DHPS

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
DHPS
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDHPS , дезоксигипузинсинтаза, DHS, DS, MIG13, NEDSSWI
Внешние идентификаторыОМИМ : 600944; МГИ : 2683592; Гомологен : 1453; GeneCards : DHPS; OMA :DHPS - ортологи
Номер ЕС2.5.1.46
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001039514
NM_201408

RefSeq (белок)

NP_001034603

Местоположение (UCSC)Хр 19: 12.68 – 12.68 МбХр 8: 85,8 – 85,8 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Дезоксигипузинсинтаза — это фермент , который у людей кодируется геном DHPS . [ 5] [6]

Необычная аминокислота гипузин образуется посттрансляционно и встречается только в одном клеточном белке, эукариотическом факторе инициации трансляции 5A ( EIF5A , EIF5A2 ). На первом этапе биосинтеза гипузина дезоксигипузинсинтаза катализирует НАД -зависимый перенос бутиламиновой части спермидина на эпсилон-аминогруппу определенного остатка лизина белка-предшественника EIF5A с образованием промежуточного остатка дезоксигипузина. Этот ген состоит из девяти экзонов, охватывающих 6,6 кб. Было выделено три варианта транскрипта. Однако только вариант транскрипта 1 кодирует активный белок. Более короткие варианты могут действовать как модулирующие факторы активности DHPS. [6]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000095059 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000060038 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Джо YA, Вольф EC, Парк MH (октябрь 1995 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК человеческой дезоксигипузинсинтазы. Структурно-функциональные исследования с рекомбинантным ферментом и мутантными белками». J Biol Chem . 270 (38): 22386– 92. doi : 10.1074/jbc.270.38.22386 . PMID  7673224.
  6. ^ ab "Ген Энтреза: дезоксигипузинсинтаза DHPS".

Дальнейшее чтение

  • Клиер Х., Чонга Р., Стейнкассерер А. и др. (1995). «Очистка и характеристика человеческой дезоксигипузинсинтазы из клеток HeLa». FEBS Lett . 364 (2): 207– 10. doi : 10.1016/0014-5793(95)00394-O . PMID  7750572. S2CID  24485865.
  • Джо YA, Парк MH (1994). "Структурные особенности предшественника eIF-5A, необходимые для посттрансляционного синтеза дезоксигипузина". J. Biol. Chem . 269 (41): 25916– 21. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47333-4 . PMID  7929297.
  • Bevec D, Kappel B, Jaksche H и др. (1996). «Молекулярная характеристика кДНК, кодирующей функциональную человеческую дезоксигипузинсинтазу, и хромосомное картирование соответствующего локуса гена». FEBS Lett . 378 (2): 195– 8. doi :10.1016/0014-5793(95)01456-X. PMID  8549832. S2CID  39329481.
  • Yan YP, Tao Y, Chen KY (1996). «Молекулярное клонирование и функциональная экспрессия кДНК человеческой дезоксигипузинсинтазы на основе информации о выраженной последовательности тега». Biochem. J . 315 (2): 429– 34. doi :10.1042/bj3150429. PMC  1217213 . PMID  8615810.
  • Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY и др. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Anal. Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
  • Jones T, Sheer D, Kapetanopoulos A и др. (1996). «Ген, кодирующий человеческую дезоксигипузинсинтазу (DHPS), отображается на хромосоме 19p13.11-p13.12». Genomics . 35 (3): 635–7 . doi :10.1006/geno.1996.0416. PMID  8812510.
  • Yu W, Andersson B, Worley KC и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Res . 7 (4): 353– 8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146. PMID  9110174 .
  • Liao DI, Wolff EC, Park MH, Davies DR (1998). "Кристаллическая структура комплекса NAD человеческой дезоксигипузинсинтазы: фермент с шарообразным механизмом для блокирования активного центра". Structure . 6 (1): 23– 32. doi : 10.1016/S0969-2126(98)00004-5 . PMID  9493264.
  • Mantuano E, Trettel F, Olsen AS и др. (1998). «Локализация и геномная структура гена человеческой дезоксигипузинсинтазы на хромосоме 19p13.2-дистальная 19p13.1» (PDF) . Gene . 215 (1): 153– 7. doi :10.1016/S0378-1119(98)00254-6. hdl : 2108/46188 . PMID  9666110.
  • Lee YB, Joe YA, Wolff EC и др. (1999). «Образование комплекса между дезоксигипузинсинтазой и ее белковым субстратом, предшественником эукариотического фактора инициации трансляции 5A (eIF5A)». Biochem. J . 340 (1): 273– 81. doi :10.1042/0264-6021:3400273. PMC  1220246 . PMID  10229683.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ober D, Harms R, Witte L, Hartmann T (2003). «Молекулярная эволюция путем изменения функции. Алкалоид-специфическая гомоспермидинсинтаза сохранила все свойства дезоксигипузинсинтазы, за исключением связывания белка-предшественника eIF5A». J. Biol. Chem . 278 (15): 12805– 12. doi : 10.1074/jbc.M207112200 . PMID  12562768.
  • Park JH, Wolff EC, Folk JE, Park MH (2003). "Обратная реакция синтеза дезоксигипузина. Генерация спермидина или гомоспермидина из дезоксигипузина дезоксигипузинсинтазой". J. Biol. Chem . 278 (35): 32683– 91. doi : 10.1074/jbc.M304247200 . PMID  12788913.
  • Kang KR, Chung SI (2004). «Протеинкиназа CK2 фосфорилирует и взаимодействует с дезоксигипузинсинтазой в клетках HeLa». Exp. Mol. Med . 35 (6): 556– 64. doi : 10.1038/emm.2003.73 . PMID  14749535.
  • Umland TC, Wolff EC, Park MH, Davies DR (2004). «Новая кристаллическая структура дезоксигипузинсинтазы раскрывает конфигурацию активного фермента и тройного комплекса фермента.НАД.ингибитора». J. Biol. Chem . 279 (27): 28697– 705. doi : 10.1074/jbc.M404095200 . PMID  15100216.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC  1847948 . PMID  17353931.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DHPS&oldid=1187997720"