ЭЛОК

ЭЛОК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1LM8, 1LQB, 1VCB, 2C9W, 2IZV, 2MA9, 3DCG, 3ZKJ, 3ZNG, 3ZRC, 3ZRF, 3ZTC, 3ZTD, 3ZUN, 4AJY, 4AWJ, 4B95, 4B9K, 4BKS, 4BKT, 4N9F, 4W9C, 9Д, 4В9Е, 4В9Ф, 4W9G, 4W9H, 4W9I, 4W9J, 4W9K, 4W9L, 4WQO, 5BO4
Идентификаторы
Псевдонимы	ELOC , SIII, eloC, TCEB1, субъединица 1 фактора элонгации транскрипции B, элонгин C
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600788; МГИ : 1915173; гомологен : 38083; GeneCards : ELOC; OMA :ELOC – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 8 (человек)
Конец	73,972,307 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	16,727,266 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	ооцит; ; сперма; ; правый желудочек; ; эпителий десны; ; конъюнктива века; ; левое яичко; ; правое яичко; ; сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; двуглавая мышца плеча; ; амниотическая жидкость;
	Верхний выражен в
	морула; ; первичный ооцит; ; бластоциста; ; примитивная черта; ; эндотелиальная клетка лимфатического сосуда; ; эпителий желудка; ; желточный мешок; ; двигательное ядро лица; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; атриовентрикулярный клапан;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; активность убиквитин-протеинтрансферазы;
Клеточный компонент	цитозоль; ядро; комплекс элонгина; нуклеоплазма;
Биологический процесс	регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; транскрипция РНК-полимеразой II; убиквитин-зависимый процесс катаболизма белка; транскрипция, ДНК-шаблон; регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию; вирусный процесс; положительная регуляция удлинения транскрипции от промотора РНК-полимеразы II; посттрансляционная модификация белка; убиквитинирование белка;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6921
	67923
	ENSG00000154582
	ENSMUSG00000079658
	Q15369
	Р83940
NM_001204857 ; NM_001204858 ; NM_001204859 ; NM_001204860 ; NM_001204861;
	NM_001204862 ; NM_001204863 ; NM_001204864 ; NM_005648
	NM_001310470 ; NM_026456
NP_001191786 ; NP_001191787 ; NP_001191788 ; NP_001191789 ; NP_001191790;
	NP_001191791 ; NP_001191792 ; NP_001191793 ; NP_005639
	NP_001297399 ; NP_080732
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Элонгин С — это белок , который у людей кодируется геном ELOC . [ ^5]^[6]

Функция

Элонгин C является субъединицей комплекса фактора транскрипции B (SIII). Комплекс SIII состоит из элонгинов A/A2, B и C. Он активирует удлинение РНК-полимеразой II , подавляя временную остановку полимеразы во многих участках внутри транскрипционных единиц. Элонгин A функционирует как транскрипционно активный компонент комплекса SIII, тогда как элонгины B и C являются регуляторными субъединицами. Элонгин A2 специфически экспрессируется в яичках и способен образовывать стабильный комплекс с элонгинами B и C. Белок -супрессор опухолей фон Гиппеля-Линдау связывается с элонгинами B и C и тем самым ингибирует удлинение транскрипции. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что TCEB1 взаимодействует с:

TCEB2 ^[8]^[9]^[10]^[11] и
Супрессор опухолей фон Гиппеля-Линдау . ^[9]^[11]^[12]^[13]^[14]^[15]^[16]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000154582 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000079658 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Garrett KP, Haque D, Conaway RC, Conaway JW (февраль 1995). "Человеческая кДНК, кодирующая малую субъединицу фактора транскрипции РНК-полимеразы II SIII". Gene . 150 (2): 413–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90467-7. PMID 7821821.
^ Duan DR, Pause A, Burgess WH, Aso T, Chen DY, Garrett KP, Conaway RC, Conaway JW, Linehan WM, Klausner RD (октябрь 1995 г.). «Ингибирование удлинения транскрипции белком-супрессором опухолей VHL». Science . 269 (5229): 1402–6. Bibcode :1995Sci...269.1402D. doi :10.1126/science.7660122. PMID 7660122. S2CID 22334719.
^ "Ген Entrez: фактор удлинения транскрипции B (SIII) TCEB1, полипептид 1 (15 кДа, элонгин C)".
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С. , Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Э., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ ab Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (декабрь 1999 г.). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между элонгином C, элонгином B и белком фон Гиппеля-Линдау». J. Clin. Invest . 104 (11): 1583–91. doi :10.1172/JCI8161. PMC 481054. PMID 10587522 .
^ Krumm A, Groudine M (сентябрь 1995 г.). «Подавление опухолей и удлинение транскрипции: ужасные последствия смены партнеров». Science . 269 (5229): 1400–1. Bibcode :1995Sci...269.1400K. doi :10.1126/science.7660121. PMID 7660121. S2CID 39758696.
^ ab Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (февраль 2002 г.). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон Гиппеля-Линдау». J. Biol. Chem . 277 (7): 4656–62. doi : 10.1074/jbc.M108269200 . PMID 11739384.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .
^ Tsuchiya H, Iseda T, Hino O (июль 1996 г.). «Идентификация нового белка (VBP-1), связывающегося с продуктом гена-супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау (VHL)». Cancer Res . 56 (13): 2881–5. PMID 8674032.
^ Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP (июнь 2002 г.). «Структура комплекса HIF-1alpha -pVHL: распознавание гидроксипролина в сигнализации». Science . 296 (5574): 1886–9. Bibcode :2002Sci...296.1886M. doi : 10.1126/science.1073440 . PMID 12004076. S2CID 19641938.
^ Hacker KE, Lee CM, Rathmell WK (2008). Zhang B (ред.). "Мутации VHL типа 2B сохраняют форму и функцию комплекса VBC". PLOS ONE . 3 (11): e3801. Bibcode : 2008PLoSO ...3.3801H. doi : 10.1371/journal.pone.0003801 . PMC 2583047. PMID 19030229.
^ Kim BY, Kim H, Cho EJ, Youn HD (февраль 2008 г.). «Nur77 повышает активность HIF-альфа, ингибируя деградацию, опосредованную pVHL». Exp. Mol. Med . 40 (1): 71–83. doi :10.3858/emm.2008.40.1.71. PMC 2679322. PMID 18305400 .

Дальнейшее чтение

Aso T, Lane WS, Conaway JW, Conaway RC (1995). "Элонгин (SIII): мультисубъединичный регулятор удлинения РНК-полимеразой II". Science . 269 (5229): 1439–43. Bibcode :1995Sci...269.1439A. doi :10.1126/science.7660129. PMID 7660129. S2CID 37649908.
Kibel A, Iliopoulos O, DeCaprio JA, Kaelin WG (1995). «Связывание белка-супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау с элонгином B и C». Science . 269 (5229): 1444–6. Bibcode :1995Sci...269.1444K. doi :10.1126/science.7660130. PMID 7660130. S2CID 25410108.
Bradsher JN, Jackson KW, Conaway RC, Conaway JW (1994). "Фактор транскрипции РНК-полимеразы II SIII. I. Идентификация, очистка и свойства". J. Biol. Chem . 268 (34): 25587–93. doi : 10.1016/S0021-9258(19)74431-7 . PMID 8244996.
Pause A, Lee S, Worrell RA, Chen DY, Burgess WH, Linehan WM, Klausner RD (1997). «Продукт гена-супрессора опухолей фон Хиппеля-Линдау образует стабильный комплекс с человеческим CUL-2, членом семейства белков Cdc53». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (6): 2156–61. Bibcode :1997PNAS...94.2156P. doi : 10.1073/pnas.94.6.2156 . PMC 20057 . PMID 9122164.
Lonergan KM, Iliopoulos O, Ohh M, Kamura T, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (1998). «Регулирование индуцируемых гипоксией мРНК белком-супрессором опухолей фон Гиппеля-Линдау требует связывания с комплексами, содержащими элонгины B/C и Cul2». Mol. Cell. Biol . 18 (2): 732–41. doi :10.1128/mcb.18.2.732. PMC 108784. PMID 9447969 .
Zhang JG, Farley A, Nicholson SE, Willson TA, Zugaro LM, Simpson RJ, Moritz RL, Cary D, Richardson R, Hausmann G, Kile BJ, Kent SB, Alexander WS, Metcalf D, Hilton DJ, Nicola NA, Baca M (1999). "Консервативный мотив SOCS-box в супрессорах сигнализации цитокинов связывается с элонгинами B и C и может связывать связанные белки с протеасомной деградацией". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (5): 2071–6. Bibcode :1999PNAS...96.2071Z. doi : 10.1073/pnas.96.5.2071 . PMC 26738 . PMID 10051596.
Stebbins CE, Kaelin WG, Pavletich NP (1999). «Структура комплекса VHL-ElonginC-ElonginB: значение для функции супрессора опухолей VHL». Science . 284 (5413): 455–61. Bibcode :1999Sci...284..455S. doi :10.1126/science.284.5413.455. PMID 10205047.
Pause A, Peterson B, Schaffar G, Stearman R, Klausner RD (1999). «Изучение взаимодействий четырех белков в дрожжевой двугибридной системе: структурное сходство комплекса pVHL/элонгина BC/hCUL-2 с комплексом убиквитинлигазы SKP1/cullin/F-box белка». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (17): 9533–8. Bibcode :1999PNAS...96.9533P. doi : 10.1073/pnas.96.17.9533 . PMC 22243 . PMID 10449727.
Iwai K, Yamanaka K, Kamura T, Minato N, Conaway RC, Conaway JW, Klausner RD, Pause A (1999). «Идентификация белка-супрессора опухолей фон Хиппель-Линдау как части активного комплекса убиквитинлигазы E3». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (22): 12436–41. Bibcode :1999PNAS...9612436I. doi : 10.1073/pnas.96.22.12436 . PMC 22941 . PMID 10535940.
Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (2000). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между элонгином C, элонгином B и белком фон Гиппеля-Линдау». J. Clin. Invest . 104 (11): 1583–91. doi :10.1172/JCI8161. PMC 481054. PMID 10587522 .
Aso T, Yamazaki K, Amimoto K, Kuroiwa A, Higashi H, Matsuda Y, Kitajima S, Hatakeyama M (2000). «Идентификация и характеристика Elongin A2, нового члена семейства факторов удлинения транскрипции Elongin, специфически экспрессируемого в яичках». J. Biol. Chem . 275 (9): 6546–52. doi : 10.1074/jbc.275.9.6546 . PMID 10692460.
Adryan B, Decker HJ, Papas TS, Hsu T (2000). «Развитие трахеи и гомолог супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау у дрозофилы». Онкоген . 19 (24): 2803–11. doi : 10.1038/sj.onc.1203611 . PMID 10851083.
Kamura T, Sato S, Iwai K, Czyzyk-Krzeska M, Conaway RC, Conaway JW (2000). "Активация убиквитинирования HIF1alpha реконструированным комплексом супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау (VHL)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (19): 10430–5. Bibcode :2000PNAS...9710430K. doi : 10.1073/pnas.190332597 . PMC 27041 . PMID 10973499.
Aso T, Yamazaki K, Aigaki T, Kitajima S (2000). «Комплекс супрессоров опухолей Drosophila von Hippel-Lindau обладает активностью убиквитинлигазы E3». Biochem. Biophys. Res. Commun . 276 (1): 355–61. doi :10.1006/bbrc.2000.3451. PMID 11006129.
Kamura T, Burian D, Yan Q, Schmidt SL, Lane WS, Querido E, Branton PE, Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (2001). "Muf1, новый белок повторов, взаимодействующий с Elongin BC, богатый лейцином, который может собираться с Cul5 и Rbx1 для восстановления убиквитинлигазы". J. Biol. Chem . 276 (32): 29748–53. doi : 10.1074/jbc.M103093200 . PMID 11384984.
Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (2002). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон Гиппеля-Линдау». J. Biol. Chem . 277 (7): 4656–62. doi : 10.1074/jbc.M108269200 . PMID 11739384.
Ямадзаки К., Го Л., Сугахара К., Чжан С., Энзан Х., Накабеппу Ю., Китадзима С., Асо Т. (2002). «Идентификация и биохимическая характеристика нового фактора элонгации транскрипции, элонгина А3». Ж. Биол. Хим . 277 (29): 26444–51. дои : 10.1074/jbc.M202859200 . ПМИД 11994304.
Porkka K, Saramäki O, Tanner M, Visakorpi T (2002). «Усиление и сверхэкспрессия гена Elongin C, обнаруженные при раке простаты с помощью микрочипов кДНК». Lab. Invest . 82 (5): 629–37. doi : 10.1038/labinvest.3780457 . PMID 12004003.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000154582 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000079658 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7821821-5] Garrett KP, Haque D, Conaway RC, Conaway JW (февраль 1995). "Человеческая кДНК, кодирующая малую субъединицу фактора транскрипции РНК-полимеразы II SIII". Gene . 150 (2): 413–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90467-7. PMID 7821821.

[pmid7660122-6] Duan DR, Pause A, Burgess WH, Aso T, Chen DY, Garrett KP, Conaway RC, Conaway JW, Linehan WM, Klausner RD (октябрь 1995 г.). «Ингибирование удлинения транскрипции белком-супрессором опухолей VHL». Science . 269 (5229): 1402–6. Bibcode :1995Sci...269.1402D. doi :10.1126/science.7660122. PMID 7660122. S2CID 22334719.

[entrez-7] "Ген Entrez: фактор удлинения транскрипции B (SIII) TCEB1, полипептид 1 (15 кДа, элонгин C)".

[pmid16189514-8] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С. , Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Э., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid10587522-9] Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (декабрь 1999 г.). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между элонгином C, элонгином B и белком фон Гиппеля-Линдау». J. Clin. Invest . 104 (11): 1583–91. doi :10.1172/JCI8161. PMC 481054. PMID 10587522 .

[pmid7660129-10] Krumm A, Groudine M (сентябрь 1995 г.). «Подавление опухолей и удлинение транскрипции: ужасные последствия смены партнеров». Science . 269 (5229): 1400–1. Bibcode :1995Sci...269.1400K. doi :10.1126/science.7660121. PMID 7660121. S2CID 39758696.

[pmid11739384-11] Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (февраль 2002 г.). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон Гиппеля-Линдау». J. Biol. Chem . 277 (7): 4656–62. doi : 10.1074/jbc.M108269200 . PMID 11739384.

[pmid17353931-12] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .

[pmid8674032-13] Tsuchiya H, Iseda T, Hino O (июль 1996 г.). «Идентификация нового белка (VBP-1), связывающегося с продуктом гена-супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау (VHL)». Cancer Res . 56 (13): 2881–5. PMID 8674032.

[pmid12004076-14] Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP (июнь 2002 г.). «Структура комплекса HIF-1alpha -pVHL: распознавание гидроксипролина в сигнализации». Science . 296 (5574): 1886–9. Bibcode :2002Sci...296.1886M. doi : 10.1126/science.1073440 . PMID 12004076. S2CID 19641938.

[pmid19030229-15] Hacker KE, Lee CM, Rathmell WK (2008). Zhang B (ред.). "Мутации VHL типа 2B сохраняют форму и функцию комплекса VBC". PLOS ONE . 3 (11): e3801. Bibcode : 2008PLoSO ...3.3801H. doi : 10.1371/journal.pone.0003801 . PMC 2583047. PMID 19030229.

[pmid18305400-16] Kim BY, Kim H, Cho EJ, Youn HD (февраль 2008 г.). «Nur77 повышает активность HIF-альфа, ингибируя деградацию, опосредованную pVHL». Exp. Mol. Med . 40 (1): 71–83. doi :10.3858/emm.2008.40.1.71. PMC 2679322. PMID 18305400 .