Проект:Pseudomonas
Псевдомонады

Псевдомонады
Колонии Pseudomonas aeruginosa на агаровой пластинке
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Псевдомонадоты
Сорт:Гаммапротеобактерии
Заказ:Псевдомонадалес
Семья:Pseudomonadaceae
Род:Псевдомонады
Типовой вид
Синегнойная палочка

Pseudomonas — это грамотрицательная бактерия . Это род , принадлежащий к семейству Pseudomonadaceae . В этом роденасчитывается около 144 видов . [1] Большинство видов Pseudomonas являются сапротрофами , то есть они выделяют ферменты, которые расщепляют большие вещества на маленькие.

История

Pseudomonas — одна из старейших обнаруженных бактерий, впервые названная «Bacterium aeruginosm» Шротером в 1872 году. Однако в 1894 году немецкий ботаник Вальтер Мигула классифицировал ее как Pseudomonas aeruginosa . По-гречески pseudo означает ложный, а monas означает «единица». [2] Эта бактерия связана со многими хроническими инфекциями и считается опасной из-за своей устойчивости ко многим антибиотикам . [3] Количество открываемых видов увеличивается из года в год. В 2013 году было обнаружено 10 видов, а в следующем году — еще 6. [4] Pseudomonas была хорошо классифицирована 100 лет спустя канадским ученым Роджером Станье . [5] Классификация была основана на физиологических и биохимических свойствах. [4]

Филогения

Основным инструментом, который используется для классификации Pseudomonas, является ген 16S рРНК . [6] Однако трудно дифференцировать близкородственные виды Pseudomonas, поэтому такие гены , как atpD, gyrB , rpoB , recA и rpoD, также используются в таксономии Pseudomonas. [7]

Филогенетическое дерево Pseudomonas, где Pseudomonas teessidea выделена красным цветом

Используя gyrB и rpoD в филогенетическом анализе , Pseudomonas произошли от двух преобладающих кластеров: внутриродовой кластер I (IGC I) и внутриродовой кластер II (IGC II). [8]

IGC I состоит из двух подкластеров: « комплекс Pseudomonas aeruginosa », включающий Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas alcaligenes , Pseudomonas citronellolis , Pseudomonas mendocina , Pseudomonas oleovorans и Pseudomonas pseudoalcaligenes , и « комплекс Pseudomonas stutzeri », включающий Pseudomonas balearica и Pseudomonas stutzeri .

IGC II состоит из трех подкластеров: « комплекс Pseudomonas syringae », « комплекс Pseudomonas fluorescens » и « комплекс Pseudomonas putida ». « Комплекс Pseudomonas syringae » — это фитопатогены и патовары. Первый включает Pseudomonas amygdali , Pseudomonas caricapapayae , Pseudomonas cichorii , Pseudomonas ficuserectae и Pseudomonas viridiflava , а последний состоит из Pseudomonas savastanoi и Pseudomonas syringae . « Комплекс Pseudomonas fluorescens » делится на две субпопуляции: « линия Pseudomonas fluorescens » и « линия Pseudomonas chlororaphis ». « Линия Pseudomonas fluorescens » содержит биотипы Pseudomonas fluorescens A, B и C, Pseudomonas azotoformans , патовары Pseudomonas marginalis , Pseudomonas mucidolens , Pseudomonas synxantha и Pseudomonas tolaasii , в то время как « линия Pseudomonas chlororaphis » включает Pseudomonas chlororaphis, Pseudomonas agarici , Pseudomonas asplenii и Pseudomonas corrugata . « Комплекс Pseudomonas putida » состоит из Pseudomonas putida и Pseudomonas fulva . [9]

Клинические проявления

Более 25 видов Pseudomonas вызывают заболевания у людей. Такие виды, как Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas putida, Pseudomonas cepacia, Pseudomonas stutzeri, Pseudomonas maltophilia и Pseudomonas putrefaciens , считаются вызывающими оппортунистические инфекции у людей. [10] Оппортунистические инфекции чаще поражают людей со слабой иммунной системой по сравнению с людьми с более сильной иммунной системой. [11] Известно, что только два вида вызывают определенные заболевания. Это Pseudomonas mallei и Pseudomonas pseudomallei , которые вызывают сап и мелиоидоз соответственно. Однако наиболее распространенным видом, вызывающим клинические проблемы, является Pseudomonas aeruginosa . [12] Общие клинические проблемы, вызываемые Pseudomonas aeruginosa, показаны в следующих пунктах. [13]

Анимированное сердце , где зеленая часть обозначает эндокардит
Некротизирующий энтероколит у новорожденного . Это пищеварительный тракт с желудком наверху и анусом ближе к концу. Он показывает некроз кишечника, а перфорированное место показано стрелкой.
Муковисцидоз, связанный с бронхоэктазами . Большие отверстия представляют собой расширенные бронхи , вызванные повышенным образованием густой слизи. Это становится питательной средой для бактерий, таких как Pseudomonas aeruginosa .

Биотехнология

Штаммы Pseudomonas были полезны в области биотехнологии . В таблице ниже показаны штаммы Pseudomonas и их соответствующее использование.

Некоторые виды псевдомонад и их использование в биотехнологии
Научное название штаммовИспользует
Синегнойная палочкаЛечение пирикуляриоза риса [35]
Pseudomonas syringaeПроизводство замороженных продуктов [35]
Pseudomonas putidaКонтроль черной корневой гнили табака [35] и производство биосинтетических химикатов и лекарств [36]
Pseudomonas флуоресцентнаяИспользуется в пищевой и кожевенной промышленности [35]
Pseudomonas oleovoransИспользуется в производстве полиэфиров [35]

Ссылки

  1. ^ Гомила, Маргарита; Пенья, Арантча; Мулет, Магдалена; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2015). «Филогеномика и систематика Pseudomonas». Границы микробиологии . 6 : 214. дои : 10.3389/fmicb.2015.00214 . ISSN  1664-302X. ПМЦ  4447124 . ПМИД  26074881.
  2. ^ "Etymologia: Pseudomonas". Новые инфекционные заболевания . 18 (8): 1241. Август 2012. doi : 10.3201/eid1808.ET1808. S2CID  26621145.
  3. ^ Рудра, Башудев; Дункан, Луиза; Шах, Аджит Дж.; Шах, Харун Н.; Гупта, Радхей С. (2022). «Филогеномные и сравнительные геномные исследования надежно разграничивают две отдельные клады штаммов Pseudomonas aeruginosa: предложение о переводе штаммов из аутсайдера в новый вид Pseudomonas paraeruginosa sp. nov». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 72 (11): 005542. doi :10.1099/ijsem.0.005542. PMID  36355412. S2CID  253445493. Получено 7 июля 2023 г.
  4. ^ аб Гомила, М; Пенья, А; Муле, М; Лалукат, Дж; Гарсиа-Вальдес, Э (2015). «Филогеномика и систематика Pseudomonas». Границы микробиологии . 6 : 214. дои : 10.3389/fmicb.2015.00214 . ПМЦ 4447124 . ПМИД  26074881. 
  5. ^ Станье, RY; Паллерони, NJ; Дудорофф, M (май 1966). «Аэробные псевдомонады: таксономическое исследование». Журнал общей микробиологии . 43 (2): 159– 271. doi : 10.1099/00221287-43-2-159 . PMID  5963505.
  6. ^ Саати-Сантамария, Z; Перал-Аранега, Э; Веласкес, Э; Ривас, Р; Гарсия-Фрайле, П. (16 августа 2021 г.). «Филогеномный анализ рода Pseudomonas привел к перегруппировке нескольких видов и определению новых родов». Биология . 10 (8): 782. doi : 10.3390/biology10080782 . ПМЦ 8389581 . ПМИД  34440014. 
  7. ^ Mulet, Magdalena; Gomila, Margarita; Scotta, Claudia; Sánchez, David; Lalucat, Jorge; García-Valdés, Elena (1 октября 2012 г.). «Соответствие между времяпролетной масс-спектрометрией с лазерной десорбцией/ионизацией с использованием цельноклеточной матрицы и подходами анализа многолокусной последовательности при различении видов в пределах рода Pseudomonas». Systematic and Applied Microbiology . 35 (7): 455– 464. doi :10.1016/j.syapm.2012.08.007. PMID  23140936.
  8. ^ Ямамото, Сатоши; Касаи, Хироаки; Арнольд, Дон Л.; Джексон, Роберт В.; Вивиан, Алан; Хараяма, Шигеаки (2000-10-01). "Филогения рода Pseudomonas: внутриродовая структура, реконструированная из нуклеотидных последовательностей генов gyrB и rpoD Номера доступа GenBank для последовательностей, определенных в этой работе, следующие: gyrB, D37926, D37297, D86005–D86019 и AB039381–AB039492; rpoD, D86020–D86036 и AB039493–AB039624". Микробиология . 146 (10): 2385– 2394. doi : 10.1099/00221287-146-10-2385 . ISSN  1350-0872. PMID  11021915.
  9. ^ Ямамото, Сатоши; Касаи, Хироаки; Арнольд, Дон Л.; Джексон, Роберт В.; Вивиан, Алан; Хараяма, Шигеаки (октябрь 2000 г.). «Филогения рода Pseudomonas: внутриродовая структура, реконструированная из нуклеотидных последовательностей генов gyrB и rpoD». Микробиология (Рединг, Англия) . 146 (ч. 10): 2385– 2394. doi : 10.1099/00221287-146-10-2385 . ISSN  1350-0872. PMID  11021915.
  10. ^ Иглевски, Барбара Х. (1996). "Pseudomonas". Медицинская микробиология (4-е изд.). Медицинское отделение Техасского университета в Галвестоне. стр. Глава 27. ISBN 978-0-9631172-1-2. Получено 24 июня 2023 г. .
  11. ^ "Что такое оппортунистическая инфекция? | NIH". hivinfo.nih.gov . Получено 24 июня 2023 г. .
  12. ^ Иглевски, Барбара Х. (1996). "Pseudomonas". Медицинская микробиология (4-е изд.). Медицинское отделение Техасского университета в Галвестоне. стр. Глава 27. ISBN 978-0-9631172-1-2. Получено 24 июня 2023 г. .
  13. ^ abc "Клиническая картина инфекции Pseudomonas: история, физика, причины". emedicine.medscape.com . Получено 2023-07-19 .
  14. ^ abc Cerioli, Matteo; Batailler, Cécile; Conrad, Anne; Roux, Sandrine; Perpoint, Thomas; Becker, Agathe; Triffault-Fillit, Claire; Lustig, Sebastien; Fessy, Michel-Henri; Laurent, Frederic; Valour, Florent; Chidiac, Christian; Ferry, Tristan (2020-10-26). "Инфекции костей и суставов, связанные с имплантатами Pseudomonas aeruginosa: опыт работы в региональном справочном центре во Франции". Frontiers in Medicine . 7 : 513242. doi : 10.3389/fmed.2020.513242 . ISSN  2296-858X. PMC 7649271. PMID 33195289  . 
  15. ^ Хассан, Коутар С.; Аль-Риями, Дауд (2012-02-01). «Инфекционный эндокардит аортального клапана, вызванный Pseudomonas aeruginosa и леченный медикаментозно у пациента на гемодиализе». Медицинский журнал Университета Султана Кабуса . 12 (1): 120– 123. doi :10.12816/0003099. ISSN  2075-051X. PMC 3286708. PMID 22375270  . 
  16. ^ Чэнь, Цзинь-Лин; Мэй, Дан-Э; Юй, Цай-Гуй; Чжао, Чжи-Ю (2022-07-26). «Выпотно-констриктивный перикардит, вызванный Pseudomonas aeruginosa, диагностированный с помощью эхокардиографии: отчет о случае». World Journal of Clinical Cases . 10 (21): 7577– 7584. doi : 10.12998/wjcc.v10.i21.7577 . ISSN  2307-8960. PMC 9353922. PMID 36158001  . 
  17. ^ Патель, Кевин; Клиффорд, Дэвид Б. (2014-10-01). «Бактериальный абсцесс мозга». The Neurohospitalist . 4 (4): 196– 204. doi :10.1177/1941874414540684. ISSN  1941-8744. PMC 4212419. PMID 25360205  . 
  18. ^ Галлахер, Чарльз; Норман, Джеймс; Сингх, Абхинав; Сандерсон, Фрэнсис (19 октября 2017 г.). «Менингит, вызванный Pseudomonas aeruginosa, приобретенный в обществе». Отчеты о случаях заболевания в BMJ . 2017 : bcr2017221839. doi : 10.1136/bcr-2017-221839. ISSN  1757-790X. PMC 5665197. PMID 29054951  . 
  19. ^ Линь, Цзяци; Хуан, Шаньшань; Лю, Манли; Линь, Лися; Гу, Цзяньцзюнь; Дуань, Фан (2022-09-14). «Эндофтальмит, вызванный Pseudomonas aeruginosa: клинические характеристики, исходы и чувствительность к антибиотикам». Журнал офтальмологии . 2022 : 1265556. doi : 10.1155/2022/1265556 . ISSN  2090-004X. PMC 9492326. PMID 36157680  . 
  20. ^ "Pseudomonas Keratitis - EyeWiki". eyewiki.aao.org . Получено 20 июля 2023 г. .
  21. ^ Матейчек, Адела; Голдман, Ран Д. (2013-11-01). «Лечение и профилактика офтальмии новорожденных». Canadian Family Physician . 59 (11): 1187– 1190. ISSN  0008-350X. PMC 3828094. PMID  24235191 . 
  22. ^ Хофф, Райан Т.; Патель, Ами; Шапиро, Алан (2020-09-02). «Pseudomonas aeruginosa: необычная причина антибиотико-ассоциированной диареи у иммунокомпетентных амбулаторных взрослых». Отчеты о случаях в гастроинтестинальной медицине . 2020 : 6261748. doi : 10.1155/2020/6261748 . ISSN  2090-6528. PMC 7484680. PMID 32934852  . 
  23. ^ Коггинс, Сара А.; Уайнн, Джеймс Л.; Вайткамп, Йорн-Хендрик (2015-03-01). «Инфекционные причины некротизирующего энтероколита». Клиники перинатологии . 42 (1): 133– 154. doi :10.1016/j.clp.2014.10.012. ISSN  0095-5108. PMC 4328138. PMID 25678001  . 
  24. ^ Касим, Абдалла; Нахас, Джозеф (2023), «Нейтропенический энтероколит (тифлит)», StatPearls , Treasure Island (FL): StatPearls Publishing, PMID  31869058 , получено 22 июля 2023 г.
  25. ^ Коломба, Клаудия; Скализи, Микела; Часио, Валерия; Альбано, Кьяра; Багарелло, Сара; Биллоне, Себастьяно; Гуида, Марко; Джордано, Сальваторе; Кандушчо, Лаура А.; Милаццо, Марио; Аморосо, Сальваторе; Кашио, Антонио (01 ноября 2022 г.). «Шанхайская лихорадка: не только азиатская болезнь». Патогены . 11 (11): 1306. doi : 10.3390/pathogens11111306 . ISSN  2076-0817. ПМЦ 9699416 . ПМИД  36365057. 
  26. ^ ab Singhal, Sameer; Wagh, DD; Kashikar, Shivali; Lonkar, Yeshwant (2011-01-01). «Случай острого эпидидимоорхита, вызванного Pseudomonas aeruginosa, проявляющийся как ОРДС у иммунокомпетентного хозяина». Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine . 1 (1): 83– 84. doi :10.1016/S2221-1691(11)60075-0. ISSN  2221-1691. PMC 3609152 . PMID  23569732. 
  27. ^ Миттал, Рахул; Аггарвал, Судхир; Шарма, Сародж; Чиббер, Санджай; Харджай, Кусум (1 января 2009 г.). «Инфекции мочевыводящих путей, вызванные Pseudomonas aeruginosa: миниобзор». Журнал инфекций и общественного здравоохранения . 2 (3): 101–111 . doi :10.1016/j.jiph.2009.08.003. ISSN  1876-0341. ПМИД  20701869.
  28. ^ "Pseudomonas | Фонд муковисцидоза". www.cff.org . Получено 22 июля 2023 г. .
  29. ^ Рамирес-Эстрада, Серхио; Боргатта, Барбара; Релло, Хорди (20 января 2016 г.). «Лечение вентилятор-ассоциированной пневмонии, вызванной Pseudomonas aeruginosa». Инфекции и устойчивость к лекарствам . 9 : 7–18 . doi : 10.2147/IDR.S50669 . ISSN  1178-6973. ПМЦ 4725638 . ПМИД  26855594. 
  30. ^ Закхур, Джонни; Шарара, Сима Л.; Хинди, Джоя-Рита; Хаддад, Сара Ф.; Кандж, Суха С. (18.10.2022). «Антимикробное лечение тяжелого сепсиса, вызванного Pseudomonas aeruginosa». Антибиотики . 11 (10): 1432. doi : 10.3390/antibiotics11101432 . ISSN  2079-6382. PMC 9598900. PMID 36290092  . 
  31. ^ Бискай, Стефани; Демончи, Диана; Афанетти, Микаэль; Дюпон, Одри; Хаас, Эрве; Тран, Антуан (13.01.2017). "Гангренозная эктима, кожное проявление сепсиса, вызванного Pseudomonas aeruginosa, у ранее здорового ребенка". Медицина . 96 (2): e5507. doi :10.1097/MD.0000000000005507. ISSN  0025-7974. PMC 5266152. PMID 28079790  . 
  32. ^ Мартинес-Лонгория, Сезар Адриан; Росалес-Солис, Глория Мария; Окампо-Гарса, Хорхе; Герреро-Гонсалес, Гильермо Антонио; Окампо-Кандиани, Хорхе (10 сентября 2017 г.). «Гангренозная эктима: отчет о восьми случаях *». Анаис Бразилейрос де Дерматологии . 92 (5): 698–700 . doi :10.1590/abd1806-4841.20175580. ISSN  0365-0596. ПМЦ 5674706 . ПМИД  29166510. 
  33. ^ Грин, С.Л.; Су, В.П.; Мюллер, С.А. (1984-01-01). «Инфекции кожи, вызванные Pseudomonas aeruginosa». American Family Physician . 29 (1): 193–200 . ISSN  0002-838X. PMID  6229990.
  34. ^ Лота, А.С.; Альтаф, Ф.; Шетти, Р.; Кортни, С.; Маккенна, П.; Айер, С. (2010-02-01). «Случай некротизирующего фасциита, вызванного Pseudomonas aeruginosa». Журнал костной и суставной хирургии, британский том . 92-B (2): 284– 285. doi :10.1302/0301-620X.92B2.22688. ISSN  2049-4408. PMID  20130324.
  35. ^ abcde Шехтер, Моселио (14 января 2009 г.). Энциклопедия микробиологии (3-е изд.). Амстердам-Бостон: Elsevier/Academic Press. ISBN 9780123739445.
  36. ^ Weimer, A; Kohlstedt, M; Volke, DC; Nikel, PI; Wittmann, C (сентябрь 2020 г.). «Промышленная биотехнология Pseudomonas putida: достижения и перспективы». Прикладная микробиология и биотехнология . 104 (18): 7745– 7766. doi :10.1007/s00253-020-10811-9. PMC 7447670. PMID 32789744.  S2CID 221111260  . 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Черновик:Pseudomonas&oldid=1257785099"