Ген деубиквитиназы лизина 63 CYLD , также называемый геном CYLD , [5] CYLD является эволюционно древним геном, который, как было обнаружено, присутствует еще в эволюционной шкале у губок . [6] У людей этот ген расположен в полосе 12.1 на длинном (или «q») плече хромосомы 16 [7] и, как известно, кодирует (т.е. направляет производство) несколько белков посредством процесса альтернативного сплайсинга . [8]
Известно, что ген CYLD кодирует цитоплазматический белок, называемый CYLD лизин 63 деубиквитиназой (далее именуемый белком CYLD), который имеет три цитоскелетно -ассоциированных домена глицин-консервированного белка (CAP-GLY) (области белка, контролирующие критические функции [9] ). Белок CYLD является деубиквитинирующим ферментом , т. е. протеазой , которая удаляет убиквитин из определенных белков и тем самым регулирует активность этих белков. Белок CYLD удаляет убиквитин из белков, участвующих в регуляции сигнальных путей клеток NF-κB , Wnt , notch , TGF-β , [10] и JNK [11] ; эти пути обычно регулируют образование волос, рост клеток, выживание клеток, воспалительные реакции и/или развитие опухолей. [10] [11]
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000083799 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036712 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Отчет о символах для CYLD". www.genenames.org/ . Получено 20 июня 2019 г. .
^ Hadweh P, Chaitoglou I, Gravato-Nobre MJ, Ligoxygakis P, Mosialos G, Hatzivassiliou E (2018). «Функциональный анализ гена cyld-1 C. elegans выявил обширное сходство с его человеческим гомологом». PLOS ONE . 13 (2): e0191864. Bibcode : 2018PLoSO..1391864H. doi : 10.1371/journal.pone.0191864 . PMC 5796713. PMID 29394249 .
^ Арруда А.П., Кардозу-Дус-Сантос AC, Мариат Л.М., Фейра М.Ф., Ковальски Т.В., Безерра К.Р., да Силва Л.А., Рибейро Э.М., Шулер-Фаччини Л. (июль 2020 г.). «Большая семья с кожным синдромом CYLD: медицинская генетика на уровне сообщества». Журнал общественной генетики . 11 (3): 279–284 . doi :10.1007/s12687-019-00447-2. ПМЦ 7295879 . ПМИД 31792733.
^ Weisbrich A, Honnappa S, Jaussi R, Okhrimenko O, Frey D, Jelesarov I, Akhmanova A, Steinmetz MO (октябрь 2007 г.). "Структурно-функциональная связь доменов CAP-Gly". Nature Structural & Molecular Biology . 14 (10): 959– 67. doi :10.1038/nsmb1291. PMID 17828277. S2CID 37088265.
^ abc Nagy N, Dubois A, Szell M, Rajan N (2021). «Генетическое тестирование при кожном синдроме CYLD: обновление». Применение клинической генетики . 14 : 427–444 . doi : 10.2147/TACG.S288274 . PMC 8566010. PMID 34744449 .
^ abc Cui Z, Kang H, Grandis JR, Johnson DE (январь 2021 г.). «Изменения CYLD в опухолеобразовании и прогрессировании рака головы и шеи, связанного с вирусом папилломы человека». Molecular Cancer Research . 19 (1): 14– 24. doi : 10.1158/1541-7786.MCR-20-0565. PMC 7840145. PMID 32883697 .
^ ab Lei H, Wang J, Hu J, Zhu Q, Wu Y (август 2021 г.). «Деубиквитиназы при гематологических злокачественных новообразованиях». Biomarker Research . 9 (1): 66. doi : 10.1186/s40364-021-00320-w . PMC 8401176. PMID 34454635 .
^ Davies HR, Hodgson K, Schwalbe E, Coxhead J, Sinclair N, Zou X, Cockell S, Husain A, Nik-Zainal S, Rajan N (октябрь 2019 г.). «Эпигенетические модификаторы DNMT3A и BCOR повторно мутируют при кожном синдроме CYLD». Nature Communications . 10 (1): 4717. Bibcode :2019NatCo..10.4717D. doi :10.1038/s41467-019-12746-w. PMC 6797807 . PMID 31624251.
Дальнейшее чтение
Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». Исследования ДНК . 9 (3): 99–106 . CiteSeerX 10.1.1.500.923 . дои : 10.1093/dnares/9.3.99. ПМИД 12168954.
Lian F, Cockerell CJ (2006). «Опухоли кожных придатков: семейный цилиндроматоз и сопутствующие опухоли, обновление». Advances in Dermatology . 21 : 217–34 . doi :10.1016/j.yadr.2005.06.005. PMID 16350444.
Biggs PJ, Wooster R, Ford D, Chapman P, Mangion J, Quirk Y, Easton DF, Burn J, Stratton MR (декабрь 1995 г.). «Ген семейного цилиндроматоза (синдром тюрбановой опухоли), локализованный в хромосоме 16q12-q13: доказательства его роли в качестве гена-супрессора опухолей». Nature Genetics . 11 (4): 441– 3. doi :10.1038/ng1295-441. PMID 7493027. S2CID 33637152.
Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Biggs PJ, Chapman P, Lakhani SR, Burn J, Stratton MR (март 1996). «Ген цилиндроматоза (cyld1) на хромосоме 16q может быть единственным геном-супрессором опухолей, участвующим в развитии цилиндром». Oncogene . 12 (6): 1375– 7. PMID 8649842.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (декабрь 1998 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 5 (6): 355– 64. doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . PMID 10048485.
Thomson SA, Rasmussen SA, Zhang J, Wallace MR (1999). «Новая наследственная семья цилиндроматоза, связанная с CYLD1 на хромосоме 16». Генетика человека . 105 ( 1– 2): 171– 3. doi :10.1007/s004399900077. PMID 10480375.
Bignell GR, Warren W, Seal S, Takahashi M, Rapley E, Barfoot R, Green H, Brown C, Biggs PJ, Lakhani SR, Jones C, Hansen J, Blair E, Hofmann B, Siebert R, Turner G, Evans DG, Schrander-Stumpel C, Beemer FA, van Den Ouweland A, Halley D, Delpech B, Cleveland MG, Leigh I, Leisti J, Rasmussen S (июнь 2000 г.). «Идентификация гена-супрессора опухолей при семейном цилиндроматозе». Nature Genetics . 25 (2): 160– 5. doi :10.1038/76006. PMID 10835629. S2CID 22829077.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34+». Genome Research . 10 (10): 1546– 60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152.
Trompouki E, Hatzivassiliou E, Tsichritzis T, Farmer H, Ashworth A, Mosialos G (август 2003 г.). "CYLD — это деубиквитинирующий фермент, который негативно регулирует активацию NF-kappaB членами семейства TNFR". Nature . 424 (6950): 793– 6. Bibcode :2003Natur.424..793T. doi :10.1038/nature01803. hdl : 21.11116/0000-0007-948F-1 . PMID 12917689. S2CID 4424549.
Brummelkamp TR, Nijman SM, Dirac AM, Bernards R (август 2003 г.). «Утрата супрессора опухолей цилиндроматоза ингибирует апоптоз путем активации NF-kappaB». Nature . 424 (6950): 797– 801. Bibcode :2003Natur.424..797B. doi :10.1038/nature01811. hdl : 1874/17767 . PMID 12917690. S2CID 4416878.
Kovalenko A, Chable-Bessia C, Cantarella G, Israël A, Wallach D, Courtois G (август 2003 г.). «Супрессор опухолей CYLD отрицательно регулирует сигнализацию NF-kappaB путем деубиквитинирования». Nature . 424 (6950): 801– 5. Bibcode :2003Natur.424..801K. doi :10.1038/nature01802. PMID 12917691. S2CID 4397177.
Hu G, Onder M, Gill M, Aksakal B, Oztas M, Gürer MA, Celebi JT (октябрь 2003 г.). «Новая миссенс-мутация в CYLD в семье с синдромом Брука-Шпиглера». Журнал исследовательской дерматологии . 121 (4): 732– 4. doi : 10.1046/j.1523-1747.2003.12514.x . hdl : 20.500.12648/7847 . PMID 14632188.
Regamey A, Hohl D, Liu JW, Roger T, Kogerman P, Toftgard R, Huber M (декабрь 2003 г.). «Супрессор опухолей CYLD взаимодействует с TRIP и отрицательно регулирует активацию ядерного фактора kappaB фактором некроза опухоли». Журнал экспериментальной медицины . 198 (12): 1959– 64. doi :10.1084/jem.20031187. PMC 2194148. PMID 14676304 .
Zhang XJ, Liang YH, He PP, Yang S, Wang HY, Chen JJ, Yuan WT, Xu SJ, Cui Y, Huang W (март 2004 г.). «Идентификация гена-супрессора опухолей цилиндроматоза, ответственного за множественную семейную трихоэпителиому». Журнал исследовательской дерматологии . 122 (3): 658– 64. doi : 10.1111/j.0022-202X.2004.22321.x . PMID 15086550.
Jono H, Lim JH, Chen LF, Xu H, Trompouki E, Pan ZK, Mosialos G, Li JD (август 2004 г.). «NF-kappaB необходим для индукции CYLD, отрицательного регулятора NF-kappaB: доказательства нового индуцируемого пути ауторегуляторной обратной связи». Журнал биологической химии . 279 (35): 36171– 4. doi : 10.1074/jbc.M406638200 . hdl : 21.11116/0000-0007-9489-7 . PMID 15226292.
Внешние ссылки
Расположение генома человека CYLD и страница с подробностями гена CYLD в браузере геномов UCSC .