Коб(I)ириновая кислота a,c-диамид аденозилтрансфераза
| АТФ:корриноидаденозилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Человеческая митохондриальная Cob(I)ириновая кислота a,c-диамидаденозилтрансфераза, MMAB . [1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.5.1.17 | ||||||||
| Номер CAS | 37277-84-2 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| АТФ:корриноидаденозилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 трехмерная структура атф:корриноид аденозилтрансферазы из сальмонеллы тифимуриум. апо-атф форма | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | CobA_CobO_BtuR | ||||||||
| Пфам | ПФ02572 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0023 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003724 | ||||||||
| СКОП2 | 1g64 / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Кобаламин аденозилтрансфераза (PduO/EutT) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура консервативного белка 0546 из thermoplasma acidophilum | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Cob_adeno_trans | ||||||||
| Пфам | ПФ01923 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002779 | ||||||||
| СКОП2 | 1nog / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии a,c-диамид аденозилтрансфераза коб(I)ириновой кислоты (также известная как аденозилтрансфераза АТФ:коб(I)аламина или аденозилтрансфераза АТФ:корриноида) EC 2.5.1.17 представляет собой фермент , который катализирует превращение кобаламина (витамина B12) в одну из его коферментных форм, аденозилкобаламин (кофермент B12, AdoCbl). [2] [3] Аденозилкобаламин требуется в качестве кофактора для активности некоторых ферментов . AdoCbl содержит аденозильную часть, лигандированную с ионом кобальта кобаламина через ковалентную связь Co-C.
АТФ:cob(I)аламин аденозилтрансферазы классифицируются на три группы: CobA-типа, [4] EutT-типа [5] и PduO-типа. [6] Каждый из трех типов ферментов, по-видимому, специализирован для определенных ферментов, зависящих от AdoCbl, или для синтеза AdoCbl de novo . PduO и EutT находятся в отдаленном родстве, разделяя короткие консервативные мотивы, в то время как CobA эволюционно не связан и является примером конвергентной эволюции .
Группа CobA включает АТФ:cob(I)аламин аденозилтрансферазы CobA ( Salmonella typhimurium ), CobO ( Pseudomonas denitrificans ) и ButR ( Escherichia coli ). Между этими белками существует высокая степень идентичности последовательностей . [7] CobA отвечает за присоединение аденозильного фрагмента АТФ к иону кобальта корринового кольца , необходимого для превращения кобаламина в аденозилкобаламин. [3] [4] PduO функционирует для превращения кобаламина в AdoCbl для деградации 1,2-пропандиола , [8] в то время как EutT производит AdoCbl для утилизации этаноламина . [9]
Синонимы
Этот фермент также известен как:
- Кобаламин аденозилтрансфераза
- АТФ:cob(I)аламин аденозилтрансфераза
- АТФ:корриноидаденозилтрансфераза
Смотрите также
Ссылки
- ^ Schubert HL, Hill CP (декабрь 2006 г.). «Структура АТФ-связанной человеческой АТФ: кобаламин аденозилтрансферазы». Биохимия . 45 (51): 15188–96. doi :10.1021/bi061396f. PMC 2532598. PMID 17176040 .
- ^ Mera PE, Escalante-Semerena JC (сентябрь 2010 г.). «Множественные роли аденозилтрансфераз АТФ:cob(I)аламина в превращении B12 в кофермент B12». Appl. Microbiol. Biotechnol . 88 (1): 41–8. doi :10.1007/s00253-010-2773-2. PMC 3034633. PMID 20677021 .
- ^ ab Sheppard DE, Penrod JT, Bobik T, Kofoid E, Roth JR (ноябрь 2004 г.). «Доказательства того, что B12-аденозилтрансфераза кодируется в опероне этаноламина Salmonella enterica». J. Bacteriol . 186 (22): 7635–44. doi :10.1128/JB.186.22.7635-7644.2004. PMC 524904. PMID 15516577 .
- ^ ab Buan NR, Rehfeld K, Escalante-Semerena JC (май 2006 г.). "Исследования фермента АТФ:Co(I)rrinoid adenosyltransferase типа CobA штамма Methanosarcina mazei Go1". J. Bacteriol . 188 (10): 3543–50. doi :10.1128/JB.188.10.3543-3550.2006. PMC 1482872. PMID 16672609 .
- ^ Buan NR, Suh SJ, Escalante-Semerena JC (сентябрь 2004 г.). «Ген eutT Salmonella enterica кодирует кислородно-лабильный, металлсодержащий фермент АТФ:корриноид аденозилтрансферазу». J. Bacteriol . 186 (17): 5708–14. doi :10.1128/JB.186.17.5708-5714.2004. PMC 516830. PMID 15317775 .
- ^ Джонсон CL, Печоник E, Парк SD, Хавеманн GD, Лил NA, Бобик TA (март 2001 г.). «Функциональная геномная, биохимическая и генетическая характеристика гена Salmonella pduO, гена АТФ:cob(I)аламин аденозилтрансферазы». J. Bacteriol . 183 (5): 1577–84. doi :10.1128/JB.183.5.1577-1584.2001. PMC 95042. PMID 11160088 .
- ^ Suh SJ, Escalante-Semerena JC (июль 1993 г.). «Клонирование, секвенирование и сверхэкспрессия cobA, кодирующего АТФ:корриноидаденозилтрансферазу в Salmonella typhimurium». Gene . 129 (1): 93–7. doi :10.1016/0378-1119(93)90701-4. PMID 7916712.
- ^ Luers F, Seyfried M, Daniel R, Gottschalk G (сентябрь 1997 г.). «Преобразование глицерина в 1,3-пропандиол с помощью Clostridium pasteurianum: клонирование и экспрессия гена, кодирующего 1,3-пропандиолдегидрогеназу». FEMS Microbiol. Lett . 154 (2): 337–45. doi : 10.1016/s0378-1097(97)00351-0 . PMID 9311132.
- ^ Buan NR, Escalante-Semerena JC (июнь 2006 г.). «Очистка и начальная биохимическая характеристика фермента АТФ:Cob(I)аламин аденозилтрансферазы (EutT) Salmonella enterica». J. Biol. Chem . 281 (25): 16971–7. doi : 10.1074/jbc.M603069200 . PMID 16636051.
