Подразделение (таксономия)
Подразделение — таксономический ранг в биологической классификации , который по-разному используется в зоологии и ботанике.
В ботанике и микологии , разделение является традиционным названием для ранга, который теперь считается эквивалентным филуму . Использование любого термина разрешено в соответствии с Международным кодексом ботанической номенклатуры . [1]
Основные отделы наземных растений — Marchantiophyta (печеночники), Anthocerotophyta (роголистники), Bryophyta (мхи), Filicophyta (папоротники), Sphenophyta (хвощи), Cycadophyta (цикады), Ginkgophyta (гинкго), Pinophyta (хвойные), Gnetophyta (гнетофиты) и Magnoliophyta (покрытосеменные, цветковые растения). Magnoliophyta в настоящее время доминируют в наземных экосистемах , составляя 80% видов сосудистых растений . [2]
В зоологии термин «подразделение» применяется к необязательному рангу, подчиненному инфраклассу и вышестоящему по отношению к легиону и когорте . Широко используемая классификация (например, Carroll 1988 [3] ) признает костистых рыб как Отдел Teleostei внутри класса Actinopterygii (лучеперые рыбы). Реже (как у Milner 1988 [4] ) современные четвероногие ранжируются как Отделы Amphibia и Amniota внутри клады позвоночных с мясистыми конечностями ( Sarcopterygii ).
Предложения по стандартизации
В 1978 году группа ботаников, включая Гарольда Чарльза Болда , Артура Кронквиста и Линн Маргулис, предложила заменить термин «отдел» на «филюм» в ботанической номенклатуре, утверждая, что сохранение разных терминов для одного и того же таксономического ранга в биологических царствах создает ненужную путаницу. Это было особенно проблематично для одноклеточных эукариот , где гетеротрофные организмы классифицировались по зоологической номенклатуре (используя «филюм»), в то время как автотрофные организмы попадали под ботаническую номенклатуру (используя «отдел»). Они предложили обновить Международный кодекс ботанической номенклатуры, чтобы использовать «филюм» и «подфилюм» повсюду, при этом утверждая, что названия, первоначально опубликованные как отделы, будут рассматриваться так, как если бы они были опубликованы как филы. [5]
Молекулярно-филогенетическая классификация
Использование молекулярных методов, в частности анализа рибосомальной РНК 16S , помогло установить основные бактериальные подразделения в 1980-х годах. В 1985 году Карл Вёзе и его коллеги идентифицировали десять основных групп эубактерий с помощью анализа олигонуклеотидных сигнатур, отметив, что эти группировки были «надлежащим образом названы эубактериальными филами или подразделениями». Эта работа предоставила ранние молекулярные доказательства эквивалентности бактериальных подразделений с филами и помогла установить филогенетическую основу для высокоуровневой бактериальной классификации. [6]
Вирусы и прокариоты
В 2020 году Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) формализовал 15-ранговую иерархическую систему классификации, начиная с самого высокого ранга « область » (а не домен ) и заканчивая более низкими рангами, в частности, используя «филюм» вместо «отдел». В рамках этой системы первым установленным вирусным царством была Riboviria , охватывающая все РНК-вирусы , которые кодируют РНК-направленную РНК-полимеразу . [7]
В 2021 году Международный кодекс номенклатуры прокариот (ICNP) впервые официально включил ранг типа, приняв суффикс «-ota» для названий типов. Это привело к публикации названий для 46 типов прокариот с культивируемыми представителями, заменив некоторые устоявшиеся названия неологизмами — например, « Proteobacteria » стала « Pseudomonadota », а « Firmicutes » стала « Bacillota ». [8]
Ссылки
- ^ McNeill, J.; et al., eds. (2012). Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Мельбурнский кодекс), принятый Восемнадцатым Международным ботаническим конгрессом в Мельбурне, Австралия, июль 2011 г. (электронное издание). Международная ассоциация по таксономии растений . Получено 14 мая 2017 г.
- ^ Джадд, Уолтер С.; Кэмпбелл, Кристофер С.; Келлог, Элизабет А.; Стивенс, Питер Ф.; Донохью, Майкл Дж. (2002). Систематика растений, филогенетический подход (2-е изд.). Сандерленд, Массачусетс, США: Sinauer Associates Inc. ISBN 0-87893-403-0.
- ^ (Кэрролл 1988)
- ^ (Милнер 1988)
- ^ Bold, HC; Cronquist, A.; Jeffey, C.; Johnson, LAS; Marguilis, L.; Merximiller, H.; Takhtajan, AL (1978). «Предложение (10) заменить термин «филум» на термин «разделение» для групп, рассматриваемых как растения» (PDF) . Таксон . 27 (1): 121–122 .
- ^ Woese, CR; Stackebrandt, E.; Macke, TJ; Fox, GE (1985). «Филогенетическое определение основных таксонов эубактерий». Systematic and Applied Microbiology . 6 (2): 143– 151. Bibcode :1985SyApM...6..143W. doi :10.1016/S0723-2020(85)80047-3. PMID 11542017.
- ^ Исполнительный комитет Международного комитета по таксономии вирусов; Горбаленя Александр Евгеньевич; Крупович, Март; Мушегян, Аркадий; Кропински, Эндрю М.; Сидделл, Стюарт Г.; Варсани, Арвинд; Адамс, Майкл Дж.; Дэвисон, Эндрю Дж.; Дутил, Бас Э.; Харрах, Балаж; Харрисон, Роберт Л.; Юнглен, Сандра; Кинг, Эндрю MQ; Ноулз, Ник Дж.; Лефковиц, Эллиот Дж.; Ниберт, Макс Л.; Рубино, Луиза; Сабанадзович, Сеад; Санфасон, Элен; Симмондс, Питер; Уокер, Питер Дж.; Зербини, Ф. Мурило; Кун, Йенс Х. (2020). «Новая сфера таксономии вирусов: разделение виросферы на 15 иерархических рангов». Nature Microbiology . 5 (5): 668– 674. doi : 10.1038 / s41564-020-0709-x . PMC 7186216. PMID 32341570.
- ^ Паллен, Марк Дж. (2024). «Динамическая история прокариотических типов: открытие, разнообразие и разделение». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 74 (9): e006508. doi :10.1099/ijsem.0.006508. PMC 11382960. PMID 39250184.
Цитируемые работы
- Кэрролл, Роберт Л. (1988), Палеонтология позвоночных и эволюция , Нью-Йорк: WH Freeman & Co., ISBN 0-716-7-1822-7
- Милнер, Эндрю (1988), «Взаимоотношения и происхождение ныне живущих амфибий», в MJ Benton (ред.),«Филогения и классификация четвероногих» , т. 1: Амфибии, рептилии , птицы, Оксфорд: Clarendon Press, стр. 59–102
