Белок внеклеточного матрикса 1

Белок, обнаруженный в организме человека
ЕСМ1
Идентификаторы
ПсевдонимыECM1 , URBWD, белок внеклеточного матрикса 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 602201; МГИ : 103060; гомологен : 3260; GeneCards : ECM1; OMA :ECM1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_022664
НМ_001202858
НМ_004425

НМ_001252653
НМ_007899
НМ_001355070

RefSeq (белок)

НП_001189787
НП_004416
НП_073155

НП_001239582
НП_031925
НП_001341999

Местоположение (UCSC)Хр 1: 150,51 – 150,51 МбХр 3: 95.64 – 95.65 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок внеклеточного матрикса 1 — это белок , который у людей кодируется геном ECM1 . [ 5] [6] [7]

Этот ген кодирует внеклеточный белок, содержащий мотивы с цистеиновым паттерном, характерным для цистеинового паттерна связывающих лиганд доменов "двойной петли" семейства белков альбумина. Этот ген картируется за пределами комплекса эпидермальной дифференциации (EDC), кластера из трех семейств генов, участвующих в эпидермальной дифференциации. Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [7]

Заболевания

ECM1 участвует в раке молочной железы , раке щитовидной железы , гепатоцеллюлярной карциноме и других видах рака, а также в язвенном колите [8] Зародышевые мутации в ECM-1 вызывают генетическое заболевание липоидный протеиноз . Аутоиммунная атака на ECM-1 ответственна за склероатрофический лишай . (см. Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии [9] ).

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000143369 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000028108 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Smits P, Ni J, Feng P, Wauters J, Van Hul W, Boutaibi ME, Dillon PJ, Merregaert J (январь 1998). «Ген человеческого внеклеточного матрикса 1 (ECM1): геномная структура, клонирование кДНК, паттерн экспрессии и хромосомная локализация». Genomics . 45 (3): 487–95 . doi :10.1006/geno.1997.4918. PMID  9367673.
  6. ^ Джонсон MR, Уилкин DJ, Вос HL, Ортис де Луна RI, Дехехия AM, Полимеропулос MH, Франкомано CA (май 1998). "Характеристика гена белка 1 внеклеточного матрикса человека на хромосоме 1q21". Matrix Biol . 16 (5): 289– 92. doi :10.1016/S0945-053X(97)90017-2. PMID  9501329.
  7. ^ ab "Ген Entrez: белок внеклеточного матрикса ECM1 1".
  8. ^ "ECM1 (белок внеклеточного матрикса 1)"..
  9. ^ «Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии». atlasgeneticsoncology.org .

Дальнейшее чтение

  • Вилявин Г.Д., Панченко К.П., Нишанов Ф., Будаев К.Д. (1978). «[Кислотообразующая функция желудка при язвах привратника]». Советская медицина (12): 43–5 . PMID  601588.
  • Smits P, Poumay Y, Karperien M и др. (2000). «Зависящий от дифференциации альтернативный сплайсинг и экспрессия гена белка внеклеточного матрикса 1 в кератиноцитах человека». J. Invest. Dermatol . 114 (4): 718–24 . doi : 10.1046/j.1523-1747.2000.00916.x . PMID  10733679.
  • Hamada T, McLean WH, Ramsay M и др. (2002). «Липоидный протеиноз отображается в 1q21 и вызывается мутациями в гене белка внеклеточного матрикса 1 (ECM1)». Hum. Mol. Genet . 11 (7): 833– 40. doi : 10.1093/hmg/11.7.833 . PMID  11929856.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Hamada T, Wessagowit V, South AP и др. (2003). «Мутации гена белка внеклеточного матрикса 1 (ECM1) при липоидном протеинозе и корреляция генотипа и фенотипа». J. Invest. Dermatol . 120 (3): 345–50 . doi : 10.1046/j.1523-1747.2003.12073.x . PMID  12603844.
  • Мацуда А., Сузуки Й., Хонда Г. и др. (2003). «Масштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген . 22 (21): 3307– 18. doi : 10.1038/sj.onc.1206406 . PMID  12761501.
  • Wang L, Yu J, Ni J и др. (2003). «Внеклеточный матричный белок 1 (ECM1) сверхэкспрессируется в злокачественных эпителиальных опухолях». Cancer Lett . 200 (1): 57– 67. doi :10.1016/S0304-3835(03)00350-1. PMID  14550953.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Хорев Л., Потиха Т., Аялон С. и др. (2006). «Новая мутация сплайс-сайта в гене ECM-1 в кровнородственной семье с липоидным протеинозом». Exp. Dermatol . 14 (12): 891– 7. doi :10.1111/j.1600-0625.2005.00374.x. PMID  16274456. S2CID  25598548.
  • Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека с помощью иммуноаффинного вычитания, химии гидразида и масс-спектрометрии». J. Proteome Res . 4 (6): 2070– 80. doi :10.1021/pr0502065. PMC  1850943. PMID  16335952 .
  • Fujimoto N, Terlizzi J, Aho S и др. (2006). «Внеклеточный матричный белок 1 ингибирует активность матриксной металлопротеиназы 9 посредством высокоаффинных белок/белковых взаимодействий». Exp. Dermatol . 15 (4): 300– 7. doi :10.1111/j.0906-6705.2006.00409.x. PMID  16512877. S2CID  40715604.
  • Lim J, Hao T, Shaw C и др. (2006). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
  • Han B, Zhang X, Liu Q и др. (2007). «Гомозиготная миссенс-мутация в гене ECM1 у китайских братьев и сестер с липоидным протеинозом». Acta Derm. Venereol . 87 (5): 387– 9. doi : 10.2340/00015555-0292 . PMID  17721643.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Внеклеточный_матричный_белок_1&oldid=1247536231"