Ап4А
Ап4А
Имена
Название ИЮПАК
O 1 , O 7 -Ди(5′-дезоксиаденозин-5′-ил) тетрагидротетрафосфат
Систематическое название ИЮПАК
O 1 , O 7 -Бис{[(2 R ,3 S ,4 R ,5 R )-5-(6-амино-9 H -пурин-9-ил)-3,4-дигидроксиоксолан-2-ил]метил} тетрагидротетрафосфат
Другие имена
Диаденозинтетрафосфат; 5',5'''-Диаденозинтетрафосфат; AppppA
Идентификаторы
  • 5542-28-9 проверятьИ
3D модель ( JSmol )
  • Интерактивное изображение
ЧЭБИ
  • ЧЕБИ:17422
ChEMBL
  • ChEMBL339385
ChemSpider
  • 20402
КЕГГ
  • С01260
CID PubChem
  • 21706
  • ИнЧИ=1S/C20H28N10O19P4/c21-15-9-17(25-3-23-15)29(5-27-9)19-13(33)11(31)7(45-19) 1-43-50(35,36)47-52(39,40)49-53(41,42)48-51(37,38)44-2-8-12(32)14(34)20( 46-8)30- 6-28-10-16(22)24-4-26-18(10)30/ч3-8,11-14,19-20,31-34Н,1-2Н2,(Н,35,36)( Н,37,38)(Н,39,40)(Н,41,42)(Н2,21,23,25)(Н2,22,24,26)/т7-,8-,11-,12- ,13-,14-,19-,20-/м1/с1
    Ключ: YOAHKNVSNCMZGQ-XPWFQUROSA-N
  • C1=NC2=C(C(=N1)N)N=CN2[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)( О)ОП(=О)(О)ОП (=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]4[C@H]([C@H]([C@@H](O4)N5C=NC6=C5N= CN=C6N)O)O)O)O
Характеристики
С20Н28Н10О19П4​​​​​​​​​
Молярная масса836,390  г·моль −1
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
Химическое соединение

Диаденозинтетрафосфат или Ap4A — предполагаемый алармоно , повсеместно встречающийся в природе, общий для всего, от бактерий до людей . Он состоит из двух аденозинов, соединенных вместе 5′-5′ связанной цепью из четырех фосфатов. Аденозинполифосфаты способны вызывать множественные физиологические эффекты. [1]

Функция

У эукариот

Ap4A может быть создан неканонической активностью Lysyl- тРНК-синтетазы (LysRS). Эта функция LysRS активируется фосфорилированием LysRS на серине 207, его последующей диссоциацией от мультисинтетазного комплекса (MSC). [2] Роль молекулы как вторичного мессенджера была недавно обнаружена в сигнальном пути LysRS -Ap4A- MITF . [3] Ap4A связывается с ингибиторным комплексом MITF-HINT1, в частности с молекулой нуклеотид-связывающего белка 1 гистидиновой триады (HINT1), высвобождая фактор транскрипции, ассоциированный с микрофтальмией (MITF), и вызывая увеличение транскрипции его целевых генов. [4] Ap4A также положительно регулирует активность фактора транскрипции USF2 через молекулярный механизм, аналогичный механизму MITF. [5]

Также было показано, что Ap4A играет роль в функциональности дендритных клеток (DC). Увеличение внутриклеточного количества улучшает их подвижность и способность представлять антигены за счет изменений в малых ГТФазах , присутствующих в клетках. Это было обнаружено путем создания мышей с дефицитом фермента NUDT2, который служит гидролазой Ap4A и, таким образом, контролирует уровни Ap4A в клетке. [6] Однако также было показано, что Ap4A вызывает апоптоз в нескольких клеточных линиях посредством неизвестного механизма, деградация Ap4A была необходима для этого процесса, поскольку устойчивые к гидролизу аналоги молекулы не проявляли апоптотической активности. [7]

У прокариот

В E. Coli было показано, что Ap4A функционирует как алармоне, поскольку внутриклеточная концентрация молекулы увеличивается при тепловом стрессе. [8] Ap4A также может быть включен в РНК в качестве 5'-колпачка вместе с другими динуклеозидполифосфатами. Он служит субстратом для РНК-полимеразы , и внутриклеточные уровни этих колпачковых РНК увеличиваются при стрессе, что позволяет предположить, что колпачок добавляет уровень стабильности РНК . [ 9]

Myxococcus xanthus — это тип грамотрицательных бактерий , а M. xanthus лизил-тРНК-синтетаза (LysS) — это фермент из бактерий, который синтезирует диаденозинтетрафосфаты (Ap4A) при наличии аденозинтрифосфата (АТФ). Диаденозинпентафосфат (Ap5A) синтезируется из Ap4A с АТФ. [10]

Ссылки

  1. ^ Луо, Цзянькай; Янковски, Вера; Гюнгар, Нихайрт; Нойманн, Иоахим; Шмитц, Вильгельм; Зидек, Вальтер; Шлютер, Хартмут; Янковски, Иоахим (2004). «Эндогенный диаденозинтетрафосфат, диаденозинпентафосфат и диаденозингексафосфат в ткани миокарда человека». Гипертензия . 43 (5): 1055– 9. doi :10.1161/01.hyp.0000126110.46402.dd. PMID  15066958. S2CID  1003539.
  2. ^ Офир-Бирин, Ифат; Фанг, Пэнфэй; Беннетт, Стивен П.; Чжан, Хуэй-Мин; Ван, Цзин; Рахмин, Инбал; Шапиро, Райан; Сун, Цзин; Даган, Арье; Посо, Хорхе; Ким, Сонхун; Маршалл, Алан Г.; Шиммель, Пол; Ян, Сян-Лэй; Нехуштан, Ховав; Разин, Эхуд; Го, Мин (10 января 2013 г.). «Структурное переключение лизил-тРНК-синтетазы между трансляцией и транскрипцией». Молекулярная клетка . 49 (1): 30–42 . doi : 10.1016/j.molcel.2012.10.010 . ISSN  1097-2765. ПМЦ 3766370 . PMID  23159739. 
  3. ^ * Ли, Ю-Ни; Нечуштан, Ховав; Фигов, Навах; Разин, Эхуд (апрель 2004 г.). "Функция лизил-тРНК-синтетазы и Ap4A как сигнальных регуляторов активности MITF в тучных клетках, активированных FcepsilonRI". Иммунитет . 20 (2): 145– 51. doi :10.1016/S1074-7613(04)00020-2. PMID  14975237. S2CID  36723485.
  4. ^ Ю, Цзин; Лю, Цзайчжоу; Лян, Юаньюань; Ло, Фэн; Чжан, Цзе; Тянь, Цуйпин; Моцик, Алекс; Чжэн, Мэнмэн; Кан, Цзинву; Чжун, Гуйшэн; Лю, Конг (11 октября 2019 г.). «Второй мессенджер Ap4A полимеризует целевой белок HINT1 для передачи сигналов в тучных клетках, активированных FcεRI». Природные коммуникации . 10 (1): 4664. doi : 10.1038/s41467-019-12710-8. ISSN  2041-1723. ПМК 6789022 . ПМИД  31604935. 
  5. ^ Ли, Ю-Ни; Разин, Эхуд (2005-10-15). "Нетрадиционное участие LysRS в молекулярном механизме транскрипционной активности USF2 в тучных клетках, активированных FcεRI". Молекулярная и клеточная биология . 25 (20): 8904– 8912. doi : 10.1128/MCB.25.20.8904-8912.2005 . ISSN  0270-7306. PMC 1265770. PMID 16199869  . 
  6. ^ Шу, Шин Ла; Паручуру, Лакшми Бхаргави; Тай, Нил Куанвэй; Чуа, Йен Леонг; Фу, Аделин Шен Юн; Ян, Крис Маолин; Лионг, Ка Ханг; Кох, Эстер Геок Лян; Ли, Анджелин; Нечуштан, Ховав; Разин, Эхуд; Кемени, Дэвид Майкл (2019-06-28). "Ap4A регулирует направленную подвижность и презентацию антигена в дендритных клетках". iScience . 16 : 524– 534. doi : 10.1016/j.isci.2019.05.045 . ISSN  2589-0042. PMC 6595237 . PMID  31254530. 
  7. ^ Вартанян, Амалия; Александров, Иван; Прудовский, Игорь; МакЛеннан, Александр; Киселев, Лев (1999). «Ap4A индуцирует апоптоз в культивируемых клетках человека». FEBS Letters . 456 (1): 175– 180. Bibcode : 1999FEBSL.456..175V. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00956-4. ISSN  1873-3468. PMID  10452553. S2CID  24954275.
  8. ^ Деспотович, Драгана; Брандис, Александр; Савидор, Алон; Левин, Ишай; Фумагалли, Лаура; Тауфик, Дэн С. (2017). «Диаденозинтетрафосфат (Ap4A) - алармон E. coli или повреждающий метаболит?». Журнал ФЭБС . 284 (14): 2194–2215 . doi : 10.1111/14113 февраля . HDL : 2434/503672 . ISSN  1742-4658. ПМИД  28516732.
  9. ^ Худечек, Олдржих; Бенони, Роберто; Рейес-Гутьеррес, Пол Э.; Калка, Мартин; Шандерова, Хана; Хубалек, Мартин; Рулишек, Любомир; Цвачка, Йозеф; Красный, Либор; Кахова, Хана (26 февраля 2020 г.). «Динуклеозидполифосфаты действуют как кэпы ​​5'-РНК у бактерий». Природные коммуникации . 11 (1): 1052. Бибкод : 2020NatCo..11.1052H. дои : 10.1038/s41467-020-14896-8 . ISSN  2041-1723. ПМК 7044304 . PMID  32103016. 
  10. ^ Кимура, Ёсио; Танака, Тихиро; Ока, Манами (июль 2018 г.). «Идентификация основных ферментов, участвующих в синтезе диаденозинтетрафосфата и / или аденозинтетрафосфата в Myxococcus xanthus». Современная микробиология . 75 (7): 811–817 . doi :10.1007/s00284-018-1452-x. ISSN  1432-0991. PMID  29468302. S2CID  3402370.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ap4A&oldid=1257910901"