Рецептор 2, содержащий домен дискоидина

DDR2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2WUH, 2Z4F
Идентификаторы
Псевдонимы	DDR2 , MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, рецепторная тирозинкиназа 2 дискоидинового домена, WRCN
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 191311; МГИ : 1345277; гомологен : 68505; Генные карты : DDR2; OMA :DDR2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	162,787,405 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	169,938,331 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	хвост придатка яичка; ; сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; полая вена; ; синовиальный сустав; ; Ахиллово сухожилие; ; головка придатка яичка; ; хрящевая ткань; ; большеберцовая кость; ; клетка слизистой оболочки щеки; ; перикард;
	Верх выражен в
	кальвария; ; восходящая аорта; ; дерма; ; поясничный спинномозговой ганглий; ; аортальный клапан; ; тело бедренной кости; ; ямка; ; лодыжка; ; ирис; ; строма костного мозга;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; связывание нуклеотидов; активность протеинкиназы; активность киназы; связывание белков; трансмембранный рецептор протеинтирозинкиназная активность; активность коллагенового рецептора протеинтирозинкиназы; активность протеинтирозинкиназы; Связывание АТФ; связывание коллагена;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; мембрана; фокальная адгезия; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; внеклеточная экзосома; апикальная плазматическая мембрана; плазматическая мембрана; актиновый цитоскелет; рецепторный комплекс;
Биологический процесс	сигнальный путь рецептора тирозинкиназы, активируемого коллагеном; окостенение; фосфорилирование; организация коллагеновых фибрилл; трансмембранный рецепторный протеинтирозинкиназный сигнальный путь; регуляция минерализации костей; позитивная регуляция пролиферации фибробластов; развитие биоминеральной ткани; позитивная регуляция активности ДНК-связывающего фактора транскрипции; организация внеклеточного матрикса; регуляция разборки внеклеточного матрикса; позитивная регуляция разборки внеклеточного матрикса; фосфорилирование белков; адгезия клеток; позитивная регуляция дифференциации остеобластов; пролиферация хондроцитов; позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции; пептидил-тирозиновое фосфорилирование; эндохондральный рост кости; позитивная регуляция миграции фибробластов; передача сигнала; позитивная регуляция активности протеинкиназы; аутофосфорилирование белков; регуляция адгезии клеток и матрикса; адгезия клеточно-матриксной структуры; дифференциация клеток; регуляция организации внеклеточного матрикса;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	4921
	18214
	ENSG00000162733
	ENSMUSG00000026674
	Q16832
	Q62371
	NM_001014796 ; NM_006182 ; NM_001354982 ; NM_001354983
	NM_022563
	NP_001014796 ; NP_006173 ; NP_001341911 ; NP_001341912
	NP_072075
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Рецептор 2, содержащий домен дискоидина , также известный как CD167b ( кластер дифференцировки 167b), представляет собой белок, который у людей кодируется геном DDR2 . ^[5] Рецептор 2, содержащий домен дискоидина, представляет собой рецепторную тирозинкиназу (RTK).

Функция

RTK играют ключевую роль в коммуникации клеток с их микроокружением. Эти молекулы участвуют в регуляции роста клеток, дифференцировки и метаболизма. В нескольких случаях биохимическим механизмом, посредством которого RTK передают сигналы через мембрану, является лиганд-индуцированная олигомеризация рецептора и последующее внутриклеточное фосфорилирование . В случае DDR2 лигандом является коллаген , который связывается с его внеклеточным дискоидиновым доменом. ^[6] Это аутофосфорилирование приводит к фосфорилированию цитозольных мишеней, а также к ассоциации с другими молекулами, которые участвуют в плейотропных эффектах передачи сигнала. DDR2 был связан с рядом заболеваний, включая фиброз и рак . ^[7]

Структура

RTK имеют трехкомпонентную структуру с внеклеточными, трансмембранными и цитоплазматическими областями. Этот ген кодирует член нового подкласса RTK и содержит отдельную внеклеточную область, охватывающую домен, подобный фактору VIII . ^[5]

Ген

Альтернативный сплайсинг в 5'-нетранслируемой области гена DDR2 приводит к появлению множественных вариантов транскрипта, кодирующих один и тот же белок. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что DDR2 (ген) взаимодействует с SHC1 ^[8] и фосфорилирует Shp2 . ^[9] DDR2 также взаимодействует с интегрином α ₁ β ₁ и α ₂ β _1, способствуя их адгезии к коллагену. ^[10]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000162733 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026674 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abc "Ген Entrez: семейство рецепторов дискоидинового домена DDR2, член 2".
^ Fu HL, Valiathan RR, Arkwright R, Sohail A, Mihai C, Kumarasiri M, Mahasenan KV, Mobashery S, Huang P, Agarwal G, Fridman R (март 2013 г.). «Рецепторы домена дискоидина: уникальные рецепторные тирозинкиназы в коллаген-опосредованной сигнализации». J. Biol. Chem . 288 (11): 7430– 7. doi : 10.1074/jbc.R112.444158 . PMC 3597784. PMID 23335507 .
^ Leitinger B (май 2011). «Трансмембранные коллагеновые рецепторы». Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 27 : 265– 90. doi :10.1146/annurev-cellbio-092910-154013. PMID 21568710.
^ Ikeda K, Wang LH, Torres R, Zhao H, Olaso E, Eng FJ, Labrador P, Klein R, Lovett D, Yancopoulos GD, Friedman SL, Lin HC (май 2002 г.). «Рецептор 2 дискоидинового домена взаимодействует с Src и Shc после его активации коллагеном I типа». J. Biol. Chem . 277 (21): 19206– 12. doi : 10.1074/jbc.M201078200 . PMID 11884411.
^ Iwai LK, Payne LS, Luczynski MT, Chang F, Xu H, Clinton RW, Paul A, Esposito EA, Gridley S, Leitinger B, Naegle KM, Huang PH (июль 2013 г.). «Фосфопротеомика сетей рецепторов коллагена выявляет фосфорилирование SHP-2 ниже по течению от дикого типа DDR2 и его мутантов рака легких». Biochem. J . 454 (3): 501– 13. doi :10.1042/BJ20121750. PMC 3893797 . PMID 23822953.
^ Xu H, Bihan D, Chang F, Huang PH, Farndale RW, Leitinger B (декабрь 2012 г.). «Рецепторы домена дискоидина способствуют адгезии клеток, опосредованной α1β1- и α2β1-интегрином, к коллагену за счет усиления активации интегрина». PLOS ONE . 7 (12): e52209. Bibcode :2012PLoSO...752209X. doi : 10.1371/journal.pone.0052209 . PMC 3527415 . PMID 23284937.

Дальнейшее чтение

Lapsys NM, Layfield R, Baker E, Callen DF, Sutherland GR , Abedinia M, Nixon PF, Mattick JS (1992). «Хромосомное расположение гена человеческой транскетолазы». Cytogenet. Cell Genet . 61 (4): 274– 5. doi :10.1159/000133421. PMID 1486804.
Abedinia M, Layfield R, Jones SM, Nixon PF, Mattick JS (1992). "Нуклеотидная и предсказанная аминокислотная последовательность клона кДНК, кодирующего часть человеческой транскетолазы". Biochem. Biophys. Res. Commun . 183 (3): 1159– 66. doi :10.1016/S0006-291X(05)80312-2. PMID 1567394.
Edelhoff S, Sweetser DA, Disteche CM (1995). «Картирование гена тирозинкиназы рецептора NEP на хромосоме человека 6p21.3 и мышиной хромосоме 17C». Genomics . 25 (1): 309– 11. doi :10.1016/0888-7543(95)80144-B. PMID 7774938.
Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Karn T, Holtrich U, Bräuninger A, Böhme B, Wolf G, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1993). «Структура, экспрессия и хромосомное картирование TKT у человека и мыши: новый подкласс рецепторных тирозинкиназ с доменом, подобным фактору VIII». Онкоген . 8 (12): 3433– 40. PMID 8247548.
Хиллиер Л.Д., Леннон Дж., Беккер М., Бональдо М.Ф., Кьяпелли Б., Чиссо С., Дитрих Н., ДюБук Т., Фавелло А., Гиш В., Хокинс М., Хультман М., Кукаба Т., Лейси М., Ле М., Ле Н., Мардис Е., Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Ролфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф., Тьерри-Мэг Дж., Треваскис Э., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М. (1996). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека». Геном Рез . 6 (9): 807–28 . doi : 10.1101/gr.6.9.807 . ПМИД 8889549.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Vogel W, Gish GD, Alves F, Pawson T (1997). «Тирозинкиназы рецептора дискоидинового домена активируются коллагеном». Mol. Cell . 1 (1): 13– 23. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80003-9 . PMID 9659899.
Mohan RR, Mohan RR, Wilson SE (2001). «Рецептор домена дискоидина (DDR) 1 и 2: коллаген-активируемые тирозинкиназные рецепторы в роговице». Exp. Eye Res . 72 (1): 87– 92. doi :10.1006/exer.2000.0932. PMID 11133186.
Ikeda K, Wang LH, Torres R, Zhao H, Olaso E, Eng FJ, Labrador P, Klein R, Lovett D, Yancopoulos GD, Friedman SL, Lin HC (2002). "Рецептор 2 дискоидинового домена взаимодействует с Src и Shc после его активации коллагеном типа I". J. Biol. Chem . 277 (21): 19206– 12. doi : 10.1074/jbc.M201078200 . PMID 11884411.
Faraci E, Eck M, Gerstmayer B, Bosio A, Vogel WF (2003). «Внеклеточный матрикс-специфический микрочип позволил идентифицировать целевые гены ниже рецепторов домена дискоидина». Matrix Biol . 22 (4): 373– 81. doi :10.1016/S0945-053X(03)00053-2. PMID 12935821.
Ferri N, Carragher NO, Raines EW (2004). "Роль рецепторов домена дискоидина 1 и 2 в ремоделировании коллагена, опосредованном клетками гладких мышц человека: потенциальные последствия при атеросклерозе и лимфангиолейомиоматозе". Am. J. Pathol . 164 (5): 1575– 85. doi :10.1016/S0002-9440(10)63716-9. PMC 1615659 . PMID 15111304.
Leitinger B, Steplewski A, Fertala A (2004). «Период D2 коллагена II содержит специфический сайт связывания для рецептора домена дискоидина человека, DDR2». J. Mol. Biol . 344 (4): 993–1003 . doi :10.1016/j.jmb.2004.09.089. PMID 15544808.
Wall SJ, Werner E, Werb Z, DeClerck YA (2005). «Рецептор 2 домена дискоидина опосредует остановку цикла опухолевых клеток, вызванную фибриллярным коллагеном». J. Biol. Chem . 280 (48): 40187– 94. doi : 10.1074/jbc.M508226200 . PMC 2768768. PMID 16186104 .
Yang K, Kim JH, Kim HJ, Park IS, Kim IY, Yang BS (2005). «Фосфорилирование тирозина 740 рецептора домена дискоидина 2 с помощью Src стимулирует внутримолекулярное аутофосфорилирование и формирование сигнального комплекса Shc». J. Biol. Chem . 280 (47): 39058– 66. doi : 10.1074/jbc.M506921200 . PMID 16186108.
Leitinger B, Kwan AP (2006). «Рецептор домена дискоидина DDR2 является рецептором коллагена типа X». Matrix Biol . 25 (6): 355–64 . doi :10.1016/j.matbio.2006.05.006. PMID 16806867.
Zhang W, Ding T, Zhang J, Su J, Li F, Liu X, Ma W, Yao L (2006). «Экспрессия внеклеточного домена рецептора дискоидинового домена 2 (DDR2) в pichia pastoris и функциональный анализ в синовиальных фибробластах и клетках NIT3T3». Mol. Cell. Biochem . 290 ( 1– 2): 43– 53. doi :10.1007/s11010-006-9136-4. PMID 16967187. S2CID 19400659.
Ford CE, Lau SK, Zhu CQ, Andersson T, Tsao MS, Vogel WF (2007). «Анализ экспрессии и мутаций рецепторов домена дискоидина 1 и 2 при немелкоклеточной карциноме легких». Br. J. Cancer . 96 (5): 808– 14. doi :10.1038/sj.bjc.6603614. PMC 2360060 . PMID 17299390.
Xu L, Servais J, Polur I, Kim D, Lee PL, Chung K, Li Y (2010). «Ослабление прогрессирования остеоартрита путем снижения рецептора 2 дискоидинового домена у мышей». Arthritis Rheum . 62 (9): 2736– 44. doi :10.1002/art.27582. PMC 2946478 . PMID 20518074.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000162733 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026674 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Ген Entrez: семейство рецепторов дискоидинового домена DDR2, член 2".

[pmid23335507-6] Fu HL, Valiathan RR, Arkwright R, Sohail A, Mihai C, Kumarasiri M, Mahasenan KV, Mobashery S, Huang P, Agarwal G, Fridman R (март 2013 г.). «Рецепторы домена дискоидина: уникальные рецепторные тирозинкиназы в коллаген-опосредованной сигнализации». J. Biol. Chem . 288 (11): 7430– 7. doi : 10.1074/jbc.R112.444158 . PMC 3597784. PMID 23335507 .

[pmid21568710-7] Leitinger B (май 2011). «Трансмембранные коллагеновые рецепторы». Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 27 : 265– 90. doi :10.1146/annurev-cellbio-092910-154013. PMID 21568710.

[pmid11884411-8] Ikeda K, Wang LH, Torres R, Zhao H, Olaso E, Eng FJ, Labrador P, Klein R, Lovett D, Yancopoulos GD, Friedman SL, Lin HC (май 2002 г.). «Рецептор 2 дискоидинового домена взаимодействует с Src и Shc после его активации коллагеном I типа». J. Biol. Chem . 277 (21): 19206– 12. doi : 10.1074/jbc.M201078200 . PMID 11884411.

[pmid23822953-9] Iwai LK, Payne LS, Luczynski MT, Chang F, Xu H, Clinton RW, Paul A, Esposito EA, Gridley S, Leitinger B, Naegle KM, Huang PH (июль 2013 г.). «Фосфопротеомика сетей рецепторов коллагена выявляет фосфорилирование SHP-2 ниже по течению от дикого типа DDR2 и его мутантов рака легких». Biochem. J . 454 (3): 501– 13. doi :10.1042/BJ20121750. PMC 3893797 . PMID 23822953.

[pmid23284937-10] Xu H, Bihan D, Chang F, Huang PH, Farndale RW, Leitinger B (декабрь 2012 г.). «Рецепторы домена дискоидина способствуют адгезии клеток, опосредованной α1β1- и α2β1-интегрином, к коллагену за счет усиления активации интегрина». PLOS ONE . 7 (12): e52209. Bibcode :2012PLoSO...752209X. doi : 10.1371/journal.pone.0052209 . PMC 3527415 . PMID 23284937.