DFNB31

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
WHRN
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыWHRN , CIP98, PDZD7B, USH2D, WI, DFNB31, вихрь, вихрь
Внешние идентификаторыОМИМ : 607928; МГИ : 2682003; гомологен : 18739; GeneCards : WHRN; OMA :WHRN — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001083885
NM_001173425
NM_015404
NM_001346890

RefSeq (белок)

NP_001077354
NP_001166896
NP_001333819
NP_056219

NP_001008791
NP_001008792
NP_001008793
NP_001263300
NP_082916

Местоположение (UCSC)Хр 9: 114,4 – 114,51 МбХр 4: 63.33 – 63.41 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Whirlin — это белок , который у людей кодируется геном DFNB31 . [ 5] [6] [7]

В мозге крысы WHRN взаимодействует с кальмодулин-зависимой сериновой киназой, CASK , и может участвовать в формировании комплексов белков-подложек, которые облегчают синаптическую передачу в центральной нервной системе (ЦНС). [8] Мутации в этом гене, также известном как WHRN, вызывают аутосомно-рецессивную глухоту. [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000095397 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039137 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Mburu P, Mustapha M, Varela A, Weil D, El-Amraoui A, Holme RH, Rump A, Hardisty RE, Blanchard S, Coimbra RS, Perfettini I, Parkinson N, Mallon AM, Glenister P, Rogers MJ, Paige AJ, Moir L, Clay J, Rosenthal A, Liu XZ, Blanco G, Steel KP, Petit C, Brown SD (август 2003 г.). «Дефекты в whirlin, молекуле домена PDZ, участвующей в удлинении стереоцилий, вызывают глухоту у мышей whirler и семей с DFNB31». Nat Genet . 34 (4): 421– 8. doi :10.1038/ng1208. PMID  12833159. S2CID  39603776.
  6. ^ Ebermann I, Scholl HP, Charbel Issa P, Becirovic E, Lamprecht J, Jurklies B, Millan JM, Aller E, Mitter D, Bolz H (март 2007 г.). «Новый ген синдрома Ашера 2-го типа: мутации в длинной изоформе whirlin связаны с пигментным ретинитом и нейросенсорной потерей слуха». Hum Genet . 121 (2): 203– 11. doi :10.1007/s00439-006-0304-0. PMID  17171570. S2CID  22632047.
  7. ^ ab "Ген Энтреза: глухота DFNB31, аутосомно-рецессивный 31".
  8. ^ Yap CC, Liang F, Yamazaki Y, et al. (2003). «CIP98, новый белок домена PDZ, экспрессируется в центральной нервной системе и взаимодействует с кальмодулин-зависимой сериновой киназой». J. Neurochem . 85 (1): 123– 34. doi : 10.1046/j.1471-4159.2003.01647.x . PMID  12641734. S2CID  46526881.

Дальнейшее чтение

  • Holm G, Björkholm M, Mellstedt H, Johansson B (1976). «Цитотоксическая активность лимфоцитов у пациентов с болезнью Ходжкина». Clin. Exp. Immunol . 21 (3): 376–83 . PMC  1538308. PMID  1081933 .
  • Нагасе Т., Кикуно Р., Ишикава К. и др. (2000). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 7 (2): 143–50 . doi : 10.1093/dnares/7.2.143 . PMID  10819331.
  • Mustapha M, Chouery E, Chardenoux S и др. (2002). "DFNB31, рецессивная форма сенсоневральной потери слуха, отображается на хромосоме 9q32-34". Eur. J. Hum. Genet . 10 (3): 210– 2. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200780 . PMID  11973626.
  • Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Взаимодействия белок–белок между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res . 12 (11): 1773– 84. doi :10.1101/gr.406902. PMC  187542. PMID  12421765 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
  • van Wijk E, van der Zwaag B, Peters T и др. (2006). «Продукт гена DFNB31 whirlin соединяется с сетью белков Usher в улитке и сетчатке посредством прямой ассоциации с USH2A и VLGR1». Hum. Mol. Genet . 15 (5): 751– 65. doi : 10.1093/hmg/ddi490 . PMID  16434480.
  • Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о синдроме Ашера типа II
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DFNB31&oldid=1208645743"