Оксидоредуктаза

Фермент, участвующий в окислительно-восстановительных реакциях

В биохимии оксидоредуктаза — это фермент , катализирующий перенос электронов от одной молекулы, восстановителя , также называемого донором электронов , к другой, окислителю , также называемому акцептором электронов . Эта группа ферментов обычно использует НАДФ+ или НАД+ в качестве кофакторов . ^[1]^[2] Трансмембранные оксидоредуктазы создают цепи переноса электронов в бактериях, хлоропластах и митохондриях , включая дыхательные комплексы I , II и III . Некоторые другие могут связываться с биологическими мембранами как периферические мембранные белки или быть прикрепленными к мембранам через одну трансмембранную спираль . ^[3]

Реакции

Например, ферментом, катализирующим эту реакцию, будет оксидоредуктаза:

А ^– + Б → А + Б ^–

В этом примере A — восстановитель (донор электронов), а B — окислитель (акцептор электронов).

В биохимических реакциях окислительно-восстановительные реакции иногда сложнее увидеть, например, эту реакцию гликолиза :

P _i + глицеральдегид-3-фосфат + НАД ⁺ → НАДН + Н ⁺ + 1,3-бисфосфоглицерат

В этой реакции НАД ⁺ является окислителем (акцептором электронов), а глицеральдегид-3-фосфат — восстановителем (донором электронов).

Номенклатура

Собственные названия оксидоредуктаз образуются как « донор:акцептор оксидоредуктазы»; однако, другие названия встречаются гораздо чаще. ^{[ необходима цитата ]}

Обычное название — « донорная дегидрогеназа », когда это возможно, например, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа для второй реакции выше.
Иногда также образуются общие названия типа « акцепторная редуктаза», например, НАД ⁺ редуктаза.
« Донорная оксидаза » — это особый случай, где _{акцептором} является O2 .

Классификация

Оксидоредуктазы классифицируются как EC 1 в классификации ферментов EC . Оксидоредуктазы можно далее классифицировать на 21 подкласс:

EC 1.1 включает оксидоредуктазы, которые действуют на группу CH-OH доноров ( алкогольные оксидоредуктазы, такие как метанолдегидрогеназа )
EC 1.2 включает оксидоредуктазы, которые действуют на альдегидную или оксогруппу доноров
EC 1.3 включает оксидоредуктазы, которые действуют на группу доноров CH-CH ( оксидоредуктазы CH-CH )
EC 1.4 включает оксидоредуктазы, которые действуют на группу доноров CH-NH _{2 (}Аминокислотные оксидоредуктазы , Моноаминоксидазы )
EC 1.5 включает оксидоредуктазы, которые действуют на группу доноров CH-NH
EC 1.6 включает оксидоредуктазы, которые действуют на NADH или NADPH
EC 1.7 включает оксидоредуктазы, которые действуют на другие азотистые соединения как доноры
EC 1.8 включает оксидоредуктазы, которые действуют на серную группу доноров
EC 1.9 включает оксидоредуктазы, которые действуют на гемовую группу доноров
EC 1.10 включает оксидоредуктазы, которые действуют на дифенолы и родственные им вещества как доноры
EC 1.11 включает оксидоредуктазы, которые действуют на пероксид как акцептор ( пероксидазы )
EC 1.12 включает оксидоредуктазы, которые действуют на водород как доноры
EC 1.13 включает оксидоредуктазы, которые действуют на одиночных донорах с включением молекулярного кислорода ( оксигеназы )
EC 1.14 включает оксидоредуктазы, которые действуют на парных донорах с включением молекулярного кислорода.
EC 1.15 включает оксидоредуктазы, которые действуют на супероксидные радикалы как акцепторы
EC 1.16 включает оксидоредуктазы, которые окисляют ионы металлов.
EC 1.17 включает оксидоредуктазы, которые действуют на группы CH или CH ₂
EC 1.18 включает оксидоредуктазы, которые действуют на железо-серные белки как доноры
EC 1.19 включает оксидоредуктазы, которые действуют на восстановленный флаводоксин как донор
EC 1.20 включает оксидоредуктазы, которые действуют на фосфор или мышьяк у доноров
EC 1.21 включает оксидоредуктазы, которые действуют на XH и YH, образуя связь XY.

Смотрите также

Ссылки

^ Эрик Дж. Тун (2006). Достижения в области энзимологии и смежных областях молекулярной биологии, Эволюция белков (том 75, ред.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
^ Николас К. Прайс; Льюис Стивенс (1999). Основы энзимологии: Клеточная и молекулярная биология каталитических белков (третье изд.). США: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
^ Суперсемейства однопроходных трансмембранных оксидоредуктаз в базе данных Membranome

Внешние ссылки

Медиа, связанные с оксидоредуктазами на Wikimedia Commons
EC 1 Введение от кафедры химии в Университете королевы Марии, Лондон

[1] Эрик Дж. Тун (2006). Достижения в области энзимологии и смежных областях молекулярной биологии, Эволюция белков (том 75, ред.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.

[2] Николас К. Прайс; Льюис Стивенс (1999). Основы энзимологии: Клеточная и молекулярная биология каталитических белков (третье изд.). США: Oxford University Press. ISBN 019850229X.

[3] Суперсемейства однопроходных трансмембранных оксидоредуктаз в базе данных Membranome