Циклический нуклеотид-связывающий домен

Циклический нуклеотид-связывающий домен
Структура комплекса CAP-ДНК. [1]
Идентификаторы
Символ	cNMP_binding
Пфам	ПФ00027
ИнтерПро	IPR000595
УМНЫЙ	SM00100
ПРОСИТ	PDOC00691
СКОП2	1cgp / SCOPe / SUPFAM
CDD	cd00038
Доступные структуры белков: Пфам   структуры / ECOD   ПДБ RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры ПДБ 1o7f A:375-462 2apk :153-242 1kmw R:154-243 1kmu R:154-243 1cx4 A:170-259 1rl3 A:153-238 1ne6 A:153-238 1ne4 A:153-238 1rgs :153-238 1apk :153-238 1pvk A:153-238 1u7e B:153-238 2bpk :275-372 1bpk :271-362 1q43 A:535-620 1q5o A:535-620 1q3e A:535-620 1vp6 C:253-336 1u12 B:253-336 1i6x A:21-112 1hw5 А:21-112 1j59 Б:21-112 1o3s А:21-112 1g6n Б:21-112 1lb2 А:21-112 1cgp Б:21-112 1ruo Б:21-112 2cgp А:21-112 1o3r А:21-112 1i5z Б:21-112 1o3t А:21-112 1run А:21-112 1o3q А:21-112 1 фут 9 А:25-107 1o5l А:12-103 1wgp А:532-632

Белки, связывающие циклические нуклеотиды ( цАМФ или цГМФ ), имеют структурный домен из примерно 120 остатков. Наиболее изученным из этих белков является прокариотический активатор гена катаболита (также известный как белок рецептора цАМФ ) (ген crp), где такой домен, как известно, состоит из трех альфа-спиралей и отличительной восьмицепочечной антипараллельной структуры бета-бочонка. В этом домене есть шесть инвариантных аминокислот, три из которых являются остатками глицина, которые, как считается, необходимы для поддержания структурной целостности бета-бочонка. цАМФ- и цГМФ-зависимые протеинкиназы (cAPK и cGPK) содержат две тандемные копии домена связывания циклических нуклеотидов. cAPK состоят из двух разных субъединиц, каталитической цепи и регуляторной цепи, которая содержит обе копии домена. cGPK — это одноцепочечные ферменты, которые включают две копии домена в своей N-концевой секции. Циклические нуклеотид-зависимые ионные каналы позвоночных также содержат этот домен. Два таких катионных канала были полностью охарактеризованы, один из них обнаружен в палочках, где он играет роль в передаче зрительного сигнала.

CNBD1; CNGA1 ; CNGA2 ; CNGA3 ; CNGB1 ; CNGB3 ; HCN1 ; HCN2 ; HCN3 ; HCN4 ; KCNH1 ; KCNH2 ; KCNH3 ; KCNH4 ; KCNH5 ; KCNH6 ; KCNH7 ; KCNH8 ; PNPLA6 ; PNPLA7; PRKAR1A ; PRKAR1B ; PRKAR2A ; PRKAR2B ; PRKG1 ; PRKG2; RAPGEF2 ; RAPGEF3 ; RAPGEF4 ; RAPGEF6 ; RCNC2; SLC9A10 ; SLC9A11 ;

• Yau, KW (1994). «Циклические нуклеотид-управляемые каналы: расширяющееся новое семейство ионных каналов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (9): 3481– 3483. Bibcode :1994PNAS...91.3481Y. doi : 10.1073/pnas.91.9.3481 . PMC  43603 . PMID  7513422.