Дезоксинуклеозидкиназа

Дезоксинуклеозидкиназы обычно группируют в два семейства на основе структурной гомологии:

Семейство TK1. Это семейство получило свое название от человеческого фермента тимидинкиназы 1. Субстратная специфичность ограничена тимидином (и в меньшей степени дезоксиуридином) среди природных субстратов. Члены семейства TK1 широко распространены и встречаются как у эукариот, так и у прокариот.

Семейство, не похожее на TK1. Это семейство включает дезоксицитидинкиназу (цитозольную), а также два митохондриальных фермента дезоксигуанозинкиназу и тимидинкиназу 2 у людей. Базовая специфичность, как правило, шире, чем у семейства TK-1. Члены семейства, не относящиеся к TK1, широко распространены и встречаются как у эукариот, так и у прокариот. Также к этому семейству принадлежит тимидинкиназа вируса герпеса, хотя это не очевидно из гомологии последовательностей (она все еще структурно связана).

В энзимологии дезоксинуклеозидкиназа ( EC 2.7.1.145 ) — это фермент , катализирующий химическую реакцию

АТФ + 2'-дезоксинуклеозид АДФ + 2'-дезоксинуклеозид 5'-фосфат${\displaystyle \rightleftharpoons}$

Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются АТФ и 2'-дезоксинуклеозид, тогда как двумя его продуктами являются АДФ и 2'-дезоксинуклеозид 5'-фосфат.

Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , в частности, тех, которые переносят фосфорсодержащие группы ( фосфотрансферазы ) со спиртовой группой в качестве акцептора. Систематическое название этого класса ферментов — АТФ:дезоксинуклеозид 5'-фосфотрансфераза . Другие общеупотребительные названия включают мультиспецифическую дезоксинуклеозидкиназу , ms-dNK , мультисубстратную дезоксирибонуклеозидкиназу , многофункциональную дезоксинуклеозидкиназу , дезоксинуклеозидкиназу D. melanogaster и Dm-dNK .

По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов было решено 5 структур с кодами доступа PDB 1OE0, 1OT3, 1ZM7, 1ZMX и 2JCS.

• Munch-Petersen B, Piskur J, Sondergaard L (1998). «Четыре вида дезоксинуклеозидкиназной активности Drosophila melanogaster содержатся в одном мономерном ферменте, новой многофункциональной дезоксинуклеозидкиназе». J. Biol. Chem . 273 (7): 3926– 31. doi : 10.1074/jbc.273.7.3926 . PMID  9461577.
• Munch-Petersen B, Knecht W, Lenz C, Sondergaard L, Piskur J (2000). "Функциональная экспрессия мультисубстратной дезоксирибонуклеозидкиназы из Drosophila melanogaster и ее мутантов с делецией C-конца". J. Biol. Chem . 275 (9): 6673– 9. doi : 10.1074/jbc.275.9.6673 . PMID  10692477.