ЭЛОБ
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ЭЛОБ
Доступные структуры
ПДБПоиск человека UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыELOB , SIII, TCEB2, субъединица 2 фактора элонгации транскрипции B, элонгин B
Внешние идентификаторыОМИМ : 600787; гомологен : 134544; GeneCards : ELOB; OMA :ELOB – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

6923

н/д

Ансамбль

ENSG00000103363

н/д

UniProt

Q15370

н/д

РефСек (мРНК)

NM_207013
NM_007108

н/д

RefSeq (белок)

NP_009039
NP_996896

н/д

Местоположение (UCSC)Хр 16: 2,77 – 2,78 Мбн/д
Поиск в PubMed[2]н/д
Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Элонгин B — это белок , который у людей кодируется геном ELOB . [ 3]

Функция

Элонгин B является субъединицей комплекса фактора транскрипции B (SIII). Комплекс SIII состоит из элонгинов A/A2, B и C. Он активирует удлинение РНК-полимеразой II , подавляя временную остановку полимеразы во многих участках внутри транскрипционных единиц. Элонгин A функционирует как транскрипционно активный компонент комплекса SIII, тогда как элонгины B и C являются регуляторными субъединицами. Элонгин A2 специфически экспрессируется в яичках и способен образовывать стабильный комплекс с элонгинами B и C. Белок -супрессор опухолей фон Гиппеля-Линдау связывается с элонгинами B и C и тем самым ингибирует удлинение транскрипции. Для этого гена были описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующих различные изоформы. [4]

Взаимодействия

Было показано, что TCEB2 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000103363 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ Garrett KP, Aso T, Bradsher JN, Foundling SI, Lane WS, Conaway RC, Conaway JW (сентябрь 1995 г.). "Положительная регуляция общего фактора транскрипции SIII с помощью хвостатого гомолога убиквитина". Proc Natl Acad Sci USA . 92 (16): 7172– 6. Bibcode :1995PNAS...92.7172G. doi : 10.1073/pnas.92.16.7172 . PMC 41301 . PMID  7638163. 
  4. ^ "ELOB elongin B [ Homo sapiens (человек) ]".
  5. ^ ab Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Wei N (2008). "Связь SAP130/SF3b-3 с комплексами убиквитинлигазы Cullin-RING и ее регуляция сигналосомой COP9". BMC Biochem . 9 : 1. doi : 10.1186/1471-2091-9-1 . PMC 2265268. PMID  18173839 . 
  6. ^ Камура Т., Буриан Д., Ян К., Шмидт С.Л., Лейн В.С., Куэридо Э., Брантон П.Е., Шилатифард А., Конавей Р.К., Конавей Д.В. (август 2001 г.). «Muf1, новый белок повторов, взаимодействующий с элонгином BC и богатый лейцином, который может собираться с Cul5 и Rbx1 для восстановления лигазы убиквитина». J. Biol. Chem . 276 (32): 29748– 53. doi : 10.1074/jbc.M103093200 . PMID  11384984.
  7. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  8. ^ ab Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (декабрь 1999 г.). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между элонгином C, элонгином B и белком фон Гиппеля-Линдау». J. Clin. Invest . 104 (11): 1583– 91. doi :10.1172/JCI8161. PMC 481054. PMID  10587522 . 
  9. ^ Krumm A, Groudine M (сентябрь 1995 г.). «Подавление опухолей и удлинение транскрипции: ужасные последствия смены партнеров». Science . 269 (5229): 1400– 1. Bibcode :1995Sci...269.1400K. doi :10.1126/science.7660121. PMID  7660121. S2CID  39758696.
  10. ^ Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (февраль 2002 г.). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон Гиппеля-Линдау». J. Biol. Chem . 277 (7): 4656– 62. doi : 10.1074/jbc.M108269200 . PMID  11739384.
  11. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 : 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID  17353931 . 
  12. ^ Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP (июнь 2002 г.). «Структура комплекса HIF-1alpha -pVHL: распознавание гидроксипролина в сигнализации». Science . 296 (5574): 1886– 9. Bibcode :2002Sci...296.1886M. doi : 10.1126/science.1073440 . PMID  12004076. S2CID  19641938.
  13. ^ Hacker KE, Lee CM, Rathmell WK (2008). Zhang B (ред.). "Мутации VHL типа 2B сохраняют форму и функцию комплекса VBC". PLOS ONE . 3 (11): e3801. Bibcode : 2008PLoSO ...3.3801H. doi : 10.1371/journal.pone.0003801 . PMC 2583047. PMID  19030229. 

Дальнейшее чтение

  • Duan DR, Pause A, Burgess WH, Aso T, Chen DY, Garrett KP, Conaway RC, Conaway JW, Linehan WM, Klausner RD (1995). «Ингибирование удлинения транскрипции белком-супрессором опухолей VHL». Science . 269 (5229): 1402– 6. Bibcode :1995Sci...269.1402D. doi :10.1126/science.7660122. PMID  7660122. S2CID  22334719.
  • Aso T, Lane WS, Conaway JW, Conaway RC (1995). "Элонгин (SIII): мультисубъединичный регулятор удлинения РНК-полимеразой II". Science . 269 (5229): 1439– 43. Bibcode :1995Sci...269.1439A. doi :10.1126/science.7660129. PMID  7660129. S2CID  37649908.
  • Kibel A, Iliopoulos O, DeCaprio JA, Kaelin WG (1995). «Связывание белка-супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау с элонгином B и C». Science . 269 (5229): 1444– 6. Bibcode :1995Sci...269.1444K. doi :10.1126/science.7660130. PMID  7660130. S2CID  25410108.
  • Bradsher JN, Jackson KW, Conaway RC, Conaway JW (1994). "Фактор транскрипции РНК-полимеразы II SIII. I. Идентификация, очистка и свойства". J. Biol. Chem . 268 (34): 25587– 93. doi : 10.1016/S0021-9258(19)74431-7 . PMID  8244996.
  • Pause A, Lee S, Worrell RA, Chen DY, Burgess WH, Linehan WM, Klausner RD (1997). «Продукт гена-супрессора опухолей фон Хиппеля-Линдау образует стабильный комплекс с человеческим CUL-2, членом семейства белков Cdc53». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (6): 2156– 61. Bibcode :1997PNAS...94.2156P. doi : 10.1073/pnas.94.6.2156 . PMC  20057 . PMID  9122164.
  • Li XY, Green MR (1998). "Клеточный коактиватор Tat ВИЧ-1 Tat Tat-SF1 является общим фактором удлинения транскрипции". Genes Dev . 12 (19): 2992– 6. doi :10.1101/gad.12.19.2992. PMC  317190. PMID  9765201 .
  • Zhang JG, Farley A, Nicholson SE, Willson TA, Zugaro LM, Simpson RJ, Moritz RL, Cary D, Richardson R, Hausmann G, Kile BJ, Kent SB, Alexander WS, Metcalf D, Hilton DJ, Nicola NA, Baca M (1999). "Консервативный мотив SOCS-box в супрессорах сигнализации цитокинов связывается с элонгинами B и C и может связывать связанные белки с протеасомной деградацией". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (5): 2071– 6. Bibcode :1999PNAS...96.2071Z. doi : 10.1073/pnas.96.5.2071 . PMC  26738 . PMID  10051596.
  • Stebbins CE, Kaelin WG, Pavletich NP (1999). «Структура комплекса VHL-ElonginC-ElonginB: значение для функции супрессора опухолей VHL». Science . 284 (5413): 455– 61. Bibcode :1999Sci...284..455S. doi :10.1126/science.284.5413.455. PMID  10205047.
  • Pause A, Peterson B, Schaffar G, Stearman R, Klausner RD (1999). «Изучение взаимодействий четырех белков в дрожжевой двугибридной системе: структурное сходство комплекса pVHL/элонгина BC/hCUL-2 с комплексом убиквитинлигазы SKP1/cullin/F-box белка». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (17): 9533– 8. Bibcode :1999PNAS...96.9533P. doi : 10.1073/pnas.96.17.9533 . PMC  22243 . PMID  10449727.
  • Iwai K, Yamanaka K, Kamura T, Minato N, Conaway RC, Conaway JW, Klausner RD, Pause A (1999). «Идентификация белка-супрессора опухолей фон Хиппель-Линдау как части активного комплекса убиквитинлигазы E3». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (22): 12436– 41. Bibcode :1999PNAS...9612436I. doi : 10.1073/pnas.96.22.12436 . PMC  22941 . PMID  10535940.
  • Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (2000). «Синтетические пептиды определяют критические контакты между элонгином C, элонгином B и белком фон Гиппеля-Линдау». J. Clin. Invest . 104 (11): 1583– 91. doi :10.1172/JCI8161. PMC  481054. PMID  10587522 .
  • Aso T, Yamazaki K, Amimoto K, Kuroiwa A, Higashi H, Matsuda Y, Kitajima S, Hatakeyama M (2000). «Идентификация и характеристика Elongin A2, нового члена семейства факторов удлинения транскрипции Elongin, специфически экспрессируемого в яичках». J. Biol. Chem . 275 (9): 6546– 52. doi : 10.1074/jbc.275.9.6546 . PMID  10692460.
  • Kamura T, Sato S, Iwai K, Czyzyk-Krzeska M, Conaway RC, Conaway JW (2000). "Активация убиквитинирования HIF1alpha реконструированным комплексом супрессора опухолей фон Гиппеля-Линдау (VHL)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (19): 10430– 5. Bibcode :2000PNAS...9710430K. doi : 10.1073/pnas.190332597 . PMC  27041 . PMID  10973499.
  • Aso T, Yamazaki K, Aigaki T, Kitajima S (2000). «Комплекс супрессоров опухолей Drosophila von Hippel-Lindau обладает активностью убиквитинлигазы E3». Biochem. Biophys. Res. Commun . 276 (1): 355– 61. doi :10.1006/bbrc.2000.3451. PMID  11006129.
  • Kamura T, Burian D, Yan Q, Schmidt SL, Lane WS, Querido E, Branton PE, Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (2001). "Muf1, новый белок повторов, взаимодействующий с Elongin BC, богатый лейцином, который может собираться с Cul5 и Rbx1 для восстановления убиквитинлигазы". J. Biol. Chem . 276 (32): 29748– 53. doi : 10.1074/jbc.M103093200 . PMID  11384984.
  • Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (2002). «Убиквитинирование нового деубиквитинирующего фермента требует прямого связывания с белком-супрессором опухолей фон Гиппеля-Линдау». J. Biol. Chem . 277 (7): 4656– 62. doi : 10.1074/jbc.M108269200 . PMID  11739384.
  • Ямадзаки К., Го Л., Сугахара К., Чжан С., Энзан Х., Накабеппу Ю., Китадзима С., Асо Т. (2002). «Идентификация и биохимическая характеристика нового фактора элонгации транскрипции, элонгина А3». Ж. Биол. Хим . 277 (29): 26444– 51. doi : 10.1074/jbc.M202859200 . ПМИД  11994304.
  • Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP (2002). «Структура комплекса HIF-1alpha -pVHL: распознавание гидроксипролина в сигнализации». Science . 296 (5574): 1886– 9. Bibcode :2002Sci...296.1886M. doi : 10.1126/science.1073440 . PMID  12004076. S2CID  19641938.
  • Hon WC, Wilson MI, Harlos K, Claridge TD, Schofield CJ, Pugh CW, Maxwell PH, Ratcliffe PJ, Stuart DI, Jones EY (2002). «Структурная основа распознавания гидроксипролина в HIF-1 альфа с помощью pVHL». Nature . 417 (6892): 975– 8. Bibcode :2002Natur.417..975H. doi :10.1038/nature00767. PMID  12050673. S2CID  4388644.
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого элонгина-B.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ELOB&oldid=1188028951"