Pawson T (октябрь 1996 г.). «Двунаправленная передача сигналов через рецептор семейства EPH Nuk и его трансмембранные лиганды». Nature . 383 (6602): 722– 5. Bibcode :1996Natur.383..722H. doi :10.1038/383722a0. hdl : 1807/9444 . PMID 8878483. S2CID 4349898.
Ephnomenclaturecommittee (август 1997 г.). "Унифицированная номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Eph Nomenclature Committee". Cell . 90 (3): 403– 4. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . PMID 9267020.
Vogt T, Stolz W, Welsh J, Jung B, Kerbel RS, Kobayashi H, Landthaler M, McClelland M (март 1998 г.). «Сверхэкспрессия РНК-мессенджера Lerk-5/Eplg5: новый маркер повышенной туморогенности и метастатического потенциала злокачественных меланом человека». Clinical Cancer Research . 4 (3): 791–7 . PMID 9533549.
Wang HU, Chen ZF, Anderson DJ (май 1998). «Молекулярное различие и ангиогенное взаимодействие между эмбриональными артериями и венами, выявленное эфрином-B2 и его рецептором Eph-B4». Cell . 93 (5): 741– 53. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81436-1 . PMID 9630219.
Николова З., Джонов В., Цюрхер Г., Андрес АС, Земецки А. (сентябрь 1998 г.). «Специфическая и эстрогензависимая экспрессия рецепторной тирозинкиназы EphB4 и ее лиганда эфрина-B2 в процессе морфогенеза молочной железы». Журнал клеточной науки . 111 (18): 2741– 51. doi :10.1242/jcs.111.18.2741. PMID 9718367.
Torres R, Firestein BL, Dong H, Staudinger J, Olson EN, Huganir RL, Bredt DS, Gale NW, Yancopoulos GD (декабрь 1998 г.). «PDZ-белки связываются, кластеризуются и синаптически колокализуются с рецепторами Eph и их лигандами эфрина». Neuron . 21 (6): 1453– 63. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80663-7 . PMID 9883737.
Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (февраль 1999). «Карбоксильный конец эфринов класса B представляет собой мотив связывания домена PDZ». Журнал биологической химии . 274 (6): 3726– 33. doi : 10.1074/jbc.274.6.3726 . PMID 9920925.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 13 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000125266 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000001300 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7833926-5] Bonaldo MF, Yu MT, Jelenc P, Brown S, Su L, Lawton L, Deaven L, Efstratiadis A, Warburton D, Soares MB (сентябрь 1994 г.). «Выбор кДНК с использованием специфичных для хромосом геномных клонов: применение к человеческой хромосоме 13». Human Molecular Genetics . 3 (9): 1663–73 . doi :10.1093/hmg/3.9.1663. PMID 7833926.

[entrez-6] "Ген Энтреза: EFNB2 эфрин-B2".

[Rotondo_2015-7] Ротондо Х.К., Боси С., Басси С., Феррацин М., Ланца Г., Гафа Р., Магри Э., Селватичи Р., Торресани С., Марси Р., Гарутти П., Негрини М., Тоньон М., Мартини Ф (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа цервикальных неопластических кератиноцитов». J Клеточная Физиол . 230 (4): 802–812 . doi :10.1002/jcp.24808. hdl : 11392/2066612 . PMID 25205602. S2CID 24986454.

[pmid8559144-8] Серретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковски Э., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт DJ (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда тирозинкиназ рецептора, родственного eph». Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205 . doi :10.1016/0161-5890(95)00108-5. ПМИД 8559144.

[pmid9195962-9] Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (июнь 1997 г.). «Лиганд для EPH-связанной киназы (LERK) 7 является предпочтительным высокоаффинным лигандом для рецептора HEK». Журнал биологической химии . 272 (26): 16521– 30. doi : 10.1074/jbc.272.26.16521 . PMID 9195962.

[10] Williams SE, Mann F, Erskine L, Sakurai T, Wei S, Rossi DJ, Gale NW, Holt CE, Mason CA, Henkemeyer M (сентябрь 2003 г.). "Ephrin-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки в зрительном перекресте". Neuron . 39 (6): 919– 35. doi : 10.1016/j.neuron.2003.08.017 . PMID 12971893.

[11] Bonaparte MI, Dimitrov AS, Bossart KN, Crameri G, Mungall BA, Bishop KA, Choudhry V, Dimitrov DS, Wang LF, Eaton BT, Broder CC (июль 2005 г.). «Лиганд Ephrin-B2 является функциональным рецептором для вирусов Хендра и Нипах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (30): 10652– 7. Bibcode : 2005PNAS..10210652B. doi : 10.1073/pnas.0504887102 . PMC 1169237. PMID 15998730 .