ДПХ5

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ДПХ5
Идентификаторы
ПсевдонимыDPH5 , CGI-30, HSPC143, NPD015, AD-018, биосинтез дифтамида 5
Внешние идентификаторыОМИМ : 611075; МГИ : 1916990; гомологен : 6471; Генные карты : DPH5; OMA :DPH5 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_001077394
НМ_001077395
НМ_015958

NM_027193

RefSeq (белок)

НП_001070862
НП_001070863
НП_057042

NP_081469

Местоположение (UCSC)Хр 1: 100.99 – 101.03 МбХр 3: 115.89 – 115.93 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Дифтинсинтаза — это фермент , который у человека кодируется геном DPH5 . [ 5] [6]

Этот ген кодирует компонент пути синтеза дифтамида . Дифтамид — это посттрансляционно модифицированный остаток гистидина, обнаруженный только в факторе элонгации трансляции 2. Он сохраняется от архебактерий до человека и является мишенью дифтерийного токсина и экзотоксина A Pseudomonas, останавливая синтез клеточного белка.

Дрожжи и гомологи китайского хомяка этого белка катализируют триметилирование остатка гистидина на факторе удлинения 2 , что приводит к образованию дифтиновой части, которая впоследствии амидируется с образованием дифтамида. Для этого гена были обнаружены множественные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы . [6]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117543 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000033554 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Liu S, Milne GT, Kuremsky JG, Fink GR, Leppla SH (октябрь 2004 г.). «Идентификация белков, необходимых для биосинтеза дифтамида, цели бактериальных АДФ-рибозилирующих токсинов на факторе удлинения трансляции 2». Mol Cell Biol . 24 (21): 9487– 97. doi :10.1128/MCB.24.21.9487-9497.2004. PMC 522255. PMID  15485916 . 
  6. ^ ab "Ген Entrez: DPH5 Гомолог DPH5 (S. cerevisiae)".

Дальнейшее чтение

  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S и др. (2000). «Метод дробового секвенирования человеческого транскриптома с использованием экспрессируемых ORF-тегов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491– 6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073 /pnas.97.7.3491 . PMC  16267. PMID  10737800.
  • Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно сохраненных в Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res . 10 (5): 703– 13. doi :10.1101/gr.10.5.703. PMC  310876. PMID  10810093 .
  • Hu RM, Han ZG, Song HD и др. (2000). «Профилирование экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (17): 9543– 8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H. doi : 10.1073 /pnas.160270997 . PMC  16901. PMID  10931946.
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34+». Genome Res . 10 (10): 1546– 60. doi :10.1101/gr.140200. PMC  310934. PMID  11042152 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DPH5&oldid=1115448025"